REAÇÃO EM CADEIA DA POLIMERASE (PCR)
PCR
Polymerase Chain Reaction



   Amplificação in vitro de uma
   seqüência específica de DNA

    * replicação in vitro
Aplicações da Técnica de PCR
    Diagnóstico de doenças infecciosas e genéticas

    Amplificação de genes para posterior clonagem e
     expressão

    Determinação de variabilidade genética

    Deteção de OGMs

    Sexagem de embriões

    Estudo da expressão gênica
História


 Kary Mullis (1983)
   Prêmio Nobel Química (1993)
   Revolucionou genética
           pesquisa genética
           medicina forense
           genética molecular
Componentes da reação

 DNA molde
 Oligonucleotídeos (primer)
 dNTP’s
 DNA Polimerase
 Magnésio
 Tampão
 Água
Equipamento




          TERMOCICLADOR
CICLOS

  Programa                       PCR
94 0C por 5 min


94 0C por 1 min
55 0C por 1 min   35 ciclos
72 0C por 1 min


72 0C por 5 min
4 0C
ETAPAS



   -Extração de DNA
-Desenho dos Primers
   -Reação de PCR
- Análise dos resultados
Obtenção do DNA genômico
DELINEAMENTO DE PRIMERS

             Os iniciadores (oligos / primers) são a
             chave do sucesso ou da falha de um
                     experimento com PCR.




-   Tamanho dos primers;

-   Estabelecimento das temperaturas corretas a serem utilizadas;
DELINEAMENTO DE PRIMERS

Primer Forward
                      5’ TAGAAGCTTCCAGCCATGAACTCAG 3’
Tm: 57.9
Enzima: Hind III
Anelamento: 16 nt
Total primer: 25 nt


Primer Reverse
                      5’ ACGGAATTCTCAGAGTGCAGTTTG 3’
Tm: 56.4
Enzima: Eco RI
Anelamento: 15 nt
Total primer: 24 nt
ANELAMENTO E POLIMERIZAÇÃO
ETAPAS DA PCR


       30-60C
ETAPAS DA PCR


DESNATURAÇÃO




ANELAMENTO




POLIMERIZAÇÃO
Eletroforese
Eletroforese em Gel de Agarose
Eletroforese em gel de agarose
Visualização do DNA em luz
         ultravioleta
Resultados

Eletroforese do DNA em gel de agarose 0.8%
Resultados
Limitações

 Extração do DNA da amostra é crítica

 Alguns compostos podem inibir a polimerase
 Condições específicas para cada reação

 Falsos resultados positivos devido a contaminação.

 Falsos resultados negativos.


  Análises conduzidas em laboratórios especializados.
http://www.pcrlinks.com/
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
Tipos de PCR


·AFLP               ·PCR-ELISA
·Alu-PCR            ·PCR-RFLP
·Asymmetric PCR     ·PCR-SSCP
·Colony PCR         ·QC-PCR
·DD-PCR             ·RACE
·Degenerate PCR     ·RAPD
·Hot-start          ·Real-Time PCR
·In situ PCR        ·Rep-PCR
·Inverse PCR        ·RT-PCR
·Long-PCR           ·TAIL-PCR
·Multiplex PCR      ·Touchdown PCR
·Nested PCR         ·Vectorette PCR
Aditivos

PCR Additivos


 DMSO (dimethyl sulfoxide)
 genomas ricos em GC

 Formamide

 Non-ionic detergents –Triton X 100 Tween 20 or NP-40

 TMAC (tetramethylammonium chloride)

 BSA (bovine serum albumin)

Pcr 12