Base molecular da
hereditariedade: natureza
química, replicação, transcrição
e tradução do DNA
Cientistas que contribuíram para a
compreensão da estrutura do DNA
Experimento de Griffith - 1928
Experimento de Avery, Macleod e McCarty -
1944
1.
A estrutura primária do DNA –
bases nitrogenadas – proporções
de Chargaff et al (1948)
anel de 6 lados ligado a um anel
de 5 lados (DNA e RNA)
Apenas um anel de 6 lados
Tipos de nucleotídeos (base
nitrogenada (N) + pentose + fosfato)
Experimento de Hersey e Chase -
1952
Experimento de Hersey e Chase
Experimento de Rosalind Franklin
- 1953
Pulo do gato de Watson e Crick – dupla
hélice - 1953
Investigaram a estrutura do DNA com
dados disponíveis de outros
pesquisadores
Testaram as diferentes possibilidades
de rearranjo químico criando
modelos de arames e placas de
ferro
Em um dos modelos, a disposição
química dos 4 nucleotídeos era
compatível com a foto 51 do raio X
O modelo de Watson e Crick é uma
dupla hélice - 1953
Características:
1 dupla fita com dois filamentos
2 os dois filamentos tem sentidos
inversos
3 giro para a direita – corrimão (DNA A e
B)
4 apresenta dois sulcos diferentes
(interagir com proteinas
reguladoras)
5 ocorrem 10 pb por giro da hélice
6 - bases nitrogenadas empilhadas
para dentro e ...
Modelo químico e a replicação – se é
complementar, deve replicar (Watson e Crick)
Replicação do DNA – inicialmente
foram propostos 3 modelos
..a molécula de DNA
original é totalmente
conservada
os
de DNA
e a fita
não é
..ambos
filamentos
quebram-se
original
conservada
..os dois filamentos
servem de molde para a
síntese de um novo DNA
Replicação do
DNA é
semiconserva
tiva
-
modelo de
Meselson e Stahl
-
centrifugação
do DNA em meio
salino
Replicação do DNA é semiconservativa -
modelo de Meselson e Stahl
Modos de replicação –
linear - eucariotos
Modos de replicação – a adição de
bases
• Existem 5 DNA polimerases em
E.coli.
• A
primeira
DNA polimerase purificada foi a DNA
polimerase I e apresenta 3
atividades:
• Uma
atividade
de polimerase que catalisa o
crescimento da cadeia no sentido 5’3’.
• Uma atividade de exonuclease 3’5’, que
remove
bases mal pareadas.
• Uma atividade 5’3’, que remove primers
Enzimas da replicação
• A DNA polimerase II pode reparar o DNA danificado e
reinicia
a replicação após o DNA danificado ter sido reparado.
• A DNA polimerase III, juntamente com a DNA polimerase
I, está envolvida na replicação do DNA de E.coli e
atua fortemente na polimerização.
• O complexo total da DNA polimerase
III contém pelo menos 20 subunidades polipeptídicas
diferentes.
• As DNA polimerase IV e V atuam no reparo do DNA.
Enzimas da replicação
DNA topoisomerases em seguida deselicoidizam o DNA e se
agrupam
em três classes: tipo I-5’, tipo I-3’e tipo II.
tipo I - quebram somente um dos polinucleotídeos
tipo II (DNA girase) - quebram ambos os polinucleotídeos
aliviando a tensão
o problema da iniciação e união dos fragmentos de Okazaki
na fita lagging
• A principal complexidade da replicação do DNA é que os dois
filamentos
dissociados da molécula original não podem ser tratados do mesmo modo.
• Um filamento é de replicação contínua e outro descontínua.
5
3
5 3
• Em ambos filamentos a DNA polimerase III não pode iniciar a síntese de
DNA sem um grupo 3’-OH (um nucleotídeo preexistente) – chamado de
iniciador (primer de RNA).
• primers de RNA são adicionados ao filamento contínuo e descontínuo,
por uma RNA polimerase.
• A RNA polimerase é chamada de primase e atua em conjunto com seis
ou
mais proteínas (formando o primossomo).
No filamento descontínuo (lagging), a DNA polimerase III sintetiza DNA
apenas por certa distância antes de atingir o primer.
Neste ponto, a DNA polimerase III pára e uma DNA polimerase I entra em
ação, continuando a síntese de DNA e desempenhando outra função
importante, a de remoção dos primers, substituindo-os por
desoxirribonucleotídeos.
DNA pol I começa a sintetizar DNA antes de encontrar o primer – qdo
encontra remove as bases do primer (RNA) e substitui por DNA.
A reação final é a união dos fragmentos de DNA pela DNA
ligase.
Replicação do DNA em eucariotos
As células eucarióticas usam milhares de origens: precisa ser sincronizadas
e 13 DNA polimerases (alta fidelidade).
Múltiplos sítios: PROBLEMA!!!!! todo o genoma deve ser
replicado precisamente uma vez e de uma vez no ciclo celular.
DNA POLIMERASES NOS EUCARIOTOS
Replicação
dos
nucleossomo
s
Ocorre durante a fase S,
imediatamente após a replicação do
DNA
Podem ser sintetizados de novo ou de
forma “semi-conservativa”
Para replicar o DNA é preciso
afrouxar as ligações histonas-DNA, o
que envolve a ação de complexos
remodeladores da cromatina e/ou
acetilação de H3 e H4
Alberts et al. (2004) Biologia Molecular da Célula,
Artmed
Replicação nos telômeros – outro
problema – DNA linear tem pontas!
Replicação nos telômeros – outro
problema – DNA linear tem pontas!
Apenas na fita
descontínua
Quando o primer no final do cromossomo da fita lagging foi removido,
ele não pode ser substituído por nucleotídeos pela
Falta da hidroxila 3’
A fita lagging do telômero é preenchida pela telomerase (uma
ribonucleoproteina que se complementa com as GGGGTT (leading) na sua
parte de RNA) ....
...a RNA telomerase fornece um molde para a síntese de cópias adicionais
de
DNA na fita leading (GGGGTTGGGG).
Replicação nos telômeros
Replicação nos
telômeros
-ainda não está claro como
lagging é sintetizada
POSSIBILIDADES???
1DNA pol α sintetiza
primer
2a ponta unifilamentar 3’
da leading dobra sobre si
mesma fornecendo uma
ponta 3’ para fechar a fita 5’
3- DNA telomerase com sua
parte de RNA e ponta 3’
funcionaria como um
“primer”???
A extremidade de fita
simples rica em g que foi
estendida pela
telomerase pode ser
dobrada sobre si mesma
Pareamento não
convencional
Formando um loop
terminal por pareamento
de bases não convencional
Para fornecer um grupo 3
´OH para anexar
nucleotídeos de DNA

Replicação do DNA e histórico de descoberta da molécula

  • 1.
    Base molecular da hereditariedade:natureza química, replicação, transcrição e tradução do DNA
  • 2.
    Cientistas que contribuírampara a compreensão da estrutura do DNA
  • 3.
  • 4.
    Experimento de Avery,Macleod e McCarty - 1944 1.
  • 5.
    A estrutura primáriado DNA – bases nitrogenadas – proporções de Chargaff et al (1948) anel de 6 lados ligado a um anel de 5 lados (DNA e RNA) Apenas um anel de 6 lados
  • 6.
    Tipos de nucleotídeos(base nitrogenada (N) + pentose + fosfato)
  • 7.
    Experimento de Herseye Chase - 1952
  • 8.
  • 9.
    Experimento de RosalindFranklin - 1953
  • 10.
    Pulo do gatode Watson e Crick – dupla hélice - 1953 Investigaram a estrutura do DNA com dados disponíveis de outros pesquisadores Testaram as diferentes possibilidades de rearranjo químico criando modelos de arames e placas de ferro Em um dos modelos, a disposição química dos 4 nucleotídeos era compatível com a foto 51 do raio X
  • 12.
    O modelo deWatson e Crick é uma dupla hélice - 1953 Características: 1 dupla fita com dois filamentos 2 os dois filamentos tem sentidos inversos 3 giro para a direita – corrimão (DNA A e B) 4 apresenta dois sulcos diferentes (interagir com proteinas reguladoras) 5 ocorrem 10 pb por giro da hélice 6 - bases nitrogenadas empilhadas para dentro e ...
  • 13.
    Modelo químico ea replicação – se é complementar, deve replicar (Watson e Crick)
  • 14.
    Replicação do DNA– inicialmente foram propostos 3 modelos ..a molécula de DNA original é totalmente conservada os de DNA e a fita não é ..ambos filamentos quebram-se original conservada ..os dois filamentos servem de molde para a síntese de um novo DNA
  • 15.
    Replicação do DNA é semiconserva tiva - modelode Meselson e Stahl - centrifugação do DNA em meio salino
  • 16.
    Replicação do DNAé semiconservativa - modelo de Meselson e Stahl
  • 17.
    Modos de replicação– linear - eucariotos
  • 18.
    Modos de replicação– a adição de bases
  • 19.
    • Existem 5DNA polimerases em E.coli. • A primeira DNA polimerase purificada foi a DNA polimerase I e apresenta 3 atividades: • Uma atividade de polimerase que catalisa o crescimento da cadeia no sentido 5’3’. • Uma atividade de exonuclease 3’5’, que remove bases mal pareadas. • Uma atividade 5’3’, que remove primers Enzimas da replicação
  • 20.
    • A DNApolimerase II pode reparar o DNA danificado e reinicia a replicação após o DNA danificado ter sido reparado. • A DNA polimerase III, juntamente com a DNA polimerase I, está envolvida na replicação do DNA de E.coli e atua fortemente na polimerização. • O complexo total da DNA polimerase III contém pelo menos 20 subunidades polipeptídicas diferentes. • As DNA polimerase IV e V atuam no reparo do DNA. Enzimas da replicação
  • 21.
    DNA topoisomerases emseguida deselicoidizam o DNA e se agrupam em três classes: tipo I-5’, tipo I-3’e tipo II. tipo I - quebram somente um dos polinucleotídeos tipo II (DNA girase) - quebram ambos os polinucleotídeos aliviando a tensão
  • 22.
    o problema dainiciação e união dos fragmentos de Okazaki na fita lagging • A principal complexidade da replicação do DNA é que os dois filamentos dissociados da molécula original não podem ser tratados do mesmo modo. • Um filamento é de replicação contínua e outro descontínua. 5 3 5 3
  • 23.
    • Em ambosfilamentos a DNA polimerase III não pode iniciar a síntese de DNA sem um grupo 3’-OH (um nucleotídeo preexistente) – chamado de iniciador (primer de RNA). • primers de RNA são adicionados ao filamento contínuo e descontínuo, por uma RNA polimerase. • A RNA polimerase é chamada de primase e atua em conjunto com seis ou mais proteínas (formando o primossomo).
  • 25.
    No filamento descontínuo(lagging), a DNA polimerase III sintetiza DNA apenas por certa distância antes de atingir o primer. Neste ponto, a DNA polimerase III pára e uma DNA polimerase I entra em ação, continuando a síntese de DNA e desempenhando outra função importante, a de remoção dos primers, substituindo-os por desoxirribonucleotídeos.
  • 26.
    DNA pol Icomeça a sintetizar DNA antes de encontrar o primer – qdo encontra remove as bases do primer (RNA) e substitui por DNA.
  • 27.
    A reação finalé a união dos fragmentos de DNA pela DNA ligase.
  • 28.
    Replicação do DNAem eucariotos As células eucarióticas usam milhares de origens: precisa ser sincronizadas e 13 DNA polimerases (alta fidelidade). Múltiplos sítios: PROBLEMA!!!!! todo o genoma deve ser replicado precisamente uma vez e de uma vez no ciclo celular.
  • 29.
  • 30.
    Replicação dos nucleossomo s Ocorre durante afase S, imediatamente após a replicação do DNA Podem ser sintetizados de novo ou de forma “semi-conservativa” Para replicar o DNA é preciso afrouxar as ligações histonas-DNA, o que envolve a ação de complexos remodeladores da cromatina e/ou acetilação de H3 e H4 Alberts et al. (2004) Biologia Molecular da Célula, Artmed
  • 31.
    Replicação nos telômeros– outro problema – DNA linear tem pontas!
  • 32.
    Replicação nos telômeros– outro problema – DNA linear tem pontas! Apenas na fita descontínua
  • 34.
    Quando o primerno final do cromossomo da fita lagging foi removido, ele não pode ser substituído por nucleotídeos pela Falta da hidroxila 3’ A fita lagging do telômero é preenchida pela telomerase (uma ribonucleoproteina que se complementa com as GGGGTT (leading) na sua parte de RNA) .... ...a RNA telomerase fornece um molde para a síntese de cópias adicionais de DNA na fita leading (GGGGTTGGGG). Replicação nos telômeros
  • 35.
  • 36.
    -ainda não estáclaro como lagging é sintetizada POSSIBILIDADES??? 1DNA pol α sintetiza primer 2a ponta unifilamentar 3’ da leading dobra sobre si mesma fornecendo uma ponta 3’ para fechar a fita 5’ 3- DNA telomerase com sua parte de RNA e ponta 3’ funcionaria como um “primer”???
  • 37.
    A extremidade defita simples rica em g que foi estendida pela telomerase pode ser dobrada sobre si mesma Pareamento não convencional Formando um loop terminal por pareamento de bases não convencional Para fornecer um grupo 3 ´OH para anexar nucleotídeos de DNA