Seminário ANCP 2018 - Calibração e validação de DEPs genômicas (Clarified Nelore v3.1) e resultados preliminares da implementação do método de passo único BLUP genômico no programa Nelore Brasil
Palestra ministrada pelo professor da Unesp de Jaboticabal e pesquisador Dr Fernando Baldi, durante o 24º Seminário Nacional de Criadores e Pesquisadores.
Seminário ANCP 2019 - Estudos de validação Clarifide NeloreANCP Ribeirão Preto
1) O documento apresenta os resultados de estudos de validação do teste genômico CLARIFIDE® Nelore para a raça Nelore.
2) Os resultados mostraram que os scores genômicos (MVPs) do CLARIFIDE® Nelore foram associados com os fenótipos de desempenho e carcaça.
3) Observou-se um ganho genético contínuo nas características estudadas ao longo das safras, indicando a eficiência do teste em diferenciar o mérito genético dos animais.
Este documento descreve os benefícios da DEP Genômica, que combina valores moleculares com a DEP tradicional para fornecer uma avaliação genética mais precisa. A DEP Genômica aumenta significativamente a acurácia da seleção, especialmente para animais jovens com baixa acurácia na DEP tradicional. Isso permite que os criadores selecionem os melhores animais mais cedo e obtenham maior retorno econômico em seu programa de melhoramento genético.
Seminário ANCP 2022 - Seleção genética para melhoria da qualidade da carne br...ANCP Ribeirão Preto
O documento discute a seleção genética para melhorar a qualidade da carne bovina no Brasil. Apresenta dados sobre a pecuária de corte no Brasil e no mundo, destacando a baixa remuneração do produto comercializado. Discute os atributos de qualidade da carne desejados, como maciez, e os resultados obtidos na Embrapa para identificar animais com potencial genético para produzir carne mais macia por meio de seleção genômica.
Seminário ANCP 2019 - Avaliação Genômica em Rebanhos Comerciais: Avanços, Liç...ANCP Ribeirão Preto
- O documento discute as atualizações técnicas e implementação do método de avaliação genômica ssGBLUP em rebanhos comerciais de gado de corte no Brasil.
- Inclui resultados preliminares do projeto "Avaliação Genômica em Rebanhos Comerciais" mostrando melhorias na acurácia com o método ssGBLUP.
- Também destaca a importância da origem e qualidade dos genótipos para a avaliação genômica.
O documento discute as vantagens das metodologias de seleção genética modernas, como o uso de marcadores de DNA e testes genômicos. Isso permite predições mais precisas do valor genético de animais jovens e acelera o progresso genético do rebanho de forma mais eficiente. Exemplos mostram como fazendas que adotaram essas técnicas tiveram maior acurácia na seleção e confiabilidade em suas decisões de manejo.
1) O documento discute estratégias de melhoramento genético em gado, incluindo seleção, cruzamento e uso de marcadores genéticos.
2) É destacada a importância do uso de ferramentas genômicas como chips de DNA para avaliação genética e seleção genômica.
3) A seleção genômica promete aumentar a acurácia das predições de mérito genético em comparação com métodos tradicionais.
08 - Uso dos marcadores de DNA Clarifide como ferramenta para selecionar anim...AgriPoint
[1] O documento discute o uso de marcadores de DNA (ClarifideTM) na seleção genética de gado para melhorar características econômicas.
[2] A seleção genômica pode ajudar na identificação precoce de animais geneticamente superiores para reprodução.
[3] Estudos mostram que o uso de marcadores de DNA aumenta a acurácia da avaliação genética de animais jovens e permite maior ganho genético.
Seminário ANCP 2019 - Estudos de validação Clarifide NeloreANCP Ribeirão Preto
1) O documento apresenta os resultados de estudos de validação do teste genômico CLARIFIDE® Nelore para a raça Nelore.
2) Os resultados mostraram que os scores genômicos (MVPs) do CLARIFIDE® Nelore foram associados com os fenótipos de desempenho e carcaça.
3) Observou-se um ganho genético contínuo nas características estudadas ao longo das safras, indicando a eficiência do teste em diferenciar o mérito genético dos animais.
Este documento descreve os benefícios da DEP Genômica, que combina valores moleculares com a DEP tradicional para fornecer uma avaliação genética mais precisa. A DEP Genômica aumenta significativamente a acurácia da seleção, especialmente para animais jovens com baixa acurácia na DEP tradicional. Isso permite que os criadores selecionem os melhores animais mais cedo e obtenham maior retorno econômico em seu programa de melhoramento genético.
Seminário ANCP 2022 - Seleção genética para melhoria da qualidade da carne br...ANCP Ribeirão Preto
O documento discute a seleção genética para melhorar a qualidade da carne bovina no Brasil. Apresenta dados sobre a pecuária de corte no Brasil e no mundo, destacando a baixa remuneração do produto comercializado. Discute os atributos de qualidade da carne desejados, como maciez, e os resultados obtidos na Embrapa para identificar animais com potencial genético para produzir carne mais macia por meio de seleção genômica.
Seminário ANCP 2019 - Avaliação Genômica em Rebanhos Comerciais: Avanços, Liç...ANCP Ribeirão Preto
- O documento discute as atualizações técnicas e implementação do método de avaliação genômica ssGBLUP em rebanhos comerciais de gado de corte no Brasil.
- Inclui resultados preliminares do projeto "Avaliação Genômica em Rebanhos Comerciais" mostrando melhorias na acurácia com o método ssGBLUP.
- Também destaca a importância da origem e qualidade dos genótipos para a avaliação genômica.
O documento discute as vantagens das metodologias de seleção genética modernas, como o uso de marcadores de DNA e testes genômicos. Isso permite predições mais precisas do valor genético de animais jovens e acelera o progresso genético do rebanho de forma mais eficiente. Exemplos mostram como fazendas que adotaram essas técnicas tiveram maior acurácia na seleção e confiabilidade em suas decisões de manejo.
1) O documento discute estratégias de melhoramento genético em gado, incluindo seleção, cruzamento e uso de marcadores genéticos.
2) É destacada a importância do uso de ferramentas genômicas como chips de DNA para avaliação genética e seleção genômica.
3) A seleção genômica promete aumentar a acurácia das predições de mérito genético em comparação com métodos tradicionais.
08 - Uso dos marcadores de DNA Clarifide como ferramenta para selecionar anim...AgriPoint
[1] O documento discute o uso de marcadores de DNA (ClarifideTM) na seleção genética de gado para melhorar características econômicas.
[2] A seleção genômica pode ajudar na identificação precoce de animais geneticamente superiores para reprodução.
[3] Estudos mostram que o uso de marcadores de DNA aumenta a acurácia da avaliação genética de animais jovens e permite maior ganho genético.
Seminário ANCP 2022 - História das avaliações genéticas - De Henderson à aval...ANCP Ribeirão Preto
This document discusses the history of animal breeding evaluations from Henderson to multi-breed evaluations. It covers key historical figures and concepts including Sewall Wright, R.A. Fisher, J.B.S. Haldane, and C.R. Henderson. It also discusses modern paradigms for evaluation including genomic selection using whole genome regressions, genomic prediction across breeds using genomic correlations, and machine learning approaches. The potential benefits of multi-breed evaluations for related breeds like Angus and Hereford cattle are also described.
Seminário ANCP 2022 - Incrementos na produtividade pecuária de corte com o us...ANCP Ribeirão Preto
Este documento discute protocolos para aumentar a produtividade da pecuária de corte com baixa emissão de carbono. Ele descreve iniciativas no Brasil e no mundo para promover a pecuária sustentável e de baixo carbono, incluindo o programa Carbono Neutro da Embrapa e o selo Carbono Baixo da CNA. Além disso, fornece evidências de que práticas como integração lavoura-pecuária, adubação de pastagens e confinamento podem aumentar a produtividade e mitigar as emissões de metano
Seminário ANCP 2022 - Mudança da demanda do mercado de genética da última décadaANCP Ribeirão Preto
O documento discute as mudanças no mercado de genética bovina na última década, incluindo o aumento da inseminação artificial, o uso de genética sexada e superdose, a ênfase na eficiência alimentar e índices econômicos, e o papel crescente da genômica, embriões e planos genéticos. O autor fornece dados sobre o mercado de corte, a genética sexada Nelore e discute como a coleta de dados do mundo real, a eficiência alimentar e os índices
Este documento discute a influência da idade à primeira concepção e nutrição na eficiência e ganho genético da pecuária de corte. Reduzir a idade ao primeiro parto aumenta a produtividade por área e o retorno econômico. Além disso, diminui o intervalo de gerações e aumenta o ganho genético. Vários fatores como peso, condição corporal e espessura de gordura subcutânea influenciam a taxa de concepção de novilhas precoces.
Seminário ANCP 2019 - Seleção para qualidade de carne: Acabamento, Musculosid...ANCP Ribeirão Preto
O documento discute a importância da seleção genética para melhorar a qualidade da carne bovina, focando em características como marmoreio, musculosidade e acabamento. A ultrassonografia é uma ferramenta eficaz para medir essas características e identificar animais geneticamente superiores. A seleção para qualidade trará vantagens econômicas aos produtores devido à valorização no mercado de carnes de maior qualidade.
Seminário ANCP 2019 - Visão do mercado de animais avaliados ANCPANCP Ribeirão Preto
1) O documento discute a visão do mercado de animais avaliados pela Associação Nacional de Criadores de Plantel (ANCP) no Brasil.
2) Apresenta o ciclo de adoção de tecnologia pelos consumidores e dados sobre as preferências do mercado em relação a sêmen bovino nos últimos anos.
3) Argumenta que o mercado tem priorizado cada vez mais a prova, raça e pedigree em detrimento de outros fatores como biótipo e preço.
Seminário ANCP 2019 - Avaliação do potencial lucrativo do genoma com o aplica...ANCP Ribeirão Preto
O documento apresenta a plataforma BeefTrader e a ferramenta Livestock Profit Tool (LPT) para identificar animais mais lucrativos para produção de carne utilizando informações genômicas. Apresenta os resultados preliminares da análise de marcadores genéticos e genes relacionados ao ponto ótimo de negociação e lucratividade dos animais.
Seminário ANCP 2019 - Seleção e melhoramento para produção de carne de qualidadeANCP Ribeirão Preto
O documento discute a raça Angus no Brasil, seu melhoramento genético para produção de carne de qualidade, e o Programa Carne Angus Certificada. Apresenta dados sobre o crescimento da raça no país desde a década de 1960, com mais de 400 associados e 6.000 produtores atualmente no programa. Discutem-se também características desejáveis para seleção e qualidade da carne segundo consumidores.
O documento discute a eficiência alimentar em gado de corte, especificamente o consumo de matéria seca. Apresenta a história do conceito de eficiência alimentar e os estudos realizados entre 1993-2000. Também descreve o programa da Fazenda Matinha para avaliar e selecionar animais com menor consumo de alimentos.
Seminário ANCP 2019 - Eficiência Alimentar: Evolução e Desafios: Exemplo práticoANCP Ribeirão Preto
O documento apresenta um exemplo prático de eficiência alimentar comparando dois animais (FANO 3.0 e FANO 1443) em termos de conversão alimentar, consumo diário de ração, valor da produção e ganho de peso por animal. O FANO 3.0 teve melhor eficiência, com consumo diário de 2,93kg de ração, valor de produção de R$82,90 por animal e ganho de peso de 28,3kg. Já o FANO 1443 teve pior eficiência, com consumo diário de 5,87kg, valor de produção
Seminário ANCP 2019 - Práticas Inovadoras para a Sustentabilidade da PecuáriaANCP Ribeirão Preto
O documento discute práticas inovadoras para a sustentabilidade da pecuária no Brasil. Aborda o contexto global de emissões de gases de efeito estufa, as emissões brasileiras por setor e como sistemas de integração lavoura-pecuária-floresta podem aumentar a eficiência e reduzir as emissões em comparação com sistemas degradados. Também apresenta resultados de pesquisas sobre linhagens de gado e novas técnicas para melhorar a produção de forma sustentável.
O documento descreve a transformação de uma fazenda produtora de gado Nelore Mocho em uma operação integrada de lavoura-pecuária-floresta (ILPF). A fazenda passou a produzir grãos em parte da área, melhorou as pastagens e a alimentação dos animais, resultando em maiores taxas de fertilidade, ganhos de peso e produtividade. A ILPF diversificou as atividades e receitas da fazenda de forma sustentável.
Seminário ANCP 2018 - Precocidade Sexual: Do mito à realidadeANCP Ribeirão Preto
Palestra ministrada pela Roberta Gestal de Siqueira, zootecnista e mestre em Genética e Melhoramento Animal, da Melhora + Consultoria Genética e Alta Genetics, e pesquisadora associada da ANCP, durante o 24º Seminário Nacional de Criadores e Pesquisadores.
Seminário ANCP 2018 - ANCP além da fronteira - A criação de gado do grupo pec...ANCP Ribeirão Preto
O documento descreve o programa genético da criação de gado da raça Brahman nas fazendas Estancias Espiritu na Bolívia. O programa genético teve início em 1998 com o objetivo de selecionar e produzir touros geneticamente superiores para melhorar a raça no rebanho e disseminá-la na região. O programa coletou dados de mais de 40.000 animais ao longo de 18 anos. Em 2016, as Estancias Espiritu ingressaram no programa genético da ANCP, transferindo toda a sua base de dados.
Seminário ANCP 2018 - Índice Bioeconômico Guzerá, Brahman e TabapuãANCP Ribeirão Preto
O documento discute a seleção de animais de fazenda usando índices bioeconômicos. Ele explica como desenvolver tais índices levando em conta objetivos e critérios de seleção, como peso e idade, assim como preços, custos e receitas para determinar o valor econômico de cada característica. O documento fornece exemplos de índices para diferentes raças e argumenta que os índices permitem aos criadores tomar decisões de seleção equilibradas considerando características relevantes do ponto de vista econômico para seu sistema
Seminário ANCP 2018 - Precocidade sexual nos machos: Qual a vantagem?ANCP Ribeirão Preto
O documento discute a precocidade sexual em machos de gado, especificamente nelore. Resume em três pontos principais:
1) Estudos identificaram touros superprecoces com puberdade aos 12 meses com perímetro escrotal de 28-30cm.
2) Análises ultrassonográficas e de hormônio anti-Mülleriano podem identificar animais precoces com maior precisão do que só o perímetro escrotal.
3) A utilização de touros superprecoces no rebanho pode acelerar o ganho gen
Seminário ANCP 2018 - Frame: importância para a seleção de animais eficazesANCP Ribeirão Preto
Palestra ministrada pelo professor do Departamento de Ciência Animal da Universidade da Califórnia (UCDavis), dos Estados Unidos, e pesquisador associado da ANCP Roberto D. Sainz, durante o 24º Seminário Nacional de Criadores e Pesquisadores.
Seminário ANCP 2018 - Aplicação da genômica na na raça Nelore: Mitos e verdades.ANCP Ribeirão Preto
Palestra ministrada pelo professor e pesquisador Dr Fabyano Fonseca e Silva da Universidade Federal de Viçosa, durante o 24º Seminário Nacional de Criadores e Pesquisadores.
Seminário ANCP 2022 - História das avaliações genéticas - De Henderson à aval...ANCP Ribeirão Preto
This document discusses the history of animal breeding evaluations from Henderson to multi-breed evaluations. It covers key historical figures and concepts including Sewall Wright, R.A. Fisher, J.B.S. Haldane, and C.R. Henderson. It also discusses modern paradigms for evaluation including genomic selection using whole genome regressions, genomic prediction across breeds using genomic correlations, and machine learning approaches. The potential benefits of multi-breed evaluations for related breeds like Angus and Hereford cattle are also described.
Seminário ANCP 2022 - Incrementos na produtividade pecuária de corte com o us...ANCP Ribeirão Preto
Este documento discute protocolos para aumentar a produtividade da pecuária de corte com baixa emissão de carbono. Ele descreve iniciativas no Brasil e no mundo para promover a pecuária sustentável e de baixo carbono, incluindo o programa Carbono Neutro da Embrapa e o selo Carbono Baixo da CNA. Além disso, fornece evidências de que práticas como integração lavoura-pecuária, adubação de pastagens e confinamento podem aumentar a produtividade e mitigar as emissões de metano
Seminário ANCP 2022 - Mudança da demanda do mercado de genética da última décadaANCP Ribeirão Preto
O documento discute as mudanças no mercado de genética bovina na última década, incluindo o aumento da inseminação artificial, o uso de genética sexada e superdose, a ênfase na eficiência alimentar e índices econômicos, e o papel crescente da genômica, embriões e planos genéticos. O autor fornece dados sobre o mercado de corte, a genética sexada Nelore e discute como a coleta de dados do mundo real, a eficiência alimentar e os índices
Este documento discute a influência da idade à primeira concepção e nutrição na eficiência e ganho genético da pecuária de corte. Reduzir a idade ao primeiro parto aumenta a produtividade por área e o retorno econômico. Além disso, diminui o intervalo de gerações e aumenta o ganho genético. Vários fatores como peso, condição corporal e espessura de gordura subcutânea influenciam a taxa de concepção de novilhas precoces.
Seminário ANCP 2019 - Seleção para qualidade de carne: Acabamento, Musculosid...ANCP Ribeirão Preto
O documento discute a importância da seleção genética para melhorar a qualidade da carne bovina, focando em características como marmoreio, musculosidade e acabamento. A ultrassonografia é uma ferramenta eficaz para medir essas características e identificar animais geneticamente superiores. A seleção para qualidade trará vantagens econômicas aos produtores devido à valorização no mercado de carnes de maior qualidade.
Seminário ANCP 2019 - Visão do mercado de animais avaliados ANCPANCP Ribeirão Preto
1) O documento discute a visão do mercado de animais avaliados pela Associação Nacional de Criadores de Plantel (ANCP) no Brasil.
2) Apresenta o ciclo de adoção de tecnologia pelos consumidores e dados sobre as preferências do mercado em relação a sêmen bovino nos últimos anos.
3) Argumenta que o mercado tem priorizado cada vez mais a prova, raça e pedigree em detrimento de outros fatores como biótipo e preço.
Seminário ANCP 2019 - Avaliação do potencial lucrativo do genoma com o aplica...ANCP Ribeirão Preto
O documento apresenta a plataforma BeefTrader e a ferramenta Livestock Profit Tool (LPT) para identificar animais mais lucrativos para produção de carne utilizando informações genômicas. Apresenta os resultados preliminares da análise de marcadores genéticos e genes relacionados ao ponto ótimo de negociação e lucratividade dos animais.
Seminário ANCP 2019 - Seleção e melhoramento para produção de carne de qualidadeANCP Ribeirão Preto
O documento discute a raça Angus no Brasil, seu melhoramento genético para produção de carne de qualidade, e o Programa Carne Angus Certificada. Apresenta dados sobre o crescimento da raça no país desde a década de 1960, com mais de 400 associados e 6.000 produtores atualmente no programa. Discutem-se também características desejáveis para seleção e qualidade da carne segundo consumidores.
O documento discute a eficiência alimentar em gado de corte, especificamente o consumo de matéria seca. Apresenta a história do conceito de eficiência alimentar e os estudos realizados entre 1993-2000. Também descreve o programa da Fazenda Matinha para avaliar e selecionar animais com menor consumo de alimentos.
Seminário ANCP 2019 - Eficiência Alimentar: Evolução e Desafios: Exemplo práticoANCP Ribeirão Preto
O documento apresenta um exemplo prático de eficiência alimentar comparando dois animais (FANO 3.0 e FANO 1443) em termos de conversão alimentar, consumo diário de ração, valor da produção e ganho de peso por animal. O FANO 3.0 teve melhor eficiência, com consumo diário de 2,93kg de ração, valor de produção de R$82,90 por animal e ganho de peso de 28,3kg. Já o FANO 1443 teve pior eficiência, com consumo diário de 5,87kg, valor de produção
Seminário ANCP 2019 - Práticas Inovadoras para a Sustentabilidade da PecuáriaANCP Ribeirão Preto
O documento discute práticas inovadoras para a sustentabilidade da pecuária no Brasil. Aborda o contexto global de emissões de gases de efeito estufa, as emissões brasileiras por setor e como sistemas de integração lavoura-pecuária-floresta podem aumentar a eficiência e reduzir as emissões em comparação com sistemas degradados. Também apresenta resultados de pesquisas sobre linhagens de gado e novas técnicas para melhorar a produção de forma sustentável.
O documento descreve a transformação de uma fazenda produtora de gado Nelore Mocho em uma operação integrada de lavoura-pecuária-floresta (ILPF). A fazenda passou a produzir grãos em parte da área, melhorou as pastagens e a alimentação dos animais, resultando em maiores taxas de fertilidade, ganhos de peso e produtividade. A ILPF diversificou as atividades e receitas da fazenda de forma sustentável.
Seminário ANCP 2018 - Precocidade Sexual: Do mito à realidadeANCP Ribeirão Preto
Palestra ministrada pela Roberta Gestal de Siqueira, zootecnista e mestre em Genética e Melhoramento Animal, da Melhora + Consultoria Genética e Alta Genetics, e pesquisadora associada da ANCP, durante o 24º Seminário Nacional de Criadores e Pesquisadores.
Seminário ANCP 2018 - ANCP além da fronteira - A criação de gado do grupo pec...ANCP Ribeirão Preto
O documento descreve o programa genético da criação de gado da raça Brahman nas fazendas Estancias Espiritu na Bolívia. O programa genético teve início em 1998 com o objetivo de selecionar e produzir touros geneticamente superiores para melhorar a raça no rebanho e disseminá-la na região. O programa coletou dados de mais de 40.000 animais ao longo de 18 anos. Em 2016, as Estancias Espiritu ingressaram no programa genético da ANCP, transferindo toda a sua base de dados.
Seminário ANCP 2018 - Índice Bioeconômico Guzerá, Brahman e TabapuãANCP Ribeirão Preto
O documento discute a seleção de animais de fazenda usando índices bioeconômicos. Ele explica como desenvolver tais índices levando em conta objetivos e critérios de seleção, como peso e idade, assim como preços, custos e receitas para determinar o valor econômico de cada característica. O documento fornece exemplos de índices para diferentes raças e argumenta que os índices permitem aos criadores tomar decisões de seleção equilibradas considerando características relevantes do ponto de vista econômico para seu sistema
Seminário ANCP 2018 - Precocidade sexual nos machos: Qual a vantagem?ANCP Ribeirão Preto
O documento discute a precocidade sexual em machos de gado, especificamente nelore. Resume em três pontos principais:
1) Estudos identificaram touros superprecoces com puberdade aos 12 meses com perímetro escrotal de 28-30cm.
2) Análises ultrassonográficas e de hormônio anti-Mülleriano podem identificar animais precoces com maior precisão do que só o perímetro escrotal.
3) A utilização de touros superprecoces no rebanho pode acelerar o ganho gen
Seminário ANCP 2018 - Frame: importância para a seleção de animais eficazesANCP Ribeirão Preto
Palestra ministrada pelo professor do Departamento de Ciência Animal da Universidade da Califórnia (UCDavis), dos Estados Unidos, e pesquisador associado da ANCP Roberto D. Sainz, durante o 24º Seminário Nacional de Criadores e Pesquisadores.
Seminário ANCP 2018 - Aplicação da genômica na na raça Nelore: Mitos e verdades.ANCP Ribeirão Preto
Palestra ministrada pelo professor e pesquisador Dr Fabyano Fonseca e Silva da Universidade Federal de Viçosa, durante o 24º Seminário Nacional de Criadores e Pesquisadores.
Seminário ANCP 2018 - Aplicação da genômica na na raça Nelore: Mitos e verdades.
Seminário ANCP 2018 - Calibração e validação de DEPs genômicas (Clarified Nelore v3.1) e resultados preliminares da implementação do método de passo único BLUP genômico no programa Nelore Brasil
1. Calibração e validação de DEPs genômicas
(Clarified Nelore v3.1) e resultados
preliminares da implementação do método
de passo único BLUP genômico no programa
Nelore Brasil
Ribeirão Preto – Maio de 2018
Prof. Fernando Baldi
Unesp – FCAV
2. Conhecendo o efeito dos marcadores, é possível
obter o valor molecular genômico, inclusive
antes do indivíduo chegar à idade reprodutiva ou
expressar características de interesse.
Seleção genômica
2
DEPg=w1
MVP+w2
DEPPais
Combinação do MVP com informação do pedigree:
MVP ou DGV: Valor Molecular Predito
DEPg: Valor genômico estimado ou DEP genômica
3. • A calibração dos marcadores significa a “reestimação dos
efeitos dos SNPs” ou atualização da equação de predição do
MVP:
• Com novos MVPs (Clarified Nelore v3.1) a correlação genética
com a base de dados também foi atualizada para a obtenção
das DEP genômica.
• Validação dos resultados em uma população independente.
Comentários sobre a recalibração
MVP = b1
*SNP1
+ b2
*SNP2
+........+ b463.124
*SNP463.124
4. Avaliação Genômica
Irmãos
Filhos Gim de Garça
Dumu
Karvardi Imp.
Mara Imp.
Dahi
Survana Imp.
Cartomante
Netos
Pedigree
+
Fenótipo
+
Progênies colaterais
DEPgenômica
Valor molecular predito (MVP) – Clarifide Nelore v3.1
(Correlação genética)+
6. Pontos importantes a destacar
• Acurácia superior da DEP genômica com Clarified v3.1
nos animais da validação
– Maior impacto nos animais jovens
• Espera-se DEPs genômicas com menor viés ou desvios do
valor verdadeiro
– Superestimação ou subestimação
• Avaliação após a recalibração mais confiável e mais
consistente
– Menor oscilação das DEP genômicas entre as avaliações
genômicas
8. Pontos importantes a destacar
• Características de baixa herdabilidade e de avaliação
tardia ou difícil são as mais beneficiadas com o uso da
genômica
– Maternal
– Longevidade e produtividade da matriz
– Precocidade sexual
• Características de moderada a alta herdabilidade menor
impacto no número de progênies equivalente
– Maior vantagem de “fenotipar”, em relação à “genotipar”
– Maior vantagem de “genotipar”, em ausência de fenótipo.
9. Abordagens em avaliações genômicas
Inclusão da informação genômica:
Método de dois passos: Método de um passo (ssGBLUP):
Qual abordagem é melhor em termos de resultados?
10. Acurácia média da DEP genômica utilizando o ssGBLUP
com diferentes densidades de marcadores
Característica N_Dados N_Gen ssDEPg_HD1 ssDEP_ZL52 r
IPP 456.951
14.223
0,42 0,46 0,91
PAC 181.871 0,41 0,45 0,98
MP120 1.085.945 0,42 0,46 0,92
DP120 1.085.945 0,46 0,50 0,92
P455 840.145 0,48 0,52 0,93
Maciez 660 0,35 0,39 0,35
CAR 2.942 0,36 0,41 0,35
IMS 2.942 0,37 0,41 0,32
# animais no pedigree 1.757.011
Duas densidades (painéis) de marcadores:
1) ssDEPg_HD: ssGBLUP com painel BovineHD BeadChip (777.962 marcadores)
2) ssDEPg_ZL5: ssGBLUP com painel ZL5 (Clarified v3.1 com 30.754 marcadores)
11. Resultados preliminares: Acurácia DEP genômica (Clarified
v3.1 ) e DEP genômica ssGBLUP_ZL5
Característica N_Gen* ssDEPg_ZL52
DEPg_v3.11
% r
IPP 1.097 0,44 0,23 91 0,77
PAC 1.061 0,43 0,37 16 0,59
MP120 996 0,44 0,42 5 0,70
DP120 1.127 0,50 0,37 35 0,71
P455 1.129 0,51 0,43 19 0,84
*Animais no conjunto de validação
Duas abordagens para avaliação genômica:
1) DEPg_v3.1: Avaliação em dois passos com o MVP (Clarified v3.1)
2) ssDEPg_ZL5: ssGBLUP com painel ZL5 (Clarified 3.1 com 30.754 marcadores)
12. Avaliação genômica de rebanhos comerciais utilizando
diferentes estratégias
Característica Estratégia N_Dados N_Genótipos Acurácia % Aumento
IPP
ssGBLUP_comercial1
53.866 2.017 0,28
46
ssGBLUP_comercial+registrado2
456.951 2.017(12.206) 0,41
PAC
ssGBLUP_comercial 18.759 2.017 0,27
48
ssGBLUP_comercial+registrado2
181.871 2.017(12.206) 0,40
MP120
ssGBLUP_comercial 143.614 2.017 0,28
46
ssGBLUP_comercial+registrado2
1.085.945 2.017(12.206) 0,41
DP120
ssGBLUP_comercial 143.614 2.017 0,31
42
ssGBLUP_comercial+registrado2
1.085.945 2.017(12.206) 0,44
P455
ssGBLUP_comercial 124.169 2.017 0,31
45
ssGBLUP_comercial+registrado2
840.145 2.017(12.206) 0,45
1272534 animais no pedigree
21.757.011 animais no pedigree
Duas abordagens ou estratégias para avaliação genômica:
1) ssGBLUP_comercial: Animais “cara limpa” com painel ZL5
2) ssGBLUP_comercial+registrado: Animais “cara limpa”+ animais registrados
Projeto Fapesp #2016/22751-6
13. Considerações finais
• Maior confiabilidade e robustez das DEP genômicas
utilizando o Nelore Clarified v3.1;
• Maior vantagem da utilização das DEP genômicas (Nelore
Clarified v3.1) para características de difícil seleção
(maternal, precocidade e longevidade);
• Implementação do ssGBLUP pode ser realizada utilizando o
mesmo painel de marcadores utilizado para a obtenção do
MVP v3.1 (Previsão para 2019 ....);
• Considerável ganho em acurácia quando os rebanhos
comerciais são avaliados de forma conjunta com a base de
dados de rebanhos registrados;
• Importância da base de dados e da metodologia ssGBLUP.