1) O estudo identificou geneticamente lagartas de Helicoverpa armigera em Roraima, Piauí e Bahia utilizando marcadores mitocondriais.
2) Foi encontrada evidência de fluxo gênico entre as populações do Norte e Nordeste do Brasil, indicando que H. armigera não está restrita a uma região.
3) Estudos futuros combinando DNA mitocondrial e nuclear são necessários para distinguir H. armigera de espécies similares como H. zea.
Semelhante a III WSF, Campinas – Thiago Mastrangelo - Identificação e Diversidade Genética de Populações de Helicoverpa armigera do Norte e Nordeste do Brasil
Semelhante a III WSF, Campinas – Thiago Mastrangelo - Identificação e Diversidade Genética de Populações de Helicoverpa armigera do Norte e Nordeste do Brasil (20)
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III WSF, Campinas – Thiago Mastrangelo - Identificação e Diversidade Genética de Populações de Helicoverpa armigera do Norte e Nordeste do Brasil
1. Universidade Estadual de Campinas
Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética
Identificação e Diversidade Genética de Populações
de Helicoverpa armigera do Norte e Nordeste do Brasil
Dr. Thiago Mastrangelo
Engº Agrônomo pela ESALQ/USP
PhD pelo CENA/USP
E-mail: mastrangelo@cbmeg.unicamp.br
2. Sumário
1. Introdução
– Crise Fitossanitária
– Identificação Morfológica de Helicoverpa armigera
– Novas incursões da praga no Brasil
– DNA barcoding
2. Material e Métodos
– Extração de DNA Total
– PCR, Purificação e Sequenciamento
3. Resultados
– Análises Filogenéticas
– Distâncias Genéticas
– DNA barcodes
– Rede de Haplótipos
– Diversidade Genética e Distribuição dos Haplótipos no Brasil
– Estrutura Genética das Populações
– Divergência Genética entre H. armigera e H. zea por 3 Genes Nucleares
4. Conclusões
4. 1. H. armigera x Crise Fitossanitária
• Praga de importância econômica no mundo:
- World: annual costs (control+yield losses) around US$ 5 billion (Lammers & MacLeod, 2007).
- China (1992): losses of US$ 1.3 billion in the Yellow River cotton region, North China (Sheng, 1993).
- India + China: 50% pesticides used to control H. armigera (Lammers & MacLeod, 2007).
- USA: 4,431 interceptions of H. 4,43 p armigera + Helicoverpa spp. since 1985 on fruits, vegetables and
ornamentals (Venette et al., 2003).
- USA: 1,400 interceptions at US ports between 2000 and 2004 (Passoa, 2004).
11. 2. Extração de DNA Total
Método Fenol:Clorofórmio (Lyra et al. , 2009)
12. 2. Extração de DNA Total
Ressuspendidos em 100 μμL de TE buffer Armazenados a -80 ºC
13. 2. Amplificação por PCR
• Primers: • Mix para PCR:
- COIF e COIR (Li et al., 2011)
- A-tLEU e B-tLYS (Liu & Beckenbach, 1992)
- 25 ng de DNA total
- 2,5 mM de MgCl2
- 0,25 mg/mL de BSA
-0,5 mM de cada primer
- 1,5 U de TaqDNA polymerase
- 10 x TaqBuffer
- EF-1α, IDH e RpS5 (Wahlberg & Wheat, 2008)
- 100 μM de dNTPs - Volume final: 25 μL
GeneAmp®PCR System
9700 thermal cycler
Condições
94oC 3’
94oC 30”
45 oC COI
2 μL
Gel agarose 1% em 1 x TAE
35 Ciclos
C - 48 ºC – COII
55 ºC - Nucleares
30”
70 oC
72 ºC – COII 1’ e 30”
oC ’
μ
70oC 7’
10oC forever
14. 2. Purificação e Sequenciamento
IllustraTMGFXTM kit
ABI3730xl DNA Analyzer sequencer
20. 3. Rede de Haplótipos – 96 sequências COI
arm13
arm12 PI‐7,16,17 RR‐5 arm11
arm7
TCS version 1.21 software
arm 1
PI‐1,2,6,8,9,10,11,13,20,21,22,
25,27,29,30,32,33,39
BA‐1 3 4 5 6 7 9 12
PI‐14,26,35
BA‐11
RR‐12
PI‐3,4
RR‐7
arm6
arm5
arm16
arm9
BA‐2
1,3,4,5,6,7,9,12
RR‐1,2,3,6,8
arm 2
PI‐5,12,15,18,19,23,24,28,
31,36,37
arm10
arm8
arm3
arm4
BA‐8, 10
arm15 RR‐4,9,10,11,13,14
PI‐38 arm14
PI‐34
13 mutations
11 mutations
H. gelotopoeon
10 mutations 6 mutations
5 mutations 6mutations
H. zea
(Li et al., 2011)
H. virescens
H. hawaiiensis
H. punctigera
6 mutations
25 mutations
39 mutations
H. assulta
21. 3. Diversidade Genética das Populações e Distribuição dos Haplótipos – COI + COII
‒ 22 haplótipos
‒Alta Ĥ e baixa π
‒ Fluxo Gênico
22. 3. Estrutura Genética das Populações – COI + COII
Arlequin v.3.5 software
As populações de H. armigera não estão estruturadas !
23. Grande Capacidade de Dispersão
• Esse padrão de variação genética é comum em
pragas capazes de se dispersar por longas
distâncias, como H. armigera (Daly & Gregg, 1985;
Zhou et al., 2000; Endersby et al., 2007) .
- Mark-recapture experiments Æ H. armigera
Moths can fly 200-300 km in a single night
(Pedgley, 1985)
y 3 g g
(Armes & Cooter, 1991).
-Barriers such as the Sahara desert had not prevented long
distance migration in H. armigera (Nibouche et al., 1998).
25. Problemas
• Problemas de usar apenas mtDNA:
- Genes COI + COII são informativos apenas quanto à herança maternal.
- Os 65 espécimes podem pertencer à linhagem original introduzida ou um híbrido
proveniente do cruzamento entre uma fêmea de H. armigera e um macho de H. zea.
30. 4. Conclusões
1) Há fortes evidências genéticas de que as lagartas analisadas de Roraima, Piauí e
Bahia são Helicoverpa armigera.
2) Estudos futuros combinando mtDNA e novos marcadores nucleares com linhagens
puras e híbridos de H. armigera e H. zea são necessários para a elaboração de
protocolos de identificação para essas duas espécies.
3) Enquanto esses protocolos estão sendo desenvolvidos, sistemas de identificação
baseados em mtDNA podem continuar provendo informações diagnósticas e de
origem geográfica que excedem aquelas que podem ser alcançadas utilizando-se
apenas chaves morfológicas.
31. 4. Conclusões
4) Há evidência de fluxo gênico entre as populações do Norte e Nordeste do Brasil.
5) H. armigera não está restrita apenas ao Brasil central ou Nordeste, tendo cruzado a
região amazônica.
6) Amostragens na Venezuela e Colômbia devem ser iniciadas o quanto antes para se
poder monitorar a entrada ou avanço dessa praga na América Central e EUA.