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PubMed
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                               O que é a PubMed?
A PubMed é uma base de dados de bibliografia especializada na área da biomedicina, com
informação também sobre biomateriais e informática médica, contendo mais de 18.200.000
de artigos.

Produzida pela National Library of Medicine (http://www.nlm.nih.gov/) dos Estados Unidos,
em conjunto com editores de literatura biomédica, começa por ser uma inteface de acesso à
Medline, incluindo também a Oldmedline e citações avulsas. Contém registos desde 1865 e é
uma poderosa ferramenta de pesquisa de artigos científicos e outra bibliografia, incluindo
revistas em texto integral dos editores participantes. A PubMed faz ligação a todos os artigos
que estejam em Open Access disponibilizados no arquivo PubMedCentral
(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/) assim como às revistas subscritas em formato
electrónico pela Universidade de Aveiro ou pela B-on (com acesso ua.pt).
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                                        A Medline
A Medline é uma base de dados da National Library of Medicine e que resulta da PubMed.
Inclui apenas artigos científicos com peer-review e nas áreas da biomedicina e as
referências nela incluídas passam por um processo de análise e indexação mais
consistente. Abrange menos publicações do que a PubMed, mas as que reúne são da
máxima pertinência. Uma das mais-valias da Medline é a ligação ao texto integral dos
artigos das revistas que estão incluídas no consórcio B-on.




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             O acesso à Medline com interface EBSCO

O acesso está limitado ao domínio ua.pt ou, a partir do exterior, desde que
configure o seu computador pessoal à rede VPN.



O manual de configuração VPN está disponível na página do CICUA
– www.cic.ua.pt > manuais&forms > manuais.




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› Artigos científicos nas áreas da medicina, enfermagem, medicina veterinária, cuidados de
saúde, medicina dentária;

› Indexa 4.800 revistas biomédicas e inclui citações das bases de dados Index Medicus,
International Nursing Index, Index to Dental Literature, PREMEDLINE, AIDSLINE,
BIOETHICSLINE, e HealthSTAR;

› Contem cerca de 1.900 revistas da base de dados de enfermagem CINAHL;

› Analisa artigo a artigo e indexa-os com termos controlados através do thesaurus MeSH;

› Interface de pesquisa em várias línguas, incluindo o português;
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                      A Medline com interface EBSCO

› Filtro por texto integral, tipologia do documento, data, etc.;
› Possibilidade de pesquisa com operadores boleanos (and, or, not), truncatura (*) e termo
composto ou pesquisa por frase (“ “);
› Acesso ao texto integral de documentos em acesso livre;
› Acesso ao texto integral das publicações subscritas pela UA e das que fazem parte da B-on
– Biblioteca do Conhecimento Online;



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› Thesaurus;
› Cruzamento da pesquisa com outras bases de dados EBSCO;
› Subscrição de feeds RSS;
› Exportação para EndNote;
› Espaço pessoal.



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            O acesso à PubMed
http://pubmed.gov (acesso universal e gratuito)




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                                         A PubMed
› Inclui a MEDLINE, a OLDMEDLINE e citações avulsas;


› A OLDMEDLINE contém artigos anteriores a 1966 (1865 a 1965) de cerca de 80 países;


› Possibilidade de pesquisa em várias publicações, que podem ir dos artigos científicos aos
pré-prints e livros;


› São também incluídas desde logo na PubMed as citações in-process e as citações
fornecidas pelos editores;

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                                        A PubMed
› As citações avulsas compreendem as citações out-of-scope (por exemplo, de artigos sobre
geofísica, arqueologia, astronomia) de alguns periódicos indexados na MEDLINE, cujos
artigos relacionados com as ciências da saúde já são indexados. Incluem também citações
que precedem o ano a partir do qual um dado periódico passou a ser integrado na MEDLINE
(catalogação retrospectiva) e citações de outros periódicos não incluídos na MEDLINE, mas
que submetem o seu texto integral à PubMedCentral e são avaliados positivamente pela
NLM;

› As citações in-process fornecem a citação básica e, na maior parte dos casos, o resumo do
artigo, antes mesmo da introdução dos assuntos (termos MeSH).
Estes registos são acrescentados diariamente e contêm a indicação [PubMed – in process].
À medida que os dados vão sendo acrescentados e os registos ficam completos, passam a
conter a indicação [PubMed – indexed for MEDLINE];
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› Filtro por texto integral, tipologia do documento, data, etc.;
› Possibilidade de pesquisa com operadores boleanos (and, or, not), truncatura (*)
e termo composto ou pesquisa por frase (“ “);
› Acesso ao texto integral de algumas publicações subscritas pela UA ou que fazem
parte da B-on – Biblioteca do Conhecimento Online (desde que no dominio ua.pt);




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› Acesso ao texto integral de documentos em acesso livre;
› Possibilidade de pesquisa em outras bases de dados e clinical trials;
› Thesaurus;
› Subscrição de feeds RSS;
› Exportação para EndNote;
› Espaço pessoal.

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                               O thesaurus MeSH
                             Vocabulário controlado

O MeSH (Medical Subject Headings) é o vocabulário controlado que é utilizado para
indexar os artigos da PubMed e da Medline. A terminologia controlada que é usada no
thesaurus MeSH dá a possibilidade de recuperar informação sobre um determinado
assunto de uma forma sistemática, eliminando os registos que não são pertinentes para
aquele tópico.
É uma óptima ferramenta de apoio para a realização de pesquisas na PubMed e Medline
pois diminui ou limita o ruído, proporcionando maior precisão.

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        Quando usar e quando não usar o MeSH…
Use o MeSH quando...                                       Use palavras quando...
... precisa de efectuar uma pesquisa                       ... pretende informação sobre um conceito
exaustiva e precisa sobre um determinado                   médico novo ou emergente, para o qual ainda
tópico (os documentos ainda não indexados não serão        não existe um termo MeSH.
apresentados).
... necessita de efectuar uma pesquisa                     ... quer obter registos de artigos publicados
elaborada, combinando vários aspectos de                   recentemente. Uma pesquisa por termo MeSH
diferentes tópicos ou assuntos.                            não consegue recuperar citações com a
                                                           indicação «Pubmed – in process», às quais ainda
                                                           não foram associados termos MeSH.
... quer encontrar rapidamente um aspecto                  ... suspeita de que há pouca informação
específico de um tópico genérico.                          publicada relativa ao tópico que lhe interessa.
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                                     A pesquisa

1 – Por autor
Use o último nome do autor, mais iniciais sem pontuação – Ex: Lederberg J


2 – Por assunto
Digite o termo seleccionado na caixa de pesquisa e opte por uma das sugestões
apresentadas.
Identifique o conceito e utilize o thesaurus MeSH para uma pesquisa direccionada




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                                     A pesquisa
3 – Localização de artigos através do título de uma revista
Através da pesquisa do título completo, da abreviatura ou do ISSN de uma revista, a PubMed
apresenta uma relação de todos os artigos nela publicados, desde que indexados na base de
dados.


4 - Localização de revistas por título
Aceda à base de dados das revistas em http://www.ncbi.nlm.nih.gov/journals e digite o
título.




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                                     A pesquisa
5 - Localização de um artigo através de informações bibliográficas já existentes
Quando já tem o título da revista, volume, número e páginas, use o Single Citation Matcher
para localizar o artigo - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/pubmedutils/citmatch.


6 – Pesquisa avançada
A pesquisa avançada para além de permitir a combinação de vários campos numa mesma
equação (autor, título, assunto…) através de operadores boleanos, permite também a
consulta do histórico das pesquisas realizadas.
A Search Builder permite através do termo de pesquisa, da selecção do campo e da opção
“Index”, uma listagem associada ao termo pesquisado (índices alfabéticos), onde informa
também o número de citações para cada termo e campo.
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                                        A pesquisa
                      Símbolos de pesquisa da PubMed:


AND, OR e NOT como operadores boleanos (ex: cerebral angiography and moniz);

*como truncatura (ex: child* recupera registos com os termos child, children, childhood,
etc.;


“ ” para uma frase exacta ou termo composto.
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                       O texto integral dos artigos

No registo completo do artigo, a existência do icon de “free-text article” ou ”full- text
article” dá acesso ao texto integral, caso seja uma revista disponível em acesso livre ou
uma publicação subscrita em formato electrónico pela Universidade de Aveiro ou pela B-
on.




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                            Tutoriais de apoio
› Tutoriais PubMed
 http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html
 http://nnlm.gov/training/resources/pmtri.pdf
 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=helppubmed&part=pubmedhelp

› Citation Matcher
 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/pubmedutils/citmatch

› Lista de bases PubMed
 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/gquery?itool=toolbar



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                                           Exercícios

1.
- Pesquise artigos sobre malaria infections in africa.

- A partir da lista de resultados, verifique a disponibilidade em texto integral do artigo:
Predictive factors of imported malaria in 272 febrile returning travelers seen as
outpatients.

- Confira se o artigo já está indexado na Medline ([PubMed - in process] ou [PubMed -
indexed for MEDLINE]).



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                                         Exercícios

2.
- Encontre o artigo correspondente à seguinte referência bibliográfica:

Rotavirus gastroenteritis and seizures in young children.
Lloyd MB, Lloyd JC, Gesteland PH, Bale JF Jr.
Pediatr Neurol. 2010 Jun;42(6):404-8.




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                                         Exercícios

3.
- Pesquise artigos sobre SIDA, usando o thesaurus.

- Analise a informação do thesaurus sobre Acquired Immunodeficiency Syndrome e
efectue uma nova pesquisa cruzando este termo com transmission.




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                                        Exercícios

4.
- Verifique se a revista PLOS Biology está indexada na PubMed.

- Pesquise artigo nesta revista sobre Immunohistochemistry.




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            A PubMed – Subscrição de feeds RSS


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1   A PubMed – exportação para EndNote                           2




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dúvidas e informações
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PubMed + MeSH Thesaurus

  • 1. PubMed + MeSH Thesaurus Imagem: Stock.XCHNG - http://www.sxc.hu/ maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro
  • 2. PubMed MeSH Thesaurus O que é a PubMed? A PubMed é uma base de dados de bibliografia especializada na área da biomedicina, com informação também sobre biomateriais e informática médica, contendo mais de 18.200.000 de artigos. Produzida pela National Library of Medicine (http://www.nlm.nih.gov/) dos Estados Unidos, em conjunto com editores de literatura biomédica, começa por ser uma inteface de acesso à Medline, incluindo também a Oldmedline e citações avulsas. Contém registos desde 1865 e é uma poderosa ferramenta de pesquisa de artigos científicos e outra bibliografia, incluindo revistas em texto integral dos editores participantes. A PubMed faz ligação a todos os artigos que estejam em Open Access disponibilizados no arquivo PubMedCentral (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/) assim como às revistas subscritas em formato electrónico pela Universidade de Aveiro ou pela B-on (com acesso ua.pt). maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro
  • 3. PubMed MeSH Thesaurus A Medline A Medline é uma base de dados da National Library of Medicine e que resulta da PubMed. Inclui apenas artigos científicos com peer-review e nas áreas da biomedicina e as referências nela incluídas passam por um processo de análise e indexação mais consistente. Abrange menos publicações do que a PubMed, mas as que reúne são da máxima pertinência. Uma das mais-valias da Medline é a ligação ao texto integral dos artigos das revistas que estão incluídas no consórcio B-on. maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro
  • 4. PubMed MeSH Thesaurus O acesso à Medline com interface EBSCO O acesso está limitado ao domínio ua.pt ou, a partir do exterior, desde que configure o seu computador pessoal à rede VPN. O manual de configuração VPN está disponível na página do CICUA – www.cic.ua.pt > manuais&forms > manuais. maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro
  • 5. PubMed MeSH Thesaurus O acesso à Medline com interface EBSCO http://search.epnet.com (ua.pt) maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro
  • 6. PubMed MeSH Thesaurus A Medline com interface EBSCO › Artigos científicos nas áreas da medicina, enfermagem, medicina veterinária, cuidados de saúde, medicina dentária; › Indexa 4.800 revistas biomédicas e inclui citações das bases de dados Index Medicus, International Nursing Index, Index to Dental Literature, PREMEDLINE, AIDSLINE, BIOETHICSLINE, e HealthSTAR; › Contem cerca de 1.900 revistas da base de dados de enfermagem CINAHL; › Analisa artigo a artigo e indexa-os com termos controlados através do thesaurus MeSH; › Interface de pesquisa em várias línguas, incluindo o português; maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro
  • 7. PubMed MeSH Thesaurus A Medline com interface EBSCO › Filtro por texto integral, tipologia do documento, data, etc.; › Possibilidade de pesquisa com operadores boleanos (and, or, not), truncatura (*) e termo composto ou pesquisa por frase (“ “); › Acesso ao texto integral de documentos em acesso livre; › Acesso ao texto integral das publicações subscritas pela UA e das que fazem parte da B-on – Biblioteca do Conhecimento Online; maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro
  • 8. PubMed MeSH Thesaurus A Medline com interface EBSCO › Thesaurus; › Cruzamento da pesquisa com outras bases de dados EBSCO; › Subscrição de feeds RSS; › Exportação para EndNote; › Espaço pessoal. maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro
  • 9. PubMed MeSH Thesaurus O acesso à PubMed http://pubmed.gov (acesso universal e gratuito) maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro
  • 10. PubMed MeSH Thesaurus A PubMed › Inclui a MEDLINE, a OLDMEDLINE e citações avulsas; › A OLDMEDLINE contém artigos anteriores a 1966 (1865 a 1965) de cerca de 80 países; › Possibilidade de pesquisa em várias publicações, que podem ir dos artigos científicos aos pré-prints e livros; › São também incluídas desde logo na PubMed as citações in-process e as citações fornecidas pelos editores; maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro
  • 11. PubMed MeSH Thesaurus A PubMed › As citações avulsas compreendem as citações out-of-scope (por exemplo, de artigos sobre geofísica, arqueologia, astronomia) de alguns periódicos indexados na MEDLINE, cujos artigos relacionados com as ciências da saúde já são indexados. Incluem também citações que precedem o ano a partir do qual um dado periódico passou a ser integrado na MEDLINE (catalogação retrospectiva) e citações de outros periódicos não incluídos na MEDLINE, mas que submetem o seu texto integral à PubMedCentral e são avaliados positivamente pela NLM; › As citações in-process fornecem a citação básica e, na maior parte dos casos, o resumo do artigo, antes mesmo da introdução dos assuntos (termos MeSH). Estes registos são acrescentados diariamente e contêm a indicação [PubMed – in process]. À medida que os dados vão sendo acrescentados e os registos ficam completos, passam a conter a indicação [PubMed – indexed for MEDLINE]; maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro
  • 12. PubMed MeSH Thesaurus A PubMed › Filtro por texto integral, tipologia do documento, data, etc.; › Possibilidade de pesquisa com operadores boleanos (and, or, not), truncatura (*) e termo composto ou pesquisa por frase (“ “); › Acesso ao texto integral de algumas publicações subscritas pela UA ou que fazem parte da B-on – Biblioteca do Conhecimento Online (desde que no dominio ua.pt); maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro
  • 13. PubMed MeSH Thesaurus A PubMed › Acesso ao texto integral de documentos em acesso livre; › Possibilidade de pesquisa em outras bases de dados e clinical trials; › Thesaurus; › Subscrição de feeds RSS; › Exportação para EndNote; › Espaço pessoal. maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro
  • 14. PubMed MeSH Thesaurus O thesaurus MeSH Vocabulário controlado O MeSH (Medical Subject Headings) é o vocabulário controlado que é utilizado para indexar os artigos da PubMed e da Medline. A terminologia controlada que é usada no thesaurus MeSH dá a possibilidade de recuperar informação sobre um determinado assunto de uma forma sistemática, eliminando os registos que não são pertinentes para aquele tópico. É uma óptima ferramenta de apoio para a realização de pesquisas na PubMed e Medline pois diminui ou limita o ruído, proporcionando maior precisão. maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro
  • 15. PubMed MeSH Thesaurus Quando usar e quando não usar o MeSH… Use o MeSH quando... Use palavras quando... ... precisa de efectuar uma pesquisa ... pretende informação sobre um conceito exaustiva e precisa sobre um determinado médico novo ou emergente, para o qual ainda tópico (os documentos ainda não indexados não serão não existe um termo MeSH. apresentados). ... necessita de efectuar uma pesquisa ... quer obter registos de artigos publicados elaborada, combinando vários aspectos de recentemente. Uma pesquisa por termo MeSH diferentes tópicos ou assuntos. não consegue recuperar citações com a indicação «Pubmed – in process», às quais ainda não foram associados termos MeSH. ... quer encontrar rapidamente um aspecto ... suspeita de que há pouca informação específico de um tópico genérico. publicada relativa ao tópico que lhe interessa. maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro
  • 16. PubMed MeSH Thesaurus A pesquisa 1 – Por autor Use o último nome do autor, mais iniciais sem pontuação – Ex: Lederberg J 2 – Por assunto Digite o termo seleccionado na caixa de pesquisa e opte por uma das sugestões apresentadas. Identifique o conceito e utilize o thesaurus MeSH para uma pesquisa direccionada maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro
  • 17. PubMed MeSH Thesaurus A pesquisa 3 – Localização de artigos através do título de uma revista Através da pesquisa do título completo, da abreviatura ou do ISSN de uma revista, a PubMed apresenta uma relação de todos os artigos nela publicados, desde que indexados na base de dados. 4 - Localização de revistas por título Aceda à base de dados das revistas em http://www.ncbi.nlm.nih.gov/journals e digite o título. maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro
  • 18. PubMed MeSH Thesaurus A pesquisa 5 - Localização de um artigo através de informações bibliográficas já existentes Quando já tem o título da revista, volume, número e páginas, use o Single Citation Matcher para localizar o artigo - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/pubmedutils/citmatch. 6 – Pesquisa avançada A pesquisa avançada para além de permitir a combinação de vários campos numa mesma equação (autor, título, assunto…) através de operadores boleanos, permite também a consulta do histórico das pesquisas realizadas. A Search Builder permite através do termo de pesquisa, da selecção do campo e da opção “Index”, uma listagem associada ao termo pesquisado (índices alfabéticos), onde informa também o número de citações para cada termo e campo. maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro
  • 19. PubMed MeSH Thesaurus A pesquisa Símbolos de pesquisa da PubMed: AND, OR e NOT como operadores boleanos (ex: cerebral angiography and moniz); *como truncatura (ex: child* recupera registos com os termos child, children, childhood, etc.; “ ” para uma frase exacta ou termo composto. maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro
  • 20. PubMed MeSH Thesaurus O texto integral dos artigos No registo completo do artigo, a existência do icon de “free-text article” ou ”full- text article” dá acesso ao texto integral, caso seja uma revista disponível em acesso livre ou uma publicação subscrita em formato electrónico pela Universidade de Aveiro ou pela B- on. maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro
  • 21. PubMed MeSH Thesaurus Tutoriais de apoio › Tutoriais PubMed http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html http://nnlm.gov/training/resources/pmtri.pdf http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=helppubmed&part=pubmedhelp › Citation Matcher http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/pubmedutils/citmatch › Lista de bases PubMed http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/gquery?itool=toolbar maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro
  • 22. PubMed MeSH Thesaurus Exercícios 1. - Pesquise artigos sobre malaria infections in africa. - A partir da lista de resultados, verifique a disponibilidade em texto integral do artigo: Predictive factors of imported malaria in 272 febrile returning travelers seen as outpatients. - Confira se o artigo já está indexado na Medline ([PubMed - in process] ou [PubMed - indexed for MEDLINE]). maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro
  • 23. PubMed MeSH Thesaurus Exercícios 2. - Encontre o artigo correspondente à seguinte referência bibliográfica: Rotavirus gastroenteritis and seizures in young children. Lloyd MB, Lloyd JC, Gesteland PH, Bale JF Jr. Pediatr Neurol. 2010 Jun;42(6):404-8. maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro
  • 24. PubMed MeSH Thesaurus Exercícios 3. - Pesquise artigos sobre SIDA, usando o thesaurus. - Analise a informação do thesaurus sobre Acquired Immunodeficiency Syndrome e efectue uma nova pesquisa cruzando este termo com transmission. maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro
  • 25. PubMed MeSH Thesaurus Exercícios 4. - Verifique se a revista PLOS Biology está indexada na PubMed. - Pesquise artigo nesta revista sobre Immunohistochemistry. maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro
  • 26. PubMed MeSH Thesaurus A PubMed – Subscrição de feeds RSS 1 2 maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro
  • 27. PubMed MeSH Thesaurus A PubMed – Subscrição de feeds RSS 3 4 5 6 maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro
  • 28. PubMed MeSH Thesaurus 1 A PubMed – exportação para EndNote 2 3 maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro
  • 29. PubMed MeSH Thesaurus 4 6 5 maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro
  • 30. PubMed MeSH Thesaurus Questionário http://portal.doc.ua.pt/formquest.asp maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro
  • 31. PubMed MeSH Thesaurus Estes conteúdos estão protegidos por uma licença Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/ As imagens pertencem a Stock.XCHNG - http://www.sxc.hu/ maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro
  • 32. dúvidas e informações referencia@doc.ua.pt 2010 Serviços de Biblioteca, Informação Documental e Museologia Imagem: Stock.XCHNG - http://www.sxc.hu/ Universidade de Aveiro maio 2010 – bibliotecas universidade de aveiro