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Extensões e exceções à transmissão mendeliana Prof. Rinaldo Pereira Programa de Pós Graduação em Ciências Genômicas e Biotecnologia
Segregação Mendeliana Como vimos na aula anterior Existe um conjunto de fenótipos que apresentam um padrão de segregação que pode facilmente ser explicado pela segregação igual ou segregação independente (quando analisamos mais de um fenótipo) Ou seja:
AA aa Fenótipo dominante Fenótipo recessivo X P: 1 A 1 a Aa Aa F1: Fenótipo dominante Fenótipo dominante X ½ A; ½ a ½ A; ½ a Fenótipo dominante Fenótipo recessivo F2: ¼ AA;  ½ Aa ¼ aa 3        :      1 Segregação igual
AAbb aaBB dominante; recessivo Recessivo; dominante X P: 1 Ab 1 aB AaBb AaBb F1: Dominante;dominante Dominante,dominante X ¼ AB; ¼ Ab; ¼ aB; ¼ ab A; ½ a ¼ AB; ¼ Ab; ¼ aB; ¼ ab A; ½ a dominante; dominante F2: ¼ A_B_ 9 3 3 3 1 dominante; recessivo ¼ A_bb recessivo; dominante ¼ aaB_ recessivo; recessivo ¼ aabb Segregação independente
As extensões e exceções à análise mendeliana colocadas no contexto das interações gênicas
Interação gênica Interação entre alelos de um mesmo gene Relações de dominância Dominância completa Dominância incompleta Codominância Alelos letais Interação entre alelos de genes diferentes Epistasia Penetrância e expressividade
Relações de dominância Até o momento apresentamos locos onde os alelos apresentam uma relação de dominância e recessividade É uma simplificação com raízes nos estudos estabelecidos por Mendel, que não explica a grande maioria das relações gene-fenótipo Uma pergunta básica A característica genética de interesse é resultado da contribuição de um gene ou mais genes
Teste de complementação Diferentes mutantes para a característica em questão Cruzamento entre os mutantes e verificação dos padrões de complementação Do ponto de vista molecular:
Dominância incompleta
Dominância incompleta Cruzamento entre plantas de pétalas vermelhas e plantas de pétalas brancas, F1 apresenta plantas de pétalas rosa Cruzamento de F1 ¼ plantas com pétalas vermelhas ½  plantas com pétalas rosa ¼ plantas com pétalas brancas
Dominância incompleta em humanos Capacidade de sentir o gosto amargo de feniltiocarbamida Controlada por um loco principal com dominância incompleta Reddy BM, Rao DC . Phenylthiocarbamide taste sensitivity revisited: complete sorting test supports residual family resemblance. Genet Epidemiol. 1989;6(3):413-21.  Gene TAS2R38 – cromossomo
Codominância Exemplo do sistema ABO
Codominância Exemplo do sistema ABO Diferentes oligossacarídeos na membrana da hemácea Gene ABO codifica para uma glicosiltransferase Loco com grande heterogeneidade
Codominância Anemia falciforme Alelos: HbA, HbS Genótipos:  HbA HbA – Hemáceas normais HbS HbS – Anemia servera; frequentemente fatal; hemoglobina anormal faz com hemáceas adquiram forma de foice HbA HbS – Não ocorre anemia, mas hemáceas adquirem forma de foice sob baixas concentrações de oxigênio
Codominância Anemia falciforme Codon CAG - CTG
Codominância Análise de hemoglobina S através de eletroforese
Dominância incompleta e codominância
Alelos letais - Pleitropia ML M AY A AYA AYA X AYAY   letal Hetrozigotos – sem cauda Homozigotos para o aleo ML               letal AYA    amarelo AA     preto
Outro exemplo de alelo letal
Alelos letais em humanos Fibrose cística Em homozigose e sem tratamento pode ser letal Fenilcetonúria Em homozigose e sem tratamento pode ser letal Doenças ligadas ao X recessivas Maior letalidade em homens Ex. Incontinent Pigmenti
Um pouco mais sobre pleitropia Quando a região genômica afetada por alguma forma de variação  interfere na síntese de uma proteína com múltiplos papeis no organismo o conjuntos de sintomas pode ser amplo dificultando a análise de segregação Vejamos o exemplo da porfiria variegata
Mutações no gene que codifica para a enzima protoporfirogênio oxidase (biosíntese do grupo heme) Acúmulo de porfirinas
Síndrome de Marfan Outro exemplo de doença com pleitropia Autossômico dominante Incidência de 1/10.000 norte americanos É clinicamente caracterizada por defeitos no sistema ocular (miopia; deslocamento de cristalino), esquelético (dolicoestenomelia: membros anormalmente longos e delgados; peito escavado, escoliose...) e cardiovascular (prolapso da válvula mitral)
Epistasia Gene epistático- o gene que tem efeito de interferir no efeito de outros genes.  Os genes epistáticos podem ser recessivos ou dominantes. Gene Hipostático- o  gene que sofre interferência
Interação entre alelos de diferentes genes:Epistasia na coloração de concha Base molecular da complementação Epistasia: Duplo recessivo
  Interações gênicas Mendel  Vias paralelas Epistasia dominante Epistasia recessiva Genes duplicados aditivos Genes duplicados dominantes Genes duplicados recessivos Supressão recessiva (1) Supressão dominante (2)
Vias paralelas bw+/_; st+/_   9 bw+/_; st/st   3 bw/bw; st+/_  3 bw/bw; st/st  1 9 : 3 : 3 : 1
Vias paralelas o+/_;b+/_9 o+/_; b/b   3 o/o; b+/_  3 o/o; b/b    1 9 : 3 : 3 : 1
Epistasia dominante
Epistasia dominante D/_; W/_    9 d/d; W/_    3 D/_; w/w    3 d/d; w/w    1 12 : 3 : 1 W  Dgene expression
Epistasia recessiva w+/_; m+/_   9 w+/_; m/m   3 w/w; m+/_    3 w/w; m/m    1 9 : 3 : 4
Interação Gênica Interação gênica provoca uma modificação nas proporções dihíbrido Interação gênica na mesma rota metabólica mutações com fenótipos diferentes proporção fenotípica 9:3:4 epistasia recessiva  e padrão de pelagem em cães labradores cor da pelagem               deposição do pigmento alelo B -preto                  alelo E - deposição nos pelos alelo b -marrom               alelo e -não deposita nos pelos B/-.E/- b/b.E/- B/-.e/e  ou b/b.e/e
Genes duplicados dominantes A1/_; A2/_     9 A1/_; a2/a23 a1/a1; A2/_    3 a1/a1; a2/a21 15 : 1 1 allelo dominante pigmento Formato de fruto em  Capsella bursa-pastoris
Genes duplicados recessivos(ação complementar) C/_; P/_    9 C/_; p/p    3 c/c; P/_    3 c/c; p/p    1 9 : 7 1 alelo recessivo pigmentação
Epistasia em humanos Atualmente é consenso que a variação genética normal e patólogica em humanos tem suas bases em interação entre alelos de diferentes locos Métodos para identificar e caracterizar esta interação estão em desenvolvimento
Variações nos padrões de herança mendelianos Penetrância: proporção de indivíduos com genótipo para um determinado fenótipo, manifestando o fenótipo Penetrância completa Todos Indivíduos com alelos para a doença/fenótipo apresentam a doença/fenótipo Penetrânciaincompleta Indivíduo apresenta o genótipo para a doença, mas não a manifesta Determinada mais facilmente em herança dominante Indivíduo que certamente teria o alelo, não manifesta o fenótipo Pode ocorrer também em herança recessiva, nos indivíduos homozigotos, porém é mais difícil de detectar. Implica na avaliação de uma grande número de famílias e aplicação de métodos estatísticos.
Penetrância incompleta
Cálculo da penetrância Número de irmandades com  pelo menos um irmão e seu genitor afetado/ Número de irmandades com pelo menos um irmão afetados Este cálculo vale para herança dominante Há métodos mais elaborados para cálculos de penetrância (fogem ao escopo de nosso curso)
Penetrância incompleta
Causas da penetrância incompleta Genes epistáticos Genes não alélicos que interagem com o gene em questão Genes modificadores Genes não alélicos que alteram a expressão do gene em questão
Penetrância dependente da idade Doença de Huntington Sintomas não vistos normalmente até os 30 anos de idade Autossômica dominante Huntington Normal
Variações nos padrões de herança mendelianos Expressividade variável Variabilidade na manifestação fenotípica Para doenças genéticas, variação de um estado mais brando até um estado mais grave A variação é mais comum em indivíduos de diferentes famílias Evidência para epistasia (genes modificadores)
Expressividade variável
Variações nos padrões de herança mendelianos Heterogeneidade genética 		-a maioria das doenças genéticas humanas apresentam heterogeinidade genética, ou seja, diferentes mutações podem causar fenótipos idênticos ou similares Novos conceitos Heterogeinidade alélica Mutações diferentes no mesmo loco Ex.: Distrofias musculares de Duchenne e Becker. Doenças clinicamente diferentes, devido a mutações diferentes no gene DMD Heterogeinidade do loco Mutações em locos diferentes Ex.: Amelogenesisimperfecta
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Heterogeneidade genética Genealogia de uma família onde  a surdez infantil profunda é causada por genes situados em locos diferentes
Variações nos padrões de herança mendelianos Pleiotropia Os genes que exercem efeitos em múltiplos aspectos da fisiologia ou anatomia são pleiotrópicos A pleitropia é uma característica comum dos genes envolvidos em doenças genéticas humanas
Pleiotropia
Variações nos padrões de herança mendelianos Imprintinggenômico Síndrome de Algeman Síndrome de Prader-Willi Trataremos deste tópico em Epigenética
Imprinting genômico
Variações nos padrões de herança mendelianos Antecipação e Expansão de repetições Distrofia miotônica Trataremos no futuro
AntecipaçãoDistrofia miotônica Vamos no futuro discutir as bases moleculares
Ligação Genética(Segregação não independente) Genótipos possíveis para dois locos AaBB AaBb Aabb aaBb aabb AABB AABb AAbb aaBB Gametas Segregação Independente aB aB ab ab AB Ab aB ab Ab ab AB aB AB AB Ab Ab Conceito de fase de ligação (cis ou trans) AB/ab Ab/aB Gametas Segregação Dependente AB ab Ab aB

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V Exceções a transmissão Mendeliana

  • 1. Extensões e exceções à transmissão mendeliana Prof. Rinaldo Pereira Programa de Pós Graduação em Ciências Genômicas e Biotecnologia
  • 2. Segregação Mendeliana Como vimos na aula anterior Existe um conjunto de fenótipos que apresentam um padrão de segregação que pode facilmente ser explicado pela segregação igual ou segregação independente (quando analisamos mais de um fenótipo) Ou seja:
  • 3. AA aa Fenótipo dominante Fenótipo recessivo X P: 1 A 1 a Aa Aa F1: Fenótipo dominante Fenótipo dominante X ½ A; ½ a ½ A; ½ a Fenótipo dominante Fenótipo recessivo F2: ¼ AA; ½ Aa ¼ aa 3 : 1 Segregação igual
  • 4. AAbb aaBB dominante; recessivo Recessivo; dominante X P: 1 Ab 1 aB AaBb AaBb F1: Dominante;dominante Dominante,dominante X ¼ AB; ¼ Ab; ¼ aB; ¼ ab A; ½ a ¼ AB; ¼ Ab; ¼ aB; ¼ ab A; ½ a dominante; dominante F2: ¼ A_B_ 9 3 3 3 1 dominante; recessivo ¼ A_bb recessivo; dominante ¼ aaB_ recessivo; recessivo ¼ aabb Segregação independente
  • 5. As extensões e exceções à análise mendeliana colocadas no contexto das interações gênicas
  • 6. Interação gênica Interação entre alelos de um mesmo gene Relações de dominância Dominância completa Dominância incompleta Codominância Alelos letais Interação entre alelos de genes diferentes Epistasia Penetrância e expressividade
  • 7. Relações de dominância Até o momento apresentamos locos onde os alelos apresentam uma relação de dominância e recessividade É uma simplificação com raízes nos estudos estabelecidos por Mendel, que não explica a grande maioria das relações gene-fenótipo Uma pergunta básica A característica genética de interesse é resultado da contribuição de um gene ou mais genes
  • 8. Teste de complementação Diferentes mutantes para a característica em questão Cruzamento entre os mutantes e verificação dos padrões de complementação Do ponto de vista molecular:
  • 10. Dominância incompleta Cruzamento entre plantas de pétalas vermelhas e plantas de pétalas brancas, F1 apresenta plantas de pétalas rosa Cruzamento de F1 ¼ plantas com pétalas vermelhas ½ plantas com pétalas rosa ¼ plantas com pétalas brancas
  • 11. Dominância incompleta em humanos Capacidade de sentir o gosto amargo de feniltiocarbamida Controlada por um loco principal com dominância incompleta Reddy BM, Rao DC . Phenylthiocarbamide taste sensitivity revisited: complete sorting test supports residual family resemblance. Genet Epidemiol. 1989;6(3):413-21. Gene TAS2R38 – cromossomo
  • 13. Codominância Exemplo do sistema ABO Diferentes oligossacarídeos na membrana da hemácea Gene ABO codifica para uma glicosiltransferase Loco com grande heterogeneidade
  • 14. Codominância Anemia falciforme Alelos: HbA, HbS Genótipos: HbA HbA – Hemáceas normais HbS HbS – Anemia servera; frequentemente fatal; hemoglobina anormal faz com hemáceas adquiram forma de foice HbA HbS – Não ocorre anemia, mas hemáceas adquirem forma de foice sob baixas concentrações de oxigênio
  • 16. Codominância Análise de hemoglobina S através de eletroforese
  • 17. Dominância incompleta e codominância
  • 18. Alelos letais - Pleitropia ML M AY A AYA AYA X AYAY letal Hetrozigotos – sem cauda Homozigotos para o aleo ML letal AYA amarelo AA preto
  • 19. Outro exemplo de alelo letal
  • 20. Alelos letais em humanos Fibrose cística Em homozigose e sem tratamento pode ser letal Fenilcetonúria Em homozigose e sem tratamento pode ser letal Doenças ligadas ao X recessivas Maior letalidade em homens Ex. Incontinent Pigmenti
  • 21. Um pouco mais sobre pleitropia Quando a região genômica afetada por alguma forma de variação interfere na síntese de uma proteína com múltiplos papeis no organismo o conjuntos de sintomas pode ser amplo dificultando a análise de segregação Vejamos o exemplo da porfiria variegata
  • 22. Mutações no gene que codifica para a enzima protoporfirogênio oxidase (biosíntese do grupo heme) Acúmulo de porfirinas
  • 23. Síndrome de Marfan Outro exemplo de doença com pleitropia Autossômico dominante Incidência de 1/10.000 norte americanos É clinicamente caracterizada por defeitos no sistema ocular (miopia; deslocamento de cristalino), esquelético (dolicoestenomelia: membros anormalmente longos e delgados; peito escavado, escoliose...) e cardiovascular (prolapso da válvula mitral)
  • 24. Epistasia Gene epistático- o gene que tem efeito de interferir no efeito de outros genes. Os genes epistáticos podem ser recessivos ou dominantes. Gene Hipostático- o gene que sofre interferência
  • 25. Interação entre alelos de diferentes genes:Epistasia na coloração de concha Base molecular da complementação Epistasia: Duplo recessivo
  • 26.   Interações gênicas Mendel Vias paralelas Epistasia dominante Epistasia recessiva Genes duplicados aditivos Genes duplicados dominantes Genes duplicados recessivos Supressão recessiva (1) Supressão dominante (2)
  • 27. Vias paralelas bw+/_; st+/_ 9 bw+/_; st/st 3 bw/bw; st+/_ 3 bw/bw; st/st 1 9 : 3 : 3 : 1
  • 28. Vias paralelas o+/_;b+/_9 o+/_; b/b 3 o/o; b+/_ 3 o/o; b/b 1 9 : 3 : 3 : 1
  • 30. Epistasia dominante D/_; W/_ 9 d/d; W/_ 3 D/_; w/w 3 d/d; w/w 1 12 : 3 : 1 W  Dgene expression
  • 31. Epistasia recessiva w+/_; m+/_ 9 w+/_; m/m 3 w/w; m+/_ 3 w/w; m/m 1 9 : 3 : 4
  • 32. Interação Gênica Interação gênica provoca uma modificação nas proporções dihíbrido Interação gênica na mesma rota metabólica mutações com fenótipos diferentes proporção fenotípica 9:3:4 epistasia recessiva e padrão de pelagem em cães labradores cor da pelagem deposição do pigmento alelo B -preto alelo E - deposição nos pelos alelo b -marrom alelo e -não deposita nos pelos B/-.E/- b/b.E/- B/-.e/e ou b/b.e/e
  • 33. Genes duplicados dominantes A1/_; A2/_ 9 A1/_; a2/a23 a1/a1; A2/_ 3 a1/a1; a2/a21 15 : 1 1 allelo dominante pigmento Formato de fruto em Capsella bursa-pastoris
  • 34. Genes duplicados recessivos(ação complementar) C/_; P/_ 9 C/_; p/p 3 c/c; P/_ 3 c/c; p/p 1 9 : 7 1 alelo recessivo pigmentação
  • 35. Epistasia em humanos Atualmente é consenso que a variação genética normal e patólogica em humanos tem suas bases em interação entre alelos de diferentes locos Métodos para identificar e caracterizar esta interação estão em desenvolvimento
  • 36. Variações nos padrões de herança mendelianos Penetrância: proporção de indivíduos com genótipo para um determinado fenótipo, manifestando o fenótipo Penetrância completa Todos Indivíduos com alelos para a doença/fenótipo apresentam a doença/fenótipo Penetrânciaincompleta Indivíduo apresenta o genótipo para a doença, mas não a manifesta Determinada mais facilmente em herança dominante Indivíduo que certamente teria o alelo, não manifesta o fenótipo Pode ocorrer também em herança recessiva, nos indivíduos homozigotos, porém é mais difícil de detectar. Implica na avaliação de uma grande número de famílias e aplicação de métodos estatísticos.
  • 38. Cálculo da penetrância Número de irmandades com pelo menos um irmão e seu genitor afetado/ Número de irmandades com pelo menos um irmão afetados Este cálculo vale para herança dominante Há métodos mais elaborados para cálculos de penetrância (fogem ao escopo de nosso curso)
  • 40. Causas da penetrância incompleta Genes epistáticos Genes não alélicos que interagem com o gene em questão Genes modificadores Genes não alélicos que alteram a expressão do gene em questão
  • 41. Penetrância dependente da idade Doença de Huntington Sintomas não vistos normalmente até os 30 anos de idade Autossômica dominante Huntington Normal
  • 42.
  • 43. Variações nos padrões de herança mendelianos Expressividade variável Variabilidade na manifestação fenotípica Para doenças genéticas, variação de um estado mais brando até um estado mais grave A variação é mais comum em indivíduos de diferentes famílias Evidência para epistasia (genes modificadores)
  • 45. Variações nos padrões de herança mendelianos Heterogeneidade genética -a maioria das doenças genéticas humanas apresentam heterogeinidade genética, ou seja, diferentes mutações podem causar fenótipos idênticos ou similares Novos conceitos Heterogeinidade alélica Mutações diferentes no mesmo loco Ex.: Distrofias musculares de Duchenne e Becker. Doenças clinicamente diferentes, devido a mutações diferentes no gene DMD Heterogeinidade do loco Mutações em locos diferentes Ex.: Amelogenesisimperfecta
  • 48. Heterogeneidade genética Genealogia de uma família onde a surdez infantil profunda é causada por genes situados em locos diferentes
  • 49. Variações nos padrões de herança mendelianos Pleiotropia Os genes que exercem efeitos em múltiplos aspectos da fisiologia ou anatomia são pleiotrópicos A pleitropia é uma característica comum dos genes envolvidos em doenças genéticas humanas
  • 51. Variações nos padrões de herança mendelianos Imprintinggenômico Síndrome de Algeman Síndrome de Prader-Willi Trataremos deste tópico em Epigenética
  • 53. Variações nos padrões de herança mendelianos Antecipação e Expansão de repetições Distrofia miotônica Trataremos no futuro
  • 54. AntecipaçãoDistrofia miotônica Vamos no futuro discutir as bases moleculares
  • 55. Ligação Genética(Segregação não independente) Genótipos possíveis para dois locos AaBB AaBb Aabb aaBb aabb AABB AABb AAbb aaBB Gametas Segregação Independente aB aB ab ab AB Ab aB ab Ab ab AB aB AB AB Ab Ab Conceito de fase de ligação (cis ou trans) AB/ab Ab/aB Gametas Segregação Dependente AB ab Ab aB