MIGUEL
BOYAYAN
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PESQUISA FAPESP 142 ■
DEZEMBRO DE 2007 ■
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BACTÉRIAS DO BEM
MICROBIOLOGIA
Enzimas degradam proteínas e garrafas
PET e podem ter novos usos industriais
>
YURI VASCONCELOS
Embora úteis e participantes do nosso dia-a-dia, as
embalagens PET, que acondicionam água e refri-
gerantes, provocam um sério problema ambiental.
Todos os anos, mais de 50% da produção nacional, estima-
da em cerca de 380 mil toneladas,é depositado em lixões onde
permanece durante anos e anos até sua completa decomposi-
ção. O restante é aproveitado em processos variados de reci-
clagem, resultando em outros produtos como cordas, carpe-
tes e peças de artesanato. Uma boa notícia vinda do Japão
aponta que, dentro de pouco tempo, pode tornar-se realida-
deumanovaformadedegradaçãodessasembalagensporuma
via microbiológica.Estudos nesse sentido são conduzidos pe-
lo pesquisador Kohei Oda,professor emérito do Instituto Tec-
nológico de Kyoto, no Japão, e um dos precursores do desco-
brimento,na década de 1970,de um inibidor deproteases,um
tipodeproteínacomafunçãodequebraroutrasproteínaspara
ativá-lasoudesativá-las,conhecidocomopepstatina,que,anos
depois, serviu para inibir uma enzima proteolítica (formada
por proteases) do HIV. Ele conseguiu que embalagens PET,
polímero fabricado a partir da resina poli (tereftalato de etile-
no),fossem degradadas em apenas oito semanas por um con-
sórcio de bactérias e, na metade desse tempo, por uma bac-
téria específica isolada desse consórcio. Esses microorganis-
mos, que não são patogênicos, secretam para o meio exter-
no uma variedade de enzimas que decompõem o polímero.
As características das bactérias e das enzimas responsáveis pela
rápidadegradaçãosãoguardadasemsegredoporforçadecon-
trato com o Instituto de Tecnologia de Kyoto.
“A degradação microbiana oferece a possibilidade de re-
cuperar locais onde as embalagens estão enterradas ou acu-
muladas ao longo dos anos e é uma alternativa capaz de com-
petir, em nível econômico, com a degradação química”, diz
Oda.Ele esteve em São Paulo,entre abril e outubro deste ano,
como professor visitante na Universidade Federal de São Pau-
lo (Unifesp) e fez palestras e reuniões em outros institutos de
pesquisa paulistas. As bactérias identificadas por ele em li-
xões no Japão metabolizam poliésteres,tais como o PET.Po-
liésteres são polímeros cujas ligações químicas resultam da
união de um ácido com um álcool. Essas ligações, chamadas
ésteres,podem se desfazer por tratamento ácido ou ainda por
meio de enzimas.“Se a degradação ocorrer por meio de um
grupo de bactérias ou por uma única bactéria, são produzi-
das enzimas, as proteases ou proteolíticas, que hidrolisam –
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quebram a ligação na presença de água
– as ligações ésteres e depois degradam
os monômeros,que são as unidades que
compõem os plásticos, formando dió-
xido de carbono e água”,explica Luiz Ju-
liano,professor do Departamento de Bi-
ofísica da Unifesp.
O maior desafio para tornar comer-
cialmente viável o processo descoberto
pelomicrobiologistajaponês–jáexistem
conversações com algumas empresas do
Japão – é resolver a quebra da cristali-
nidade do PET, sem a qual as bactérias
nãoconseguemfazeradecomposiçãodas
embalagens. Quando o poli (tereftalato
de etileno) é processado para formar as
garrafas, ele adquire uma consistência
cristalinaqueimpedequalquerinteração
das paredes da garrafa com a água. Essa
propriedade é benéfica, porque permite
ousodaembalagemPETnapreservação
enoacondicionamentodebebidas,mas,
ao mesmo tempo,dificulta sua degrada-
ção. Segundo Oda, a saída para quebrar
a estrutura cristalina do PET é submetê-
loaumaquecimentode260°Celsius(C)
emautoclavesouportratamentopormi-
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logia aplicada.Esse ramo da ciência visa
à prospecção e utilização de microorga-
nismos que produzam enzimas ou ou-
tras substâncias para uso nos mais di-
versos ramos de atividade,como na me-
dicina,na indústria alimentícia,de cur-
tume,cosmética,de tecelagem,sucroal-
cooleira e de papel e celulose, entre ou-
tros.Hoje,umdosfocosdamicrobiologia
é a fermentação de açúcares para bio-
combustíveis. “O Brasil também tem
contribuições em microbiologia de pa-
tologias humanas,como doença de Cha-
gas,leishmaniose,tuberculose e dengue,
mas, por sua biodiversidade, oferece
muitas possibilidades para o avanço da
microbiologia em outras áreas”, afirma
Juliano.“O Brasil está acordando para
esse potencial”,diz o pesquisador brasi-
leiro,coordenador de um projeto temá-
tico sobre o tema,que tem o objetivo de
identificar enzimas de humanos, fun-
gos,bactérias e venenos de animais com
alguma utilidade industrial ou farma-
cológica. Ele aponta o trabalho da pro-
fessora Maria de Lourdes Teixeira de
Moraes Polizeli, do Departamento de
Biologia da Faculdade de Filosofia, Ci-
ências e Letras de Ribeirão Preto da Uni-
versidade de São Paulo (USP). Ela iso-
lou de compostagem de cogumelos uma
variedade de fungo, Rhisopus micros-
porus, que se mostrou um excelente pro-
dutor de amilase. Essa enzima é usada
na produção de adoçantes, xarope de
glicose para as indústrias de cerveja e de
medicamentos. O mais interessante é
que esses fungos crescem em suportes
sólidos muito baratos como sabugo de
milho e bagaço de cana e em tempera-
turas acima de 45°C, facilitando a pro-
dução industrial.
Hipopótamos e outros bichos do zoológico podem ser fontes de bactérias úteis
croondas. O calor quebra a cristalinida-
de do material e deixa as ligações éste-
res mais expostas à hidrólise, tornando
possível o processo de decomposição.
Múltiplas aplicações – O uso de mi-
croorganismos para degradação de pro-
dutosquepoluem oambiente–um pro-
cesso conhecido como biorremediação
– é apenas uma das áreas da microbio-
OS PROJETOS
EDUARDO
CESAR
1. Substratos e inibidores peptídicos
para enzimas proteolíticas
MODALIDADE
Projeto Temático
COORDENADOR
LUIZ JULIANO NETO – Unifesp
INVESTIMENTO
R$ 376.320,26 e
US$ 111.757,59 (FAPESP)
2. Kohei Oda, Kyoto Institute
of Technology, Japão
MODALIDADE
Auxílio à vinda
de Pesquisador Visitante
COORDENADOR
LUIZ JULIANO NETO – Unifesp
INVESTIMENTO
R$ 41.193,00 (FAPESP)
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lógicas ou industriais,os pesquisadores
fazem um verdadeiro trabalho de dete-
tive. Eles vão a campo e vasculham di-
ferentes ambientes em busca desses se-
res microscópicos.
Riqueza animal – A prospecção de mi-
croorganismos foi um dos motivos da
visita que Luiz Juliano e Kohei Oda fi-
zeram à Fundação Parque Zoológico de
São Paulo em outubro passado. Há
pouco tempo, Oda conseguiu isolar em
fezes de animais de zoo-
lógicos do Japão cerca de
500 cepas de bactérias
que têm em comum a
produção de ácido lácti-
co ou ácido acético. Em
geral, essas bactérias não
são patogênicas nem
tóxicas e podem produ-
zir enzimas ou outras
substâncias de interesse
biológico.
Juliano acredita que
material igualmente rico,
diverso e abundante pos-
sa ser encontrado no zôo
paulistano, onde as fezes
dos bichos são mistura-
das a cavacos de madeira
e outros restos de vegeta-
ção e são compostados.
“No processo de com-
postagem,a temperatura
chega a 70°C. Podemos
encontrar fungos e bac-
térias crescendo em con-
dições extremas de tem-
peratura”, diz ele.“Creio
que temos uma oportu-
nidade de prospectar
uma variedade imensa de
microorganismos vindos
de diferentes espécies de
animais.” Tudo isso sem
precisar tocar ou impor-
tunar os animais.
Além do zoológico,Juliano e Oda vi-
sitaram outras instituições de pesquisa
em microbiologia da capital e interior
paulista para propor o estabelecimen-
to de uma rede de cooperação na área,
como a USP de Ribeirão Preto, Univer-
sidade Estadual Paulista de São José do
Rio Preto e de Rio Claro, e Universida-
de Estadual de Campinas, e da unida-
de da Unifesp em Diadema. A associa-
ção dos grupos de pesquisa do profes-
Um dos trabalhos do grupo de Ju-
liano está relacionado à doença celía-
ca, caracterizada pela intolerância das
pessoas ao glúten.Esse problema decor-
re de o glúten ter uma proteína denomi-
nada gliadina,que é muito rica em pro-
lina, um dos 20 aminoácidos naturais
que compõem as proteínas.Isso torna a
gliadina pouco suscetível à digestão,di-
ficultando a hidrólise pelas enzimas di-
gestivas do estômago e do intestino. Os
fragmentos dessa proteína não digeri-
dos podem ser absorvidos e desenvolver
em muitas pessoas (numa proporção de
uma para 200,nos países ocidentais) um
quadro clínico de intolerância.“Estamos
sintetizando centenas de substratos pep-
tídicos (fragmentos de proteínas) con-
tendo prolina para examinarmos enzi-
mas proteólicas com preferência por
prolina. Isso nos permitirá buscar pro-
teases de alta eficiência na degradação
dos fragmentos de gliadina”, diz o pes-
quisador da Unifesp.O objetivo final do
projeto, portanto, é descobrir enzimas
que possam ser usadas no tratamento
do glúten ou administradas, na forma
de cápsulas,em pacientes que sofrem de
intolerância ao produto.
Outro projeto importante que con-
ta com a participação do grupo da Uni-
fesp tem como foco uma enzima pro-
teolítica isolada de bactérias que cres-
cem em fermentados de peixe na Tai-
lândia. Essa pesquisa conta com a cola-
boração do professor Oda e de cientis-
tas tailandeses. E qual a importância
dessa enzima?“A fermentação de sardi-
nhas é feita em altíssimas concentrações
de sal de cozinha,substrato onde vivem
as bactérias”,responde Juliano.“As pro-
teases secretadas por essas bactérias tam-
bém operam em altas concentrações sa-
linas,superiores a 20%.E a indústria re-
quer enzimas desse tipo, que suportem
salinidade e temperaturas altas”, ressal-
ta. O Brasil tem plantas que crescem à
beira de salinas e o pesquisador João
Lúcio de Azevedo, da Escola Superior
de Agricultura Luiz de Queiroz (Esalq),
da Universidade de São Paulo (USP),já
acenou com a possibilidade de bacté-
rias endofíticas (que vivem no interior
de tecidos vegetais) dessas plantas ex-
pressarem proteases que operem em al-
ta concentração de sal. Para encontrar
microorganismos como os que atuam
na fermentação de sardinhas ou que te-
nham outras aplicações médicas, bio-
Formações do
fungo Rhisopus
microsporus,
um produtor
de amilase,
enzima usada
na produção
de adoçantes
MARIA
DE
LOURDES
TEIXEIRA
POLIZELI/USP
sor Juliano e do professor Oda incre-
mentará os estudos das proteases já des-
cobertas e, ao mesmo tempo, será uma
oportunidade para disseminação, tam-
bémparaoutrosgruposinteressados,das
experiênciasemprospecçãodemicroor-
ganismos de uso prático. “Queremos
também oferecer a nossa contribuição
na área de enzimas proteolíticas, dispo-
nibilizando a plataforma de estudo das
proteasesqueonossogrupomontounos
últimos 27 anos”, conta Juliano. ■
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    PESQUISA FAPESP 142■ DEZEMBRO DE 2007 ■ 73 BACTÉRIAS DO BEM MICROBIOLOGIA Enzimas degradam proteínas e garrafas PET e podem ter novos usos industriais > YURI VASCONCELOS Embora úteis e participantes do nosso dia-a-dia, as embalagens PET, que acondicionam água e refri- gerantes, provocam um sério problema ambiental. Todos os anos, mais de 50% da produção nacional, estima- da em cerca de 380 mil toneladas,é depositado em lixões onde permanece durante anos e anos até sua completa decomposi- ção. O restante é aproveitado em processos variados de reci- clagem, resultando em outros produtos como cordas, carpe- tes e peças de artesanato. Uma boa notícia vinda do Japão aponta que, dentro de pouco tempo, pode tornar-se realida- deumanovaformadedegradaçãodessasembalagensporuma via microbiológica.Estudos nesse sentido são conduzidos pe- lo pesquisador Kohei Oda,professor emérito do Instituto Tec- nológico de Kyoto, no Japão, e um dos precursores do desco- brimento,na década de 1970,de um inibidor deproteases,um tipodeproteínacomafunçãodequebraroutrasproteínaspara ativá-lasoudesativá-las,conhecidocomopepstatina,que,anos depois, serviu para inibir uma enzima proteolítica (formada por proteases) do HIV. Ele conseguiu que embalagens PET, polímero fabricado a partir da resina poli (tereftalato de etile- no),fossem degradadas em apenas oito semanas por um con- sórcio de bactérias e, na metade desse tempo, por uma bac- téria específica isolada desse consórcio. Esses microorganis- mos, que não são patogênicos, secretam para o meio exter- no uma variedade de enzimas que decompõem o polímero. As características das bactérias e das enzimas responsáveis pela rápidadegradaçãosãoguardadasemsegredoporforçadecon- trato com o Instituto de Tecnologia de Kyoto. “A degradação microbiana oferece a possibilidade de re- cuperar locais onde as embalagens estão enterradas ou acu- muladas ao longo dos anos e é uma alternativa capaz de com- petir, em nível econômico, com a degradação química”, diz Oda.Ele esteve em São Paulo,entre abril e outubro deste ano, como professor visitante na Universidade Federal de São Pau- lo (Unifesp) e fez palestras e reuniões em outros institutos de pesquisa paulistas. As bactérias identificadas por ele em li- xões no Japão metabolizam poliésteres,tais como o PET.Po- liésteres são polímeros cujas ligações químicas resultam da união de um ácido com um álcool. Essas ligações, chamadas ésteres,podem se desfazer por tratamento ácido ou ainda por meio de enzimas.“Se a degradação ocorrer por meio de um grupo de bactérias ou por uma única bactéria, são produzi- das enzimas, as proteases ou proteolíticas, que hidrolisam – 72-75_Bacteria_142 11/27/07 17:08 Page 73
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    quebram a ligaçãona presença de água – as ligações ésteres e depois degradam os monômeros,que são as unidades que compõem os plásticos, formando dió- xido de carbono e água”,explica Luiz Ju- liano,professor do Departamento de Bi- ofísica da Unifesp. O maior desafio para tornar comer- cialmente viável o processo descoberto pelomicrobiologistajaponês–jáexistem conversações com algumas empresas do Japão – é resolver a quebra da cristali- nidade do PET, sem a qual as bactérias nãoconseguemfazeradecomposiçãodas embalagens. Quando o poli (tereftalato de etileno) é processado para formar as garrafas, ele adquire uma consistência cristalinaqueimpedequalquerinteração das paredes da garrafa com a água. Essa propriedade é benéfica, porque permite ousodaembalagemPETnapreservação enoacondicionamentodebebidas,mas, ao mesmo tempo,dificulta sua degrada- ção. Segundo Oda, a saída para quebrar a estrutura cristalina do PET é submetê- loaumaquecimentode260°Celsius(C) emautoclavesouportratamentopormi- 74 ■ DEZEMBRO DE 2007 ■ PESQUISA FAPESP 142 logia aplicada.Esse ramo da ciência visa à prospecção e utilização de microorga- nismos que produzam enzimas ou ou- tras substâncias para uso nos mais di- versos ramos de atividade,como na me- dicina,na indústria alimentícia,de cur- tume,cosmética,de tecelagem,sucroal- cooleira e de papel e celulose, entre ou- tros.Hoje,umdosfocosdamicrobiologia é a fermentação de açúcares para bio- combustíveis. “O Brasil também tem contribuições em microbiologia de pa- tologias humanas,como doença de Cha- gas,leishmaniose,tuberculose e dengue, mas, por sua biodiversidade, oferece muitas possibilidades para o avanço da microbiologia em outras áreas”, afirma Juliano.“O Brasil está acordando para esse potencial”,diz o pesquisador brasi- leiro,coordenador de um projeto temá- tico sobre o tema,que tem o objetivo de identificar enzimas de humanos, fun- gos,bactérias e venenos de animais com alguma utilidade industrial ou farma- cológica. Ele aponta o trabalho da pro- fessora Maria de Lourdes Teixeira de Moraes Polizeli, do Departamento de Biologia da Faculdade de Filosofia, Ci- ências e Letras de Ribeirão Preto da Uni- versidade de São Paulo (USP). Ela iso- lou de compostagem de cogumelos uma variedade de fungo, Rhisopus micros- porus, que se mostrou um excelente pro- dutor de amilase. Essa enzima é usada na produção de adoçantes, xarope de glicose para as indústrias de cerveja e de medicamentos. O mais interessante é que esses fungos crescem em suportes sólidos muito baratos como sabugo de milho e bagaço de cana e em tempera- turas acima de 45°C, facilitando a pro- dução industrial. Hipopótamos e outros bichos do zoológico podem ser fontes de bactérias úteis croondas. O calor quebra a cristalinida- de do material e deixa as ligações éste- res mais expostas à hidrólise, tornando possível o processo de decomposição. Múltiplas aplicações – O uso de mi- croorganismos para degradação de pro- dutosquepoluem oambiente–um pro- cesso conhecido como biorremediação – é apenas uma das áreas da microbio- OS PROJETOS EDUARDO CESAR 1. Substratos e inibidores peptídicos para enzimas proteolíticas MODALIDADE Projeto Temático COORDENADOR LUIZ JULIANO NETO – Unifesp INVESTIMENTO R$ 376.320,26 e US$ 111.757,59 (FAPESP) 2. Kohei Oda, Kyoto Institute of Technology, Japão MODALIDADE Auxílio à vinda de Pesquisador Visitante COORDENADOR LUIZ JULIANO NETO – Unifesp INVESTIMENTO R$ 41.193,00 (FAPESP) 72-75_Bacteria_142 11/27/07 17:08 Page 74
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    PESQUISA FAPESP 142■ DEZEMBRO DE 2007 ■ 75 lógicas ou industriais,os pesquisadores fazem um verdadeiro trabalho de dete- tive. Eles vão a campo e vasculham di- ferentes ambientes em busca desses se- res microscópicos. Riqueza animal – A prospecção de mi- croorganismos foi um dos motivos da visita que Luiz Juliano e Kohei Oda fi- zeram à Fundação Parque Zoológico de São Paulo em outubro passado. Há pouco tempo, Oda conseguiu isolar em fezes de animais de zoo- lógicos do Japão cerca de 500 cepas de bactérias que têm em comum a produção de ácido lácti- co ou ácido acético. Em geral, essas bactérias não são patogênicas nem tóxicas e podem produ- zir enzimas ou outras substâncias de interesse biológico. Juliano acredita que material igualmente rico, diverso e abundante pos- sa ser encontrado no zôo paulistano, onde as fezes dos bichos são mistura- das a cavacos de madeira e outros restos de vegeta- ção e são compostados. “No processo de com- postagem,a temperatura chega a 70°C. Podemos encontrar fungos e bac- térias crescendo em con- dições extremas de tem- peratura”, diz ele.“Creio que temos uma oportu- nidade de prospectar uma variedade imensa de microorganismos vindos de diferentes espécies de animais.” Tudo isso sem precisar tocar ou impor- tunar os animais. Além do zoológico,Juliano e Oda vi- sitaram outras instituições de pesquisa em microbiologia da capital e interior paulista para propor o estabelecimen- to de uma rede de cooperação na área, como a USP de Ribeirão Preto, Univer- sidade Estadual Paulista de São José do Rio Preto e de Rio Claro, e Universida- de Estadual de Campinas, e da unida- de da Unifesp em Diadema. A associa- ção dos grupos de pesquisa do profes- Um dos trabalhos do grupo de Ju- liano está relacionado à doença celía- ca, caracterizada pela intolerância das pessoas ao glúten.Esse problema decor- re de o glúten ter uma proteína denomi- nada gliadina,que é muito rica em pro- lina, um dos 20 aminoácidos naturais que compõem as proteínas.Isso torna a gliadina pouco suscetível à digestão,di- ficultando a hidrólise pelas enzimas di- gestivas do estômago e do intestino. Os fragmentos dessa proteína não digeri- dos podem ser absorvidos e desenvolver em muitas pessoas (numa proporção de uma para 200,nos países ocidentais) um quadro clínico de intolerância.“Estamos sintetizando centenas de substratos pep- tídicos (fragmentos de proteínas) con- tendo prolina para examinarmos enzi- mas proteólicas com preferência por prolina. Isso nos permitirá buscar pro- teases de alta eficiência na degradação dos fragmentos de gliadina”, diz o pes- quisador da Unifesp.O objetivo final do projeto, portanto, é descobrir enzimas que possam ser usadas no tratamento do glúten ou administradas, na forma de cápsulas,em pacientes que sofrem de intolerância ao produto. Outro projeto importante que con- ta com a participação do grupo da Uni- fesp tem como foco uma enzima pro- teolítica isolada de bactérias que cres- cem em fermentados de peixe na Tai- lândia. Essa pesquisa conta com a cola- boração do professor Oda e de cientis- tas tailandeses. E qual a importância dessa enzima?“A fermentação de sardi- nhas é feita em altíssimas concentrações de sal de cozinha,substrato onde vivem as bactérias”,responde Juliano.“As pro- teases secretadas por essas bactérias tam- bém operam em altas concentrações sa- linas,superiores a 20%.E a indústria re- quer enzimas desse tipo, que suportem salinidade e temperaturas altas”, ressal- ta. O Brasil tem plantas que crescem à beira de salinas e o pesquisador João Lúcio de Azevedo, da Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (Esalq), da Universidade de São Paulo (USP),já acenou com a possibilidade de bacté- rias endofíticas (que vivem no interior de tecidos vegetais) dessas plantas ex- pressarem proteases que operem em al- ta concentração de sal. Para encontrar microorganismos como os que atuam na fermentação de sardinhas ou que te- nham outras aplicações médicas, bio- Formações do fungo Rhisopus microsporus, um produtor de amilase, enzima usada na produção de adoçantes MARIA DE LOURDES TEIXEIRA POLIZELI/USP sor Juliano e do professor Oda incre- mentará os estudos das proteases já des- cobertas e, ao mesmo tempo, será uma oportunidade para disseminação, tam- bémparaoutrosgruposinteressados,das experiênciasemprospecçãodemicroor- ganismos de uso prático. “Queremos também oferecer a nossa contribuição na área de enzimas proteolíticas, dispo- nibilizando a plataforma de estudo das proteasesqueonossogrupomontounos últimos 27 anos”, conta Juliano. ■ 72-75_Bacteria_142 11/27/07 17:08 Page 75