Trabalho realizado por:
João Ribeiro
Nuno Bastos
Grupo 4 P5
Química Bioinorgânica
Licenciatura em Bioquímica
Ano lectivo 2012/2013
Traços Gerais
A hemocianina é uma metaloproteína cuja principal função
é transportar o oxigénio em alguns artrópodes e moluscos.
• Contém 2 átomos de cobre que se
ligam reversivelmente ao O2.
• Encontra-se suspensa na hemolinfa.
• A forma desoxigenada é incolor e a
forma oxigenada é azul.
Por estar presente nas mais diversas espécies
de moluscos e artrópodes, através do PDB,
encontram-se várias estruturas, obtidas por
cristalografia de raios-X da hemocianina. Cada uma
das estruturas está associada a uma única espécie.
Citar-se-ão as estruturas que têm como
identificação 1OXY, 1NOL e 1LLA, por serem as
primeiras a serem inseridas no PDB, ou seja, que
representam os primeiros estudos cristalográficos
desta proteína.
Traços Gerais
As hemocianinas fazem parte do grupo das proteínas de cobre de tipo III
do qual também pertencem, por exemplo, a catecol oxidase e a tirosinase.
Alinhamento das sequências de aminoácidos dos sítios
activos da catecol oxidase da batata doce, tirosinase humana
e hemocinina do caracol (adaptada de Eicken et al, 1999).
Centro activo de várias proteínas de cobre do tipo
III: A e C correspondem à hemocianina de límulo e
polvo-gigante-do-pacífico, respetivamente; B,
catecol oxidase de batata doce e D tirosinase de
um microorganismo (Li et al, 2009)
Traços Gerais
A unidade básica de organização das hemocianinas é um conjunto de
seis subunidades, com um peso aproximado de 450000 Da.
A hemocianina circulante pode ser composta por uma, duas, quatro ou
oito desses hexâmeros, pelo que o seu peso é crescente e a sua solubilidade é,
consequentemente, maior.
x6
Traços Gerais
Hemocianina de Limulus polyphemus. A sua estrutura
secundária é 33% α-hélices , 18% folhas-β, 19% β-turn e
30% sem estrutura específica.Incorpora um centro de
cobre binuclear do tipo III. Rasmol, 1OXY
Centro ativo da Hemocianina de
Limulus polyphemus. Composta por dois átomos de
cobre, assinalados a amarelo, estando no centro a
molécula de oxigénio. A amarelo estão
representados os resíduos de Histidina que
coordenam com os centros metálicos, pelo átomo de
azoto. DeepView, 1OXY
Estrutura da proteína e do centro
ativo
Na forma desoxigenada, os iões
cobre estão sob a forma de Cu+.
Geometria do centro metálico
Desdobramento de orbitais,
para um complexo de
geometria trigonal plana
d¹⁰
transições d-d proibidas por spin
Orbitais completamente preenchidas
Complexo incolor
Os centros de cobre(I) na desoxihemocianina têm uma geometria trigonal
planar com 3 ligações Cu-N(His).
Há 2 estruturas cristalinas (R e T) da desoxihemocianina que diferem em
grande parte na distância Cu-Cu e na distorção piramidal desta geometria.
Estado T - tensoEstado R - relaxado
Formas R e T
A ligação reversível ao oxigénio é feita através de um
centro de cobre binuclear geralmente referido como centro de
cobre de ‘tipo III’.
Mecanismo de transporte
Durante a coordenação do O₂,
há uma reorientação dos ligandos que
altera a geometria de coordenação
para piramidal quadrada. Esta
alteração do campo de ligando altera
e destabiliza as orbitais ativas do
cobre, favorecendo a transferência
eletrónica.
Mecanismo de transporte
Ligação/ Libertação do O₂
ΔH
Ligação/ Libertação do O₂
Na oxihemocianina os dois iões cobre estão sob
a forma Cu2+, levando a que o O₂ seja reduzido pelos 2
eletrões, para O₂²¯.
No complexo binuclear, ambos os cobres(II) têm
um geometria piramidal quadrada com duas ligações de
2,0 Å a 2 histidinas, pelo átomo de azoto, no plano
equatorial. Cada uma das outras histidinas está em
posição trans-axial aos centros de cobre a uma distância
de 2,4 Å.
Alterações Estruturais
Estrutura do sítio ativo da
oxihemocianina da espécie L.
polyphemus. Os azotos ligados
directamente ao centro de cobre
estão numerados. Os mais
distanciados são os ligandos trans-
axiais. Rasmol, 1OXY.
Estrutura do sítio ativo da
desoxihemocianina da espécie L.
polyphemus. Rasmol, 1LLA.
Alterações Estruturais
O espectro de absorção da oxihemocianina exibe
uma transição muito intensa a 350 nm (ε≈20000
M¯¹cm¯¹) e uma banda mais fraca a 550 nm (ε≈
1000 M¯¹cm¯¹) que são atribuídas às transferência
de carga Ligando-Metal, O₂²¯ Cu(II)
Geometria do centro metálico
A banda de maior energia é atribuída à
transição πσ*(O2
2-) dx2-y2 (Cu(II)) e a mais
baixa à transição πv*(O2
2-) dx2-y2(Cu(II)),
onde πσ* é a orbital da espécie O2
2- no plano
Cu₂O₂ (ligação σ aos centros metálicos de
Cu(II)) enquanto a orbital πv* é
perpendicular a esse plano.
Geometria do centro metálico
EPR- Silencioso na forma oxigenada
e desoxigenada
EXAFS
Distância entre catiões de cobre
Oxihemocianina - 3,6 Å
Desoxihemocianina - 3,5 a 4,6 Å
Esfera de coordenação
Oxihemocianina - 3 átomos de azoto e 2
àtomos de oxigênio
Desoxihemocinanina - 3 átomos de
azoto
Oxihemicianina
Desoxihemocianina
Ressonância Paramagnética Eletrónica (EPR) e
Espetroscopia Alargada da Estrutura Fina de
Absorção de Raios X (EXAFS)
• Theodor Svedberg
Descobriu a metaloproteína na espécie de
caracol, Helix pomatia.
• Anne Volbeda
Primeira investigadora a estudar a estrutura
da hemocianina.
• Edward Solomon
Principal investigador da geometria do centro
metálico da Hemocianina.
Principais
Investigadores
A KLH, Keyhole Limpet Hemocyanin, é uma metaloproteína,
composta por várias subunidades da hemocianina, encontrada
na hemolinfa do molusco californiano, Megathura crenulata.
Megathura crenulata, molusco de
onde é retirado a KLH.
Aplicações
Biotecnológicas
Aplicações:
• Transporte de proteínas
• Terapia em cancro
• Sullivan B., Bonaventura J., Bonaventura C., Functional Differences in the Multiple Hemocyanins of the Horseshoe
Crab, Limulus polyphemus L., Proc. Nat. Acad. Sci., Vol. 71, No. 6, pp. 2558-2562, June 1974.
• Elena Borghi, Pier Lorenzo Solari, et. al, Oxidized Derivatives of Octopus vulgaris and Carcinus
aestuariiHemocyanins at pH 7.5 and Related Models by X-rayAbsorption Spectroscopy, Biophysical Journal, Volume
82, pp. 3254–3268, June 2002.
• Bonaventura J., Bonaventura C., et. al, Cristal Structure of deoxygenated Limulus polyphemus subunit II
hemocyanin at 2.8 Å resolution: Clues for a mechanism for allosteric regulation, Cambridge University Press,
Protein Science, 2, pp. 597-619, 1993.
• Edward I. Solomon, Electronic And Geometric Structure-Function correlations of the coupled binuclear copperactive
site, Pure & Appi. Chem., Vol. 55, No. 7, pp. 1069-1088, 1983.
• Metz M.,Solomon E. I. J Am. Chem. Soc., 123, 4938-4950, 2001.
• Solomon E. I. Pure & Appi. Chem., 55, 1069-1088, 1983.
• Rubino J. T.; Franz K. J. J. Inor. Chem., 107, 129-143, 2012.
• Frieden E., Osaki S., Kobayashi H., Correlations between structure and function of the copper oxidases, The Journal
of General Physiology, pp. 213-252, 1964.
• W. Tröger, et al., Coordination Studies of the Metal Center of Hemocyanin by 199mHg Nuclear Quadrupole
Interaction, Z. Naturforsch., 57 a, 623–626, 2002.
• Grace O. Tan, X-RAY Absorption Spectroscopic Studies of the Active sites of Nickel and Copper containing
Metalloproteins, June 1993
• Ali S.A., et. al, Oxygen transport proteins III: Structural studies of the scorpion (Buthus sindicus) hemocyanin, partial
primary structure of its subunit Bsin1, Comp Biochem Physiol B Biochem Mol Biol., 126(3), pp 361-376, Julho 2000.
• Harris J.R., Markl J., Keyhole limpet hemocyanin (KLH): a biomedical review, Micron, 6, pp. 597-623, Dezembro
1999
Referências Bibliográficas

Hemocianina

  • 1.
    Trabalho realizado por: JoãoRibeiro Nuno Bastos Grupo 4 P5 Química Bioinorgânica Licenciatura em Bioquímica Ano lectivo 2012/2013
  • 2.
    Traços Gerais A hemocianinaé uma metaloproteína cuja principal função é transportar o oxigénio em alguns artrópodes e moluscos. • Contém 2 átomos de cobre que se ligam reversivelmente ao O2. • Encontra-se suspensa na hemolinfa. • A forma desoxigenada é incolor e a forma oxigenada é azul.
  • 3.
    Por estar presentenas mais diversas espécies de moluscos e artrópodes, através do PDB, encontram-se várias estruturas, obtidas por cristalografia de raios-X da hemocianina. Cada uma das estruturas está associada a uma única espécie. Citar-se-ão as estruturas que têm como identificação 1OXY, 1NOL e 1LLA, por serem as primeiras a serem inseridas no PDB, ou seja, que representam os primeiros estudos cristalográficos desta proteína. Traços Gerais
  • 4.
    As hemocianinas fazemparte do grupo das proteínas de cobre de tipo III do qual também pertencem, por exemplo, a catecol oxidase e a tirosinase. Alinhamento das sequências de aminoácidos dos sítios activos da catecol oxidase da batata doce, tirosinase humana e hemocinina do caracol (adaptada de Eicken et al, 1999). Centro activo de várias proteínas de cobre do tipo III: A e C correspondem à hemocianina de límulo e polvo-gigante-do-pacífico, respetivamente; B, catecol oxidase de batata doce e D tirosinase de um microorganismo (Li et al, 2009) Traços Gerais
  • 5.
    A unidade básicade organização das hemocianinas é um conjunto de seis subunidades, com um peso aproximado de 450000 Da. A hemocianina circulante pode ser composta por uma, duas, quatro ou oito desses hexâmeros, pelo que o seu peso é crescente e a sua solubilidade é, consequentemente, maior. x6 Traços Gerais
  • 6.
    Hemocianina de Limuluspolyphemus. A sua estrutura secundária é 33% α-hélices , 18% folhas-β, 19% β-turn e 30% sem estrutura específica.Incorpora um centro de cobre binuclear do tipo III. Rasmol, 1OXY Centro ativo da Hemocianina de Limulus polyphemus. Composta por dois átomos de cobre, assinalados a amarelo, estando no centro a molécula de oxigénio. A amarelo estão representados os resíduos de Histidina que coordenam com os centros metálicos, pelo átomo de azoto. DeepView, 1OXY Estrutura da proteína e do centro ativo
  • 7.
    Na forma desoxigenada,os iões cobre estão sob a forma de Cu+. Geometria do centro metálico Desdobramento de orbitais, para um complexo de geometria trigonal plana d¹⁰ transições d-d proibidas por spin Orbitais completamente preenchidas Complexo incolor
  • 8.
    Os centros decobre(I) na desoxihemocianina têm uma geometria trigonal planar com 3 ligações Cu-N(His). Há 2 estruturas cristalinas (R e T) da desoxihemocianina que diferem em grande parte na distância Cu-Cu e na distorção piramidal desta geometria. Estado T - tensoEstado R - relaxado Formas R e T
  • 9.
    A ligação reversívelao oxigénio é feita através de um centro de cobre binuclear geralmente referido como centro de cobre de ‘tipo III’. Mecanismo de transporte
  • 10.
    Durante a coordenaçãodo O₂, há uma reorientação dos ligandos que altera a geometria de coordenação para piramidal quadrada. Esta alteração do campo de ligando altera e destabiliza as orbitais ativas do cobre, favorecendo a transferência eletrónica. Mecanismo de transporte
  • 11.
  • 12.
  • 13.
    Na oxihemocianina osdois iões cobre estão sob a forma Cu2+, levando a que o O₂ seja reduzido pelos 2 eletrões, para O₂²¯. No complexo binuclear, ambos os cobres(II) têm um geometria piramidal quadrada com duas ligações de 2,0 Å a 2 histidinas, pelo átomo de azoto, no plano equatorial. Cada uma das outras histidinas está em posição trans-axial aos centros de cobre a uma distância de 2,4 Å. Alterações Estruturais
  • 14.
    Estrutura do sítioativo da oxihemocianina da espécie L. polyphemus. Os azotos ligados directamente ao centro de cobre estão numerados. Os mais distanciados são os ligandos trans- axiais. Rasmol, 1OXY. Estrutura do sítio ativo da desoxihemocianina da espécie L. polyphemus. Rasmol, 1LLA. Alterações Estruturais
  • 15.
    O espectro deabsorção da oxihemocianina exibe uma transição muito intensa a 350 nm (ε≈20000 M¯¹cm¯¹) e uma banda mais fraca a 550 nm (ε≈ 1000 M¯¹cm¯¹) que são atribuídas às transferência de carga Ligando-Metal, O₂²¯ Cu(II) Geometria do centro metálico
  • 16.
    A banda demaior energia é atribuída à transição πσ*(O2 2-) dx2-y2 (Cu(II)) e a mais baixa à transição πv*(O2 2-) dx2-y2(Cu(II)), onde πσ* é a orbital da espécie O2 2- no plano Cu₂O₂ (ligação σ aos centros metálicos de Cu(II)) enquanto a orbital πv* é perpendicular a esse plano. Geometria do centro metálico
  • 17.
    EPR- Silencioso naforma oxigenada e desoxigenada EXAFS Distância entre catiões de cobre Oxihemocianina - 3,6 Å Desoxihemocianina - 3,5 a 4,6 Å Esfera de coordenação Oxihemocianina - 3 átomos de azoto e 2 àtomos de oxigênio Desoxihemocinanina - 3 átomos de azoto Oxihemicianina Desoxihemocianina Ressonância Paramagnética Eletrónica (EPR) e Espetroscopia Alargada da Estrutura Fina de Absorção de Raios X (EXAFS)
  • 18.
    • Theodor Svedberg Descobriua metaloproteína na espécie de caracol, Helix pomatia. • Anne Volbeda Primeira investigadora a estudar a estrutura da hemocianina. • Edward Solomon Principal investigador da geometria do centro metálico da Hemocianina. Principais Investigadores
  • 19.
    A KLH, KeyholeLimpet Hemocyanin, é uma metaloproteína, composta por várias subunidades da hemocianina, encontrada na hemolinfa do molusco californiano, Megathura crenulata. Megathura crenulata, molusco de onde é retirado a KLH. Aplicações Biotecnológicas Aplicações: • Transporte de proteínas • Terapia em cancro
  • 20.
    • Sullivan B.,Bonaventura J., Bonaventura C., Functional Differences in the Multiple Hemocyanins of the Horseshoe Crab, Limulus polyphemus L., Proc. Nat. Acad. Sci., Vol. 71, No. 6, pp. 2558-2562, June 1974. • Elena Borghi, Pier Lorenzo Solari, et. al, Oxidized Derivatives of Octopus vulgaris and Carcinus aestuariiHemocyanins at pH 7.5 and Related Models by X-rayAbsorption Spectroscopy, Biophysical Journal, Volume 82, pp. 3254–3268, June 2002. • Bonaventura J., Bonaventura C., et. al, Cristal Structure of deoxygenated Limulus polyphemus subunit II hemocyanin at 2.8 Å resolution: Clues for a mechanism for allosteric regulation, Cambridge University Press, Protein Science, 2, pp. 597-619, 1993. • Edward I. Solomon, Electronic And Geometric Structure-Function correlations of the coupled binuclear copperactive site, Pure & Appi. Chem., Vol. 55, No. 7, pp. 1069-1088, 1983. • Metz M.,Solomon E. I. J Am. Chem. Soc., 123, 4938-4950, 2001. • Solomon E. I. Pure & Appi. Chem., 55, 1069-1088, 1983. • Rubino J. T.; Franz K. J. J. Inor. Chem., 107, 129-143, 2012. • Frieden E., Osaki S., Kobayashi H., Correlations between structure and function of the copper oxidases, The Journal of General Physiology, pp. 213-252, 1964. • W. Tröger, et al., Coordination Studies of the Metal Center of Hemocyanin by 199mHg Nuclear Quadrupole Interaction, Z. Naturforsch., 57 a, 623–626, 2002. • Grace O. Tan, X-RAY Absorption Spectroscopic Studies of the Active sites of Nickel and Copper containing Metalloproteins, June 1993 • Ali S.A., et. al, Oxygen transport proteins III: Structural studies of the scorpion (Buthus sindicus) hemocyanin, partial primary structure of its subunit Bsin1, Comp Biochem Physiol B Biochem Mol Biol., 126(3), pp 361-376, Julho 2000. • Harris J.R., Markl J., Keyhole limpet hemocyanin (KLH): a biomedical review, Micron, 6, pp. 597-623, Dezembro 1999 Referências Bibliográficas