O documento discute diferentes tipos de marcadores moleculares derivados de sequências expressas, incluindo SNP, ESTP e ASP. SNP refere-se a polimorfismos de nucleotídeos únicos, ESTP usa sequências de genes expressos para desenvolver marcadores e ASP identifica variantes alélicos de genes. Esses marcadores podem ser usados para mapeamento genético, análise de populações e identificação de cultivares.
Marcadores moleculares de expressão e derivados de sequências expressas
1. UNIVERSIDADE DO ESTADO DE MATO GROSSO
CAMPUS UNIVERSITÁRIO DE CÁCERES “JANE VANINI”
BIOLOGIA MOLECULAR
Marcadores Moleculares
Discente: Taniele Oliveira
2. Marcadores Moleculares de
Expressão
Surgiram recentemente com o advento da
biologia molecular;
Nível alto de polimorfismo para cada loco
estudado;
Neutros em relação a efeitos fenotípicos;
Em geral, são co-dominantes, contendo maior
quantidade de informação genética por loco;
Podem ser usados para caracterizar o genótipo
de um indivíduo a partir de amostras de células
ou de tecidos e, em qualquer estádio de
desenvolvimento da planta.
3. Marcadores derivados de
sequencias
expressas: SNP
SNP - Single Nucleotide Polymorphism ou
Polimorfismos de Nucleotídeos Únicos
Polimorfismo
baseados na alteração de uma
única base no genoma.
4. Marcadores derivados de
sequencias
expressas: SNP
Tipos mais comuns de
SNPs:
Transição:
base púrica é
substituída
por
outra
púrica A-T, G-C.
Transversão:
púrica
substituída por pirimídica
ou vice-versa : A-C, G-T,
A-C e C-T.
SNP: variação >1%
Mutação: variação <1%
5. Marcadores derivados de
sequencias
expressas: SNP
Vantagens:
Abundância
no genoma
Elevado grau de polimorfismo
Detecção de diferentes alelos para genes de
interesse
Desvantagem:
Sequenciamento
de DNA em grande escala.
6. Marcadores derivados de
sequencias
expressas: SNP
Aplicações:
Construção
de mapas genéticos
Mapeamento de características de interesse
Análise de populações
Identificação de cultivares
Utilização:
Identificação
e validação de marcadores
moleculares INDEL e SNP lipoxigenases de
sementes de soja.
7. Marcadores derivados de
sequencias
expressas: ESTP
ESTP - Expressed sequence tag polymorphism
ou Sequencia expressa de polimorfismo.
Sequência de DNA para genes expressos.
Desenvolvimento
de marcadores baseados
sequência de genes.
Teste em diferentes genótipos.
Utilização:
Caracterização de cultivares de videira através de
ESTP.
(Sítios específicos em videiras)
na
8. Marcadores derivados de
sequencias
expressas: ASP
ASP – Allele Specific Polymorphism ou Alelo
Polimorfismo Específico
Trabalha-se
com a sequência do gene
Identificação de plantas variantes alélicos de um
gene
Eventos de Inserção / Deleção / Substituição de
base na região transcrita de um gene
9. Marcadores derivados de
sequencias
expressas: ASP
Desenvolvimento:
Identificação
e sequenciamento dos variantes
alélicos do gene de interesse
Desenho de um par de primers
Anelamento – local de inserção / deleção /
substituição
Aplicação:
Analise
filogenética e mapeamento genético.