UNIVERSIDADE PRESIDENTE ANTÔNIO CARLOS




                 RFLP
Restriction Fragment Lenght
       Polymorphism


                Juiz de Fora, 09 de dezembro de 2011.
Grupo


•   Bárbara Tuâne;
•   Carlos Eduardo Cardoso;
•   Marina Cognalato;
•   Poliane Lopes.
Introdução

• A técnica de RFLP foi descrita inicialmete
  por Botstein em 1980; RFLP é um dos
  muitos tipos de marcadores moleculares,
  e são capazes de detectar variações em
  sequências de DNA de 4 a 8 pares de
  base, reconhecidas por enzimas de
  restrição, capazes de clivar DNA por
  reconhecimento de sequências.
Marcadores Genéticos


• Qualquer característica morfológica ou
  molecular que diferencia indivíduos, e que
  seja facilmente detectável é um potencial
  marcador genético.
Marcadores Genéticos


                          Marcadores moleculares




Morfológicos        Bioquímicos                DNA
Marcadores Dominantes
Marcadores Codominantes
RFLP


• São fragmentos de DNA obtidos de
  enzimas de restrição, separados por
  eletroforese e visualizados por meio de
  hibridizações com sondas marcadas com
  radioatividade ou fluorescência.
Etapas para aquisição de RFLP’s
• Extração do DNA;
• Digestão com endonucleases de restrição (cortam a
  molécula de DNA através do reconhecimento de
  sequências nucleotídicas específicas);
• Eletroforese;
• Transferência dos fragmentos para uma membrana de
  nitrocelulose;
• Hibridização dos fragmentos com sondas marcadas;
• Visualização dos polimorfismos através de auto-
  radiografia.
Base Genéticas dos Marcadores RFLP’s


       • O polimorfismo observado na técnica de
         RFLP ocorre porque o DNA de indivíduos
         geneticamente distintos difere na
         sequência de nucleotídeos ao longo da
         fita.
Interpretação
Autoradiografia de uma
membrana de
hibridização revelando
marcadores RFLP.
Indivíduos homozigotos
para o alelo
A1(3,5,6,7,8,9) e
homozigotos para os
alelos A2(1,2,4).
Vantagens e Desvantagens
• Reprodutível;
• Marcadores co-dominantes;
• Simples.




• Trabalhoso;
• Caro;
• Uso de sondas radioativa.
Aplicações

•   Mapeamento do Genoma;
•   Genotipagem;
•   Ciência forense;
•   Teste de paternidade;
•   Detecção de doenças hereditárias, etc.
Análise do RFLP para a Fibrose Cística
PCR-RFLP
      (AFLP- Amplified Fragment
       Length Polymorphisms)
• Isolamento de DNA suficiente para a análise RFLP é
  demorado e trabalhoso. No entanto, a PCR pode
  ser usado para amplificar pequenas quantidades
  de DNA, geralmente em 2-3 horas, para os níveis
  exigidos para a análise de RFLP. Portanto,mais
  amostras podem ser analisadas em um curto tempo.
Artigo: Identification of a criminal by DNA
typing in a rape case in Rio de Janeiro,
Brazil.

        A identificação humana por DNA é uma
      ferramenta poderosa para casos de paternidade,
      assim como investigação criminal pela tipagem de
      evidências biológicas coletadas em cenas de crime
      e identificação de restos mortais.
OBJETIVO: Identificação de criminoso em caso de estupro
com quatro suspeitos.

PARTICIPANTES: Sangue de quatro suspeitos e vítima e
pele do feto.

PROCEDIMENTOS: Reação em cadeia da polimerase
(PCR) e polimorfismo de tamanho de fragmentos de
restrição (RFLP).
RESULTADOS: Três suspeitos foram excluídos e um
suspeito foi incluído como pai biológico do feto.
Um teste complementar com 3 loci VNTR também foi
realizado.
O suspeito foi incluído como pai biológico apresentando
Índice de Paternidade de 412.860 (probabilidade de
paternidade: 99,9997%).
Conclusão
      O desenvolvimento de técnicas baseadas
na hibridização de sequências de DNA abriu
novas opções para o estudo de variações . A
descoberta de enzimas de restrição, a
possibilidade de transferência de fragmentos de
DNA para membranas e o desenvolvimento de
novos métodos de marcação radioativa e
luminescente para fins de hibridização de
fragmentos de DNA determinaram o emprego
eficiente de RFLP em análise genética.
Bibliografia
• Artigo: GOES, Andréa Carla de Souza et al . Identification of a
  criminal by DNA typing in a rape case in Rio de Janeiro, Brazil. Sao
  Paulo Med. J., São Paulo, v. 120, n. 3, maio 2002 . Disponível
  em <http://www.scielo.br/scielo>
• Livro: “Marcadores Genéticos Moleculares” – Fábio Gelape Faleiro
  (2007);
• Livro: “Introdução ao Uso de Marcadores Moleculares em Análise
  Genética” – Márcio Elias Ferreira & Dário Grattapaglia (1996);
• Livro: “Marcadores Moleculares em Plantas” – Sandra Milach (1998);
• Site: http://www.e-escola.pt/biologia;
• Site: http://www.ncbi.nlm.nih.gov;
• Site: http://www.sciencedirect.com/
Obrigado!

Rflp

  • 1.
    UNIVERSIDADE PRESIDENTE ANTÔNIOCARLOS RFLP Restriction Fragment Lenght Polymorphism Juiz de Fora, 09 de dezembro de 2011.
  • 2.
    Grupo • Bárbara Tuâne; • Carlos Eduardo Cardoso; • Marina Cognalato; • Poliane Lopes.
  • 3.
    Introdução • A técnicade RFLP foi descrita inicialmete por Botstein em 1980; RFLP é um dos muitos tipos de marcadores moleculares, e são capazes de detectar variações em sequências de DNA de 4 a 8 pares de base, reconhecidas por enzimas de restrição, capazes de clivar DNA por reconhecimento de sequências.
  • 4.
    Marcadores Genéticos • Qualquercaracterística morfológica ou molecular que diferencia indivíduos, e que seja facilmente detectável é um potencial marcador genético.
  • 5.
    Marcadores Genéticos Marcadores moleculares Morfológicos Bioquímicos DNA
  • 6.
  • 7.
  • 8.
    RFLP • São fragmentosde DNA obtidos de enzimas de restrição, separados por eletroforese e visualizados por meio de hibridizações com sondas marcadas com radioatividade ou fluorescência.
  • 9.
    Etapas para aquisiçãode RFLP’s • Extração do DNA; • Digestão com endonucleases de restrição (cortam a molécula de DNA através do reconhecimento de sequências nucleotídicas específicas); • Eletroforese; • Transferência dos fragmentos para uma membrana de nitrocelulose; • Hibridização dos fragmentos com sondas marcadas; • Visualização dos polimorfismos através de auto- radiografia.
  • 11.
    Base Genéticas dosMarcadores RFLP’s • O polimorfismo observado na técnica de RFLP ocorre porque o DNA de indivíduos geneticamente distintos difere na sequência de nucleotídeos ao longo da fita.
  • 12.
  • 13.
    Autoradiografia de uma membranade hibridização revelando marcadores RFLP. Indivíduos homozigotos para o alelo A1(3,5,6,7,8,9) e homozigotos para os alelos A2(1,2,4).
  • 14.
    Vantagens e Desvantagens •Reprodutível; • Marcadores co-dominantes; • Simples. • Trabalhoso; • Caro; • Uso de sondas radioativa.
  • 15.
    Aplicações • Mapeamento do Genoma; • Genotipagem; • Ciência forense; • Teste de paternidade; • Detecção de doenças hereditárias, etc.
  • 16.
    Análise do RFLPpara a Fibrose Cística
  • 17.
    PCR-RFLP (AFLP- Amplified Fragment Length Polymorphisms) • Isolamento de DNA suficiente para a análise RFLP é demorado e trabalhoso. No entanto, a PCR pode ser usado para amplificar pequenas quantidades de DNA, geralmente em 2-3 horas, para os níveis exigidos para a análise de RFLP. Portanto,mais amostras podem ser analisadas em um curto tempo.
  • 18.
    Artigo: Identification ofa criminal by DNA typing in a rape case in Rio de Janeiro, Brazil. A identificação humana por DNA é uma ferramenta poderosa para casos de paternidade, assim como investigação criminal pela tipagem de evidências biológicas coletadas em cenas de crime e identificação de restos mortais.
  • 20.
    OBJETIVO: Identificação decriminoso em caso de estupro com quatro suspeitos. PARTICIPANTES: Sangue de quatro suspeitos e vítima e pele do feto. PROCEDIMENTOS: Reação em cadeia da polimerase (PCR) e polimorfismo de tamanho de fragmentos de restrição (RFLP).
  • 22.
    RESULTADOS: Três suspeitosforam excluídos e um suspeito foi incluído como pai biológico do feto. Um teste complementar com 3 loci VNTR também foi realizado. O suspeito foi incluído como pai biológico apresentando Índice de Paternidade de 412.860 (probabilidade de paternidade: 99,9997%).
  • 23.
    Conclusão O desenvolvimento de técnicas baseadas na hibridização de sequências de DNA abriu novas opções para o estudo de variações . A descoberta de enzimas de restrição, a possibilidade de transferência de fragmentos de DNA para membranas e o desenvolvimento de novos métodos de marcação radioativa e luminescente para fins de hibridização de fragmentos de DNA determinaram o emprego eficiente de RFLP em análise genética.
  • 24.
    Bibliografia • Artigo: GOES,Andréa Carla de Souza et al . Identification of a criminal by DNA typing in a rape case in Rio de Janeiro, Brazil. Sao Paulo Med. J., São Paulo, v. 120, n. 3, maio 2002 . Disponível em <http://www.scielo.br/scielo> • Livro: “Marcadores Genéticos Moleculares” – Fábio Gelape Faleiro (2007); • Livro: “Introdução ao Uso de Marcadores Moleculares em Análise Genética” – Márcio Elias Ferreira & Dário Grattapaglia (1996); • Livro: “Marcadores Moleculares em Plantas” – Sandra Milach (1998); • Site: http://www.e-escola.pt/biologia; • Site: http://www.ncbi.nlm.nih.gov; • Site: http://www.sciencedirect.com/
  • 25.