O documento discute o avanço das tecnologias de sequenciamento de DNA e suas aplicações na biologia. Descreve a evolução do método de Sanger e a chegada das plataformas de sequenciamento de nova geração. Aponta como essas novas tecnologias ampliam as possibilidades de investigar a variabilidade genética através do sequenciamento de genomas individuais.
MESTRES DA CULTURA DE ASSARÉ Prof. Francisco Leite.pdf
Novas tecnologias sequenciamento fronteiras biologia unb 10112010
1. Novas tecnologias de Sequenciamento
de DNA como ferramentas para o
avanço em novas fronteiras da biologia
Foco em Genética Humana
Prof. Dr. Rinaldo Wellerson Pereira
Bolsista Produtividade CNPq 2
Universidade Católica de Brasília
Orientador Permanente:
Ciências Genômicas e Biotecnologia, UCB
Educação Física, UCB
Orientador Credenciado:
Patologia Molecular, UNB
2. De Mendel a era “omica”
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Mendel Cromossomos Dupla Hélice Sequência de nucleotídeos mRNA Proteína
8. Sequenciamento de DNA
• 1977 -2004 – Evolução e consolidação do
método de Sanger
• 2004 - ……. – Plataformas de NGS – Next
Generation Sequencing (Na verdade pode ser:
“Now Generation Sequencing”)
• Segunda Geração
• Terceira Geração
27. Cromatina
mRNA ncRNA
Proteínas
Variação Normal ou PatológicaAmbiente
Variação em seqüência Variação estrutural Variação química na cromatina
Epigenômica
Genômica
Transcritômica
Proteômica
Dogma Central
28. Sequenciando Genomas para
Investigar Variabilidade
• SNVs – Single nucleotide variants
• SNPs – Single nucleotide polymorphisms
• CNVs – Copy number variants
• CNPs – Copy number polymorphisms
51. Splicing Alternativo
• 95% de sequências codificantes multiexônicas
apresentam splicing altertivo
• Estima-se que em média, cada sequências codificantes
multiexônicas tenha 7 isoformas
• Há variação interpopulacional e interindividual no
repertório de isoformas em diferentes tipos celulares
• No começo do começo do entendimento de como
estas variações contribuem para a variabilidade normal
e patológica
• NGS tem clara vantagem sobre microarranjos baseados
em transcritos conhecidos
65. Genoma
mRNA ncRNA
Proteínas
Variação Normal ou PatológicaAmbiente
Variação em seqüência Variação estrutural Variação química na cromatina
Epigenômica
Genômica
Transcritômica
Proteômica
66.
67.
68. Onde estamos na UCB
• Genômica DF
– 454 Titanium
– Illumina GAIIx
• Projetos
– RNAseq em Leucemia linfóide aguda (FAP-DF)
– RNAseq, Metiloma e ChipSeq em projeto de
investigação de mecanismos moleculares envolvidos
na adaptação molecular ao exercício aeróbio (Pronex
– FAP-DF)
– Projeto Edital Pró-Centro Oeste – Sequenciamento de
exons em pacientes com retardo mental, displasias
esqueléticas e mal formações cardíacas
69. Polícia Civil do DF
O Centro de Genômica como uma estratégia e
desafio ao fomento da inovação no Distrito
Federal.