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AMINOÁCIDOS
O dogma central da Biologia Molecular
Uma vez a informação chega à proteína não flui
de volta para o DNA.
Por que estudar proteínas?
- As proteínas são as macromoléculas mais abundantes nas células;
-Grande variedade de tamanhos e tipos;
- Grande variedade de funções biológicas
-São os produtos da informação gênica!
- São os instrumentos pelos quais a informação gênica é expressa!
- Quase todo o trabalho celular é feito por proteínas.
As proteínas têm estruturas muito variadas
As proteínas têm funções muito variadas
As proteínas têm funções muito variadas
Níveis estruturais das proteínas
As proteínas são polímeros de aminoácidos
Cada resíduo de aminoácido é ligado ao vizinho por uma ligação covalente,
a ligação peptídica
Estrutura geral dos aminoácidos
Todos os aminoácidos comuns são α-aminoácidos
Os Aminoácidos apresentam um grupo carboxílico e um grupo amino
ligados ao mesmo carbono (carbono α).
Estrutura geral:
Carbono α - Centro quiral
O QUE DIFERE UM AMINOÁCIDO DO OUTRO É O
GRUPAMENTO/CADEIA LATERAL!!!
Grupamento carboxìl
Grupamento amino
Identificaçãodos carbonos em um aminoácido
Os aminoácidos têm atividade óptica
Virtualmente todos os
aminoácidos achados
em proteínas são
isômeros L
O que difere um aminoácido do outro é o grupamento
(ou cadeia) lateral (R)
Os aminoácidos são classificados de acordo com as
propriedades de seus grupamentos laterais.
A cadeia lateral e a classificação dos
aminoácidos
Cadeia Lateral – varia em tamanho, estrutura, carga
elétrica e influencia a solubilidade do aminoácido em
água.
Classificação dos AminoácidosClassificação dos Aminoácidos
Como você classificaria estas latas?
Conteúdo de açúcar?
Cor? Fabricante?
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Classificação dos aminoácidos
de acordo com a propriedade
dos grupos laterais
Classificação dos aminoácidos:
1 – Aminoácidos com grupamentos laterais apolares e alifáticos
Cadeias laterais tendem a
se agrupar
Estabilização da proteína
por interação Hidrofóbica
não tem contribuição real
para Interação Hidrofóbica
estrutura cíclica/conformação rígida/
reduz a flexibilidadegrupo tioeter
não polar
Sobre os aminoácidos com grupamentos laterais apolares e alifáticos:
Classificação dos aminoácidos:
2 – Aminoácidos com grupamentos laterais aromáticos
• relativamente não polares
(hidrofóbicas)
• participam em interações
hidrofóbicas.
• grupo OH da tirosina
– pode formar ponte de
hidrogênio
– grupo funcional
importante em algumas
enzimas
• Tirosina e Triptofano – mais
polares do que Fenilalanina
Classificação dos aminoácidos:
3 – Aminoácidos com grupamentos laterais polares não carregados
Grupos R – mais solúveis em água ou mais hidrofílicos do que os não polares
– grupos funcionais que formam ligações de hidrogênio com a água.
Exceto cisteína
Polaridade conferida por:
• Serina e Treonina –hidroxila
• Cisteína – sulfidrila
• Asparagina e glutamina - amida
Formação de Cistina
Dois resíduos de Cisteína se oxidam e formam o aminoácido dimérico Cistina
Ponte dissulfeto
Classificação dos aminoácidos:
4 – Aminoácidos com grupamentos laterais carregados positivamente
• Lisina – 2o
grupo amino na posição ε
• Arginina – grupo guanidino
• Histidina – grupo imidazol
(pKa ~neutro)
– doador/receptor de
protons em muitas
reações enzimáticas
– fração significante
carregada positivamente
em pH neutro
Grupo R – carga positiva em pH 7,0
Classificação dos aminoácidos:
5 – Aminoácidos com grupamentos laterais carregados negativamente
Aspartato
e
Glutamato
segundo grupo carboxila
Grupo R – carga negativa em pH 7,0
Os grupamentos laterais polares e carregados
tendem a mapear na superfície da proteína
Diagrama de Ribbon Mapa de superfície
Os grupamentos laterais não polares tendem a se
enterrar no centro das proteínas
Grupamentos laterais não polares
heme
Mioglobina
Os aminoácidos podem agir como ácidos e como
bases
Dissociação dos AminoácidosDissociação dos Aminoácidos
COOCOO--
CHCH33
H-C-NHH-C-NH33
++
H-C-NHH-C-NH22
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Região de
tamponamento
devida ao
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devida ao
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• pH neutro – íons dipolares ou “zwitterions”
grupo α-amino – protonado (íon amônio – NH3
+
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grupo α-carboxila – dissociado (íon carboxilato –
COO-
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• opticamente ativos – desviam o plano da luz polarizada
carbono α – centro quiral – ligado a quatro substituintes diferentes
arranjados em configuração tetraédrica e assimétrica
Estereoisômeros – moléculas que diferem somente no arranjo espacial
• α- aminoácidos – configuração estereoquímica L
Por convenção – forma L – grupo α-NH3
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Aminoácidos: estrutura e classificação

  • 2. O dogma central da Biologia Molecular Uma vez a informação chega à proteína não flui de volta para o DNA.
  • 3. Por que estudar proteínas? - As proteínas são as macromoléculas mais abundantes nas células; -Grande variedade de tamanhos e tipos; - Grande variedade de funções biológicas -São os produtos da informação gênica! - São os instrumentos pelos quais a informação gênica é expressa! - Quase todo o trabalho celular é feito por proteínas.
  • 4. As proteínas têm estruturas muito variadas
  • 5. As proteínas têm funções muito variadas
  • 6. As proteínas têm funções muito variadas
  • 8.
  • 9. As proteínas são polímeros de aminoácidos Cada resíduo de aminoácido é ligado ao vizinho por uma ligação covalente, a ligação peptídica
  • 10. Estrutura geral dos aminoácidos Todos os aminoácidos comuns são α-aminoácidos Os Aminoácidos apresentam um grupo carboxílico e um grupo amino ligados ao mesmo carbono (carbono α). Estrutura geral: Carbono α - Centro quiral O QUE DIFERE UM AMINOÁCIDO DO OUTRO É O GRUPAMENTO/CADEIA LATERAL!!! Grupamento carboxìl Grupamento amino
  • 12. Os aminoácidos têm atividade óptica Virtualmente todos os aminoácidos achados em proteínas são isômeros L
  • 13. O que difere um aminoácido do outro é o grupamento (ou cadeia) lateral (R) Os aminoácidos são classificados de acordo com as propriedades de seus grupamentos laterais. A cadeia lateral e a classificação dos aminoácidos Cadeia Lateral – varia em tamanho, estrutura, carga elétrica e influencia a solubilidade do aminoácido em água.
  • 14. Classificação dos AminoácidosClassificação dos Aminoácidos Como você classificaria estas latas?
  • 15. Conteúdo de açúcar? Cor? Fabricante? Sabor?
  • 16. Classificação dos aminoácidos de acordo com a propriedade dos grupos laterais
  • 17.
  • 18. Classificação dos aminoácidos: 1 – Aminoácidos com grupamentos laterais apolares e alifáticos
  • 19. Cadeias laterais tendem a se agrupar Estabilização da proteína por interação Hidrofóbica não tem contribuição real para Interação Hidrofóbica estrutura cíclica/conformação rígida/ reduz a flexibilidadegrupo tioeter não polar Sobre os aminoácidos com grupamentos laterais apolares e alifáticos:
  • 20. Classificação dos aminoácidos: 2 – Aminoácidos com grupamentos laterais aromáticos • relativamente não polares (hidrofóbicas) • participam em interações hidrofóbicas. • grupo OH da tirosina – pode formar ponte de hidrogênio – grupo funcional importante em algumas enzimas • Tirosina e Triptofano – mais polares do que Fenilalanina
  • 21.
  • 22. Classificação dos aminoácidos: 3 – Aminoácidos com grupamentos laterais polares não carregados Grupos R – mais solúveis em água ou mais hidrofílicos do que os não polares – grupos funcionais que formam ligações de hidrogênio com a água. Exceto cisteína Polaridade conferida por: • Serina e Treonina –hidroxila • Cisteína – sulfidrila • Asparagina e glutamina - amida
  • 23. Formação de Cistina Dois resíduos de Cisteína se oxidam e formam o aminoácido dimérico Cistina Ponte dissulfeto
  • 24. Classificação dos aminoácidos: 4 – Aminoácidos com grupamentos laterais carregados positivamente • Lisina – 2o grupo amino na posição ε • Arginina – grupo guanidino • Histidina – grupo imidazol (pKa ~neutro) – doador/receptor de protons em muitas reações enzimáticas – fração significante carregada positivamente em pH neutro Grupo R – carga positiva em pH 7,0
  • 25. Classificação dos aminoácidos: 5 – Aminoácidos com grupamentos laterais carregados negativamente Aspartato e Glutamato segundo grupo carboxila Grupo R – carga negativa em pH 7,0
  • 26. Os grupamentos laterais polares e carregados tendem a mapear na superfície da proteína Diagrama de Ribbon Mapa de superfície
  • 27. Os grupamentos laterais não polares tendem a se enterrar no centro das proteínas Grupamentos laterais não polares heme Mioglobina
  • 28. Os aminoácidos podem agir como ácidos e como bases
  • 29. Dissociação dos AminoácidosDissociação dos Aminoácidos COOCOO-- CHCH33 H-C-NHH-C-NH33 ++ H-C-NHH-C-NH22 COOCOO-- CHCH33 COOHCOOH CHCH33 H-C - NHH-C - NH33 ++ pKpK11 pKpK22 Região de tamponamento devida ao grupo -COOH Base- capta prótons do meio Ácido -doa prótons para o meio Região de tamponamento devida ao grupo -NH2
  • 30. Derivados de aminoácidos com atividade biológica
  • 31. • pH neutro – íons dipolares ou “zwitterions” grupo α-amino – protonado (íon amônio – NH3 + ) grupo α-carboxila – dissociado (íon carboxilato – COO- ) • opticamente ativos – desviam o plano da luz polarizada carbono α – centro quiral – ligado a quatro substituintes diferentes arranjados em configuração tetraédrica e assimétrica Estereoisômeros – moléculas que diferem somente no arranjo espacial • α- aminoácidos – configuração estereoquímica L Por convenção – forma L – grupo α-NH3 + - projetado para a esquerda forma D – grupo α-NH3 + - projetado para a direita • Cadeia lateral (R) – determina as propriedades físico-químicas de cada aminoácido Características comuns dos aminoácidos