A EBSERH é responsável pela gestão de hospitais universitários federais mediante contratos. A legislação aplicada à EBSERH inclui a Lei 12.550/2011, que criou a empresa, e o Decreto 7.661/2011, que aprovou seu estatuto social. A EBSERH deve obedecer à legislação de licitações e contratação de pessoal, podendo celebrar contratos temporários por até 5 anos para implantação.