Este artigo apresenta os resultados de uma pesquisa qualitativa que investigou a percepção de alunos de mestrado profissional em ensino na saúde sobre interdisciplinaridade. Os alunos demonstraram entender interdisciplinaridade como integração de saberes e reconheceram desafios como cultura disciplinar fragmentada e escassez de tempo, mas também viram vantagens como resolutividade e mudança na política de saúde.