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Uso dos marcadores de DNA
(ClarifideTM) na seleção genética


              Priscila Barros
      Happy-hour BeefPoint do mercado pecuário
                Feicorte – São Paulo
                    Junho/2011




                                                 1
1ª        2ª
geração   geração




 + 10     + 15
»  Desempenho.

»  Programas de
   Melhoramento Genético
   (DEPs).


»  Avaliações de DNA.
Como a seleção genômica pode ajudar?

 »  Identificação PRECOCE de animais
    geneticamente superiores para características
    de reprodução com auxílio da seleção
    genômica;




                                               4
CLARIFIDE Nelore: marcadores de
    DNA para características
  economicamente importantes.
90% da População   A   A   A     A   A   C   A   A   A   A




10% da População   A   A   A     A   A   C   T   A   A   A




                               Polimorfismo de nucleotídeo único
Qual o objetivo do pecuarista brasileiro?
             Comercial   (N=47)                       Selecionador         (N=53)



        38         25        23    14                  44            22   19    15




0            25    50         75        100   0         25      50        75         100


    Reprodução      Eficiência Alimentar          Crescimento    Qualidade de Carne

                         Único e de maior importância




                                                                                     7
Característica              Unidade    Min     Max         Conf (%)

Probabilidade de Parto Precoce (PPP)     %       42.24    61.07         49

    Idade ao Primeiro Parto (IPP)      Meses     -2.47    1.34          57

         Stayability (STAY)              %       46.19    63.74         70

  Produtividade Acumulada (PAC)          Kg      -6.58    12.52         62

      Peso aos 120 dias (P120)           Kg      -6.75    10.35         54

      Peso aos 365 dias (P365)           Kg      -7.91    14.00         54

      Peso aos 450 dias (P450)           Kg      -16.41   25.21         47

    Habilidade Materna (HM120)           Kg      -2.18    4.77          36
Circunferência Escrotal aos 365 dias
                                         cm      -0.39    0.97          48
              (CE365)
Circunferência Escrotal aos 450 dias
                                         cm      -1.17    2.00          49
              (CE450)
   Área de Olho de Lombo (AOL)          cm2      -2.94    3.69          51

   Espessura de Gordura (GORD)           mm      -0.68    0.51          44

 Índice Reprodutivo Pfizer - iMVPREP     Kg       29      272     8




                                                                             8
Índice Reprodutivo Pfizer - iMVPREP
                                 Associação do potencial genético com a
Indice Reprodutivo Pfizer
                            kg   fertilidade, precocidade sexual, permanência e
(iMVPREP)
                                 produtividade.


Característica                       Contribuição
Idade ao Primeiro Parto (IPP)              17%
Probabilidade de Parto Precoce (PPP)       16%
Stayability (STAY)                         48%
Habilidade Materna (HM 120)                5%
Peso aos 120 dias (P 120)                  7%
Peso aos 365 dias (P 365)                  7%


                                                                              9
Parceiros




                   -  Henrique Nunes (UNESP Jaboticabal)
                      -  José Buratini Jr. (UNESP Botucatu)
             -  José Luis M. Vasconcelos (UNESP Botucatu)
               -  José Fernando Garcia (UNESP Araçatuba)
     -  Marcos Vinicius Barbosa da Silva (EMBRAPA Gado de Leite)
                    -  Raysildo Barbosa Lobo (USP/ANCP)



                                                                   10
CLARIFIDE Nelore – MVP & DEP




          Autorizado por Colonial Agropecuária




                                                 11
Macuni do Salto
                                                                                                                                      Nasc. 09/02

                                                                                                                             iMVPREP = 202 (Rank 2%)

                                                                                                                             MGT = 13,55 (Top 2%)




            PPP	
              IPP	
           STAY	
              PAC	
           P120	
             P365	
             P450	
   HM120	
   CE365	
   CE450	
                                         AOL	
            GORD	
  

         MVP	
   Rank	
   MVP	
   Rank	
   MVP	
   Rank	
   MVP	
   Rank	
   MVP	
   Rank	
   MVP	
   Rank	
   MVP	
   Rank	
   MVP	
   Rank	
   MVP	
   Rank	
   MVP	
   Rank	
   MVP	
   Rank	
   MVP	
   Rank	
  



MVP	
   52,15	
   6	
   -­‐0,80	
   9	
     60,9	
      1	
     7,6	
     1	
     5,6	
     5	
     11,9	
     1	
     19,4	
     1	
     -­‐0,6	
   94	
     0,5	
     5	
     0,9	
       6	
     0,8	
     21	
   -­‐0,1	
   80	
  

DEP	
   52,95	
   4	
   -­‐1,43	
   0.5	
   65,20	
   0.1	
   7,04	
   0.5	
   7,61	
   0.5	
   18,86	
   0.5	
   21,31	
   0.5	
   -­‐1,65	
   100	
   0,76	
          1	
     0,53	
   10	
   -­‐0,35	
   70	
   -­‐0,34	
   100	
  




                                                                                                                                                                                                                          12
Animais         Peso na desmama              Peso ao desmama            Peso ao sobreano               PE ao ano
Série   RGN    Ajust.    Grupo    Class.     Ajust.   Grupo    Class.   Ajust.   Grupo   Class.    Obs.     Ajust.     Class.
RDM     4012    300.9      E       124       381.0      E       117     477.0     E       113      30.0      27.9        122

RDM     4030    285.6      E       117       353.0      S       109     431.0     S       102      26.0      24.0        105

RDM     4096    235.6      R        94       322.2      R        99     443.7     S       105      27.0      25.5        111

RDM     4153    275.0      E       112       351.7      S       108     476.6     E       113      23.0      23.2        101




   Animais     Área de olho de lombo - cm²      EG na costela - mm         EG na garupa - mm         PGIM - %         Ind. Repr.
Série   RGN    Ajust.    Grupo    Class.     Ajust.   Grupo    Class.   Ajust.   Grupo   Class.    Obs.     Class.     % Rank
RDM     4012    78.19      E       120       4.11       S       105     4.63      S       113      2.60      154          8

RDM     4030    78.25      E       120       2.85       I        73     3.37       I          82   1.32      78          14

RDM     4096    75.25      E       116       4.93       E       125     5.18      E       126      3.01      179         18

RDM     4153    74.65      E       115       5.10       E       130     4.34      S       106      1.45      86           5




                                                                                                                         13
Rancho da Matinha/MG




Mandarin FIV Matinha       Maia FIV Matinha
Nasc.: Out/2008            Nasc.: Set/2008
iMVPREP: 173 Kg – TOP 5%   iMVPREP: 158 Kg – TOP 8%




                                                      14
Fazenda Camparino/MT




                Teatro JHV – Top 1% iMVPREP
                Nasc: Abr/2009


    1o TOP 1% Pfizer Clarifide depois do lançamento


                                                      15
253 Novilhas

                                                      38 Touros
 53 Descarte                 200 EM
                                         Cabeceira      Meio       Fundo
                             8 Lotes

                                                       iMVPREP      iMVPREP
 iMVPREP                      iMVPREP     iMVPREP        99 Kg        69 Kg
  74 Kg        + 33 kg         107 Kg      137 Kg     (Rank 52%)   (Rank 87%)
(Rank 83%)                  (Rank 43%)   (Rank 16%)
Progênies e
         Pedigree                +          Fenótipo                +          colaterais




                                         DEP
Adaptado do 17o Seminário Nacional de Criadores e Pesquisadores – Incorporação de marcadores de DNA na
Avaliação Genética




                                                                                                         17
Progênies e
         Pedigree                  +        Fenótipo               +           colaterais
                                                 +



                               DEP/AG
Adaptado do 17o Seminário Nacional de Criadores e Pesquisadores – Incorporação de marcadores de DNA na
Avaliação Genética



                                                                                                         18
Característica              Média de Acurácia     Acréscimo (%)
                      Sem MVP           Com MVP
    STAY                 0,13              0,21        62
     IPP                 0,16              0,25        56
     3P                  0,16              0,19        19
    PAC                  0,14              0,19        36

   Fonte: ANCP & Pfizer (2011)




                                                              19
•  Aumento da Acurácia de animais jovens e da
   Pressão de Seleção

•  Redução do intervalo de gerações


•  Redução do tempo do teste de progênie


•  MAIOR GANHO GENÉTICO



                                                20

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Uso de marcadores de DNA na seleção genética de gado

  • 1. Uso dos marcadores de DNA (ClarifideTM) na seleção genética Priscila Barros Happy-hour BeefPoint do mercado pecuário Feicorte – São Paulo Junho/2011 1
  • 2. 2ª geração geração + 10 + 15
  • 3. »  Desempenho. »  Programas de Melhoramento Genético (DEPs). »  Avaliações de DNA.
  • 4. Como a seleção genômica pode ajudar? »  Identificação PRECOCE de animais geneticamente superiores para características de reprodução com auxílio da seleção genômica; 4
  • 5. CLARIFIDE Nelore: marcadores de DNA para características economicamente importantes.
  • 6. 90% da População A A A A A C A A A A 10% da População A A A A A C T A A A Polimorfismo de nucleotídeo único
  • 7. Qual o objetivo do pecuarista brasileiro? Comercial (N=47) Selecionador (N=53) 38 25 23 14 44 22 19 15 0 25 50 75 100 0 25 50 75 100 Reprodução Eficiência Alimentar Crescimento Qualidade de Carne Único e de maior importância 7
  • 8. Característica Unidade Min Max Conf (%) Probabilidade de Parto Precoce (PPP) % 42.24 61.07 49 Idade ao Primeiro Parto (IPP) Meses -2.47 1.34 57 Stayability (STAY) % 46.19 63.74 70 Produtividade Acumulada (PAC) Kg -6.58 12.52 62 Peso aos 120 dias (P120) Kg -6.75 10.35 54 Peso aos 365 dias (P365) Kg -7.91 14.00 54 Peso aos 450 dias (P450) Kg -16.41 25.21 47 Habilidade Materna (HM120) Kg -2.18 4.77 36 Circunferência Escrotal aos 365 dias cm -0.39 0.97 48 (CE365) Circunferência Escrotal aos 450 dias cm -1.17 2.00 49 (CE450) Área de Olho de Lombo (AOL) cm2 -2.94 3.69 51 Espessura de Gordura (GORD) mm -0.68 0.51 44 Índice Reprodutivo Pfizer - iMVPREP Kg 29 272 8 8
  • 9. Índice Reprodutivo Pfizer - iMVPREP Associação do potencial genético com a Indice Reprodutivo Pfizer kg fertilidade, precocidade sexual, permanência e (iMVPREP) produtividade. Característica Contribuição Idade ao Primeiro Parto (IPP) 17% Probabilidade de Parto Precoce (PPP) 16% Stayability (STAY) 48% Habilidade Materna (HM 120) 5% Peso aos 120 dias (P 120) 7% Peso aos 365 dias (P 365) 7% 9
  • 10. Parceiros -  Henrique Nunes (UNESP Jaboticabal) -  José Buratini Jr. (UNESP Botucatu) -  José Luis M. Vasconcelos (UNESP Botucatu) -  José Fernando Garcia (UNESP Araçatuba) -  Marcos Vinicius Barbosa da Silva (EMBRAPA Gado de Leite) -  Raysildo Barbosa Lobo (USP/ANCP) 10
  • 11. CLARIFIDE Nelore – MVP & DEP Autorizado por Colonial Agropecuária 11
  • 12. Macuni do Salto Nasc. 09/02 iMVPREP = 202 (Rank 2%) MGT = 13,55 (Top 2%) PPP   IPP   STAY   PAC   P120   P365   P450   HM120   CE365   CE450   AOL   GORD   MVP   Rank   MVP   Rank   MVP   Rank   MVP   Rank   MVP   Rank   MVP   Rank   MVP   Rank   MVP   Rank   MVP   Rank   MVP   Rank   MVP   Rank   MVP   Rank   MVP   52,15   6   -­‐0,80   9   60,9   1   7,6   1   5,6   5   11,9   1   19,4   1   -­‐0,6   94   0,5   5   0,9   6   0,8   21   -­‐0,1   80   DEP   52,95   4   -­‐1,43   0.5   65,20   0.1   7,04   0.5   7,61   0.5   18,86   0.5   21,31   0.5   -­‐1,65   100   0,76   1   0,53   10   -­‐0,35   70   -­‐0,34   100   12
  • 13. Animais Peso na desmama Peso ao desmama Peso ao sobreano PE ao ano Série RGN Ajust. Grupo Class. Ajust. Grupo Class. Ajust. Grupo Class. Obs. Ajust. Class. RDM 4012 300.9 E 124 381.0 E 117 477.0 E 113 30.0 27.9 122 RDM 4030 285.6 E 117 353.0 S 109 431.0 S 102 26.0 24.0 105 RDM 4096 235.6 R 94 322.2 R 99 443.7 S 105 27.0 25.5 111 RDM 4153 275.0 E 112 351.7 S 108 476.6 E 113 23.0 23.2 101 Animais Área de olho de lombo - cm² EG na costela - mm EG na garupa - mm PGIM - % Ind. Repr. Série RGN Ajust. Grupo Class. Ajust. Grupo Class. Ajust. Grupo Class. Obs. Class. % Rank RDM 4012 78.19 E 120 4.11 S 105 4.63 S 113 2.60 154 8 RDM 4030 78.25 E 120 2.85 I 73 3.37 I 82 1.32 78 14 RDM 4096 75.25 E 116 4.93 E 125 5.18 E 126 3.01 179 18 RDM 4153 74.65 E 115 5.10 E 130 4.34 S 106 1.45 86 5 13
  • 14. Rancho da Matinha/MG Mandarin FIV Matinha Maia FIV Matinha Nasc.: Out/2008 Nasc.: Set/2008 iMVPREP: 173 Kg – TOP 5% iMVPREP: 158 Kg – TOP 8% 14
  • 15. Fazenda Camparino/MT Teatro JHV – Top 1% iMVPREP Nasc: Abr/2009 1o TOP 1% Pfizer Clarifide depois do lançamento 15
  • 16. 253 Novilhas 38 Touros 53 Descarte 200 EM Cabeceira Meio Fundo 8 Lotes iMVPREP iMVPREP iMVPREP iMVPREP iMVPREP 99 Kg 69 Kg 74 Kg + 33 kg 107 Kg 137 Kg (Rank 52%) (Rank 87%) (Rank 83%) (Rank 43%) (Rank 16%)
  • 17. Progênies e Pedigree + Fenótipo + colaterais DEP Adaptado do 17o Seminário Nacional de Criadores e Pesquisadores – Incorporação de marcadores de DNA na Avaliação Genética 17
  • 18. Progênies e Pedigree + Fenótipo + colaterais + DEP/AG Adaptado do 17o Seminário Nacional de Criadores e Pesquisadores – Incorporação de marcadores de DNA na Avaliação Genética 18
  • 19. Característica Média de Acurácia Acréscimo (%) Sem MVP Com MVP STAY 0,13 0,21 62 IPP 0,16 0,25 56 3P 0,16 0,19 19 PAC 0,14 0,19 36 Fonte: ANCP & Pfizer (2011) 19
  • 20. •  Aumento da Acurácia de animais jovens e da Pressão de Seleção •  Redução do intervalo de gerações •  Redução do tempo do teste de progênie •  MAIOR GANHO GENÉTICO 20