Micróbios podem ser classificados em quatro grupos: vírus, bactérias, protozoários e fungos. Bactérias podem ser classificadas de acordo com sua forma em cocos, bacilos, espirilos ou víbrios. Alguns micróbios como bactérias lácticas e leveduras são úteis, enquanto outros como Neisseria meningitidis podem causar doenças ao homem.