O projeto SPE tem como objetivo promover saúde e prevenção nas escolas através de uma abordagem integrada entre saúde e educação sobre temas como saúde sexual, doenças sexualmente transmissíveis, diversidade sexual e relações de gênero. Ele é executado em parceria entre os ministérios da saúde e educação com apoio de agências internacionais e envolve gestão compartilhada entre os níveis federal, estadual e municipal. O projeto busca também estimular o protagonismo juvenil por meio da participação de adolesc