O documento discute os tópicos da quimioinformática como ferramenta para o desenvolvimento de novos materiais. Ele define quimioinformática como o uso da informática para resolver problemas envolvendo química e descreve os principais usos como descoberta de novas drogas, entendimento da relação estrutura-atividade e propriedades, e desenvolvimento de novas moléculas e materiais. Também discute os tipos de descritores moleculares usados na quimioinformática e como a seleção adequada de descritores é importante para a análise
A BC END apresenta a técnica de Eddy Current Array e sua aplicação na inspeção de engrenagens, estabelecendo melhorias na produtividade e aquisição de dados em comparação aos ensaios de Líquido Penetrante e Partículas Magnéticas.
Presentation on ICH guidelines Q5A (R1) and Q4B Annex 2 (R1)HadiaNaz1
EXECUTIVE SUMMARY OF ICH GUIDELINES Q5A (R1) AND Q4B ANNEX 2 (R1)
VIRAL SAFETY EVALUATION OF BIOTECHNOLOGY PRODUCTS DERIVED FROM CELL LINES OF HUMAN OR ANIMAL ORIGIN – Q4B ANNEX 2 (R1):
This document is concerned with testing and evaluation of the viral safety of biotechnology products derived from characterized cell lines of human or animal origin. The scope of the document covers products derived from cell cultures initiated from characterized cell banks. It covers products derived from in vitro cell cultures, recombinant DNA – derived products and also includes products derived from hybridoma cells grown in vivo.
Three principal approaches have evolved to control the potential viral contamination of biotechnology products:
a) Selecting & testing cell lines and other raw materials, including media components, for the absence of undesirable viruses which may be infectious and/or pathogenic for humans.
b) Assessing the capacity of the production processes to clear infectious viruses.
c) Testing the product at appropriate steps of production for absence of contaminating infectious viruses.
The guideline suggests approaches for the evaluation of the risk of viral contamination and for the removal of virus from the product. Following are the recommended tests for the brief description of a general framework and philosophical background within which the manufacturer should justify the testing that was done;
1) Test for Retroviruses
2) In vitro Assay
3) In vivo Assay
4) Antibody Production Tests
TEST FOR EXTRACTABLE VOLUME OF PARENTRAL PREPARATIONS GENERAL CHAPTER – Q4B ANNEX 2 (R1):
This annex is the result of the Q4B process for the Test for Extractable Volume of Parenteral Preparations General Chapter. The proposed texts were submitted by the Pharmacopoeial Discussion Group (PDG). The acceptance criteria of this document are same in the three pharmacopoeias.
The annex contains the following considerations for the implementation;
1) General Consideration
2) FDA Consideration
3) EU Consideration
4) MHLW Consideration
A BC END apresenta a técnica de Eddy Current Array e sua aplicação na inspeção de engrenagens, estabelecendo melhorias na produtividade e aquisição de dados em comparação aos ensaios de Líquido Penetrante e Partículas Magnéticas.
Presentation on ICH guidelines Q5A (R1) and Q4B Annex 2 (R1)HadiaNaz1
EXECUTIVE SUMMARY OF ICH GUIDELINES Q5A (R1) AND Q4B ANNEX 2 (R1)
VIRAL SAFETY EVALUATION OF BIOTECHNOLOGY PRODUCTS DERIVED FROM CELL LINES OF HUMAN OR ANIMAL ORIGIN – Q4B ANNEX 2 (R1):
This document is concerned with testing and evaluation of the viral safety of biotechnology products derived from characterized cell lines of human or animal origin. The scope of the document covers products derived from cell cultures initiated from characterized cell banks. It covers products derived from in vitro cell cultures, recombinant DNA – derived products and also includes products derived from hybridoma cells grown in vivo.
Three principal approaches have evolved to control the potential viral contamination of biotechnology products:
a) Selecting & testing cell lines and other raw materials, including media components, for the absence of undesirable viruses which may be infectious and/or pathogenic for humans.
b) Assessing the capacity of the production processes to clear infectious viruses.
c) Testing the product at appropriate steps of production for absence of contaminating infectious viruses.
The guideline suggests approaches for the evaluation of the risk of viral contamination and for the removal of virus from the product. Following are the recommended tests for the brief description of a general framework and philosophical background within which the manufacturer should justify the testing that was done;
1) Test for Retroviruses
2) In vitro Assay
3) In vivo Assay
4) Antibody Production Tests
TEST FOR EXTRACTABLE VOLUME OF PARENTRAL PREPARATIONS GENERAL CHAPTER – Q4B ANNEX 2 (R1):
This annex is the result of the Q4B process for the Test for Extractable Volume of Parenteral Preparations General Chapter. The proposed texts were submitted by the Pharmacopoeial Discussion Group (PDG). The acceptance criteria of this document are same in the three pharmacopoeias.
The annex contains the following considerations for the implementation;
1) General Consideration
2) FDA Consideration
3) EU Consideration
4) MHLW Consideration
Medicação intracanal na Endodontia (Paramonoclorofenol canforado + Hidróxido...Ines Jacyntho Inojosa
Esta apresentação tem por objetivo descrever as indicações , contra-indicações e diferentes formas de manipulação e técnicas de emprego da medicação intracanal a base de Parmonoclorofenolcanforado (PMCC) associado ao hidróxido de cálcio , na endodontia.
Anatomia, Histologia e Fisiologia do Periodonto - Arriba DentistaAndré Milioli Martins
Slides da minha aula postada no Youtube sobre anatomia, histologia e fisiologia do periodonto.
Neste vídeo aula, explico tudo sobre periodonto de sustentação e periodonto de proteção, a partir de uma visão macro e microoscópica.
A periodontia é um tema frequente em provas de concursos públicos para dentistas, por isso o domínio deste tema é essencial.
Para assistir a vídeo aula completa acesse: https://youtu.be/e14c6SZUFIw
Nesta aula discutimos a organização dos levantamentos epidemiológicos e discutimos resultados de alguns dados de 1996, 2003 e 2010 no Brasil.
Uma boa reflexão e exercício sobre calibração para exames populacionais.
Medicação intracanal na Endodontia (Paramonoclorofenol canforado + Hidróxido...Ines Jacyntho Inojosa
Esta apresentação tem por objetivo descrever as indicações , contra-indicações e diferentes formas de manipulação e técnicas de emprego da medicação intracanal a base de Parmonoclorofenolcanforado (PMCC) associado ao hidróxido de cálcio , na endodontia.
Anatomia, Histologia e Fisiologia do Periodonto - Arriba DentistaAndré Milioli Martins
Slides da minha aula postada no Youtube sobre anatomia, histologia e fisiologia do periodonto.
Neste vídeo aula, explico tudo sobre periodonto de sustentação e periodonto de proteção, a partir de uma visão macro e microoscópica.
A periodontia é um tema frequente em provas de concursos públicos para dentistas, por isso o domínio deste tema é essencial.
Para assistir a vídeo aula completa acesse: https://youtu.be/e14c6SZUFIw
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Uma boa reflexão e exercício sobre calibração para exames populacionais.
Atividade - Letra da música "Tem Que Sorrir" - Jorge e MateusMary Alvarenga
A música 'Tem Que Sorrir', da dupla sertaneja Jorge & Mateus, é um apelo à reflexão sobre a simplicidade e a importância dos sentimentos positivos na vida. A letra transmite uma mensagem de superação, esperança e otimismo. Ela destaca a importância de enfrentar as adversidades da vida com um sorriso no rosto, mesmo quando a jornada é difícil.
Sistema de Bibliotecas UCS - Chronica do emperador Clarimundo, donde os reis ...Biblioteca UCS
A biblioteca abriga, em seu acervo de coleções especiais o terceiro volume da obra editada em Lisboa, em 1843. Sua exibe
detalhes dourados e vermelhos. A obra narra um romance de cavalaria, relatando a
vida e façanhas do cavaleiro Clarimundo,
que se torna Rei da Hungria e Imperador
de Constantinopla.
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livro em pdf para professores da educação de jovens e adultos dos anos iniciais ( alfabetização e 1º ano)- material excelente para quem trabalha com turmas de eja. Material para quem dar aula na educação de jovens e adultos . excelente material para professores
Caderno de Resumos XVIII ENPFil UFU, IX EPGFil UFU E VII EPFEM.pdfenpfilosofiaufu
Caderno de Resumos XVIII Encontro de Pesquisa em Filosofia da UFU, IX Encontro de Pós-Graduação em Filosofia da UFU e VII Encontro de Pesquisa em Filosofia no Ensino Médio
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Quimioinformatica
1. Tópicos em Materiais I Quimioinformática como ferramenta no desenvolvimento de novos materiais Programa de Pós-graduação em Ciências de Materiais (PPGMAt) Universidade Federal de Mato Grosso Prof. Dr. Ricardo Stefani ICET/CUA Baseado em Kier et al., 2009
2. Informática vs. Computação Programa de Pós-graduação em Ciências de Materiais (PPGMAt) Universidade Federal de Mato Grosso Informática: Tratamento automatizado da informação Computação: Resolução de problemas numéricos ou não numéricos através de algoritmos Algoritmo: Sequência de passos lógicos para a resolução de um problema
3. Quimioinformática Programa de Pós-graduação em Ciências de Materiais (PPGMAt) Universidade Federal de Mato Grosso Segundo Brown (1999): “ Quimioinformática é o uso da informática para a resolução de problemas Envolvendo química” Área Interdisciplinar: Química, informática, matemática, Ciência da Computação Bioinformática: Uso da informática para resolver problemas envolvendo Macromoléculas biológicas
8. Descritores moleculares Programa de Pós-graduação em Ciências de Materiais (PPGMAt) Universidade Federal de Mato Grosso “ Estrutura determina a propriedade” “ Uma propriedade da molécula depende de outras” Descritor molecular é a descrição numérica de certa propriedade da molécula Tipos: 0D (Ponto de fusão, ebulição, peso e volume molecular, etc.) 1D (Numero de ligações, de átomos, cargas totais, momento de dipolo.etc.) 2D (distância entre átomos, número de grafos, conectividade,etc) 3D (Volume molecular, raio de van der Waals, TPSA, WASA, SAA, etc.) 4D (volume do sítio ativos, número de interações intermoleculares, etc.) 5D (Tipos de interações com o sistema)
9. Espaço Químico Programa de Pós-graduação em Ciências de Materiais (PPGMAt) Universidade Federal de Mato Grosso Banco que contém as moléculas e os dados a serem analisados. Bons dados geram boas análises Gera-se descritores moleculares para cada molécula no ChemSpace
10. Descritores Moleculares Programa de Pós-graduação em Ciências de Materiais (PPGMAt) Universidade Federal de Mato Grosso Cada tipo de problema requer uma classe de descritor diferente, ou mesmo vários tipos de descritores
11. Descritores Moleculares Programa de Pós-graduação em Ciências de Materiais (PPGMAt) Universidade Federal de Mato Grosso Cada tipo de problema requer uma classe de descritor diferente, ou mesmo vários tipos de descritores
12. Descritores Moleculares Programa de Pós-graduação em Ciências de Materiais (PPGMAt) Universidade Federal de Mato Grosso Descritores Consititucionais Descritores Topológicos Descritores geométricos Descritores eletrostáticos Descritores quânticos Descritores Termodinâmicos Descritores de reatividade
13. Programa de Pós-graduação em Ciências de Materiais (PPGMAt) Universidade Federal de Mato Grosso Topological 2-D (Kier & Hall indices) Electrostatic Charge distribution (partial charges, H-bond donors/acceptors) Geometric 3-D ( I , SA , Molecular Volume) Quantum-chemical Molecular orbital structure (HOMO-LUMO energies, dipole moment)
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17. Descritores Eletrostáticos Programa de Pós-graduação em Ciências de Materiais (PPGMAt) Universidade Federal de Mato Grosso Cargas parciais atômicas Parâmetros de polaridade Momento de dipolo Polarizabilidade Potenciais eletrostáticos na superfície molecular
18. Descritores Quânticos Programa de Pós-graduação em Ciências de Materiais (PPGMAt) Universidade Federal de Mato Grosso Energia total da molécula Energia de repulsão eletron-eletron Energia de ressonância Cinética eletrônica Energia total de cinética
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21. Geração de descritores Programa de Pós-graduação em Ciências de Materiais (PPGMAt) Universidade Federal de Mato Grosso
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24. Tanimoto (padrão) Programa de Pós-graduação em Ciências de Materiais (PPGMAt) Universidade Federal de Mato Grosso ( , ) = 0.68 ( , ) = 21.93
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26. Impressão digital (bits) Programa de Pós-graduação em Ciências de Materiais (PPGMAt) Universidade Federal de Mato Grosso 0100010100010100010000000001101010011010100000010100000000100000 01000101000101000100000000011010100110101000000 0 0100000000100000
27. Pequenas diferenças estruturais podem alterar muito as propriedades Programa de Pós-graduação em Ciências de Materiais (PPGMAt) Universidade Federal de Mato Grosso
28. Como descobrir os melhores descritores ? Programa de Pós-graduação em Ciências de Materiais (PPGMAt) Universidade Federal de Mato Grosso e.g. Comparação de faces requer a identificação de características chaves. Como as identificamos? O mesmo se aplica a moléculas.
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33. Programa de Pós-graduação em Ciências de Materiais (PPGMAt) Universidade Federal de Mato Grosso Rede Neural Artificial (ANN) Camada escondida Saída Parâmetros Funções Previsão Input Input Input Input Input Input Input Input Input
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37. Programa de Pós-graduação em Ciências de Materiais (PPGMAt) Universidade Federal de Mato Grosso Motivação da SVM Como separar as duas classes? Como separar as duas classes?
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40. Programa de Pós-graduação em Ciências de Materiais (PPGMAt) Universidade Federal de Mato Grosso Virtual Screening Triagem virtual Substâncias ótimas protótipos Seleção de substâncias biblioteca
42. Programa de Pós-graduação em Ciências de Materiais (PPGMAt) Universidade Federal de Mato Grosso Método: Virtual Screening 3D Filtering 3D Fitting 1D Filtering 2D Filtering e.g. MW 200-500 Lipinsky
43. Programa de Pós-graduação em Ciências de Materiais (PPGMAt) Universidade Federal de Mato Grosso Quantitative Structure-Properties-Relationship (QSPR) Encontrar correlações entre estrutura química e determinadas propriedades Predizer a característica de novas moléculas e materiais a partir de substâncias conhecidas
44. Programa de Pós-graduação em Ciências de Materiais (PPGMAt) Universidade Federal de Mato Grosso Extrair e organizar descritores Quantitative Structure-Properties Relationship (QSPR) Dados
45. Programa de Pós-graduação em Ciências de Materiais (PPGMAt) Universidade Federal de Mato Grosso Construindo modelos QSPR (propriedades) (Descritores) Y = f (X i ) Multiple Linear Regression (MLR) pK i = a o + a 1 (Mol Vol i ) + a 2 (logP) + a 3 ( i ) + ... Hansch, 1969 Partial Least-Squares (PLS) Regression pK i = a o + a 1 (PC1) + a 2 (PC2) + a 3 (PC3) + ... Wold, et al. 1984 Simple (Univariate) Linear Regression Hammett, 1939 pK i = a o + a 1 (Mol Vol i )
46. Programa de Pós-graduação em Ciências de Materiais (PPGMAt) Universidade Federal de Mato Grosso Quantitative Structure-Performance Relationship (QSPR) Models Conjunto de polímeros In vitro/In vivo Data (Y) Molecular Descriptors (X i ) QSPR Y = f (X i ) Interpretação Predição
47. Programa de Pós-graduação em Ciências de Materiais (PPGMAt) Universidade Federal de Mato Grosso Biblioteca combinatória Y or R Size of library Explosão Combinatória n diacid component diphenol component R O C C NH O O CH 2 CH 2 C O CH 2 O CH C O Y O
51. Programa de Pós-graduação em Ciências de Materiais (PPGMAt) Universidade Federal de Mato Grosso Cluster representatives Predicted value Synthesis-> Biol. testing-> QSPR model Dipole Molecular volume Rotatable bonds Good diversity Double bonds Moment of inertia Density Poor diversity
52. Programa de Pós-graduação em Ciências de Materiais (PPGMAt) Universidade Federal de Mato Grosso Do modelo QSPR, selecionar os melhores descritos e valores que se relacionam com a propriedade desejada Sintesizar polímeros conhecidos e testar Planejar e sintestizar novos polímeros 1 2 3 Dos modelos para o planejamento racional e síntese n diacid component diphenol component R O C C NH O O CH 2 CH 2 C O CH 2 O CH C O Y O
54. Programa de Pós-graduação em Ciências de Materiais (PPGMAt) Universidade Federal de Mato Grosso 1 Ferramentas: ChemAxon: http://www.chemaxon.com Virtual Chemistry Lab: http://www.vcclab.org Weka: www.cs.waikato.ac.nz/ml/ weka / libSVM: An integrated and easy-to-use tool for support vector classification and regression. ww w.csie.ntu.edu.tw/~cjlin/ libsvm / ADRIANA: http://www.molecular-networks.com/products/adrianacode THERESA: http://www.molecular-networks.com/products/theresa
55. Programa de Pós-graduação em Ciências de Materiais (PPGMAt) Universidade Federal de Mato Grosso 1 Referências Comp. Mat. Sci, 2009, 45, 52-59. Biosensors and Bioeletronics, 2009, 25, 543-52. Biomaterials, 2007, 28, 4171-4177. Adv. Matr., 2001, 13, 1713-1717.