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Produtos Naturais
Marinhos com Atividade
Anticâncer
LETICIA V. COSTA-LOTUFO & COLABORADORES
DEPARTAMENTO DE FARMACOLOGIA
INSTITUTO DE CIÊNCIAS BIOMÉDICAS
UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO
Sumário
• Produtos naturais no tratamento do Câncer
• Rede ProspecMar – abordagens integrativas na
prospecção de substâncias anticâncer
• Estudos Alvo-Direcionados
• Fator de transcrição TBX2
• Proteínas inibidoras de apoptose
Câncer em Números:
• Segunda causa de morte por doenças;
• O número de novos casos de câncer
chegará a 21 milhões nas próximas
duas décadas;
• Mais que 60% dos casos
diagnosticados ocorrem na Africa,
Asia, a América Central e do Sul; 70%
das mortes também ocorrem nessas
localidades.
https://www.cancer.gov/about-cancer/understanding/statistics
Tratamento do Câncer
https://www.alliedmarketresearch.com/oncology-cancer-drugs-market
• Resistência
• Toxicidade
• Custo
Fármacos Anti-Câncer:
Newman & Cragg, 2016. J. Nat. Prod., 79:629.
Propriedades Estruturais:
• Presença de centros estereogênicos
e maior complexidade estrutural que
as moléculas sintéticas;
• Maior quantidade de relativa de
carbono, hidrogênio e oxigênio que as
moléculas sintéticas;
• Tamanho (massa molecular > 500Da)
e polaridade (maior solubilidade em
água).
Clardy & Walsh. Nature, 432: 829.
Diversidade gênica
Diversidade biológica
Diversidade química
BIODIVERSIDADE MARINHA
+ -
Biodiversity
http://comlmaps.org/oceanlifemap/past-present-future
A CONQUISTA DO AMBIENTE
1950 DIAS ATUAIS…
Jacques Cousteau e Simone Cousteau
A CONQUISTA DO AMBIENTE
- Invenção do equipamento de
mergulho autônomo (1943);
- Revolução na exploração do
ambiente marinho;
It will happen, surgery will affix a set of
artificial gills to man's circulatory system-right
here at the neck-which will permit him to
breathe oxygen from the water like a fish.
Then the lungs will be by-passed and he will
be able to live and breathe in any depth for
any amount of time without harm.
- Advento dos submersíveis.
PRODUTOS NATURAIS MARINHOS
Quantidade de novos produtos naturais
marinhos isolados de 1965 a 2006.
Costa-Lotufo et al., 2009.
- 1as décadas:
Explosão de moléculas com
estruturas peculiares, alta potência,
alvos biológicos novos
- 1990-2000:
Calmaria, indústria
farmacêutica aposta na síntese
e química combinatória
- 2001-atual:
Ressurgimento do interesse da
indústria farmacêutica. Novo perfil,
empresas novas pequeno porte
ALVOS MOLECULARES:
Canais iônicos
Enzimas
Microtúbulos
DNA
Lisossomos
Calmodulina
Proteossomos
Estresse oxidativo
Modulação do sistema
imune
Prófase metáfase anáfase telófase
Ab
Aa
Newman & Cragg, 2006. Current Drug Targets 7: 279-304.
FÁRMACOS MARINHOS
(Martins et al., 2014)
Cryptotethya crypta
Espongotimidina
Espongouridina
Bergman & Feeney, 1951
NUCLEOSÍDEOS DE ESPONJA
Ara-a
(vidarabina®, thilo®)
Ara-c
(citarabina®, alexan®, udicil®)
AZT
(retrovir®, zidovir®)
Adenina arabinosídeo Citosina arabinosídeo Azidotimidina
Anticâncer Antiviral Antiviral
MECANISMO DE AÇÃO:
1. Cytarabine
internalization by
nucleosides transporter
• Inhibition of DNA duplication
• Inhibition of DNA transcription
• Apoptosis induction
Mechanisms of action
and effects of cytarabine
Cytarabine
Synthesis inspired by
natural products
Cytarabine
Arabinonucleosides isolated from
marine sponge Tectitethya cripta
O
N
N
O O
OH
HO
HO
H
1
O
N
N
O O
OH
HO
HO
H
2
O
N
N
O NH2
OH
HO
HO
.HCl
3
O
N
OH
HO
HO
N
N
N
NH2
4
Citoplasma
C
T
Citarabina
A B
Spongothymidine Spongouridine
O
N
OH
HO
HO
1
O
N
OH
HO
HO
2
O
N
N
O NH2
OH
HO
HO
.HCl
3
O
N
OH
HO
HO
N
N
N
NH2
4
Núcleo
Citoplasma
Transportador
de nucleosídeos
Citarabina
Trifosfato
DNA
polimerase
• Inibição da
duplicação d
• Inibição da
transcrição d
• Indução de
apoptose
2. Conversion to
cytarabine-5’-triphosphate
3. Fake nucleotide
incorporation in DNA
TRABECTEDINA
Trabectedina (ET-743)
Origem: Ascídia Ecteinascidia turbinata
Usos:
Aprovado pela EMEA, em 2007, para o tratamento de sarcoma de tecidos
moles.
Aprovado pelo FDA em 2015.
SUPRIMENTO – ET743
Rendimento a partir da coleta - 0.0001%
Aquacultura:
◦ Hastes ou redes submersas
◦ Recifes artificias de concreto
Produtividade:
◦ 2001 – 80 ton métricas
◦ 2004 – 100 ton métricas
◦ Máximo – 250 ton métricas
Rendimento:
◦ 0.5 and 4.0 μg g-1 Quantidades suficientes para testes
clínicos!!!
Economicamente inviável para
comercialização.
Cuevas & Francesch, 2009. NPR 26: 322-337.
Elias James Corey
Emeritus Professor Harvard U.
Nobel Prize in Chemistry, 1990 Pseudomonas fluorescens
Cianosafracina B Trabectedina
Mechanism of action
Bind covalently to the exocyclic amino group of guanines in the minor groove of DNA
D’Inalci et al., 2014, British J Cancer 111: 646
D’Inalci and Galmarini, 2010, Mol Cancer Ther; 9(8); OF1–7.
Blockade and degradation of
RNA polymerase II
Larsen et al., Cancer Chemother Pharmacol (2016) 77:663–671
Mechanism of Action
D’Inalci and Galmarini ., 2010, Mol Cancer Ther; 9(8); OF1–7.
Características únicas:
vTrabectedina - primeira substância descrita capaz de deslocar
fatores de transcrição oncogênico de seus promotores
vCélulas deficientes no sistema de reparo (nucleotide excision
repair – NER) são geralmente mais sensíveis a cisplatina
enquanto são resistentes a trabectedina
vCélulas deficientes no sistema de recombinação heteróloga
(HR) (por ex., com mutação nos genes BRCA1 ou BRCA2) são
sensíveis a trabectedina assim como a compostos de platina
D’Inalci et al., 2014, British J Cancer 111: 646
http://www.pharmamar.com
Sede: Madrid - Espanha
Trabectedina
(ET-743, Ecteinascidina)
USO CLÍNICO:
YONDELIS® é o único tratamento recentemente aprovado
especificamente para liposarcoma inoperável ou metástico ou
leiomiosarcoma após tratamento com antraciclina
Presença da proteína quimérica FUS-CHOP ou EWS-CHOP – atuam
como fatores anormais de transcrição. A trabectedina bloqueia a
habilidade dessas quimeras de ativar a transcrição, reativando a
rediferenciação.
www.yondelis.com
Halichondria okadai Lissodendoryx
• 1985 - Uemura et al. – 600 Kg de
esponja
• 1987 – Munro & Blunt – encontram
halicondrinas em esponjas do gênero
Lissodendoryx (200Kg)
• 1 tonelada de esponja – 310 mg de
halicondrina B
HALICONDRINA
Halichondria okadai Lissodendoryx
• 1985 - Uemura et al. – 600 Kg de
H. okadai
• 1987 – Munro & Blunt –
Lissodendoryx (200Kg)
• 1 ton de esponja – 310 mg de
halicondrina B
Halaven®
2011– Aprovado
para tratamento
de cancer de
mama metastático
HO
HO
HO
O
O
O
O
O
O
O
H
H
H
H
H
H
H
H
O
O
O
O
O O
H
H
O
H
H
O
O
H
H
H
6
O
O
+
H3N
O
OH
O
O O
H
H
O
H
O
O
O
MeSO3
-
7
Eribulina
Despolimerização
preservada Formação de agregados
de Eribulina com tubulina
Inibição da
polimerização
Sequestro de tubulina
• Inibição persistente da divisão celular
• Apoptose
HALAVEN®
A Eisai está comercializando o mesilato de eribulina desde 2010 nos
EUA;
Em 2011, o Halaven foi aprovado na europa, Singapura e Japão.
Indicação: câncer de mama
refratário a quimioterapia
com antraciclinas e
taxanos.
Adcetris®
Senter & Sievers, 2012. Nature Biotechnology, 30, 631.
CD30
MMAE
1. Reconhecimento
do ADCetris por
células tumorais 2. Internalização
3. Liberação
da MMAE 4. Bloqueio da
polimerização
dos microtúbulos
• Inibição da mitose seguida por
apoptose de células CD30+
meio extracelular citoplasma
Compound
Name
Trademark
(FDA Approved
Year)
Marine
Organism
Chemical
Class
Molecular
Target
Disease
Area
Plinabulin
(NPI-2358)
NA Fungus Diketopiperazine Microtubules
Cancer: Non-Small Cell
Lung Cancer, Brain
Tumor
Tetrodotoxin HalneuronTM
Pufferfish
Guanidinium
alkaloid
Sodium Channel Pain: Chronic Pain
Lurbinectedin
(PM01183)
NA Tunicate Alkaloid
RNA Polymerase
II
Cancer: Ovarian Cancer,
Breast Cancer, SCLC
Depatuxizumab
mafodotin
(ABT-414)
NA
Mollusk/
cyanobacteriu
m
ADC (MMAF)
EGFR &
microtubules
Cancer: Glioblastoma,
Pediatric Brain Tumors
Polatuzumab
vedotin
(DCDS-4501A)
NA
Mollusk/
cyanobacteriu
m
ADC (MMAE)
CD79b &
microtubules
Cancer: Non-Hodgkin
lymphoma, Chronic
lymphocytic leukemia,
Lymphoma, B-Cell,
lymphoma, Follicular
http://marinepharmacology.midwestern.edu/clinical_pipeline.html
MICRORGANISMOS MARINHOS
FLEMING E A DESCOBERTA DA
PENICILINA
Tudo começou com a descoberta da penicilina, um importante antibiótico, por Alexander
Fleming em 1929. Nos últimos 60 anos, entre 30.000 e 50.000 produtos naturais foram
descobertos a partir de microrganismos. Mais de 10.000 destes compostos são
biologicamente ativos e mais de 8.000 são compostos antitumorais e antibióticos (Fenical,
1993; Fenical & Jensen, 1994, Fenical, 2006).
MICRORGANISMOS MARINHOS
abundâncias estimadas em 106 microorganismos/mL de água do
mar e 109/cm3 de sedimento (Fenical & Jensen, 2006).
• compreendem diferentes
habitats, incluindo a
interface água-ar, a coluna
d’água que pode chegar a
10.000 metros, e os
complexos sedimentos do
assoalho marinho (Ward &
Bora, 2006).
BIOIVERSIDADE:
MICRORGANISMOS MARINHOS
DIVERSIDADE QUÍMICA
SUSTENTABILIDADE
Fermentação líquida
PROSPECÇÃO GENÔMICA
20% do genoma – produção de
metabólitos secundários
SALINOSPORAMIDA A
Mecanismo de ação:
Inibição da função catalítica do
proteossomo
Origem:
Actinomiceto Salinispora tropica
Usos:
Tratamento em potencial de NSCLC,
melanoma e linfomas em combinação
com vorinostat e de tumores sólidos
avançados e mieloma múltiplo (Fase I).
Salinosporamida A
SALINOSPORAMIDA A
PROSPECÇÃO GENÔMICA
Previsão dos metabólitos produzidos pelo
microrganismo a partir de suas seqüências genômicas,
independente de seu cultivo
PROSPECÇÃO GENÔMICA
4 November, 2008
Volume 15, Issue 11, pp. 1139-1240
Briostatina 1
Pettit et al., 1982
PROSPECÇÃO
GENÔMICA
OS PNM SÃO UM BOM NEGÓCIO?
Espanha, 1986
Reino Unido, 2000
Estados Unidos, 1998
Reino Unido, 2005
www.pharmamar.com
- Fundada: 1986
- Investimento: € 420 milhões
- Coleção: 65 mil organismos marinhos
- Substâncias novas isoladas: 700
- Substâncias em fase clínica: 5
www.eisai.com
http://www.glycomar.com
GlycoMar’s primary focus is in the
discovery and development of sugar-
related compounds derived from a
wide range of marine invertebrates
and microalgae, providing an array
of novel biochemistry. Sede: Oban - Escócia
http://www.nereuspharm.com
Nereus Pharmaceuticals is a
pioneer in the discovery and
development of new
therapeutics for cancer,
inflammatory and infectious
diseases that were derived
from marine microbial
sources.
Biodiversidade Marinha no
Desenvolvimento de Fármacos
vEstima-se que novos tratamentos para o câncer a partir de
organismos marinhos tenham o valor estimado entre U$563
bilhões e U$ 5,69 triilhões
vExistem mais de 550K novas substâncias esperando para ser
descobertas
vPodem levar a descoberta de 55 a 214 novos medicamentos
para o tratamento do câncer
"Science for Environment Policy": European Commission DG Environment News Alert Service, edited
by SCU, The University of the West of England, Bristol
Diversidade
biológica
Diversidade
Química
Inovação
Biotecnológica
E no Brasil?
• Amazônia Azul
• Extensão da costa 8.500 km
• Mar Territorial Brasileiro + ZEE:
3,5 milhões de km2
• Maior costa tipicamente tropical
do mundo
• Plataforma continental
• Ilhas Oceânicas
• Diversidade inestimada
Sumário
• Produtos naturais no tratamento do Câncer
• Rede ProspecMar – abordagens integrativas na
prospecção de substâncias anticâncer
• Estudos Alvo-Direcionados
• Fator de transcrição TBX2
• Proteínas inibidoras de apoptose
UMA PROPOSTA DE MODELO DE REDE RACIONAL E SUSTENTÁVEL
ProspecMar
Prospecção de compostos
bioativos
Caracterização da atividade, melhoramento e
produção
Ecologia química
Diversidade
Microbiana
Quimio-sistemática
identificação de
compostos bioativos
Vias de sinalização
Papel ecológico
Epigenética
Síntese e biossíntese
Biotransfor- mação
Alvo molecular
Banco de cepas
Caracterização química
Diversidade química
Atividade biológica
Eficácia
Estratégias para obtenção do protótipo
Proteção intelectual
Purificação química guiada pelo atividade
biológica ou alvo
Conhecimento da biodiversidade
I
III
II
Cromatografia de afinidade
reversa
Biogeografia
Assinaturas taxonômicas
Vias
Biossíntéticas
I e III
(UCSD/USP)
I, II e IV
Conectividade
Fermentação em larga
escala
Banco de algas
Criação de banco de
dados de perfil químico
CGGGTTACGAAATCCGT
AGGATGACACACCCCA
GTTTAATGGATATTTAAA
ACCCCGCGCGTTTATAT
CCCGGAAGT
PROSPECMAR
BIOASSAY-
GUIDED
FRACTIONATION
METAGENOMICS
METABOLOMICS MECHANISM OF
ACTION
Objetivo da Rede:
v Realização de prospecção de
recursos biológicos nas ilhas
brasileiras visando o
conhecimento da sua diversidade
e seu uso sustentável na
identificação de serviços
ecossistêmicos e do
desenvolvimento de produtos e
processos biotecnológicos.
UFF
UFC
UNESP
UFSC
USP
UFRN
UCSD
UA
UFRJ
Ideia Central:
Microrganismos
Marinhos
Substâncias
Químicas
Modelos de
Câncer
Novos
Protótipos
O
N
N
N
O O
C
H3
O
N
C
H3 H
C
H3
R1
R2
H
1
2
3
4
4a
4b
4c
5
7
7a
7b
7c
8
9
10
11
11a
12a 12b
13a
2'
3'
4'
5'
6'
I. R1 = OH; R2 = H
II. R1 = H; R2 = OH
SUBSTÂNCIAS
ANTICÂNCER
ABORDAGEM
CONVENCIONAL
PROSPECÇÃO
GENÔMICA
METABOLÔMICA
INTERAÇÃO
ENTRE
BACTÉRIAS
ESTUDOS ALVOS
DIRECIONADOS -
AFINIDADE
REVERSA
Método
dessecação/carimbo
Diluição em
água do mar estéril e
aquecimento a 55° por 10 min
Carimbo da amostra com
esponja estéril sob meio
de cultura sólido
38%
31%
31%
18%
43%
39%
Método
diluição/aquecimento
Incubação em
estufa de B. O. D.
a 28 °C por 90 dias
Secagem à temperatura
ambiente no fluxo
laminar por 48h
Semeadura da amostra
com haste estéril sob
meio de cultura sólido
N = 173
N = 95
Amostra de
sedimento
SCA SWA TMA
Meios de cultura
Isolamento de Microrganismos
Arquipélago de São Pedro
e São Paulo, 140, 14%
Fernando de Noronha,
23, 2%
Atol das Rocas,
92, 9%
Trindade e
Martin Vaz,
14, 2%
Ceará, 246, 25%
Rio Grande do Norte, 4,
0%
Rio de Janeiro, 126, 13%
Santa Catarina, 2, 0%
Litoral Norte de
São Paulo,
173, 18%
Baixada Santista, 76, 8%
Mar Profundo, 36, 4%
Antartica, 31, 3%
Alcatrazes, 22, 2%
Banco de Microrganismos
A)
B)
78%
22%
50%
37%
13%
Cultivo em meio A1
líquido a 200 RPM
e 28°C por 7 dias
Cepa isolada Ensaio para atividade citotóxica em
células tumorais
Extratos brutos
AcOEt
BuOH
MeOH
(Liofilizado)
Extração/
partição
Extrato
72h
MTT MTT Formazan
N = 224
N = 50
Não ativos Ativos*
AcOEt BuOH MeOH
Extratos testados
Natureza do extrato
Potência do efeito antiproliferativo
CI50 < 1 1 ≤ CI50 ≤ 10 CI50 > 10
Percentual
de
extratos
0
10
20
30
40
50
60
70
80
Alta Moderada Baixa
(µg/mL)
C)
AcOEt
BuOH
MeOH
Triagem da Atividade Biológica
Perfil químico:
• Análise por LC-MS
• Redes moleculares -
GNPRS
Archipelago
Costa CE
BRA-177
Antimycin
Diketopeperazine
Prodiginine
Desferrioxamine
Staurosporine
Rifamycin
Saliniketal
234
250
235
249
214
227
177
177
177
Hit na FC
Sumário
• Produtos naturais no tratamento do Câncer
• Rede ProspecMar – abordagens integrativas na
prospecção de substâncias anticâncer
• Estudos Alvo-Direcionados
• Fator de transcrição TBX2
• Proteínas inibidoras de apoptose
Fator de transcrição Tbx2
vParte da família de fatores de transcrição T-box com papel bem estabelecido
no desenvolvimento embrionário
vEncontra-se superexpresso em vários tipos de câncer, especialmente
melanoma, sarcoma e carcinoma de mama, correlacionando com um
prognóstico ruim
Wansleben et al., Biochimica et Biophysica Acta 1846 (2014) 380–391
Lu et al., Biochimica et Biophysica Acta 1806 (2010) 268–274
Sharon Prince
University of Cape Town
África do Sul
Inibe pontos de checagem
do ciclo celular
Checkpoint de tetraploidia
Induz aneuploidy/CIN
Checkpoint de senescência
(inibe cdki p21 e p14)
Immortalização celular
Prince et al. Cancer Research (2004)
Davis et al. Oncogene (2008)
Control TBX2 overexpression
Control TBX2 overexpression
A superexpressão de TBX2 contribui com a carcinogênese
levando a imortalidade das células
Superexpressão de TBX2 em células normais
Tbx2 é um fator pro-proliferação em câncer de mama e
melanoma
Silenciamento do TBX2 diminui proliferação e aumenta
senescência (câncer de mama & melanoma)
0
100000
200000
300000
400000
500000
600000
0 2 4 6 8 10 12
Cell
number
Time (Days)
shctrl(3)
shctrl(6)
Curvas de crescimento- Células de mama
Knocking down de TBX2 induz
senescência & resulta na inibição da
proliferação
Knocking down de TBX2 sensibiliza
células-resistentes ao tratamento com
cisplatina
Ensaio da β-galactosidase – senescência Cisplatina Células de mamaMCF-7
Peres et al. Genes and Cancer (2010)
Wansleben et al. Cell Death
and Disease (2013)
Potencial alvo para tratamento desses tumores
(inclusive em associação com outros fármacos)
TBX2: gene e proteína
v Os estudos com Tbx2/3 como alvo é desafiador – não possuem atividade
enzimática e são relativamente instáveis
v Screen contra o domínio de ligação do DNA?? Problemas com a seletividade –
domínio altamente conservado na família
• Domínio de ligação ao DNA de TBX2 foi clonado com vetor de expressão
pET28b – com cauda de histidina
• Obtenção de grandes quantidades de proteínas.
N C
1 64 106 289 540 584 712 aa
R R
T-BOX
Cromatografia de bioafinidade
Screening da biblioteca de extratos marinhos
FUNCTIONAL (BIOAFFINITY)
CHROMATOGRAPHY
Extract
Protein
Resin
Protein bound to
the resin
Wash
Incubation with
extract overnight
Ligand bound to the
protein on resin
Elution
Ligand and protein
on resin
Dereplicateligand by LC-MS and
database search
Dictionary of
Natural Products
SciFinder
AN OVERVIEW - FISHING MOLECULES!
Kang et al., 2014, Chembiochem 14, 2125.
Lau et al., 2015, Org. Biomol. Chem. 13, 2255.
Eli Chapman
University of Arizona
Tucson, EUA
James La Clair
UCSD and Xenobe
Institute, EUA
Protein
Crude extract (pre-FC)
Hits (post-FC)
216.95
245.10
1+
289.21
3+
365.16
1+
427.16
468.34
2+
597.89 643.26
1+
682.68
3+
701.54
1+
744.77 788.34 833.75
912.70
1+
934.67
1+
LCMS_BRB081_TBX2_1-9_01_7885.d:+MS,24.4-24.5min#2146-2150
0.0
0.5
1.0
1.5
7
x10
Intens.
200 300 400 500 600 700 800 900 1000 m/z
LC-MS ANALYSIS
FUNCTIONAL (BIOAFFINITY)
CHROMATOGRAPHY
SETTING UP AN EXPERIMENT – POTENTIAL TARGET TUBULIN
Arenosclera brasiliensis
extract
incubate with
protein-bound resin
protein protein on
resin
ligand-bound
protein on
ligand and
protein on
derreplicate
ligand by
POTENTIAL TARGET - TUBULIN
!-Tubulin – commercially available
Positive control – Taxol (Recovered as Taxol-K+)
CONTROLE_POS_1-61_01_4017.d: BPC +All MS
501_POS_1-62_01_4018.d: BPC +All MS
900_POS_1-63_01_4019.d: BPC +All MS
0
1
2
3
4
5
8
x10
Intens.
0
2
4
6
8
x10
Intens.
0.0
0.2
0.4
0.6
0.8
1.0
9
x10
Intens.
2.5 5.0 7.5 10.0 12.5 15.0 17.5 20.0 22.5 Time [min]
CONTROLE_POS_1-61_01_4017.d: BPC +All MS
501_POS_1-62_01_4018.d: BPC +All MS
900_POS_1-63_01_4019.d: BPC +All MS
0.5
1.0
1.5
2.0
6
x10
Intens.
0
1
2
3
7
x10
Intens.
0
1
2
3
4
5
7
x10
Intens.
4.0 4.5 5.0 5.5 6.0 6.5 7.0 7.5 Time [min]
134
157
180
216
234
247
260
277 316 342
358
384
398
410
424 439
100 150 200 250 300 350 400 450 m/z
Xestoproxamine (m/z 441)
148 173 206
220 244
260
303 330 368
410
424
436
450
465
100 150 200 250 300 350 400 450 500 m/z
Haliclocyclamine (m/z 467)
and analog (m/z 465)
222 244 424
465
481
50 100 150 200 250 300 350 400 450 500 550
m/z
Arenosclerins (m/z 483) and
derivatives (m/z 481, 485 and 497)
Proposed structure for the
novel Arenosclerin F
Arenosclera brasiliensis
Arenosclerins A-C and Haliclonacyclamine E, New Tetracyclic Alkaloids from a
Brazilian Endemic Haplosclerid Sponge Arenosclera bra siliensis
Yohandra R. Torres,† Roberto G. S. Berlinck,*,† Alviclér Magalhães,‡ Alexandre B. Schefer,‡ Antonio G. Ferreira,‡
Eduardo Hajdu,§ and Guilherme Muricy§
Instituto de Quı́m ica de S ão Carlos, Universidade de S ão Paulo CP 780, CEP 13560-970, S ão Carlos, S P, Brasil,
Departam ento de Quı́m ica, Universidade Federal de S ão Carlos CP 676, CEP 13565-905, S ão Carlos, S P, Brazil, and
Museu Nacional, Departam ento de Invertebrados, Universidade Federal do Rio de J aneiro, Quinta da Boa Vista s/ n,
CEP 20940-040, Rio de J aneiro, RJ , Brazil
Received Novem ber 5, 1999
Arenosclerins A (2), B (3), and C (4), as well as haliclonacyclamine E (1), are new tetracyclic alkylpiperidine
alkaloids isolated from a new species of marine sponge belonging to the order Haplosclerida, Arenosclera
brasiliensis, a species endemic to the southeastern Brazilian coast. The alkaloids were isolated as their
hydrochloride salts and identified by analysis of spectroscopic data. Data obtained from 1H-1H COSY,
HMBC, and HSQC-TOCSY NMR experiments allowed complete assignment of the 1H and 13C resonances,
and analysis of the NOESY and ROESY spectra showed that the only differences between 2, 3, and 4
were the relative stereochemistries of the bispiperidine ring system. Arenosclerins A-C are the first
haliclonacyclamine/halicyclamine-related alkaloids with a hydroxy group in the bridging alkyl chain.
Advances in the chemotaxonomy of marine sponges have
been hampered for many years by a lack of chemical data
from a large number of species ascribed to different taxa.1
However, with the rapid development of modern isolation
and identification methods during the past two decades,
an increasing number of secondary metabolites have been
isolated from marine sponges.2 Thereafter, several hypoth-
eses for the chemotaxonomy of marine sponges belonging
to different taxa have been proposed.3-5 Marine sponges
of the order Haplosclerida are a rich source of alkylpyridine
and alkylpiperidine alkaloids, and more than 100 com-
pounds with 30 different carbon skeletons have been
isolated from Haplosclerid sponges.6 Furthermore, the
occurrence of such alkaloids in marine sponges other than
extract of a new species of marine sponge, Arenosclera
brasiliensis Muricy & Ribeiro 1999 (Haplosclerida, Demo-
spongiae10) displayed strong cytotoxicity and antimicrobial
activity against common11 and resistant bacteria. Prelimi-
nary analysis of the crude extract by 1H NMR and TLC
(Dragendorff) revealed the presence of a mixture of alka-
loids. Herein we report the isolation and structure deter-
mination of three new compounds, arenosclerins A-C (2-
4), which are the first examples of hydroxylated hali-
clonacyclamine/halicyclamine alkaloids. Additionally, we
report the structure of a new member of the tetracyclic
group of haplosclerid alkaloids, haliclonacyclamine E (1).
1098 J . Nat. Prod. 2000, 63, 1098-1105
Received Novem ber 5, 1999
Arenosclerins A (2), B (3), and C (4), as well as haliclonacyclamine E (1), are new tetracyclic alkylpiperidine
alkaloids isolated from a new species of marine sponge belonging to the order Haplosclerida, Arenosclera
brasiliensis, a species endemic to the southeastern Brazilian coast. The alkaloids were isolated as their
hydrochloride salts and identified by analysis of spectroscopic data. Data obtained from 1H-1H COSY,
HMBC, and HSQC-TOCSY NMR experiments allowed complete assignment of the 1H and 13C resonances,
and analysis of the NOESY and ROESY spectra showed that the only differences between 2, 3, and 4
were the relative stereochemistries of the bispiperidine ring system. Arenosclerins A-C are the first
haliclonacyclamine/halicyclamine-related alkaloids with a hydroxy group in the bridging alkyl chain.
Advances in the chemotaxonomy of marine sponges have
been hampered for many years by a lack of chemical data
from a large number of species ascribed to different taxa.1
However, with the rapid development of modern isolation
and identification methods during the past two decades,
an increasing number of secondary metabolites have been
isolated from marine sponges.2 Thereafter, several hypoth-
eses for the chemotaxonomy of marine sponges belonging
to different taxa have been proposed.3-5 Marine sponges
of the order Haplosclerida are a rich source of alkylpyridine
and alkylpiperidine alkaloids, and more than 100 com-
pounds with 30 different carbon skeletons have been
isolated from Haplosclerid sponges.6 Furthermore, the
occurrence of such alkaloids in marine sponges other than
the Haplosclerida has been reported in only a few cases.
The occurrence of such a large number of biogenetically
related alkaloids in the sponges of the order Haplosclerida
constitutes one of the best chemotaxonomic indicators for
this order.6
Two groups have recently reported the isolation of a new
class of tetracyclic alkylpiperidine alkaloids from marine
sponges of the genus Haliclona. J aspars et al.7a and
Harrison et al.7b have isolated halicyclamines A and B from
a species of Haliclona from Biak (Indonesia), while Charan
et al.8a and Clark et al.8b have reported the isolation of
closely related alkaloids, the haliclonacyclamines, from a
Haliclona species collected at Heron Island (Australia). The
structure determination of halicyclamine A was based on
analysis of spectroscopic data7a and, in the case of halicy-
clamine B,7b by X-ray diffraction analysis. The structures
of haliclonacyclamines were established by analysis of
spectroscopic data and by X-ray diffraction analysis.8 In
both cases, the complete assignments of 1H and 13C signals
were particularly challenging, because of the poor resolu-
tion and the overlap of several signals in the 1H NMR
spectra.
During our continuing program in the search for bioac-
tive marine natural products,9 we observed that the crude
extract of a new species of marine sponge, Arenosclera
brasiliensis Muricy & Ribeiro 1999 (Haplosclerida, Demo-
spongiae10) displayed strong cytotoxicity and antimicrobial
activity against common11 and resistant bacteria. Prelimi-
nary analysis of the crude extract by 1H NMR and TLC
(Dragendorff) revealed the presence of a mixture of alka-
loids. Herein we report the isolation and structure deter-
mination of three new compounds, arenosclerins A-C (2-
4), which are the first examples of hydroxylated hali-
clonacyclamine/halicyclamine alkaloids. Additionally, we
report the structure of a new member of the tetracyclic
group of haplosclerid alkaloids, haliclonacyclamine E (1).
Results and Discussion
* To whom correspondence should be addressed. Tel.: +55-16-2739954.
Fax: +55-16-2739987. E-mail: rberlinck@iqsc.sc.usp.br.
†
Instituto de Quı́mica de São Carlos, Universidade de São Paulo.
Molecular Docking
colchicine
paclitaxel
vimblastine
Arenosclerin F
Cell line IC50 (µM)
HCT-116 1.76
MCF-7 0.52
Malme-3M 2.45
MM200 1.61
WM239A 0.68
Cytotoxicity
Considerações finais:
•Diversidade biológica gera diversidade química –
perspectiva de inovação
• Brasil – Megadiversidade biológica
• É preciso estruturar redes de pesquisa com foco no
desenvolvimento de fármacos
• Existem centenas de fármacos esperando para serem
descobertos
•Descoberta de novos alvos terapêuticos

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Produtos naturais marinhos anticâncer

  • 1. Produtos Naturais Marinhos com Atividade Anticâncer LETICIA V. COSTA-LOTUFO & COLABORADORES DEPARTAMENTO DE FARMACOLOGIA INSTITUTO DE CIÊNCIAS BIOMÉDICAS UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO
  • 2. Sumário • Produtos naturais no tratamento do Câncer • Rede ProspecMar – abordagens integrativas na prospecção de substâncias anticâncer • Estudos Alvo-Direcionados • Fator de transcrição TBX2 • Proteínas inibidoras de apoptose
  • 3. Câncer em Números: • Segunda causa de morte por doenças; • O número de novos casos de câncer chegará a 21 milhões nas próximas duas décadas; • Mais que 60% dos casos diagnosticados ocorrem na Africa, Asia, a América Central e do Sul; 70% das mortes também ocorrem nessas localidades. https://www.cancer.gov/about-cancer/understanding/statistics
  • 5. Fármacos Anti-Câncer: Newman & Cragg, 2016. J. Nat. Prod., 79:629.
  • 6. Propriedades Estruturais: • Presença de centros estereogênicos e maior complexidade estrutural que as moléculas sintéticas; • Maior quantidade de relativa de carbono, hidrogênio e oxigênio que as moléculas sintéticas; • Tamanho (massa molecular > 500Da) e polaridade (maior solubilidade em água). Clardy & Walsh. Nature, 432: 829.
  • 9.
  • 10. A CONQUISTA DO AMBIENTE 1950 DIAS ATUAIS…
  • 11. Jacques Cousteau e Simone Cousteau A CONQUISTA DO AMBIENTE - Invenção do equipamento de mergulho autônomo (1943); - Revolução na exploração do ambiente marinho; It will happen, surgery will affix a set of artificial gills to man's circulatory system-right here at the neck-which will permit him to breathe oxygen from the water like a fish. Then the lungs will be by-passed and he will be able to live and breathe in any depth for any amount of time without harm. - Advento dos submersíveis.
  • 12. PRODUTOS NATURAIS MARINHOS Quantidade de novos produtos naturais marinhos isolados de 1965 a 2006. Costa-Lotufo et al., 2009. - 1as décadas: Explosão de moléculas com estruturas peculiares, alta potência, alvos biológicos novos - 1990-2000: Calmaria, indústria farmacêutica aposta na síntese e química combinatória - 2001-atual: Ressurgimento do interesse da indústria farmacêutica. Novo perfil, empresas novas pequeno porte
  • 13. ALVOS MOLECULARES: Canais iônicos Enzimas Microtúbulos DNA Lisossomos Calmodulina Proteossomos Estresse oxidativo Modulação do sistema imune Prófase metáfase anáfase telófase Ab Aa Newman & Cragg, 2006. Current Drug Targets 7: 279-304.
  • 15.
  • 16. Cryptotethya crypta Espongotimidina Espongouridina Bergman & Feeney, 1951 NUCLEOSÍDEOS DE ESPONJA Ara-a (vidarabina®, thilo®) Ara-c (citarabina®, alexan®, udicil®) AZT (retrovir®, zidovir®) Adenina arabinosídeo Citosina arabinosídeo Azidotimidina Anticâncer Antiviral Antiviral
  • 17. MECANISMO DE AÇÃO: 1. Cytarabine internalization by nucleosides transporter • Inhibition of DNA duplication • Inhibition of DNA transcription • Apoptosis induction Mechanisms of action and effects of cytarabine Cytarabine Synthesis inspired by natural products Cytarabine Arabinonucleosides isolated from marine sponge Tectitethya cripta O N N O O OH HO HO H 1 O N N O O OH HO HO H 2 O N N O NH2 OH HO HO .HCl 3 O N OH HO HO N N N NH2 4 Citoplasma C T Citarabina A B Spongothymidine Spongouridine O N OH HO HO 1 O N OH HO HO 2 O N N O NH2 OH HO HO .HCl 3 O N OH HO HO N N N NH2 4 Núcleo Citoplasma Transportador de nucleosídeos Citarabina Trifosfato DNA polimerase • Inibição da duplicação d • Inibição da transcrição d • Indução de apoptose 2. Conversion to cytarabine-5’-triphosphate 3. Fake nucleotide incorporation in DNA
  • 18. TRABECTEDINA Trabectedina (ET-743) Origem: Ascídia Ecteinascidia turbinata Usos: Aprovado pela EMEA, em 2007, para o tratamento de sarcoma de tecidos moles. Aprovado pelo FDA em 2015.
  • 19. SUPRIMENTO – ET743 Rendimento a partir da coleta - 0.0001% Aquacultura: ◦ Hastes ou redes submersas ◦ Recifes artificias de concreto Produtividade: ◦ 2001 – 80 ton métricas ◦ 2004 – 100 ton métricas ◦ Máximo – 250 ton métricas Rendimento: ◦ 0.5 and 4.0 μg g-1 Quantidades suficientes para testes clínicos!!! Economicamente inviável para comercialização. Cuevas & Francesch, 2009. NPR 26: 322-337.
  • 20. Elias James Corey Emeritus Professor Harvard U. Nobel Prize in Chemistry, 1990 Pseudomonas fluorescens Cianosafracina B Trabectedina
  • 21. Mechanism of action Bind covalently to the exocyclic amino group of guanines in the minor groove of DNA D’Inalci et al., 2014, British J Cancer 111: 646 D’Inalci and Galmarini, 2010, Mol Cancer Ther; 9(8); OF1–7.
  • 22. Blockade and degradation of RNA polymerase II Larsen et al., Cancer Chemother Pharmacol (2016) 77:663–671
  • 23. Mechanism of Action D’Inalci and Galmarini ., 2010, Mol Cancer Ther; 9(8); OF1–7.
  • 24.
  • 25. Características únicas: vTrabectedina - primeira substância descrita capaz de deslocar fatores de transcrição oncogênico de seus promotores vCélulas deficientes no sistema de reparo (nucleotide excision repair – NER) são geralmente mais sensíveis a cisplatina enquanto são resistentes a trabectedina vCélulas deficientes no sistema de recombinação heteróloga (HR) (por ex., com mutação nos genes BRCA1 ou BRCA2) são sensíveis a trabectedina assim como a compostos de platina D’Inalci et al., 2014, British J Cancer 111: 646
  • 26. http://www.pharmamar.com Sede: Madrid - Espanha Trabectedina (ET-743, Ecteinascidina)
  • 27. USO CLÍNICO: YONDELIS® é o único tratamento recentemente aprovado especificamente para liposarcoma inoperável ou metástico ou leiomiosarcoma após tratamento com antraciclina Presença da proteína quimérica FUS-CHOP ou EWS-CHOP – atuam como fatores anormais de transcrição. A trabectedina bloqueia a habilidade dessas quimeras de ativar a transcrição, reativando a rediferenciação. www.yondelis.com
  • 28. Halichondria okadai Lissodendoryx • 1985 - Uemura et al. – 600 Kg de esponja • 1987 – Munro & Blunt – encontram halicondrinas em esponjas do gênero Lissodendoryx (200Kg) • 1 tonelada de esponja – 310 mg de halicondrina B HALICONDRINA
  • 29. Halichondria okadai Lissodendoryx • 1985 - Uemura et al. – 600 Kg de H. okadai • 1987 – Munro & Blunt – Lissodendoryx (200Kg) • 1 ton de esponja – 310 mg de halicondrina B Halaven® 2011– Aprovado para tratamento de cancer de mama metastático HO HO HO O O O O O O O H H H H H H H H O O O O O O H H O H H O O H H H 6 O O + H3N O OH O O O H H O H O O O MeSO3 - 7
  • 30. Eribulina Despolimerização preservada Formação de agregados de Eribulina com tubulina Inibição da polimerização Sequestro de tubulina • Inibição persistente da divisão celular • Apoptose
  • 31. HALAVEN® A Eisai está comercializando o mesilato de eribulina desde 2010 nos EUA; Em 2011, o Halaven foi aprovado na europa, Singapura e Japão. Indicação: câncer de mama refratário a quimioterapia com antraciclinas e taxanos.
  • 32. Adcetris® Senter & Sievers, 2012. Nature Biotechnology, 30, 631.
  • 33. CD30 MMAE 1. Reconhecimento do ADCetris por células tumorais 2. Internalização 3. Liberação da MMAE 4. Bloqueio da polimerização dos microtúbulos • Inibição da mitose seguida por apoptose de células CD30+ meio extracelular citoplasma
  • 34. Compound Name Trademark (FDA Approved Year) Marine Organism Chemical Class Molecular Target Disease Area Plinabulin (NPI-2358) NA Fungus Diketopiperazine Microtubules Cancer: Non-Small Cell Lung Cancer, Brain Tumor Tetrodotoxin HalneuronTM Pufferfish Guanidinium alkaloid Sodium Channel Pain: Chronic Pain Lurbinectedin (PM01183) NA Tunicate Alkaloid RNA Polymerase II Cancer: Ovarian Cancer, Breast Cancer, SCLC Depatuxizumab mafodotin (ABT-414) NA Mollusk/ cyanobacteriu m ADC (MMAF) EGFR & microtubules Cancer: Glioblastoma, Pediatric Brain Tumors Polatuzumab vedotin (DCDS-4501A) NA Mollusk/ cyanobacteriu m ADC (MMAE) CD79b & microtubules Cancer: Non-Hodgkin lymphoma, Chronic lymphocytic leukemia, Lymphoma, B-Cell, lymphoma, Follicular http://marinepharmacology.midwestern.edu/clinical_pipeline.html
  • 36. FLEMING E A DESCOBERTA DA PENICILINA Tudo começou com a descoberta da penicilina, um importante antibiótico, por Alexander Fleming em 1929. Nos últimos 60 anos, entre 30.000 e 50.000 produtos naturais foram descobertos a partir de microrganismos. Mais de 10.000 destes compostos são biologicamente ativos e mais de 8.000 são compostos antitumorais e antibióticos (Fenical, 1993; Fenical & Jensen, 1994, Fenical, 2006).
  • 37. MICRORGANISMOS MARINHOS abundâncias estimadas em 106 microorganismos/mL de água do mar e 109/cm3 de sedimento (Fenical & Jensen, 2006). • compreendem diferentes habitats, incluindo a interface água-ar, a coluna d’água que pode chegar a 10.000 metros, e os complexos sedimentos do assoalho marinho (Ward & Bora, 2006). BIOIVERSIDADE:
  • 38. MICRORGANISMOS MARINHOS DIVERSIDADE QUÍMICA SUSTENTABILIDADE Fermentação líquida PROSPECÇÃO GENÔMICA 20% do genoma – produção de metabólitos secundários
  • 39. SALINOSPORAMIDA A Mecanismo de ação: Inibição da função catalítica do proteossomo Origem: Actinomiceto Salinispora tropica Usos: Tratamento em potencial de NSCLC, melanoma e linfomas em combinação com vorinostat e de tumores sólidos avançados e mieloma múltiplo (Fase I). Salinosporamida A
  • 41. PROSPECÇÃO GENÔMICA Previsão dos metabólitos produzidos pelo microrganismo a partir de suas seqüências genômicas, independente de seu cultivo
  • 43. 4 November, 2008 Volume 15, Issue 11, pp. 1139-1240 Briostatina 1 Pettit et al., 1982 PROSPECÇÃO GENÔMICA
  • 44. OS PNM SÃO UM BOM NEGÓCIO? Espanha, 1986 Reino Unido, 2000 Estados Unidos, 1998 Reino Unido, 2005
  • 45. www.pharmamar.com - Fundada: 1986 - Investimento: € 420 milhões - Coleção: 65 mil organismos marinhos - Substâncias novas isoladas: 700 - Substâncias em fase clínica: 5
  • 47. http://www.glycomar.com GlycoMar’s primary focus is in the discovery and development of sugar- related compounds derived from a wide range of marine invertebrates and microalgae, providing an array of novel biochemistry. Sede: Oban - Escócia
  • 48. http://www.nereuspharm.com Nereus Pharmaceuticals is a pioneer in the discovery and development of new therapeutics for cancer, inflammatory and infectious diseases that were derived from marine microbial sources.
  • 49. Biodiversidade Marinha no Desenvolvimento de Fármacos vEstima-se que novos tratamentos para o câncer a partir de organismos marinhos tenham o valor estimado entre U$563 bilhões e U$ 5,69 triilhões vExistem mais de 550K novas substâncias esperando para ser descobertas vPodem levar a descoberta de 55 a 214 novos medicamentos para o tratamento do câncer "Science for Environment Policy": European Commission DG Environment News Alert Service, edited by SCU, The University of the West of England, Bristol Diversidade biológica Diversidade Química Inovação Biotecnológica
  • 50. E no Brasil? • Amazônia Azul • Extensão da costa 8.500 km • Mar Territorial Brasileiro + ZEE: 3,5 milhões de km2 • Maior costa tipicamente tropical do mundo • Plataforma continental • Ilhas Oceânicas • Diversidade inestimada
  • 51. Sumário • Produtos naturais no tratamento do Câncer • Rede ProspecMar – abordagens integrativas na prospecção de substâncias anticâncer • Estudos Alvo-Direcionados • Fator de transcrição TBX2 • Proteínas inibidoras de apoptose
  • 52. UMA PROPOSTA DE MODELO DE REDE RACIONAL E SUSTENTÁVEL ProspecMar Prospecção de compostos bioativos Caracterização da atividade, melhoramento e produção Ecologia química Diversidade Microbiana Quimio-sistemática identificação de compostos bioativos Vias de sinalização Papel ecológico Epigenética Síntese e biossíntese Biotransfor- mação Alvo molecular Banco de cepas Caracterização química Diversidade química Atividade biológica Eficácia Estratégias para obtenção do protótipo Proteção intelectual Purificação química guiada pelo atividade biológica ou alvo Conhecimento da biodiversidade I III II Cromatografia de afinidade reversa Biogeografia Assinaturas taxonômicas Vias Biossíntéticas I e III (UCSD/USP) I, II e IV Conectividade Fermentação em larga escala Banco de algas Criação de banco de dados de perfil químico CGGGTTACGAAATCCGT AGGATGACACACCCCA GTTTAATGGATATTTAAA ACCCCGCGCGTTTATAT CCCGGAAGT PROSPECMAR BIOASSAY- GUIDED FRACTIONATION METAGENOMICS METABOLOMICS MECHANISM OF ACTION
  • 53. Objetivo da Rede: v Realização de prospecção de recursos biológicos nas ilhas brasileiras visando o conhecimento da sua diversidade e seu uso sustentável na identificação de serviços ecossistêmicos e do desenvolvimento de produtos e processos biotecnológicos. UFF UFC UNESP UFSC USP UFRN UCSD UA UFRJ
  • 54. Ideia Central: Microrganismos Marinhos Substâncias Químicas Modelos de Câncer Novos Protótipos O N N N O O C H3 O N C H3 H C H3 R1 R2 H 1 2 3 4 4a 4b 4c 5 7 7a 7b 7c 8 9 10 11 11a 12a 12b 13a 2' 3' 4' 5' 6' I. R1 = OH; R2 = H II. R1 = H; R2 = OH
  • 56. Método dessecação/carimbo Diluição em água do mar estéril e aquecimento a 55° por 10 min Carimbo da amostra com esponja estéril sob meio de cultura sólido 38% 31% 31% 18% 43% 39% Método diluição/aquecimento Incubação em estufa de B. O. D. a 28 °C por 90 dias Secagem à temperatura ambiente no fluxo laminar por 48h Semeadura da amostra com haste estéril sob meio de cultura sólido N = 173 N = 95 Amostra de sedimento SCA SWA TMA Meios de cultura Isolamento de Microrganismos
  • 57. Arquipélago de São Pedro e São Paulo, 140, 14% Fernando de Noronha, 23, 2% Atol das Rocas, 92, 9% Trindade e Martin Vaz, 14, 2% Ceará, 246, 25% Rio Grande do Norte, 4, 0% Rio de Janeiro, 126, 13% Santa Catarina, 2, 0% Litoral Norte de São Paulo, 173, 18% Baixada Santista, 76, 8% Mar Profundo, 36, 4% Antartica, 31, 3% Alcatrazes, 22, 2% Banco de Microrganismos
  • 58. A) B) 78% 22% 50% 37% 13% Cultivo em meio A1 líquido a 200 RPM e 28°C por 7 dias Cepa isolada Ensaio para atividade citotóxica em células tumorais Extratos brutos AcOEt BuOH MeOH (Liofilizado) Extração/ partição Extrato 72h MTT MTT Formazan N = 224 N = 50 Não ativos Ativos* AcOEt BuOH MeOH Extratos testados Natureza do extrato Potência do efeito antiproliferativo CI50 < 1 1 ≤ CI50 ≤ 10 CI50 > 10 Percentual de extratos 0 10 20 30 40 50 60 70 80 Alta Moderada Baixa (µg/mL) C) AcOEt BuOH MeOH Triagem da Atividade Biológica
  • 59. Perfil químico: • Análise por LC-MS • Redes moleculares - GNPRS Archipelago Costa CE BRA-177 Antimycin Diketopeperazine Prodiginine Desferrioxamine Staurosporine Rifamycin Saliniketal 234 250 235 249 214 227 177 177 177 Hit na FC
  • 60. Sumário • Produtos naturais no tratamento do Câncer • Rede ProspecMar – abordagens integrativas na prospecção de substâncias anticâncer • Estudos Alvo-Direcionados • Fator de transcrição TBX2 • Proteínas inibidoras de apoptose
  • 61. Fator de transcrição Tbx2 vParte da família de fatores de transcrição T-box com papel bem estabelecido no desenvolvimento embrionário vEncontra-se superexpresso em vários tipos de câncer, especialmente melanoma, sarcoma e carcinoma de mama, correlacionando com um prognóstico ruim Wansleben et al., Biochimica et Biophysica Acta 1846 (2014) 380–391 Lu et al., Biochimica et Biophysica Acta 1806 (2010) 268–274 Sharon Prince University of Cape Town África do Sul
  • 62. Inibe pontos de checagem do ciclo celular Checkpoint de tetraploidia Induz aneuploidy/CIN Checkpoint de senescência (inibe cdki p21 e p14) Immortalização celular Prince et al. Cancer Research (2004) Davis et al. Oncogene (2008) Control TBX2 overexpression Control TBX2 overexpression A superexpressão de TBX2 contribui com a carcinogênese levando a imortalidade das células Superexpressão de TBX2 em células normais Tbx2 é um fator pro-proliferação em câncer de mama e melanoma
  • 63. Silenciamento do TBX2 diminui proliferação e aumenta senescência (câncer de mama & melanoma) 0 100000 200000 300000 400000 500000 600000 0 2 4 6 8 10 12 Cell number Time (Days) shctrl(3) shctrl(6) Curvas de crescimento- Células de mama Knocking down de TBX2 induz senescência & resulta na inibição da proliferação Knocking down de TBX2 sensibiliza células-resistentes ao tratamento com cisplatina Ensaio da β-galactosidase – senescência Cisplatina Células de mamaMCF-7 Peres et al. Genes and Cancer (2010) Wansleben et al. Cell Death and Disease (2013) Potencial alvo para tratamento desses tumores (inclusive em associação com outros fármacos)
  • 64.
  • 65. TBX2: gene e proteína v Os estudos com Tbx2/3 como alvo é desafiador – não possuem atividade enzimática e são relativamente instáveis v Screen contra o domínio de ligação do DNA?? Problemas com a seletividade – domínio altamente conservado na família
  • 66. • Domínio de ligação ao DNA de TBX2 foi clonado com vetor de expressão pET28b – com cauda de histidina • Obtenção de grandes quantidades de proteínas. N C 1 64 106 289 540 584 712 aa R R T-BOX Cromatografia de bioafinidade Screening da biblioteca de extratos marinhos
  • 67. FUNCTIONAL (BIOAFFINITY) CHROMATOGRAPHY Extract Protein Resin Protein bound to the resin Wash Incubation with extract overnight Ligand bound to the protein on resin Elution Ligand and protein on resin Dereplicateligand by LC-MS and database search Dictionary of Natural Products SciFinder AN OVERVIEW - FISHING MOLECULES! Kang et al., 2014, Chembiochem 14, 2125. Lau et al., 2015, Org. Biomol. Chem. 13, 2255. Eli Chapman University of Arizona Tucson, EUA James La Clair UCSD and Xenobe Institute, EUA
  • 68. Protein Crude extract (pre-FC) Hits (post-FC) 216.95 245.10 1+ 289.21 3+ 365.16 1+ 427.16 468.34 2+ 597.89 643.26 1+ 682.68 3+ 701.54 1+ 744.77 788.34 833.75 912.70 1+ 934.67 1+ LCMS_BRB081_TBX2_1-9_01_7885.d:+MS,24.4-24.5min#2146-2150 0.0 0.5 1.0 1.5 7 x10 Intens. 200 300 400 500 600 700 800 900 1000 m/z LC-MS ANALYSIS
  • 69. FUNCTIONAL (BIOAFFINITY) CHROMATOGRAPHY SETTING UP AN EXPERIMENT – POTENTIAL TARGET TUBULIN Arenosclera brasiliensis extract incubate with protein-bound resin protein protein on resin ligand-bound protein on ligand and protein on derreplicate ligand by
  • 70. POTENTIAL TARGET - TUBULIN !-Tubulin – commercially available Positive control – Taxol (Recovered as Taxol-K+) CONTROLE_POS_1-61_01_4017.d: BPC +All MS 501_POS_1-62_01_4018.d: BPC +All MS 900_POS_1-63_01_4019.d: BPC +All MS 0 1 2 3 4 5 8 x10 Intens. 0 2 4 6 8 x10 Intens. 0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 1.0 9 x10 Intens. 2.5 5.0 7.5 10.0 12.5 15.0 17.5 20.0 22.5 Time [min] CONTROLE_POS_1-61_01_4017.d: BPC +All MS 501_POS_1-62_01_4018.d: BPC +All MS 900_POS_1-63_01_4019.d: BPC +All MS 0.5 1.0 1.5 2.0 6 x10 Intens. 0 1 2 3 7 x10 Intens. 0 1 2 3 4 5 7 x10 Intens. 4.0 4.5 5.0 5.5 6.0 6.5 7.0 7.5 Time [min]
  • 71. 134 157 180 216 234 247 260 277 316 342 358 384 398 410 424 439 100 150 200 250 300 350 400 450 m/z Xestoproxamine (m/z 441) 148 173 206 220 244 260 303 330 368 410 424 436 450 465 100 150 200 250 300 350 400 450 500 m/z Haliclocyclamine (m/z 467) and analog (m/z 465) 222 244 424 465 481 50 100 150 200 250 300 350 400 450 500 550 m/z Arenosclerins (m/z 483) and derivatives (m/z 481, 485 and 497) Proposed structure for the novel Arenosclerin F
  • 72. Arenosclera brasiliensis Arenosclerins A-C and Haliclonacyclamine E, New Tetracyclic Alkaloids from a Brazilian Endemic Haplosclerid Sponge Arenosclera bra siliensis Yohandra R. Torres,† Roberto G. S. Berlinck,*,† Alviclér Magalhães,‡ Alexandre B. Schefer,‡ Antonio G. Ferreira,‡ Eduardo Hajdu,§ and Guilherme Muricy§ Instituto de Quı́m ica de S ão Carlos, Universidade de S ão Paulo CP 780, CEP 13560-970, S ão Carlos, S P, Brasil, Departam ento de Quı́m ica, Universidade Federal de S ão Carlos CP 676, CEP 13565-905, S ão Carlos, S P, Brazil, and Museu Nacional, Departam ento de Invertebrados, Universidade Federal do Rio de J aneiro, Quinta da Boa Vista s/ n, CEP 20940-040, Rio de J aneiro, RJ , Brazil Received Novem ber 5, 1999 Arenosclerins A (2), B (3), and C (4), as well as haliclonacyclamine E (1), are new tetracyclic alkylpiperidine alkaloids isolated from a new species of marine sponge belonging to the order Haplosclerida, Arenosclera brasiliensis, a species endemic to the southeastern Brazilian coast. The alkaloids were isolated as their hydrochloride salts and identified by analysis of spectroscopic data. Data obtained from 1H-1H COSY, HMBC, and HSQC-TOCSY NMR experiments allowed complete assignment of the 1H and 13C resonances, and analysis of the NOESY and ROESY spectra showed that the only differences between 2, 3, and 4 were the relative stereochemistries of the bispiperidine ring system. Arenosclerins A-C are the first haliclonacyclamine/halicyclamine-related alkaloids with a hydroxy group in the bridging alkyl chain. Advances in the chemotaxonomy of marine sponges have been hampered for many years by a lack of chemical data from a large number of species ascribed to different taxa.1 However, with the rapid development of modern isolation and identification methods during the past two decades, an increasing number of secondary metabolites have been isolated from marine sponges.2 Thereafter, several hypoth- eses for the chemotaxonomy of marine sponges belonging to different taxa have been proposed.3-5 Marine sponges of the order Haplosclerida are a rich source of alkylpyridine and alkylpiperidine alkaloids, and more than 100 com- pounds with 30 different carbon skeletons have been isolated from Haplosclerid sponges.6 Furthermore, the occurrence of such alkaloids in marine sponges other than extract of a new species of marine sponge, Arenosclera brasiliensis Muricy & Ribeiro 1999 (Haplosclerida, Demo- spongiae10) displayed strong cytotoxicity and antimicrobial activity against common11 and resistant bacteria. Prelimi- nary analysis of the crude extract by 1H NMR and TLC (Dragendorff) revealed the presence of a mixture of alka- loids. Herein we report the isolation and structure deter- mination of three new compounds, arenosclerins A-C (2- 4), which are the first examples of hydroxylated hali- clonacyclamine/halicyclamine alkaloids. Additionally, we report the structure of a new member of the tetracyclic group of haplosclerid alkaloids, haliclonacyclamine E (1). 1098 J . Nat. Prod. 2000, 63, 1098-1105 Received Novem ber 5, 1999 Arenosclerins A (2), B (3), and C (4), as well as haliclonacyclamine E (1), are new tetracyclic alkylpiperidine alkaloids isolated from a new species of marine sponge belonging to the order Haplosclerida, Arenosclera brasiliensis, a species endemic to the southeastern Brazilian coast. The alkaloids were isolated as their hydrochloride salts and identified by analysis of spectroscopic data. Data obtained from 1H-1H COSY, HMBC, and HSQC-TOCSY NMR experiments allowed complete assignment of the 1H and 13C resonances, and analysis of the NOESY and ROESY spectra showed that the only differences between 2, 3, and 4 were the relative stereochemistries of the bispiperidine ring system. Arenosclerins A-C are the first haliclonacyclamine/halicyclamine-related alkaloids with a hydroxy group in the bridging alkyl chain. Advances in the chemotaxonomy of marine sponges have been hampered for many years by a lack of chemical data from a large number of species ascribed to different taxa.1 However, with the rapid development of modern isolation and identification methods during the past two decades, an increasing number of secondary metabolites have been isolated from marine sponges.2 Thereafter, several hypoth- eses for the chemotaxonomy of marine sponges belonging to different taxa have been proposed.3-5 Marine sponges of the order Haplosclerida are a rich source of alkylpyridine and alkylpiperidine alkaloids, and more than 100 com- pounds with 30 different carbon skeletons have been isolated from Haplosclerid sponges.6 Furthermore, the occurrence of such alkaloids in marine sponges other than the Haplosclerida has been reported in only a few cases. The occurrence of such a large number of biogenetically related alkaloids in the sponges of the order Haplosclerida constitutes one of the best chemotaxonomic indicators for this order.6 Two groups have recently reported the isolation of a new class of tetracyclic alkylpiperidine alkaloids from marine sponges of the genus Haliclona. J aspars et al.7a and Harrison et al.7b have isolated halicyclamines A and B from a species of Haliclona from Biak (Indonesia), while Charan et al.8a and Clark et al.8b have reported the isolation of closely related alkaloids, the haliclonacyclamines, from a Haliclona species collected at Heron Island (Australia). The structure determination of halicyclamine A was based on analysis of spectroscopic data7a and, in the case of halicy- clamine B,7b by X-ray diffraction analysis. The structures of haliclonacyclamines were established by analysis of spectroscopic data and by X-ray diffraction analysis.8 In both cases, the complete assignments of 1H and 13C signals were particularly challenging, because of the poor resolu- tion and the overlap of several signals in the 1H NMR spectra. During our continuing program in the search for bioac- tive marine natural products,9 we observed that the crude extract of a new species of marine sponge, Arenosclera brasiliensis Muricy & Ribeiro 1999 (Haplosclerida, Demo- spongiae10) displayed strong cytotoxicity and antimicrobial activity against common11 and resistant bacteria. Prelimi- nary analysis of the crude extract by 1H NMR and TLC (Dragendorff) revealed the presence of a mixture of alka- loids. Herein we report the isolation and structure deter- mination of three new compounds, arenosclerins A-C (2- 4), which are the first examples of hydroxylated hali- clonacyclamine/halicyclamine alkaloids. Additionally, we report the structure of a new member of the tetracyclic group of haplosclerid alkaloids, haliclonacyclamine E (1). Results and Discussion * To whom correspondence should be addressed. Tel.: +55-16-2739954. Fax: +55-16-2739987. E-mail: rberlinck@iqsc.sc.usp.br. † Instituto de Quı́mica de São Carlos, Universidade de São Paulo.
  • 73. Molecular Docking colchicine paclitaxel vimblastine Arenosclerin F Cell line IC50 (µM) HCT-116 1.76 MCF-7 0.52 Malme-3M 2.45 MM200 1.61 WM239A 0.68 Cytotoxicity
  • 74. Considerações finais: •Diversidade biológica gera diversidade química – perspectiva de inovação • Brasil – Megadiversidade biológica • É preciso estruturar redes de pesquisa com foco no desenvolvimento de fármacos • Existem centenas de fármacos esperando para serem descobertos •Descoberta de novos alvos terapêuticos