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Microbiologia do Solo
Jordana Luísa de Castro
Bióloga, Mestra em Ciência do Solo - UFLA
Doutoranda em Ciência do Solo – UFLA
Um breve resumo histórico:
• Processos mediados por microrganismos são utilizados desde a.C.
• Louis Pasteur – pai da Microbiologia
Louis Pasteur
Um breve resumo histórico:
• Século XIX: avanços nos estudos de Química e Nutrição Mineral de plantas 
leguminosas e fixação biológica de nitrogênio
• Século XX: a Microbiologia do Solo tornou-se ciência autônoma
• Final da década de 50 e início da década de 60: a euforia da alta produtividade –
resultado do avanço científico e tecnológica
Um breve resumo histórico:
• Década de 70 – consequências do uso de agroquímicos e crise
energética - Agricultura orgânica
• Microbiologia do Solo – novamente em evidência (Engenharia
Genética e Biologia Molecular)
• Johanna Döbereiner – significativas contribuições para a
Microbiologia do Solo
Um breve resumo histórico:
Agrotecnologia do século XXI: Otimização da eficiência biológica
visando a produção sustentada dos ecossistemas.
Solo
Biota e seus processos
Fluxo de energia
Os Organismos do Solo
Os organismos do Solo
• Diversidade biológica –
procariotos e eucariotos
• Diversidade funcional
• Diversidade metabólica
Os organismos do Solo
• Biota do solo inclui representantes de todos os domínios e reinos
• Grande diversidade ainda desconhecida
Organismos do solo
Organismos do solo
Bactérias pertencentes ao gênero Pseudomonas
Organismos do solo
Ecologia do Solo
Complexidade
Biológica
Garante relações
diversas
Limita a explosão
populacional
Gera equilíbrio
Metabolismo e processos microbianos
• Decomposição de materiais orgânicos
• Mineralização de compostos orgânicos
• Transformações inorgânicas de N e S
• Produção de metabólitos diversos
• Degradação de compostos xenobióticos
Máquina
decompositora
Húmus
MS
MS
MS
MS
MS
Decomposição de restos vegetais no solo: máquina d ecompositora
operada pelos microrganismos (Siqueira & Franco, 1988)
Microrganismo
operário
MS
Nitrogênio
Carbono
Fósforo
Potássio
Cálcio
Magnésio
Ferro
Enxofre
Manganês
Cobre
outros
Resíduos
orgânicos
Redundância funcional
• Várias espécies de microrganismos realizam o mesmo processo, têm a
mesma função – o que garante a RESILIÊNCIA dos processos no solo.
• Cada espécie microbiana realiza várias funções  Azospirillum brasilense,
Bradyrhizobium japonicum – fixadores de N2 e desnitrificadores. Outros
fixadores de N2 participam dos Ciclos do C, P, S, etc.
Componentes do Solo
Interações microrganismos-solo
• Solo não rizosférico  deserto nutricional
• Participam da gênese do habitat onde vivem
O efeito rizosférico
Interações microrganismos-solo
• Enzimas do solo – medida da atividade microbiana no solo  degradação de
matéria orgânica e liberação de nutrientes.
• Microrganismos e a agregação do solo  fatores abióticos e bióticos
Interações microrganismos-solo
Fatores ambientais que afetam os microrganismos
• Substratos e fontes de energia
• Fatores de crescimento – substancias essenciais ou estimulantes para o
crescimento de microrganismos
• Nutrientes minerais
• Composição e força iônica da solução do solo
• pH
Fatores ambientais que afetam os microrganismos
• Gases do solo
• Água no solo
• Potencial redox
• Temperatura e radiação solar
Interações entre organismos
• Interações positivas: comensalismo, protocooperação,
mutualismo.
• Interações negativas: competição, alelopatia, amensalismo,
parasitismo, predação
Efeitos
antropogênicos
• Adição e remoção de
elementos
• Práticas de cultivo
• Mineração
Métodos de avaliação da biota do solo
Qualidade do solo
• Capacidade de funcionar nos limites do ecossistema, para sustentar a
produtividade biológica, manter a qualidade ambiental e promover a
saúde vegetal e animal (Doran e Parkin, 1994).
Organismos envolvidos na decomposição
da Matéria Orgânica do Solo
• Trituradores: coleópteros, ácaros,
crustáceos, lepidópteros, formigas,
miriápodes, quilópodos
• Trituradores/decompositores:
colêmbolas, miriápodes, coleópteros,
dípteros, ácaros, minhocas, enquitrídeos,
fungos, bactérias e actinomicetos
• Decompositores/trituradores: fungos,
bactérias, actinomicetos, colêmbolas,
enquitrídeos, minhocas
• Apenas decompositores: fungos,
bactérias, actinomicetos
Matéria orgânica do solo
Matéria orgânica do solo
Xenobióticos no solo
• Papel dos microrganismos e efeitos sob a microbiota do solo
Biorremediação microbiana
• Estratégia utilizando microrganismos ou suas enzimas para
destoxificar contaminantes no solo ou outros ambientes.
Rizosfera
• Corresponde à zona de influência das raízes que vai desde sua
superfície até uma distância de 1 a 3 mm (Hiltner, 1904).
Fonte: Dam & Bouwmeester, 2016.
(A) Exsudação de compostos fenólicos para inibir a germinação ou
crescimento de outras plantas (alelopatia); (B) Larvas de insetos que
se alimentam das raízes induzem a produção de compostos voláteis,
como compostos contendo enxofre, atraindo nematóides patogênicos
(C) o exsudato radicular das plantas afeta a colonização por bactérias
da rizosfera e inicia a colonização e formação de nódulos radiculares
por Rhizobium; (D) exsudatos radiculares induzem a eclosão de cistos
de nematoides e atraem nematóides juvenis em direção à raiz; (E) a
ponta das raízes é o local de exsudação mais ativa; (F) Exsudatos
induzem a ramificação de hifas de fungos micorrízicos arbusculares e
(G) a germinação de plantas parasitas é induzida por exsudatos
radiculares de seu hospedeiro.
As transformações dos elementos e a
sustentabilidade
• Processos biológicos  disponibilidade dos elementos químicos
• Ciclagem dos elementos
• Os microrganismos atuam direta ou indiretamente nos processos
As transformações dos elementos e a
sustentabilidade
• Mineralização
• Imobilização orgânica
• Oxidação/redução
• Solubilização
• Precipitação e volatilização de elementos no sistema solo-planta como:
H, O, C, N, P, S, K, Ca, Si, Mn, dentre outros.
Micorrizas
• Definição: “Associações simbióticas mutualísticas entre raízes de
plantas e determinados fungos do solo”.
• São afetadas pelo ambiente edáfico: pH, manejo do solo, especificidade
da planta, a fertilidade do solo (adição de P ao solo, geralmente reduz a
colonização).
• Benefícios para as plantas: P, água, agregação do solo, etc.
Micorrizas
Micorrizas mais frequentes nos ecossistemas:
 Micorrizas arbusculares:
• Colonizam as raízes de plantas de quase todos os gêneros de
Gimnospermas e Angiospermas, além de algumas Briófitas e
Pteridófitas
• Formam arbúsculos, estruturas intra-radiculares altamente
ramificadas
Micorrizas
 Ectomicorrizas:
• São formadas por fungos septados, em geral pertencentes ao grupo
dos Basidiomicetos
• Ocorre formação de manto fúngico ao redor das raízes
• Intensas modificações morfológicas das raízes colonizadas, típicas
de árvores de clima temperado
Micorrizas
Fixação Biológica de Nitrogênio
• Disponibilidade de N para os seres vivos – atmosfera
• Processos de fixação de nitrogênio: biológico x industrial
• Organismos fixadores de nitrogênio: vida livre, associativas e
simbióticas
• Genes relacionados à nodulação: NIF e NOD
Fixação Biológica de Nitrogênio
• Simbiose entre rizóbios e leguminosas – importante!!!
- Economicamente
- Ecologicamente
Fixação Biológica de Nitrogênio
Fonte: Laborgene, 2019.
Fixação Biológica de Nitrogênio
Fixação Biológica de Nitrogênio
• Benefícios da utilização da FBN
 Onde utilizar?
 Porque utilizar?
Fonte: Rehagro.
“A importância dos infinitamente pequenos é infinitamente grande”.
Louis Pasteur
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  • 1. Microbiologia do Solo Jordana Luísa de Castro Bióloga, Mestra em Ciência do Solo - UFLA Doutoranda em Ciência do Solo – UFLA
  • 2. Um breve resumo histórico: • Processos mediados por microrganismos são utilizados desde a.C. • Louis Pasteur – pai da Microbiologia Louis Pasteur
  • 3. Um breve resumo histórico: • Século XIX: avanços nos estudos de Química e Nutrição Mineral de plantas  leguminosas e fixação biológica de nitrogênio • Século XX: a Microbiologia do Solo tornou-se ciência autônoma • Final da década de 50 e início da década de 60: a euforia da alta produtividade – resultado do avanço científico e tecnológica
  • 4. Um breve resumo histórico: • Década de 70 – consequências do uso de agroquímicos e crise energética - Agricultura orgânica • Microbiologia do Solo – novamente em evidência (Engenharia Genética e Biologia Molecular) • Johanna Döbereiner – significativas contribuições para a Microbiologia do Solo
  • 5. Um breve resumo histórico: Agrotecnologia do século XXI: Otimização da eficiência biológica visando a produção sustentada dos ecossistemas. Solo Biota e seus processos Fluxo de energia
  • 7. Os organismos do Solo • Diversidade biológica – procariotos e eucariotos • Diversidade funcional • Diversidade metabólica
  • 8. Os organismos do Solo • Biota do solo inclui representantes de todos os domínios e reinos • Grande diversidade ainda desconhecida
  • 10. Organismos do solo Bactérias pertencentes ao gênero Pseudomonas
  • 12. Ecologia do Solo Complexidade Biológica Garante relações diversas Limita a explosão populacional Gera equilíbrio
  • 13. Metabolismo e processos microbianos • Decomposição de materiais orgânicos • Mineralização de compostos orgânicos • Transformações inorgânicas de N e S • Produção de metabólitos diversos • Degradação de compostos xenobióticos
  • 14. Máquina decompositora Húmus MS MS MS MS MS Decomposição de restos vegetais no solo: máquina d ecompositora operada pelos microrganismos (Siqueira & Franco, 1988) Microrganismo operário MS Nitrogênio Carbono Fósforo Potássio Cálcio Magnésio Ferro Enxofre Manganês Cobre outros Resíduos orgânicos
  • 15. Redundância funcional • Várias espécies de microrganismos realizam o mesmo processo, têm a mesma função – o que garante a RESILIÊNCIA dos processos no solo. • Cada espécie microbiana realiza várias funções  Azospirillum brasilense, Bradyrhizobium japonicum – fixadores de N2 e desnitrificadores. Outros fixadores de N2 participam dos Ciclos do C, P, S, etc.
  • 17. Interações microrganismos-solo • Solo não rizosférico  deserto nutricional • Participam da gênese do habitat onde vivem O efeito rizosférico
  • 18. Interações microrganismos-solo • Enzimas do solo – medida da atividade microbiana no solo  degradação de matéria orgânica e liberação de nutrientes. • Microrganismos e a agregação do solo  fatores abióticos e bióticos
  • 20. Fatores ambientais que afetam os microrganismos • Substratos e fontes de energia • Fatores de crescimento – substancias essenciais ou estimulantes para o crescimento de microrganismos • Nutrientes minerais • Composição e força iônica da solução do solo • pH
  • 21. Fatores ambientais que afetam os microrganismos • Gases do solo • Água no solo • Potencial redox • Temperatura e radiação solar
  • 22. Interações entre organismos • Interações positivas: comensalismo, protocooperação, mutualismo. • Interações negativas: competição, alelopatia, amensalismo, parasitismo, predação
  • 23. Efeitos antropogênicos • Adição e remoção de elementos • Práticas de cultivo • Mineração
  • 24. Métodos de avaliação da biota do solo
  • 25. Qualidade do solo • Capacidade de funcionar nos limites do ecossistema, para sustentar a produtividade biológica, manter a qualidade ambiental e promover a saúde vegetal e animal (Doran e Parkin, 1994).
  • 26. Organismos envolvidos na decomposição da Matéria Orgânica do Solo • Trituradores: coleópteros, ácaros, crustáceos, lepidópteros, formigas, miriápodes, quilópodos • Trituradores/decompositores: colêmbolas, miriápodes, coleópteros, dípteros, ácaros, minhocas, enquitrídeos, fungos, bactérias e actinomicetos • Decompositores/trituradores: fungos, bactérias, actinomicetos, colêmbolas, enquitrídeos, minhocas • Apenas decompositores: fungos, bactérias, actinomicetos
  • 29. Xenobióticos no solo • Papel dos microrganismos e efeitos sob a microbiota do solo
  • 30. Biorremediação microbiana • Estratégia utilizando microrganismos ou suas enzimas para destoxificar contaminantes no solo ou outros ambientes.
  • 31. Rizosfera • Corresponde à zona de influência das raízes que vai desde sua superfície até uma distância de 1 a 3 mm (Hiltner, 1904). Fonte: Dam & Bouwmeester, 2016. (A) Exsudação de compostos fenólicos para inibir a germinação ou crescimento de outras plantas (alelopatia); (B) Larvas de insetos que se alimentam das raízes induzem a produção de compostos voláteis, como compostos contendo enxofre, atraindo nematóides patogênicos (C) o exsudato radicular das plantas afeta a colonização por bactérias da rizosfera e inicia a colonização e formação de nódulos radiculares por Rhizobium; (D) exsudatos radiculares induzem a eclosão de cistos de nematoides e atraem nematóides juvenis em direção à raiz; (E) a ponta das raízes é o local de exsudação mais ativa; (F) Exsudatos induzem a ramificação de hifas de fungos micorrízicos arbusculares e (G) a germinação de plantas parasitas é induzida por exsudatos radiculares de seu hospedeiro.
  • 32. As transformações dos elementos e a sustentabilidade • Processos biológicos  disponibilidade dos elementos químicos • Ciclagem dos elementos • Os microrganismos atuam direta ou indiretamente nos processos
  • 33. As transformações dos elementos e a sustentabilidade • Mineralização • Imobilização orgânica • Oxidação/redução • Solubilização • Precipitação e volatilização de elementos no sistema solo-planta como: H, O, C, N, P, S, K, Ca, Si, Mn, dentre outros.
  • 34. Micorrizas • Definição: “Associações simbióticas mutualísticas entre raízes de plantas e determinados fungos do solo”. • São afetadas pelo ambiente edáfico: pH, manejo do solo, especificidade da planta, a fertilidade do solo (adição de P ao solo, geralmente reduz a colonização). • Benefícios para as plantas: P, água, agregação do solo, etc.
  • 35. Micorrizas Micorrizas mais frequentes nos ecossistemas:  Micorrizas arbusculares: • Colonizam as raízes de plantas de quase todos os gêneros de Gimnospermas e Angiospermas, além de algumas Briófitas e Pteridófitas • Formam arbúsculos, estruturas intra-radiculares altamente ramificadas
  • 36. Micorrizas  Ectomicorrizas: • São formadas por fungos septados, em geral pertencentes ao grupo dos Basidiomicetos • Ocorre formação de manto fúngico ao redor das raízes • Intensas modificações morfológicas das raízes colonizadas, típicas de árvores de clima temperado
  • 38. Fixação Biológica de Nitrogênio • Disponibilidade de N para os seres vivos – atmosfera • Processos de fixação de nitrogênio: biológico x industrial • Organismos fixadores de nitrogênio: vida livre, associativas e simbióticas • Genes relacionados à nodulação: NIF e NOD
  • 39. Fixação Biológica de Nitrogênio • Simbiose entre rizóbios e leguminosas – importante!!! - Economicamente - Ecologicamente
  • 40. Fixação Biológica de Nitrogênio Fonte: Laborgene, 2019.
  • 41. Fixação Biológica de Nitrogênio
  • 42. Fixação Biológica de Nitrogênio • Benefícios da utilização da FBN  Onde utilizar?  Porque utilizar? Fonte: Rehagro.
  • 43. “A importância dos infinitamente pequenos é infinitamente grande”. Louis Pasteur Obrigada!