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Modelagem de Doenças
Infecciosas e Calibração
Tazio Vanni, MD, PhD
Contexto: A modelagem matemática tem sido amplamente
utilizada na tomada de decisão em saúde, permitindo não
apenas integrar dados de diferentes estudos, mas também
projetar custos e benefícios no futuro, considerando
diferentes cenários.
Objetivo 1: Capacitar os participantes para que possam
compreender e construir modelos matemáticos que
representem a dinâmica populacional das doenças
infecciosas, especialmente no contexto da Avaliação
Econômica em Saúde.
Objetivo 2: Capacitar os participantes para que possam
validar/calibrar seus modelos no contexto da Avaliação
Econômica em Saúde.
Softwares utilizados: Excel VBA, Gephi e Netlogo.
Dia 1
Tarde (3 horas)
• Modelagem matemática: colocando em contexto
• Pré-teste – Validação e Calibração
• Aula – Incerteza, Validação e Calibração
• Exercício – Validação e Calibração
• Discussão dos Resultados do Exercício e Pré-teste
Dia 2
Manhã (3 horas)
• Pré-teste – Modelagem de Doenças Infecciosas
• Aula – Modelagem de Doenças Infecciosas
• Exercício – Modelo Dinâmico Fechado
• Discussão dos Resultados do Exercício e Pré-teste
Tarde (3 horas)
• Exercício – Modelo Dinâmico Aberto
• Análise Crítica do Artigo – Vaccine 2012
Dia 3
Manhã (3 horas)
• Exercício – Modelo Dinâmico Estocástico
• Análise do Modelo do Artigo – Vaccine 2012
Tarde (3 horas)
• Aula – Análise de Redes Sociais e Modelagem em Rede
• Exercício – Análise de Redes Sociais e Modelagem em Rede
• Discussão dos Resultados do Exercício
• Encerramento
Modelagem matemática: colocando em contexto
Tazio Vanni
Estrutura
• Definição
• Elementos
• Propósito (class.)
• Tipos (class.)
• Metodologias
• Aplicações
Definição
• “A representation of the essential aspects of
an existing system (or a system to be
constructed) which presents knowledge of
that system in usable form”
Pieter Eykhoff
• “All models are wrong, some are useful”
George Box
Elementos
• Modelos são baseados:
– Conhecimento atual sobre a doença
– Parametros + alvos de validação/calibração
– Pressupostos
Propósito do modelo
• Teoria Científica
– Hipótese estrutural
– Hipótese paramétrica
• Tomada de Decisão
– Vacinação
– Rastreamento
– Tratamento
– Intervenções complexas
Tipos de modelos
• Linear vs. non-linear
• Population-based vs. individual-based
• Deterministic vs. stochastic
• Static vs. dynamic
• Close vs. open
• Discrete-time vs discrete-event
CD4 ≥ 200
CD4 < 200
AIDS
Death
Miners et al. HIV Med 2001;2:52–58
0.01
0.012
0.202
0.407
0.25
0.067
0.721
0.581
0.750
A
B
C
D
Recovered/ImmuneSusceptible Infectious

Birth
Susceptible 16 HPV 16 CIN 1 16 CIN 2 16 CIN 3
6&11 HPV Genital Warts
18 HPV 18 CIN 1 18 CIN 2 18 CIN 3
C Cancer
DeathDeath
Death Death Death
Death Death Death Death
Death
DeathDeath CC
Death
Vanni et al. Vaccine 2012; 30:4866–71
Kim et al. AJE 2007; 166:137–150
J. R. Soc. Interface (2008) 5, 1001–1007
The Spread of Obesity in a Large Social
Network over 32 Years
30http://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMsa066082
Modelo Pandemia Ebola 2014
http://blog.wolfram.com/2014/11/04/modeling-a-pandemic-like-ebola-with-the-wolfram-language/
Tem certeza?
CD4 ≥ 200
CD4 < 200
AIDS
Death
Miners et al. HIV Med 2001;2:52–58
0.01
0.012
0.202
0.407
0.25
0.067
0.721
0.581
0.750
A
B
C
D
Durkee et al. JCO 2015; 33:7397
Luz, Vanni et al. Lancet 2011; 377: 1673–80
Expressões
–Validação
–Calibração ou fitting
–Validação cruzada
–Calibração Bayesiana
O que é calibração?
1. Compara as estimativas produzidas pelo
modelo (por exemplo, taxa de prevalência de
doença) com dados empíricos.
2. Explora a variação dos parâmetros do
modelo
3. Identificar combinações de parâmetros do
modelo que proporcionem um melhor ajuste
aos dados
Vanni et al. IJC 2011; 129:671–9
Vanni et al. IJC 2011; 129:671–9
Vanni et al. IJC 2011; 129:671–9
To travel hopefully is a better thing than to arrive,
and the true success is to labour.
•Robert Louis Stevenson
El Dorado (Chapter VI of Virginibus Puerisque and Other Essays)

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Modelagem Matemática de Doenças Infecciosas e Calibração

  • 1. Modelagem de Doenças Infecciosas e Calibração Tazio Vanni, MD, PhD
  • 2. Contexto: A modelagem matemática tem sido amplamente utilizada na tomada de decisão em saúde, permitindo não apenas integrar dados de diferentes estudos, mas também projetar custos e benefícios no futuro, considerando diferentes cenários.
  • 3.
  • 4.
  • 5. Objetivo 1: Capacitar os participantes para que possam compreender e construir modelos matemáticos que representem a dinâmica populacional das doenças infecciosas, especialmente no contexto da Avaliação Econômica em Saúde. Objetivo 2: Capacitar os participantes para que possam validar/calibrar seus modelos no contexto da Avaliação Econômica em Saúde. Softwares utilizados: Excel VBA, Gephi e Netlogo.
  • 6.
  • 7.
  • 8.
  • 9.
  • 10.
  • 11.
  • 12. Dia 1 Tarde (3 horas) • Modelagem matemática: colocando em contexto • Pré-teste – Validação e Calibração • Aula – Incerteza, Validação e Calibração • Exercício – Validação e Calibração • Discussão dos Resultados do Exercício e Pré-teste
  • 13. Dia 2 Manhã (3 horas) • Pré-teste – Modelagem de Doenças Infecciosas • Aula – Modelagem de Doenças Infecciosas • Exercício – Modelo Dinâmico Fechado • Discussão dos Resultados do Exercício e Pré-teste Tarde (3 horas) • Exercício – Modelo Dinâmico Aberto • Análise Crítica do Artigo – Vaccine 2012
  • 14. Dia 3 Manhã (3 horas) • Exercício – Modelo Dinâmico Estocástico • Análise do Modelo do Artigo – Vaccine 2012 Tarde (3 horas) • Aula – Análise de Redes Sociais e Modelagem em Rede • Exercício – Análise de Redes Sociais e Modelagem em Rede • Discussão dos Resultados do Exercício • Encerramento
  • 15. Modelagem matemática: colocando em contexto Tazio Vanni
  • 16. Estrutura • Definição • Elementos • Propósito (class.) • Tipos (class.) • Metodologias • Aplicações
  • 17. Definição • “A representation of the essential aspects of an existing system (or a system to be constructed) which presents knowledge of that system in usable form” Pieter Eykhoff • “All models are wrong, some are useful” George Box
  • 18. Elementos • Modelos são baseados: – Conhecimento atual sobre a doença – Parametros + alvos de validação/calibração – Pressupostos
  • 19. Propósito do modelo • Teoria Científica – Hipótese estrutural – Hipótese paramétrica • Tomada de Decisão – Vacinação – Rastreamento – Tratamento – Intervenções complexas
  • 20. Tipos de modelos • Linear vs. non-linear • Population-based vs. individual-based • Deterministic vs. stochastic • Static vs. dynamic • Close vs. open • Discrete-time vs discrete-event
  • 21.
  • 22. CD4 ≥ 200 CD4 < 200 AIDS Death Miners et al. HIV Med 2001;2:52–58 0.01 0.012 0.202 0.407 0.25 0.067 0.721 0.581 0.750 A B C D
  • 23.
  • 25. Birth Susceptible 16 HPV 16 CIN 1 16 CIN 2 16 CIN 3 6&11 HPV Genital Warts 18 HPV 18 CIN 1 18 CIN 2 18 CIN 3 C Cancer DeathDeath Death Death Death Death Death Death Death Death DeathDeath CC Death Vanni et al. Vaccine 2012; 30:4866–71 Kim et al. AJE 2007; 166:137–150
  • 26.
  • 27.
  • 28.
  • 29. J. R. Soc. Interface (2008) 5, 1001–1007
  • 30. The Spread of Obesity in a Large Social Network over 32 Years 30http://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMsa066082
  • 31. Modelo Pandemia Ebola 2014 http://blog.wolfram.com/2014/11/04/modeling-a-pandemic-like-ebola-with-the-wolfram-language/
  • 33. CD4 ≥ 200 CD4 < 200 AIDS Death Miners et al. HIV Med 2001;2:52–58 0.01 0.012 0.202 0.407 0.25 0.067 0.721 0.581 0.750 A B C D
  • 34. Durkee et al. JCO 2015; 33:7397
  • 35. Luz, Vanni et al. Lancet 2011; 377: 1673–80
  • 37. O que é calibração? 1. Compara as estimativas produzidas pelo modelo (por exemplo, taxa de prevalência de doença) com dados empíricos. 2. Explora a variação dos parâmetros do modelo 3. Identificar combinações de parâmetros do modelo que proporcionem um melhor ajuste aos dados
  • 38. Vanni et al. IJC 2011; 129:671–9
  • 39. Vanni et al. IJC 2011; 129:671–9
  • 40. Vanni et al. IJC 2011; 129:671–9
  • 41. To travel hopefully is a better thing than to arrive, and the true success is to labour. •Robert Louis Stevenson El Dorado (Chapter VI of Virginibus Puerisque and Other Essays)

Notas do Editor

  1. The Spread of Obesity in a Large Social Network over 32 Years Nicholas A. Christakis, M.D., Ph.D., M.P.H., and James H. Fowler, Ph.D. A person’s chances of becoming obese increased by 57% (95%) if he or she had a friend who became obese in a given interval. Among pairs of adult siblings, if one sibling became obese, the chance that the other would become obese increased by 40% (95%). If one spouse became obese, the likelihood that the other spouse would become obese increased by 37% (95%). yellow denotes an obese person (body-mass index, ≥30) green denotes a nonobese person