O documento discute diferentes tipos de marcadores moleculares derivados de sequências expressas, incluindo SNP, ESTP e ASP. SNP refere-se a polimorfismos de nucleotídeos únicos, ESTP usa sequências de genes expressos para desenvolver marcadores e ASP identifica variantes alélicos de genes. Esses marcadores podem ser usados para mapeamento genético, análise de populações e identificação de cultivares.

1. UNIVERSIDADE DO ESTADO DE MATO GROSSO
CAMPUS UNIVERSITÁRIO DE CÁCERES “JANE VANINI”
BIOLOGIA MOLECULAR
Marcadores Moleculares
Discente: Taniele Oliveira

2. Marcadores Moleculares de
Expressão
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Surgiram recentemente com o advento da
biologia molecular;
Nível alto de polimorfismo para cada loco
estudado;
Neutros em relação a efeitos fenotípicos;
Em geral, são co-dominantes, contendo maior
quantidade de informação genética por loco;
Podem ser usados para caracterizar o genótipo
de um indivíduo a partir de amostras de células
ou de tecidos e, em qualquer estádio de
desenvolvimento da planta.

3. Marcadores derivados de
sequencias
expressas: SNP
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SNP - Single Nucleotide Polymorphism ou
Polimorfismos de Nucleotídeos Únicos
 Polimorfismo
baseados na alteração de uma
única base no genoma.

4. Marcadores derivados de
sequencias
expressas: SNP

Tipos mais comuns de
SNPs:
 Transição:
base púrica é
substituída
por
outra
púrica A-T, G-C.
 Transversão:
púrica
substituída por pirimídica
ou vice-versa : A-C, G-T,
A-C e C-T.
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SNP: variação >1%
Mutação: variação <1%

5. Marcadores derivados de
sequencias
expressas: SNP
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Vantagens:
 Abundância
no genoma
 Elevado grau de polimorfismo
 Detecção de diferentes alelos para genes de
interesse

Desvantagem:
 Sequenciamento
de DNA em grande escala.

6. Marcadores derivados de
sequencias
expressas: SNP
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Aplicações:
 Construção
de mapas genéticos
 Mapeamento de características de interesse
 Análise de populações
 Identificação de cultivares

Utilização:
 Identificação
e validação de marcadores
moleculares INDEL e SNP lipoxigenases de
sementes de soja.

7. Marcadores derivados de
sequencias
expressas: ESTP
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ESTP - Expressed sequence tag polymorphism
ou Sequencia expressa de polimorfismo.
Sequência de DNA para genes expressos.
 Desenvolvimento
de marcadores baseados
sequência de genes.
 Teste em diferentes genótipos.


Utilização:

Caracterização de cultivares de videira através de
ESTP.

(Sítios específicos em videiras)
na

8. Marcadores derivados de
sequencias
expressas: ASP
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ASP – Allele Specific Polymorphism ou Alelo
Polimorfismo Específico
 Trabalha-se
com a sequência do gene
 Identificação de plantas variantes alélicos de um
gene
 Eventos de Inserção / Deleção / Substituição de
base na região transcrita de um gene

9. Marcadores derivados de
sequencias
expressas: ASP
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Desenvolvimento:
 Identificação
e sequenciamento dos variantes
alélicos do gene de interesse
 Desenho de um par de primers
 Anelamento – local de inserção / deleção /
substituição
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Aplicação:
 Analise
filogenética e mapeamento genético.