Reação em cadeia da polimerase


            Grupo:
            Caique Moreira       10158
            Guilherme Victor     10167
            Gustavo Assis        10169
            Laura Lassance       10176
            Pedro Chinen         10186
            Rubens               10190

            3º Informática
 Paraquê?
     Criar facilmente milhares
     de cópias de um único
     pedaço de DNA

 Onde?
     In vitro
 Do   que precisa?
            Um pedaço do DNA desejado
            Dois primers (DNAs iniciadores)
            diferentes
            Nucleotídeos (adenina - A, guanina –G,
            citosina - C e timina - T)
            Enzima DNA polimerase (enzima que
            faz replicação do DNA)
O   que são primers?
          Fitas de DNA
          Mais ou menos 20 bases nitrogenadas
           (A, T, C, G) complementares ao início
           da sequência de DNA alvo
          São usados dois diferentes, pois as
           “pontas” das fitas de DNA base são
           diferentes
•   No tubo de ensaio:
      Amostra de DNA
      Primers (oligonucleótidos) complementares
      DNA polimerase
      Nucleotídeos
 Uso da máquina de PCR (máquina que aumenta e
  diminui a temperatura de acordo com um
  programa)
 Passos seguintes:
  dentro da máquina
 Aquece-se o tubo a 94ºC para desnaturar
 (separar a dupla fita) o DNA.
•   Fita simples do DNA desnaturado: molde
•   Resfria-se a 54ºC
•   Primers
      • Anelam-se ao início das duas fitas simples
      • Iniciadores para a enzima polimerase
 Tuboa 72ºC (temperatura ideal de
 funcionamento da DNA polimerase)
 Cofator   enzimático Mg2+, do MgCl2
 Duplicaçãoda fita, a DNA polimerase começa
 seu trabalho  formação de nova fita dupla
Taxa de replicação:
       2 ciclos
     (exponencial)



Vídeo:
http://www.ib.usp.br/microg
ene/atividades0popup.php?Ar
quivo=atividades-5-
Arquivo.swf
 Do   que precisa?
           Dideoxinucleotídeo trifosfato
            (dNTPs; nucleotídeos contendo grupos
            trifosfatos), os blocos de construção
            com os quais a DNA polimerase sintetiza
            uma nova fita de DNA
Inibem a PCR
 Contaminantes   da amostra de DNA (limitante)


     Inibidores da Polimerase
 Fenol;

 Elevadas   concentrações de sais;
ELETROFORESE
 Identifica   tamanho dos fragmentos (produtos)
 Carga   de uma fita de DNA é negativa
 Corrente:    carga negativa atraída por cátodo
 (positivo)
 “Peneira”
          (gel de agarose) – dependendo do
 tamanho viaja ou não pelos poros
 Distância    percorrida comparada com Ladders
ELETROFORESE
 Determinar    sequência de nucleotídeos
 Dna   e Rna
 Sequenciamento    Químico(Maxam – Gilbert)
 Sequenciamento    Enzimático(Sanger-Coulson)
 Final
      do trecho de DNA Selecionado é marcado
 com fósforo 32P
 Moléculaserá decomposta em pontos específicos,
 sendo dividida em bases nitrogenadas C, G, G+A e
 T+C
 Porfim os fragmentos são analisados por migração
 causada por eletroforese causada pelo gel de
 policrilamida.
 LABELLING   REACTION
   TERMINATING CHAIN REACTION
 Uso
    de enzima polimerase para catalisar reação
 em cadeia
 NaSequenciação não é preciso acumular DNA
 duplicado, logo é usado apenas um primer
 Quantidade   DNA disponível é reduzida;

 Em   teoria, com o PCR é possível amplificar a
 quantidade de qualquer DNA;

 Medicina   forense;
 Identificação   de doenças hereditárias;

 Construção   de árvores filogenéticas;

 Clonagem    de genes;

 Teste   de paternidade;

 Detecção   de organismos causadores de infecções;

 Concepção    de organismos transgênicos.

 Sequenciamento     gênico de animais pré-históricos;
 Atualmente      aumentou o número de co-
 infecção tuberculose e HIV;
    Letalidade da tuberculose pode ser 2,4 a 19 vezes maior;



 PCR   utilizado para o diagnóstico da
 tuberculose;
   http://www.ib.usp.br/microgene/index.php?pagina=atividades
   http://www.sobiologia.com.br/conteudos/Biotecnologia/PCR.php
   http://pt.wikipedia.org/wiki/Rea%C3%A7%C3%A3o_em_cadeia_da_pol
    imerase
   http://www.infoescola.com/genetica/reacao-em-cadeia-da-
    polimerase/
   http://en.wikipedia.org/wiki/Polymerase_chain_reaction
   http://www.e-escola.pt/topico.asp?id=339
   http://www.imt.usp.br/portal/images/pdf/proto/aula1.pdf
   http://www.icb.ufmg.br/mor/pad-morf/pcr2.htm
   Rev. Saúde Pública, 33 (3) p. 281-6, 1999

3S_PCR

  • 1.
    Reação em cadeiada polimerase Grupo: Caique Moreira 10158 Guilherme Victor 10167 Gustavo Assis 10169 Laura Lassance 10176 Pedro Chinen 10186 Rubens 10190 3º Informática
  • 9.
     Paraquê? Criar facilmente milhares de cópias de um único pedaço de DNA  Onde? In vitro
  • 10.
     Do que precisa?  Um pedaço do DNA desejado  Dois primers (DNAs iniciadores) diferentes  Nucleotídeos (adenina - A, guanina –G, citosina - C e timina - T)  Enzima DNA polimerase (enzima que faz replicação do DNA)
  • 11.
    O que são primers?  Fitas de DNA  Mais ou menos 20 bases nitrogenadas (A, T, C, G) complementares ao início da sequência de DNA alvo  São usados dois diferentes, pois as “pontas” das fitas de DNA base são diferentes
  • 12.
    No tubo de ensaio:  Amostra de DNA  Primers (oligonucleótidos) complementares  DNA polimerase  Nucleotídeos
  • 13.
     Uso damáquina de PCR (máquina que aumenta e diminui a temperatura de acordo com um programa)  Passos seguintes: dentro da máquina
  • 14.
     Aquece-se otubo a 94ºC para desnaturar (separar a dupla fita) o DNA.
  • 15.
    Fita simples do DNA desnaturado: molde • Resfria-se a 54ºC • Primers • Anelam-se ao início das duas fitas simples • Iniciadores para a enzima polimerase
  • 16.
     Tuboa 72ºC(temperatura ideal de funcionamento da DNA polimerase)  Cofator enzimático Mg2+, do MgCl2  Duplicaçãoda fita, a DNA polimerase começa seu trabalho  formação de nova fita dupla
  • 17.
    Taxa de replicação: 2 ciclos (exponencial) Vídeo: http://www.ib.usp.br/microg ene/atividades0popup.php?Ar quivo=atividades-5- Arquivo.swf
  • 18.
     Do que precisa?  Dideoxinucleotídeo trifosfato (dNTPs; nucleotídeos contendo grupos trifosfatos), os blocos de construção com os quais a DNA polimerase sintetiza uma nova fita de DNA
  • 21.
    Inibem a PCR Contaminantes da amostra de DNA (limitante) Inibidores da Polimerase  Fenol;  Elevadas concentrações de sais;
  • 22.
    ELETROFORESE  Identifica tamanho dos fragmentos (produtos)  Carga de uma fita de DNA é negativa  Corrente: carga negativa atraída por cátodo (positivo)  “Peneira” (gel de agarose) – dependendo do tamanho viaja ou não pelos poros  Distância percorrida comparada com Ladders
  • 23.
  • 25.
     Determinar sequência de nucleotídeos  Dna e Rna  Sequenciamento Químico(Maxam – Gilbert)  Sequenciamento Enzimático(Sanger-Coulson)
  • 26.
     Final do trecho de DNA Selecionado é marcado com fósforo 32P  Moléculaserá decomposta em pontos específicos, sendo dividida em bases nitrogenadas C, G, G+A e T+C  Porfim os fragmentos são analisados por migração causada por eletroforese causada pelo gel de policrilamida.
  • 30.
  • 31.
    TERMINATING CHAIN REACTION
  • 32.
     Uso de enzima polimerase para catalisar reação em cadeia  NaSequenciação não é preciso acumular DNA duplicado, logo é usado apenas um primer
  • 37.
     Quantidade DNA disponível é reduzida;  Em teoria, com o PCR é possível amplificar a quantidade de qualquer DNA;  Medicina forense;
  • 38.
     Identificação de doenças hereditárias;  Construção de árvores filogenéticas;  Clonagem de genes;  Teste de paternidade;  Detecção de organismos causadores de infecções;  Concepção de organismos transgênicos.  Sequenciamento gênico de animais pré-históricos;
  • 39.
     Atualmente aumentou o número de co- infecção tuberculose e HIV;  Letalidade da tuberculose pode ser 2,4 a 19 vezes maior;  PCR utilizado para o diagnóstico da tuberculose;
  • 40.
    http://www.ib.usp.br/microgene/index.php?pagina=atividades  http://www.sobiologia.com.br/conteudos/Biotecnologia/PCR.php  http://pt.wikipedia.org/wiki/Rea%C3%A7%C3%A3o_em_cadeia_da_pol imerase  http://www.infoescola.com/genetica/reacao-em-cadeia-da- polimerase/  http://en.wikipedia.org/wiki/Polymerase_chain_reaction  http://www.e-escola.pt/topico.asp?id=339  http://www.imt.usp.br/portal/images/pdf/proto/aula1.pdf  http://www.icb.ufmg.br/mor/pad-morf/pcr2.htm  Rev. Saúde Pública, 33 (3) p. 281-6, 1999