Este documento introduz a avaliação genômica, que aumenta a acurácia dos valores preditos dos animais combinando informações de pedigree, desempenho e marcadores genéticos. A avaliação genômica melhora a seleção ao permitir uma maior pressão de seleção em animais jovens com ganhos genéticos maiores e redução de custos na produção animal.

1. INTRODUCAO A DEP GENÔMICA
Prof. Raysildo B. Lôbo
ANCP - USP

2. = G + E
FENÓTIPO Mérito Genético
Nutrição
Manejo
Sanidade
Mudanças transmitidas
de pai/mãe para filho
Mudanças
Temporárias

3. Contribuição do reprodutor
• ½ do Mérito Genético
Mérito Genético do Animal ½ Mérito Genético
DEP

4. Diferença Esperada na Progênie
(DEP)
Prediz a habilidade de transmissão genética
de um animal avaliado como PROGENITOR.

5. DEP- Efeitos
DEP para efeito direto: previsão da habilidade
de transmitir genes de crescimento ou
fertilidade à progênie.
DEP para efeito materno: diferença esperada
em peso da progênie das filhas do reprodutor,
ou seja, netos.

6. Base Genética
A base genética (zero) é determinada pelos
valores das DEPs dos “animais fundadores”.
Animais fundadores são aqueles sem
pedigree de um ou de ambos os pais.
A base genética é específica para cada
avaliação.

7. Acurácia
Mede a confiança no valor da DEP
Depende do número de informações
disponíveis do animal

8. DEP – Informações Utilizadas
DEP Pedigree DEP Interina DEP Progênie
Informações Pais/Parentes
Pais/Parentes
Performance
própria
Pais/Parentes
Performance própria
e das progênies
Uso
Animais jovens
TE/FIV
Animais jovens
Animais sem
progênies
Animais com
progênies
Acurácia Muito baixa Baixa Média a Alta

9. Acurácia
A seleção deve ser baseada no valor da DEP, a acurácia será
usada como guia da intensidade de uso dos reprodutores.
+ 10
Touro A DEP = + 10 kg Touro C
Acc. = 0,90 Acc. = 0,30
A
C

10. O que são Marcadores Genéticos?

11. O que são Marcadores?
Marcador Genético
Aquele que segrega segundo as Leis de Mendel.
Referências
Discrimina
Classifica

12. SNP
Polimorfismos de nucleotídeo único que pode variar de
animal para animal
IDEAL
Alteração no SNP
Alteração Fenotípica
Animal 1 C/G: menor IPP
Animal 2 T/A: maior IPP
RARAMENTE UM ÚNCO SNP É RESPONSÁVEL POR VARIAÇÃO EM CARACTERÍSTICAS DE
INTERESSE ECONÔMICO

13. Modelo
Animal
1980
Seleção
Assistida
Marcadores
1995
Seleção
Auxiliada
Genômica
2009
Seleção
Genômica
2009
Seleção
Auxiliada pela
Genômica
2011
Nelore
Evolução das Avaliações Genéticas

14.  AG: tradicional x Auxiliada pelo Genômica
 Resultados Preliminares
Avaliação Auxiliada pela Genômica

15. DEP
PROGÊNIES e
COLATERAIS
+
FENÓTIPO
+
PEDIGREE
Irmãos
Filhos
Gim de
Garça
Dumu
Karvardi
Imp.
Mara Imp.
Dahi
Survana Imp.
Cartomante
Netos
AG TRADICIONAL

16. AG Auxiliada pela Genômica
Irmãos
Filhos Gim de Garça
Dumu
Karvardi Imp.
Mara Imp.
Dahi
Survana Imp.
Cartomante
Netos
PEDIGREE
+
FENÓTIPO
+
PROGÊNIES E
COLATERAIS
DEP/AG
+
VALOR MOLECULAR PREDITO

17. O que é DEP Auxiliada pela Genômica?
É a DEP calculada com informações de pedigree,
desempenho próprio e de progênies, acrescida dos Valores
Moleculares (MVPs). A interpretação é similar a da DEP
TRADICIONAL com as vantagens de aumentar a acurácia dos
animais jovens, diminuir o intervalo de gerações e os custos do
teste de progênie.

18. Efeito dos Marcadores Moleculares na
Acurácia

19. Número aproximado de equivalente progênie
Característica h² r
Média
Acurácia
Pedigree
Média
Acurácia
Molecular
Mudança
Média
Número
aproximado
equivalente
progênie
IPP 0,11 0,40 0,13 0,25 0,12 10
PP30 0,24 0,32 0,10 0,19 0,09 3
PAC 0,20 0,27 0,12 0,20 0,08 4
STAY 0,12 0,38 0,13 0,21 0,08 6
MP120 0,11 0,23 0,12 0,19 0,07 6
P120 0,23 0,24 0,13 0,30 0,17 8
P365 0,32 0,21 0,15 0,35 0,20 7
P450 0,34 0,16 0,15 0,35 0,20 6
PE365 0,40 0,28 0,11 0,26 0,15 4
PE450 0,43 0,28 0,12 0,27 0,15 3
AOL 0,35 0,31 0,12 0,29 0,17 5
ACAB 0,35 0,09 0,12 0,25 0,13 3

20. Conclusão
• Aumento da Acurácia de animais jovens e da
Pressão de Seleção
• Redução do intervalo de gerações
• Redução do tempo de teste de touros da RP
• Maior ganho genético e lucro
Seleção Auxiliada pela Genômica