Prof. Rodrigo L. O. R. Cunha

Lucas Kuniyoshi                11089711
Marina Aparecida Cubi          11036811
Quando foi dado o tema do trabalho, buscamos escolher
uma proteína que tivesse funções essências para o
organismo. Seguimos a linha de pensamento: o que é
importante e insubstituível para o corpo humano? De
diversas resposta escolhemos: a água. Assim, precisávamos
escolher uma proteína relacionada com a água, resultando na
Aquaporina, cuja a função discutiremos a seguir.
Aquaporinas são canais de membrana de água que desempenham
papéis críticos no controle dos teores de água das células. Esta
proteína permite o aumento da eficiência dos sistemas catalíticos
pela crescente compartimentalização e especialização dos
mecanismo de seletividade, mas acima de tudo, permitem a
superação das relações com o meio, a sobrevivência celular contra
gradientes osmóticos. É encontrada em células eucariotas. Nos
mamíferos, por exemplo, em vasos sanguíneos, no trato
gastrointestinal, no plexo coróide, em glândulas sudoríparas,
túbulos renais proximais, alça de Henle, orelhas e olhos.
Antes de identificar a estrutura da aquaporina analisaremos o conjunto a
              qual ela está inserida: as porinas. Porinas são proteínas de grande peso molecular
              encontradas tipicamente em membranas externas de bactérias, como ilustrado na
              figura(1), sua função é permitir a passagem de água e alguns solutos hidrofílicos. A
              na figura(2) representa a forma trimérica da porina, ou seja, a composição por 3
              subunidades idênticas, interagindo entre si. A porina é uma proteína formada por
              aminoácidos polares e apolares, demonstrado na figura(3a) – polares e figura(3b)-
              apolares. A região da proteína que faz contato com os lipídios é apolar. Observe
              também que o interior do poro é constituído de vários aminoácidos hidrofílicos,
              coerente com o fato que este poro serve para o transporte de água.




                                                                                                   (a)                                   (b)
Figura 1 – porina da Rhodobacter capsulatus   Figura 2 – Estrutura da porina e suas sub-unidades
                                                                                                    Figura 3 – aminoácidos Polares e apolares
Podemos analisar a estrutura secundária das porinas na figura(4). A direção
   das setas (do N para o C-terminal) indica que trata-se de folhas-beta pregueadas
   anti-paralelas. Tal estrutura é comumente observada em proteínas de membrana.
   Na realidade, é possível agrupar proteínas com base nas formas de organização da
   estrutura secundária (folds ou dobramentos). A conservação de um fold durante a
   evolução é uma indicação que tal forma de estruturação é bastante importante,
   biologicamente. Este fold provê a estruturação necessária à formação de um poro
   central. A forma mais estável para uma organização deste tipo de estrutura
   secundária é a formação de uma "bola", possibilitando que a proteína se organize
   de forma a penetrar a membrana.
         Assim, a função da porina é intimamente associada à sua estrutura:
1. formação do poro pelo fold de folhas-beta anti-paralelas
2. disposição dos aminoácidos hidrofóbicos/hidrofílicos, que possibilita a inserção
   desta na membrana.




              Figura 4– representação do esqueleto peptídico
Aquaporinas são ligeiramente similares as porinas bacterianas. Como o nome sugere, as
        Aquaporinas têm a função de permitir a passagem de moléculas de água pela membrana, sem permitir a
        entrada de solutos. Como se pode imaginar, tais proteínas são de imensa importância para a manutenção
        do equilíbrio hídrico de certas células. Por exemplo, a pele de anfíbios como sapo são bastante permeáveis
        à água, graças à presença de aquaporinas. Tais proteínas são encontradas de bactéria a humanos. As
        aquaporinas são divididas em:
•       grupo I, AQP0, AQP1, AQP2, AQP4, AQP5, AQP6 e AQP8 permeáveis à água somente
•       grupo II, AQP3, AQP7 e AQP9 permeáveis a glicerol e ureia, além de água.

                Para estudar a aquaporina, selecionamos a AQP1 de Bos taurus, figura(5). Podemos observar a
        presença de 4 poros dispostos simetricamente, exibido na figura(6). Igual a porina, a aquaporina possui
        subunidades, cada uma constituindo um poro, figura(7). Também similarmente à porina de R. capsulata, a
        aquaporina é notavelmente hidrofóbica, possibilitando sua inserção na membrana lipídica, figura(8). Esta é
        a região de contato com a membrana. Note que as faces expostas à água, figura(6- amarelo)-extra e
        figura(6-laranja) - intracelular, são respectivamente, polar e apolar.




    Figura 5 – AQP1 – de Bos Taurus   Figura 6 – AQP1 – Os 4 Poros   Figura 7– AQP1 – Os 4   Figura 8 – AQP1 – Parte
                                                                          monômeros                Hidrofóbica
A conformação dos monômeros que constituem a proteína permite a formação de
poros. O diâmetro da entrada desse canal é drasticamente reduzido, impondo um limite
físico ao tamanho das moléculas que podem passar.
        As molécula de água do meio estão ligadas à outras moléculas de água mas como a
entrada do canal é pequena, para passar pelo poro é necessário quebrar essas ligações. A
quebra acontece porque no interior do canal existem aminoácidos polares que interagem
mais fortemente com essas moléculas, quebrando a ligação água água e passando para
dentro do canal apenas uma molécula de água.
      O canal é formado, em sua grande maioria, por aminoácidos hidrofóbicos, fazendo com
que a água interaja pouco com as paredes, o que tornaria a passagem muito lenta. Além
disso no centro do canal as moléculas de água passam por um filtro de seletividade que
determina a passagem somente de água.
Como visto nos slides anteriores, a Aquaporina 1 possui diversos mecanismos de filtragem de
água, assim torna-se uma importante ferramenta de pesquisa para a solução de problemas em
áreas diversas. Uma destas áreas é solucionar o problema de filtragem de água não potável,
como por exemplo resíduos de processos industrias, águas salobras.
• Ambiental :tratamento de águas poluídas.
• Farmacêutico: desenvolvimento de fármacos para melhorar a hidratação de células.
• Biológicos: Desenvolvimento de mecanismos de controle (para aquaporinas que não efetuam
    sua função como esperado, causando assim doenças) e reprodução (para organismos com
    escassez da proteína).
•   AQUAPORIN. Join the revolution Now. Video: Aquaporin Cinematic Version & Aquaporin Academic Version. Disponível em:
    <http://www.aquaporin.dk/>. Data de acesso: 14/11/2012.

•   AQUAPORIN.ORG. The medical significance of water channels. Disponível em: <http://www.aquaporins.org/>. Data de acesso:
    13/11/2012.

•   THEORETICAL AND COMPUTATIONAL BIOPHYSICS GROUPS. Structure, dynamics, and function of Aquaporins. Disponível em
    : <http://www.ks.uiuc.edu/Research/aquaporins/>. Data de acesso: 13/11/2012.

•   WIKIPEDIA, THE FREE ENCYCLOPEDIA. Aquaporin. Disponível em:<http://en.wikipedia.org/wiki/Aquaporin>. Data de acesso:
    11/11/2012.

•   DERMEGE. Aquaporine Active AQP3. Disponível em: <http://www.dermage.com.br/dermage/paginas/Estudo-Aquaporine.pdf>.
    Data de acesso:11/11/2012.

•   INSTITUTO         DE       QUÍMICA        DA       USP.      Estrutura     e      função:      porina.    Disponível   em:
    <http://www.iq.usp.br/bayardo/softwares/proteina/advanced/cap1/main1.html>. Data de acesso: 10/11/2012.

•   PROTEIN        DATA       BANK.       A     refined     structure    of     human       aquaporin    1.   Disponível   em:
    <http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=1H6I>. Data de acesso: 10/11/12.

Aquaporina

  • 1.
    Prof. Rodrigo L.O. R. Cunha Lucas Kuniyoshi 11089711 Marina Aparecida Cubi 11036811
  • 2.
    Quando foi dadoo tema do trabalho, buscamos escolher uma proteína que tivesse funções essências para o organismo. Seguimos a linha de pensamento: o que é importante e insubstituível para o corpo humano? De diversas resposta escolhemos: a água. Assim, precisávamos escolher uma proteína relacionada com a água, resultando na Aquaporina, cuja a função discutiremos a seguir.
  • 3.
    Aquaporinas são canaisde membrana de água que desempenham papéis críticos no controle dos teores de água das células. Esta proteína permite o aumento da eficiência dos sistemas catalíticos pela crescente compartimentalização e especialização dos mecanismo de seletividade, mas acima de tudo, permitem a superação das relações com o meio, a sobrevivência celular contra gradientes osmóticos. É encontrada em células eucariotas. Nos mamíferos, por exemplo, em vasos sanguíneos, no trato gastrointestinal, no plexo coróide, em glândulas sudoríparas, túbulos renais proximais, alça de Henle, orelhas e olhos.
  • 4.
    Antes de identificara estrutura da aquaporina analisaremos o conjunto a qual ela está inserida: as porinas. Porinas são proteínas de grande peso molecular encontradas tipicamente em membranas externas de bactérias, como ilustrado na figura(1), sua função é permitir a passagem de água e alguns solutos hidrofílicos. A na figura(2) representa a forma trimérica da porina, ou seja, a composição por 3 subunidades idênticas, interagindo entre si. A porina é uma proteína formada por aminoácidos polares e apolares, demonstrado na figura(3a) – polares e figura(3b)- apolares. A região da proteína que faz contato com os lipídios é apolar. Observe também que o interior do poro é constituído de vários aminoácidos hidrofílicos, coerente com o fato que este poro serve para o transporte de água. (a) (b) Figura 1 – porina da Rhodobacter capsulatus Figura 2 – Estrutura da porina e suas sub-unidades Figura 3 – aminoácidos Polares e apolares
  • 5.
    Podemos analisar aestrutura secundária das porinas na figura(4). A direção das setas (do N para o C-terminal) indica que trata-se de folhas-beta pregueadas anti-paralelas. Tal estrutura é comumente observada em proteínas de membrana. Na realidade, é possível agrupar proteínas com base nas formas de organização da estrutura secundária (folds ou dobramentos). A conservação de um fold durante a evolução é uma indicação que tal forma de estruturação é bastante importante, biologicamente. Este fold provê a estruturação necessária à formação de um poro central. A forma mais estável para uma organização deste tipo de estrutura secundária é a formação de uma "bola", possibilitando que a proteína se organize de forma a penetrar a membrana. Assim, a função da porina é intimamente associada à sua estrutura: 1. formação do poro pelo fold de folhas-beta anti-paralelas 2. disposição dos aminoácidos hidrofóbicos/hidrofílicos, que possibilita a inserção desta na membrana. Figura 4– representação do esqueleto peptídico
  • 6.
    Aquaporinas são ligeiramentesimilares as porinas bacterianas. Como o nome sugere, as Aquaporinas têm a função de permitir a passagem de moléculas de água pela membrana, sem permitir a entrada de solutos. Como se pode imaginar, tais proteínas são de imensa importância para a manutenção do equilíbrio hídrico de certas células. Por exemplo, a pele de anfíbios como sapo são bastante permeáveis à água, graças à presença de aquaporinas. Tais proteínas são encontradas de bactéria a humanos. As aquaporinas são divididas em: • grupo I, AQP0, AQP1, AQP2, AQP4, AQP5, AQP6 e AQP8 permeáveis à água somente • grupo II, AQP3, AQP7 e AQP9 permeáveis a glicerol e ureia, além de água. Para estudar a aquaporina, selecionamos a AQP1 de Bos taurus, figura(5). Podemos observar a presença de 4 poros dispostos simetricamente, exibido na figura(6). Igual a porina, a aquaporina possui subunidades, cada uma constituindo um poro, figura(7). Também similarmente à porina de R. capsulata, a aquaporina é notavelmente hidrofóbica, possibilitando sua inserção na membrana lipídica, figura(8). Esta é a região de contato com a membrana. Note que as faces expostas à água, figura(6- amarelo)-extra e figura(6-laranja) - intracelular, são respectivamente, polar e apolar. Figura 5 – AQP1 – de Bos Taurus Figura 6 – AQP1 – Os 4 Poros Figura 7– AQP1 – Os 4 Figura 8 – AQP1 – Parte monômeros Hidrofóbica
  • 7.
    A conformação dosmonômeros que constituem a proteína permite a formação de poros. O diâmetro da entrada desse canal é drasticamente reduzido, impondo um limite físico ao tamanho das moléculas que podem passar. As molécula de água do meio estão ligadas à outras moléculas de água mas como a entrada do canal é pequena, para passar pelo poro é necessário quebrar essas ligações. A quebra acontece porque no interior do canal existem aminoácidos polares que interagem mais fortemente com essas moléculas, quebrando a ligação água água e passando para dentro do canal apenas uma molécula de água. O canal é formado, em sua grande maioria, por aminoácidos hidrofóbicos, fazendo com que a água interaja pouco com as paredes, o que tornaria a passagem muito lenta. Além disso no centro do canal as moléculas de água passam por um filtro de seletividade que determina a passagem somente de água.
  • 8.
    Como visto nosslides anteriores, a Aquaporina 1 possui diversos mecanismos de filtragem de água, assim torna-se uma importante ferramenta de pesquisa para a solução de problemas em áreas diversas. Uma destas áreas é solucionar o problema de filtragem de água não potável, como por exemplo resíduos de processos industrias, águas salobras. • Ambiental :tratamento de águas poluídas. • Farmacêutico: desenvolvimento de fármacos para melhorar a hidratação de células. • Biológicos: Desenvolvimento de mecanismos de controle (para aquaporinas que não efetuam sua função como esperado, causando assim doenças) e reprodução (para organismos com escassez da proteína).
  • 9.
    AQUAPORIN. Join the revolution Now. Video: Aquaporin Cinematic Version & Aquaporin Academic Version. Disponível em: <http://www.aquaporin.dk/>. Data de acesso: 14/11/2012. • AQUAPORIN.ORG. The medical significance of water channels. Disponível em: <http://www.aquaporins.org/>. Data de acesso: 13/11/2012. • THEORETICAL AND COMPUTATIONAL BIOPHYSICS GROUPS. Structure, dynamics, and function of Aquaporins. Disponível em : <http://www.ks.uiuc.edu/Research/aquaporins/>. Data de acesso: 13/11/2012. • WIKIPEDIA, THE FREE ENCYCLOPEDIA. Aquaporin. Disponível em:<http://en.wikipedia.org/wiki/Aquaporin>. Data de acesso: 11/11/2012. • DERMEGE. Aquaporine Active AQP3. Disponível em: <http://www.dermage.com.br/dermage/paginas/Estudo-Aquaporine.pdf>. Data de acesso:11/11/2012. • INSTITUTO DE QUÍMICA DA USP. Estrutura e função: porina. Disponível em: <http://www.iq.usp.br/bayardo/softwares/proteina/advanced/cap1/main1.html>. Data de acesso: 10/11/2012. • PROTEIN DATA BANK. A refined structure of human aquaporin 1. Disponível em: <http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=1H6I>. Data de acesso: 10/11/12.