Fungos são classificados em dois filos: Mixomycota, que inclui fungos gelatinosos em ambientes úmidos, e Eumycota, que inclui zigomicetos, ascomicetos e basidiomicetos. Estes últimos incluem cogumelos comestíveis e fungos que formam associações mutualísticas como líquens e micorrizas, onde ambos os organismos se beneficiam através da troca de nutrientes e proteção.