Sistemas de múltiplos estágios permitem atender instalações com várias câmaras frias que necessitam de mais de um evaporador ou baixas temperaturas. Estes sistemas podem usar um compressor para todo o sistema com válvulas reguladoras de pressão ou compressores em paralelo ou série dependendo da diferença de temperatura entre as câmaras. Compressão por estágios é recomendada para grandes diferenças de temperatura para evitar problemas no compressor.