Messias Miranda Junior
Enzimas
Messias.miranda@yahoo.com.br
Unidade Itapetininga - SP
1.Replicação;
2.Catálise de reações químicas com eficiência e seletividade
CONDIÇÕES FUNDAMENTAIS DA VIDA:
Participam das vias bioquímicas
• Enzimas realizam o controle preciso do metabolismo
celular
• O metabolismo energético
é um dos principais
temas de estudo
da bioquímica
• Permitem resposta
e adaptação a um
meio em mudança
O que são as enzimas?
• Proteínas notáveis, altamente especializadas
– Alto grau de especificidade com substratos
• Poder catalítico extraordinário
• Aceleram reações químicas
– Em condições suaves de temperatura e pH
• São o centro e o objeto de estudo principal da
bioquímica
– Atuando de forma organizada catalisam centenas de
reações que degradam as moléculas dos nutrientes e
conservam suas energias
• Doenças ocorrem quando elas não funcionam bem
• Como os cientistas descobriram as enzimas?
LOUIS PASTEUR
 1835: Berzelius, conceito de catálise
 1885: fermentação do acúcar por lêvedos,
gerando álcool
 1896: Edward Buchner consegue fermentar o açúcar num
extrato de lêvedo sem vida!
 Fermentos, portanto, catalisavam reações químicas (açúcar a
álcool) – biocatalisadores
Louis Pasteur
1822-1895
Um pouco de história...
EMIL FISCHER
 Sacarase
 Quebra da sacarose em glicose e frutose
 Produziu diversos análogos de sacarose para
testar se a enzima funcionava
 Determinadas mutações tornavam os análogos
resistentes à sacarase
 Modelo de ação enzimática
chave-e-fechadura
Hermann Emil Fischer
1852 - 1919
 Kunitz e Northrop
 Eletroforese e centrifugação: enzimas
estão na fração protéica!
 Mesmo em quantidades proteícas
indetectáveis pelos métodos, as
enzimas continuavam tendo atividades
 Como as milhares de reações catalíticas
eram possíveis a uma proteína?
John Howard Northrop
1891-1987
Finalmente, Sanger
 1952
 Publica a primeira estrutura primária
de uma proteína: a Insulina, com 51
aminoácidos
 O trabalho mostrava também que a
estrutura das proteínas poderia ser
descrita pela sua sequência de aminoácidos, do N ao C
terminal
 A sequência, entretanto, não ajudava a prever a
função da proteína (antes da bioinformática)
Frederick Sanger
13 August 1918
CONCLUSÃO: HISTÓRIA DA BIOQUÍMICA
 As enzimas realizam reações catalíticas e transformam moléculas
umas nas outras
 Os organismos biológicos são ricos em enzimas e as enzimas
funcionam também fora dos organismos biológicos →
biotecnologia!
 As enzimas são proteínas formadas por polímeros de
aminoácidos
 A multiplicidade de função se dá pela interação tridimensional
formada (modelo chave-fechadura) por interações
não-covalentes a partir de uma série de
aminoácidos ligados covalentemente
(ligação peptídica)
Toda enzima é proteína?!
• Não!, há alguns RNAs que
funcionam enquanto enzimas
também
• Componente químico adicional
necessário para a função
– Cofator: íons inorgânicos
– Coenzima: moléculas orgânicas
complexas
– Se liga muito firmemente: grupo
prostético
• Enzima completa: holoenzima
– Parte protéica: apoenzima ou
apoproteína
Cobre
Ferro
Potássio
Magnésio
Manganês
Molbdênio
Níquel
Selênio
Zinco
Apoenzima Holoenzima
As enzimas quando ligadas
às coenzimas, são
chamadas de holoenzimas
Grupo prostético
(coenzima ou íon)
Nomenclatura das enzimas
• Normalmente se adiciona o sufixo ase ao nome do
substrato ou à atividade realizada
– Urease – hidrolisa a uréia
– DNA-polimerase – polimeriza DNA
– Pepsina – pepsis vem do grego (digestão)
– Lipase
– Protease
• Sistema de classificação
enzimático – EC number (Enzyme Commission)
– Quatro números: 2.7.1.1
• 1. Classe
• 2. Sub-classe dentro da classe
• 3. grupos químicos específicos que participam da reação.
• 4. a molécula que está recebendo o grupo funcional
• EXEMPLO: ATP: glicose-fosfotransferase EC 2.7.1.1
• 2 → Classe = Transferase
• 7 → Subclasse = fosfotransferase
• 1 → fosfotransferase que tem um grupo hidroxila como aceptor
• 1 → glicose como aceptor
1. Oxido-redutases
São todas as enzimas que catalisam reações de oxidação-redução. O
substrato oxidado é um hidrogênio ou doador de elétron.
Lactato desidrogenase
2. Transferases
São enzimas que catalisam a transferência de grupos entre duas
moléculas.
Alanina amino transferase
3. Hidrolases
Catalisam a reação de hidrólise de várias ligações covalentes. O nome,
em geral, é dado pelo “substrato” + o sufixo “ase”.
Peptidases
4. Liases
Liases são enzimas que catalisam a clivagem de ligações C-C, C-O, C-N,.
5. Isomerases
Catalisam a modificação de uma única molécula, sem participação de
outra.
6. Ligases
Catalisam reações de síntese de uma nova molécula a partir da
ligação entre duas moléculas, com a concomitante hidrólise de
ATP ou outro composto trifosfatado.
Moléculas catalisadoras que aumentam a velocidade das reações,
sem sofrerem alterações no processo global;
Na faixa de 106 a 1012 ordens de magnitude.
Praticamente todas as reações que caracterizam
o metabolismo celular são catalisadas por
enzimas.
Reação enzimática
Equilíbrio químico
• As enzimas realizam, muitas
vezes, as reações nos dois
sentidos
• A concentração de substratos e
produtos é o que define a
velocidade das reações
• Poder catalítico das enzimas vem
da energia livre liberada na
formação de ligações fracas
quando da interação enzima-
substrato
– Interações fracas entre ES são
otimizadas no estado de transição
Reação enzimática
• Reação se dá em fases:
• Enzima aumenta a velocidade das reações
• Os catalisadores aumentam a velocidade das
reações por que diminuem a energia de ativação
Bastonase como modelo enzimático
Estabiliza o
substrato
Cinética enzimática
• A concentração do substrato [S] influi
na velocidade das reações catalisadas
por enzimas
• Velocidade máxima é abstraída para
concentrações excessivas de
Substrato
• Constante de Michaelis-Menten
– kM = [S] correspondente a ½
Vmax;
V0
A velocidade da reação é diretamente proporcional à
concentração da enzima
Equação de Michaelis-Menten
Reações com dois substratos
• Enzimas podem formar os chamados complexos ternários ou
realizar as reações uma-depois-da-outra
• Velocidade das reações químicas depende também da faixa
de pH
– Maior velocidade está normalmente associada ao pH do ambiente
onde a enzima atua
Efeito do pH na atividade enzimática
H+
H+
A. pH ótimo
B. pH inferior ao
ótimo (maior [H+])
• Velocidade das reações químicas depende também da faixa
de temperatura
– Maior velocidade está normalmente associada temperatura do
ambiente onde a enzima atua
Exceto: organismos termófilos
Inibição enzimática reversível
(inibição competitiva)
Inibição enzimática reversível
(inibição competitiva)
1/Vmax
-1/Km
Inibição enzimática reversível
(inibição não competitiva/incompetitiva)
Inibição enzimática reversível
(inibição não competitiva/incompetitiva)
1/Vmax
-1/Km
Inibição enzimática reversível
(inibição mista)
Inibidor enzimático irreversível
Ligam-se a enzima, alterando estrutura do sítio ativo, inativando a
enzima
Sítio ativo
inativado
A função fisiológica da inibição enzimática
Enzimas alostéricas
Enzimas regulatórias

Enzimas

  • 1.
  • 2.
    1.Replicação; 2.Catálise de reaçõesquímicas com eficiência e seletividade CONDIÇÕES FUNDAMENTAIS DA VIDA:
  • 3.
    Participam das viasbioquímicas • Enzimas realizam o controle preciso do metabolismo celular • O metabolismo energético é um dos principais temas de estudo da bioquímica • Permitem resposta e adaptação a um meio em mudança
  • 4.
    O que sãoas enzimas? • Proteínas notáveis, altamente especializadas – Alto grau de especificidade com substratos • Poder catalítico extraordinário • Aceleram reações químicas – Em condições suaves de temperatura e pH • São o centro e o objeto de estudo principal da bioquímica – Atuando de forma organizada catalisam centenas de reações que degradam as moléculas dos nutrientes e conservam suas energias • Doenças ocorrem quando elas não funcionam bem • Como os cientistas descobriram as enzimas?
  • 5.
    LOUIS PASTEUR  1835:Berzelius, conceito de catálise  1885: fermentação do acúcar por lêvedos, gerando álcool  1896: Edward Buchner consegue fermentar o açúcar num extrato de lêvedo sem vida!  Fermentos, portanto, catalisavam reações químicas (açúcar a álcool) – biocatalisadores Louis Pasteur 1822-1895 Um pouco de história...
  • 6.
    EMIL FISCHER  Sacarase Quebra da sacarose em glicose e frutose  Produziu diversos análogos de sacarose para testar se a enzima funcionava  Determinadas mutações tornavam os análogos resistentes à sacarase  Modelo de ação enzimática chave-e-fechadura Hermann Emil Fischer 1852 - 1919
  • 8.
     Kunitz eNorthrop  Eletroforese e centrifugação: enzimas estão na fração protéica!  Mesmo em quantidades proteícas indetectáveis pelos métodos, as enzimas continuavam tendo atividades  Como as milhares de reações catalíticas eram possíveis a uma proteína? John Howard Northrop 1891-1987
  • 9.
    Finalmente, Sanger  1952 Publica a primeira estrutura primária de uma proteína: a Insulina, com 51 aminoácidos  O trabalho mostrava também que a estrutura das proteínas poderia ser descrita pela sua sequência de aminoácidos, do N ao C terminal  A sequência, entretanto, não ajudava a prever a função da proteína (antes da bioinformática) Frederick Sanger 13 August 1918
  • 10.
    CONCLUSÃO: HISTÓRIA DABIOQUÍMICA  As enzimas realizam reações catalíticas e transformam moléculas umas nas outras  Os organismos biológicos são ricos em enzimas e as enzimas funcionam também fora dos organismos biológicos → biotecnologia!  As enzimas são proteínas formadas por polímeros de aminoácidos  A multiplicidade de função se dá pela interação tridimensional formada (modelo chave-fechadura) por interações não-covalentes a partir de uma série de aminoácidos ligados covalentemente (ligação peptídica)
  • 11.
    Toda enzima éproteína?! • Não!, há alguns RNAs que funcionam enquanto enzimas também • Componente químico adicional necessário para a função – Cofator: íons inorgânicos – Coenzima: moléculas orgânicas complexas – Se liga muito firmemente: grupo prostético • Enzima completa: holoenzima – Parte protéica: apoenzima ou apoproteína
  • 12.
  • 13.
    Apoenzima Holoenzima As enzimasquando ligadas às coenzimas, são chamadas de holoenzimas Grupo prostético (coenzima ou íon)
  • 14.
    Nomenclatura das enzimas •Normalmente se adiciona o sufixo ase ao nome do substrato ou à atividade realizada – Urease – hidrolisa a uréia – DNA-polimerase – polimeriza DNA – Pepsina – pepsis vem do grego (digestão) – Lipase – Protease
  • 15.
    • Sistema declassificação enzimático – EC number (Enzyme Commission) – Quatro números: 2.7.1.1 • 1. Classe • 2. Sub-classe dentro da classe • 3. grupos químicos específicos que participam da reação. • 4. a molécula que está recebendo o grupo funcional
  • 19.
    • EXEMPLO: ATP:glicose-fosfotransferase EC 2.7.1.1 • 2 → Classe = Transferase • 7 → Subclasse = fosfotransferase • 1 → fosfotransferase que tem um grupo hidroxila como aceptor • 1 → glicose como aceptor
  • 20.
    1. Oxido-redutases São todasas enzimas que catalisam reações de oxidação-redução. O substrato oxidado é um hidrogênio ou doador de elétron. Lactato desidrogenase
  • 21.
    2. Transferases São enzimasque catalisam a transferência de grupos entre duas moléculas. Alanina amino transferase
  • 22.
    3. Hidrolases Catalisam areação de hidrólise de várias ligações covalentes. O nome, em geral, é dado pelo “substrato” + o sufixo “ase”. Peptidases
  • 23.
    4. Liases Liases sãoenzimas que catalisam a clivagem de ligações C-C, C-O, C-N,.
  • 24.
    5. Isomerases Catalisam amodificação de uma única molécula, sem participação de outra.
  • 25.
    6. Ligases Catalisam reaçõesde síntese de uma nova molécula a partir da ligação entre duas moléculas, com a concomitante hidrólise de ATP ou outro composto trifosfatado.
  • 26.
    Moléculas catalisadoras queaumentam a velocidade das reações, sem sofrerem alterações no processo global; Na faixa de 106 a 1012 ordens de magnitude. Praticamente todas as reações que caracterizam o metabolismo celular são catalisadas por enzimas.
  • 27.
  • 28.
    Equilíbrio químico • Asenzimas realizam, muitas vezes, as reações nos dois sentidos • A concentração de substratos e produtos é o que define a velocidade das reações • Poder catalítico das enzimas vem da energia livre liberada na formação de ligações fracas quando da interação enzima- substrato – Interações fracas entre ES são otimizadas no estado de transição
  • 29.
    Reação enzimática • Reaçãose dá em fases: • Enzima aumenta a velocidade das reações • Os catalisadores aumentam a velocidade das reações por que diminuem a energia de ativação
  • 30.
    Bastonase como modeloenzimático Estabiliza o substrato
  • 31.
    Cinética enzimática • Aconcentração do substrato [S] influi na velocidade das reações catalisadas por enzimas • Velocidade máxima é abstraída para concentrações excessivas de Substrato • Constante de Michaelis-Menten – kM = [S] correspondente a ½ Vmax; V0
  • 32.
    A velocidade dareação é diretamente proporcional à concentração da enzima
  • 33.
  • 34.
    Reações com doissubstratos • Enzimas podem formar os chamados complexos ternários ou realizar as reações uma-depois-da-outra
  • 35.
    • Velocidade dasreações químicas depende também da faixa de pH – Maior velocidade está normalmente associada ao pH do ambiente onde a enzima atua
  • 36.
    Efeito do pHna atividade enzimática H+ H+ A. pH ótimo B. pH inferior ao ótimo (maior [H+])
  • 37.
    • Velocidade dasreações químicas depende também da faixa de temperatura – Maior velocidade está normalmente associada temperatura do ambiente onde a enzima atua Exceto: organismos termófilos
  • 38.
  • 39.
  • 40.
    Inibição enzimática reversível (inibiçãonão competitiva/incompetitiva)
  • 41.
    Inibição enzimática reversível (inibiçãonão competitiva/incompetitiva) 1/Vmax -1/Km
  • 42.
  • 43.
    Inibidor enzimático irreversível Ligam-sea enzima, alterando estrutura do sítio ativo, inativando a enzima Sítio ativo inativado
  • 44.
    A função fisiológicada inibição enzimática
  • 45.