CIRCADIAN CLOCK PROTEIN KAIA
(PROTEÍNA RELÓGIO CIRCADIANO
KAIA)


 Crystal Structure of Circadian Clock Protein KaiA from
 Synechococcus elongatus.
 Estrutura de cristal da proteína relógio
 circadiano KaiA em Synechococcus
 elongatus.
                     Bruna Camporezi 11054011
                     Raphael Scarano de Oliveira 11090711
JUSTIFICATIVA DA ESCOLHA


                      A proteína foi
                     escolhida por ser
                      importante no
                     papel fisiológico
                      do organismo.
DESCRIÇÃO DA PROTEÍNA
Existe um conjunto complexo de proteínas que
  controlam o relógio biológico do organismo. Esse
  sistema de relógio é encontrado na maioria dos
  organismos eucarióticos e modulam diversos
  processos fisiológicos de regulagem.
A importância evolutiva de um oscilador circadiano
  endógeno é ainda mais enfatizada por sua
  presença em organismos antigos, tais como
  cianobactérias. Esse ciclo é o mais simples e
  antigo identificado até agora e é composto por
  pelo menos três proteínas interativas: KaiA,
  KaiB e KaiC.
CONHECENDO UM POUCO O ORGANISMO:

               O gênero Synechococcus engloba
                cianobactérias em água doce e
                ambientes marinhos.
               Synechococcus elongatus é uma
                cianobactéria    unicelular    de
                água doce.
               Synechococcus    elongatus tem
                uma aparência em forma de
                bastonete e é oligotrófico, tendo
                a capacidade de sobreviver em
                ambientes de água doce com
                baixos nutrientes.
KaiA é composta por dois domínios. A
estrutura do NH 2 -terminal do           DESCRIÇÃO DA
domínio KaiA é a de um pseudo            ESTRUTURA
domínio-receptor, semelhantes aos
encontrados em reguladores de
resposta de bactérias. Apesar de a
dobra ser o de um domínio receptor
canônico, a sequência primária é
diferente, e falta-lhe o resíduo
aspartato conservado, necessário para
a fosforilação. A estrutura da solução
do domínio KaiA COOH-terminal
mostrou uma nova dobra toda
homodimérica α-helicoidal. O domínio
do terminal COOH de KaiA possui
uma ranhura, o que provavelmente se
liga à região de ligação entre a CI e
CII de domínios KaiC. Essa interação
entre KaiA e KaiC aumenta a
atividade de autokinase KaiC.
Como já mencionado, o NH 2 -terminal pseudo domínio
 receptor é estruturalmente semelhante ao do receptor
 bacteriano domínio regulador de resposta, enquanto
 que o terminal COOH do domínio feixe de quatro
 hélices é uma dobra romance. Além disso, mostra a
 formação de um homodímero através da interface do
 dímero extensa formando entre ambos os domínios e o
 linker canônica. A análise da interface do dímero
 sugere que existem duas conformações alternativas. A
 conformação da estrutura cristalina representa a
 conformação fechada.
A estrutura de Kaia aqui relatada é o primeiro passo
 nos esforços para utilizar estudos estruturais para a
 elucidação da função relógio circadiano. Ele serve como
 uma estrutura para futuros estudos sobre o sistema
 KaiABC e outras proteínas relacionadas com relógio.
IMPLICAÇÕES PRÁTICAS COM O
CONHECIMENTO

Como a KaiA ainda está sendo estudada, podemos
  tomar como principio de análise o conjunto de
  proteínas responsáveis pelo relógio biológico do
  organismo. Para tal, há uma que nos chamou
  atenção.
A melatonina é produzido seletivamente durante a
  noite e circula no sangue para coordenar as
  atividades, tais como as nossas noites de sono.
Um tratamento farmacológico com a melatonina
  pode ser usado para alterar artificialmente o ciclo
  circadiano, por exemplo, pode ajudar a corrigir os
  ciclos de sono alterados pela mudança rápida de
  fuso horário.
PROTEÍNA QUE FAZ PARTE DO CONJUNTO
 RESPONSÁVEL PELO RELÓGIO BIOLÓGICO

  Exemplo:
Melatonina
REFERÊNCIAS
   http://microbewiki.kenyon.edu/index.php/Synechococcus_elongatu
    s (acessado 10/11/2012 às 14:05)
   http://www.jbc.org/content/279/19/20511.long (acessado
    10/11/2012 às 14:45)
   http://saude.hsw.uol.com.br/sono.htm (acessado 13/11/2012 às
    16:50)
   http://www.pianetachimica.it/mol_mese/mol_mese_2008/01_Orolo
    gio_Circadiano/Orologio_Circadiano_2.htm (acessado 10/11/2012
    às 16:30)
   http://www.pianetachimica.it/mol_mese/mol_mese_2008/01_Orolo
    gio_Circadiano/Orologio_Circadiano_1.htm (acessado 11/11/2012
    às 15:45)
   http://www.rcsb.org/pdb/101/motm.do?momID=97 (acessado
    10/11/2012 às 20:10)
   http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=1r8j
    (acessado 10/11/2012 às 14:25)

Circadian Clock Protein kaiA

  • 1.
    CIRCADIAN CLOCK PROTEINKAIA (PROTEÍNA RELÓGIO CIRCADIANO KAIA) Crystal Structure of Circadian Clock Protein KaiA from Synechococcus elongatus. Estrutura de cristal da proteína relógio circadiano KaiA em Synechococcus elongatus. Bruna Camporezi 11054011 Raphael Scarano de Oliveira 11090711
  • 2.
    JUSTIFICATIVA DA ESCOLHA A proteína foi escolhida por ser importante no papel fisiológico do organismo.
  • 3.
    DESCRIÇÃO DA PROTEÍNA Existeum conjunto complexo de proteínas que controlam o relógio biológico do organismo. Esse sistema de relógio é encontrado na maioria dos organismos eucarióticos e modulam diversos processos fisiológicos de regulagem. A importância evolutiva de um oscilador circadiano endógeno é ainda mais enfatizada por sua presença em organismos antigos, tais como cianobactérias. Esse ciclo é o mais simples e antigo identificado até agora e é composto por pelo menos três proteínas interativas: KaiA, KaiB e KaiC.
  • 4.
    CONHECENDO UM POUCOO ORGANISMO:  O gênero Synechococcus engloba cianobactérias em água doce e ambientes marinhos.  Synechococcus elongatus é uma cianobactéria unicelular de água doce.  Synechococcus elongatus tem uma aparência em forma de bastonete e é oligotrófico, tendo a capacidade de sobreviver em ambientes de água doce com baixos nutrientes.
  • 5.
    KaiA é compostapor dois domínios. A estrutura do NH 2 -terminal do DESCRIÇÃO DA domínio KaiA é a de um pseudo ESTRUTURA domínio-receptor, semelhantes aos encontrados em reguladores de resposta de bactérias. Apesar de a dobra ser o de um domínio receptor canônico, a sequência primária é diferente, e falta-lhe o resíduo aspartato conservado, necessário para a fosforilação. A estrutura da solução do domínio KaiA COOH-terminal mostrou uma nova dobra toda homodimérica α-helicoidal. O domínio do terminal COOH de KaiA possui uma ranhura, o que provavelmente se liga à região de ligação entre a CI e CII de domínios KaiC. Essa interação entre KaiA e KaiC aumenta a atividade de autokinase KaiC.
  • 6.
    Como já mencionado,o NH 2 -terminal pseudo domínio receptor é estruturalmente semelhante ao do receptor bacteriano domínio regulador de resposta, enquanto que o terminal COOH do domínio feixe de quatro hélices é uma dobra romance. Além disso, mostra a formação de um homodímero através da interface do dímero extensa formando entre ambos os domínios e o linker canônica. A análise da interface do dímero sugere que existem duas conformações alternativas. A conformação da estrutura cristalina representa a conformação fechada. A estrutura de Kaia aqui relatada é o primeiro passo nos esforços para utilizar estudos estruturais para a elucidação da função relógio circadiano. Ele serve como uma estrutura para futuros estudos sobre o sistema KaiABC e outras proteínas relacionadas com relógio.
  • 7.
    IMPLICAÇÕES PRÁTICAS COMO CONHECIMENTO Como a KaiA ainda está sendo estudada, podemos tomar como principio de análise o conjunto de proteínas responsáveis pelo relógio biológico do organismo. Para tal, há uma que nos chamou atenção. A melatonina é produzido seletivamente durante a noite e circula no sangue para coordenar as atividades, tais como as nossas noites de sono. Um tratamento farmacológico com a melatonina pode ser usado para alterar artificialmente o ciclo circadiano, por exemplo, pode ajudar a corrigir os ciclos de sono alterados pela mudança rápida de fuso horário.
  • 8.
    PROTEÍNA QUE FAZPARTE DO CONJUNTO RESPONSÁVEL PELO RELÓGIO BIOLÓGICO Exemplo: Melatonina
  • 10.
    REFERÊNCIAS  http://microbewiki.kenyon.edu/index.php/Synechococcus_elongatu s (acessado 10/11/2012 às 14:05)  http://www.jbc.org/content/279/19/20511.long (acessado 10/11/2012 às 14:45)  http://saude.hsw.uol.com.br/sono.htm (acessado 13/11/2012 às 16:50)  http://www.pianetachimica.it/mol_mese/mol_mese_2008/01_Orolo gio_Circadiano/Orologio_Circadiano_2.htm (acessado 10/11/2012 às 16:30)  http://www.pianetachimica.it/mol_mese/mol_mese_2008/01_Orolo gio_Circadiano/Orologio_Circadiano_1.htm (acessado 11/11/2012 às 15:45)  http://www.rcsb.org/pdb/101/motm.do?momID=97 (acessado 10/11/2012 às 20:10)  http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=1r8j (acessado 10/11/2012 às 14:25)