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UNIVERSIDADE FEDERAL DA PARAÍBA
      CENTRO DE CIÊNCIAS EXATAS E DA NATUREZA
       DEPARTAMENTO DE BIOLOGIA MOLECULAR


      DISCIPLINA: GENÉTICA MOLECULAR



O material genético e
  a sua duplicação
 Profª Hilzeth de Luna Freire Pessôa


                                                1
Material genético
 Composição   química

 Estrutura


 Função




                          2
Quais são os compostos químicos que
    formam a molécula do DNA?




                            3
Composição química
 Ácido   fosfórico




                          4
Composição química
 Açúcar
  – Pentose → 5 carbonos
     desoxirribose
Composição química
 Bases    nitrogenadas


 PURINAS




   PIRIMIDINAS



                           6
Composição química
   Número de adeninas = número de timinas
   (A =T)
   Número de guaninas = número de citosinas
   (G = C)
   Número de purinas = número de pirimidinas
   (AG = TC)
   Número de pares AT ≠ CG → característico de cada
    tipo de DNA


                                       7
Como os compostos químicos se ligam?




                           8
Ligações químicas
 Ligação açúcar – ácido fosfórico
 Ligação açúcar – base nitrogenada




                                9
O nucleotídeo




                10
Composição química
Nucleotídeo
 Grupo fosfato
 Açúcar
  – Desoxirribose
 Base   nitrogenada                          Base
                                          nitrogenada

  – Adenina
  – Citosina           Grupo
                       fosfato

  – Guanina
                                 Açúcar
  – Timina
                                   11
Como se forma um filamento da
      molécula de DNA?




                        12
Ligação Fosfodiéster
 Liganucleotídeos
 para formar o
 filamento de DNA

Ligação fosfodiéster
 Carbono 3’ de um
  nucleotídeo
 Carbono 5’ do
  nucleotídeo adjacente
                          13
Filamento ou fita
  simples de DNA
- Extremidade 5’ →
  carbono 5’ da pentose

- Extremidade 3’→ carbono
  3’ da pentose




                            14
Como os dois filamentos da molécula de
         DNA se associam?




                             15
Pontes de hidrogênio
 Ligam os dois
 filamentos da
 molécula de DNA

 Pontes   de hidrogênio
  – A e T → 2 pontes
  – C e G → 3 pontes


                           16
Qual é a estrutura da molécula de DNA?




                            17
DNA - Estrutura plana
 Dupla  hélice              5’         3’

 2 filamentos ou fitas
  – Ligados por pontes de
    hidrogênio
  – Polaridades opostas
   (5’ - 3’)
  – antiparalelos

                            3’         5’


                                  18
DNA - Estrutura tridimensional
 Alfa hélice
 Eixo central imaginário
 Rotação para direita
 Sulco maior e menor
  alternados em uma
  mesma fita
 Sulco maior
  corresponde a sulco
  menor em lados
  opostos da molécula
                                                 19
            http://www.naquelesite.com/profcharles/?m=20091027
DNA – Modelo molecular
   1953 → James Dewey
    Watson, Francis Harry
    Compton Crick e Maurice
    Hugh Frederick Wilkins
   Descrição da alfa-hélice
    com a primeira utilização
    de um modelo molecular
    construído com hastes
    de metal e esferas de
    madeira
   1962 → Prêmio Nobel de
    Fisiologia            http://www.myspace.com/paperstreet2006
                                                20
DNA – Estrutura Molecular
 Estabilidade
 Pontes de hidrogênio
  entre as bases
  nitrogenadas
 Forças hidrofóbicas
  devido ao
  empilhamento dos
  pares de bases
  nitrogenadas pareadas
                      http://blog.cmdmc.com.br/album/default/2
                                       21
DNA - Estrutura molecular
   B-DNA= condições
    fisiológicas (baixa
    concentração de sal)
   A-DNA= “in vitro”
    (alta concentração
    de sais ou
    parcialmente
    desidratada)
   Z-DNA= “in vitro”
    (polímeros ricos em
    G:C, com purinas e
    pirimidinas
    alternadas na          http://www.ufpe.br/biolmol/aula2_DNAestrutrep.htm
    mesma fita)
                                                      22
Qual é a função do DNA?




                    23
Função
 Armazenamento    da
  informação genética
 Transmissão das
  características
  hereditárias para as
  próximas gerações
 Regulação da
  expressão dos
  genes
        http://www.techfak.uni-bielefeld.de/bcd/ForAll/Basics/welcome2.html
                                                     24
Como o material genético se duplica?
Mecanismo de duplicação
 Semiconservativo
   Cada fita da
    molécula de DNA
    origina uma nova
    fita
   Cada fita da
    molécula de DNA
    funciona como um
    molde
Quais são as enzimas que participam do
       processo de duplicação?
Enzimas
 DNA helicase
 Proteínas de ligação de fita simples (SSB)
 RNA primase
 DNA polimerases (I e III)
 DNA ligase
 DNA topoisomerase
DNA helicase
 Quebra as pontes
  de hidrogênio entre
  as bases                  DNA
                           helicase
  complementares
  separando as duas
  fitas da molécula
  de DNA
Proteínas de ligação de fita
          simples (SSB)
 Se ligam às
  regiões de fita
  simples para              DNA
                           helicase

  protegê-las da             SSB

  degradação
  (hidrólise) por
  enzimas
  (nucleases)
RNA primase
 Sintetiza o fragmento iniciador para que em
  seguida a DNA polimerase continue a síntese
                   DNA molde


                               RNA primase



            Iniciador
              RNA
                        DNA polimerase III



                          DNA
DNA polimerases
 Adicionam nucleotídeos ao filamento em
  crescimento na extremidade 3’ OH
 Não são capazes iniciar a síntese,
  necessitam de um pequeno filamento de
  nucleotídeos, um iniciador
 Necessitam dos quatro
  desoxirribonucleotídeos trifosfato
  (dTTP, dATP, dGTP e dCTP)
 Dependem de Mg 2+
DNA polimerase III
 Complexo enzimático com 10 subunidades
  responsável pela polimerização no sentido
  5’→3’ da fita de DNA recém-formada
 Esta holoenzima apresenta ainda a atividade
  3’→5’ exonucleásica que permite que
  nucleotídeos incorretos adicionados sejam
  prontamente removidos, um por vez, durante
  a duplicação e substituídos por nucleotídeos
  corretos, mecanismo de revisão e reparo
DNA polimerase III
 Polimerização no sentido 5’ → 3’
                      dTTP a ser
                     incorporado




                              Fita em
        Fita molde                        Direção da
                            crescimento
                                            síntese
DNA polimerase III
 Mecanismo de revisão e reparo
   Atividade 3’→5’ exonucleásica
   Remoção de nucleotídeos incorretos
    adicionados
   um nucleotídeo de cada vez
   durante a replicação
   substituição por nucleotídeos corretos
DNA polimerase III
 Atividade 3’→5’ exonucleásica
DNA polimerase I
 Reparo de DNA danificado
 Atividades
   polimerase 5’→3’
   exonuclease 3’→5’
   exonuclease 5’→3’, permite que vários
    nucleotídeos sejam removidos de cada vez
DNA polimerase I
 Atividade 3’→5’ e 5’→3’ exonucleásica
Duplicação do DNA
 Fita líder → replicada de forma contínua
  na direção 5’→3’
 Fita retardatária → replicada de forma
  descontínua e no sentido inverso para
  manter a mesma direção 5’→3’
 A fita descontínua é replicada através de
  fragmentos de Okasaki
Forquilha de duplicação

                         Fitas molde


                         Forquilha de
                          replicação


                             DNA
                         polimerase III
        Fragmentos
            de
                               DNA
          Okasaki
                              ligase
     Fita retardatária
           Fita líder
Fragmentos de Okasaki
 1000 a 2000 nucleotídeos
 DNA recém sintetizado
 RNA iniciador que será substituído por
  desoxirribonucleotídeos pela DNA
  polimerase I
 DNA ligase reconstituirá a nova fita.
Duplicação do DNA
 Procariontes (bactérias e algas cianofíceas)
 Um ponto de origem e um ponto de
  término da duplicação
 Eucariontes
 Vários pontos de origem e vários pontos
  de término da duplicação
Duplicação do DNA
Procariontes   Eucariontes
Como a duplicação da molécula de DNA
ocorre nas duas fitas ao mesmo tempo?
Duplicação do DNA
 A partir do ponto de origem as forquilhas de
  seguem nas duas direções até o(s) ponto(s)
  de término.

                                O    Forquilha de replicação
    Forquilha de replicação




                                                       T
      T


                       Direção da replicação
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www.enq.ufsc.br/.../genetica/DNA.html
Qual é a função da DNA topoisomerase I ?
DNA topoisomerase I
 Reduz o enovelamento a frente da
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  fornecendo um eixo de rotação que
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  lados     opostos    da    quebra    girem
  independentemente, com o filamento
  intacto servindo como eixo.
Duplicação
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      A medida que as
       novas moléculas
       vão sendo
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O material genético e a sua duplicação

  • 1. UNIVERSIDADE FEDERAL DA PARAÍBA CENTRO DE CIÊNCIAS EXATAS E DA NATUREZA DEPARTAMENTO DE BIOLOGIA MOLECULAR DISCIPLINA: GENÉTICA MOLECULAR O material genético e a sua duplicação Profª Hilzeth de Luna Freire Pessôa 1
  • 2. Material genético  Composição química  Estrutura  Função 2
  • 3. Quais são os compostos químicos que formam a molécula do DNA? 3
  • 5. Composição química  Açúcar – Pentose → 5 carbonos  desoxirribose
  • 6. Composição química  Bases nitrogenadas PURINAS PIRIMIDINAS 6
  • 7. Composição química  Número de adeninas = número de timinas  (A =T)  Número de guaninas = número de citosinas  (G = C)  Número de purinas = número de pirimidinas  (AG = TC)  Número de pares AT ≠ CG → característico de cada tipo de DNA 7
  • 8. Como os compostos químicos se ligam? 8
  • 9. Ligações químicas  Ligação açúcar – ácido fosfórico  Ligação açúcar – base nitrogenada 9
  • 11. Composição química Nucleotídeo  Grupo fosfato  Açúcar – Desoxirribose  Base nitrogenada Base nitrogenada – Adenina – Citosina Grupo fosfato – Guanina Açúcar – Timina 11
  • 12. Como se forma um filamento da molécula de DNA? 12
  • 13. Ligação Fosfodiéster  Liganucleotídeos para formar o filamento de DNA Ligação fosfodiéster  Carbono 3’ de um nucleotídeo  Carbono 5’ do nucleotídeo adjacente 13
  • 14. Filamento ou fita simples de DNA - Extremidade 5’ → carbono 5’ da pentose - Extremidade 3’→ carbono 3’ da pentose 14
  • 15. Como os dois filamentos da molécula de DNA se associam? 15
  • 16. Pontes de hidrogênio  Ligam os dois filamentos da molécula de DNA  Pontes de hidrogênio – A e T → 2 pontes – C e G → 3 pontes 16
  • 17. Qual é a estrutura da molécula de DNA? 17
  • 18. DNA - Estrutura plana  Dupla hélice 5’ 3’  2 filamentos ou fitas – Ligados por pontes de hidrogênio – Polaridades opostas (5’ - 3’) – antiparalelos 3’ 5’ 18
  • 19. DNA - Estrutura tridimensional  Alfa hélice  Eixo central imaginário  Rotação para direita  Sulco maior e menor alternados em uma mesma fita  Sulco maior corresponde a sulco menor em lados opostos da molécula 19 http://www.naquelesite.com/profcharles/?m=20091027
  • 20. DNA – Modelo molecular  1953 → James Dewey Watson, Francis Harry Compton Crick e Maurice Hugh Frederick Wilkins  Descrição da alfa-hélice com a primeira utilização de um modelo molecular construído com hastes de metal e esferas de madeira  1962 → Prêmio Nobel de Fisiologia http://www.myspace.com/paperstreet2006 20
  • 21. DNA – Estrutura Molecular  Estabilidade  Pontes de hidrogênio entre as bases nitrogenadas  Forças hidrofóbicas devido ao empilhamento dos pares de bases nitrogenadas pareadas http://blog.cmdmc.com.br/album/default/2 21
  • 22. DNA - Estrutura molecular  B-DNA= condições fisiológicas (baixa concentração de sal)  A-DNA= “in vitro” (alta concentração de sais ou parcialmente desidratada)  Z-DNA= “in vitro” (polímeros ricos em G:C, com purinas e pirimidinas alternadas na http://www.ufpe.br/biolmol/aula2_DNAestrutrep.htm mesma fita) 22
  • 23. Qual é a função do DNA? 23
  • 24. Função  Armazenamento da informação genética  Transmissão das características hereditárias para as próximas gerações  Regulação da expressão dos genes http://www.techfak.uni-bielefeld.de/bcd/ForAll/Basics/welcome2.html 24
  • 25. Como o material genético se duplica?
  • 26. Mecanismo de duplicação  Semiconservativo  Cada fita da molécula de DNA origina uma nova fita  Cada fita da molécula de DNA funciona como um molde
  • 27. Quais são as enzimas que participam do processo de duplicação?
  • 28. Enzimas  DNA helicase  Proteínas de ligação de fita simples (SSB)  RNA primase  DNA polimerases (I e III)  DNA ligase  DNA topoisomerase
  • 29. DNA helicase  Quebra as pontes de hidrogênio entre as bases DNA helicase complementares separando as duas fitas da molécula de DNA
  • 30. Proteínas de ligação de fita simples (SSB)  Se ligam às regiões de fita simples para DNA helicase protegê-las da SSB degradação (hidrólise) por enzimas (nucleases)
  • 31. RNA primase  Sintetiza o fragmento iniciador para que em seguida a DNA polimerase continue a síntese DNA molde RNA primase Iniciador RNA DNA polimerase III DNA
  • 32. DNA polimerases  Adicionam nucleotídeos ao filamento em crescimento na extremidade 3’ OH  Não são capazes iniciar a síntese, necessitam de um pequeno filamento de nucleotídeos, um iniciador  Necessitam dos quatro desoxirribonucleotídeos trifosfato (dTTP, dATP, dGTP e dCTP)  Dependem de Mg 2+
  • 33. DNA polimerase III  Complexo enzimático com 10 subunidades responsável pela polimerização no sentido 5’→3’ da fita de DNA recém-formada  Esta holoenzima apresenta ainda a atividade 3’→5’ exonucleásica que permite que nucleotídeos incorretos adicionados sejam prontamente removidos, um por vez, durante a duplicação e substituídos por nucleotídeos corretos, mecanismo de revisão e reparo
  • 34. DNA polimerase III  Polimerização no sentido 5’ → 3’ dTTP a ser incorporado Fita em Fita molde Direção da crescimento síntese
  • 35. DNA polimerase III  Mecanismo de revisão e reparo  Atividade 3’→5’ exonucleásica  Remoção de nucleotídeos incorretos adicionados  um nucleotídeo de cada vez  durante a replicação  substituição por nucleotídeos corretos
  • 36. DNA polimerase III  Atividade 3’→5’ exonucleásica
  • 37. DNA polimerase I  Reparo de DNA danificado  Atividades  polimerase 5’→3’  exonuclease 3’→5’  exonuclease 5’→3’, permite que vários nucleotídeos sejam removidos de cada vez
  • 38. DNA polimerase I  Atividade 3’→5’ e 5’→3’ exonucleásica
  • 39. Duplicação do DNA  Fita líder → replicada de forma contínua na direção 5’→3’  Fita retardatária → replicada de forma descontínua e no sentido inverso para manter a mesma direção 5’→3’  A fita descontínua é replicada através de fragmentos de Okasaki
  • 40. Forquilha de duplicação Fitas molde Forquilha de replicação DNA polimerase III Fragmentos de DNA Okasaki ligase Fita retardatária Fita líder
  • 41. Fragmentos de Okasaki  1000 a 2000 nucleotídeos  DNA recém sintetizado  RNA iniciador que será substituído por desoxirribonucleotídeos pela DNA polimerase I  DNA ligase reconstituirá a nova fita.
  • 42. Duplicação do DNA  Procariontes (bactérias e algas cianofíceas)  Um ponto de origem e um ponto de término da duplicação  Eucariontes  Vários pontos de origem e vários pontos de término da duplicação
  • 44. Como a duplicação da molécula de DNA ocorre nas duas fitas ao mesmo tempo?
  • 45. Duplicação do DNA  A partir do ponto de origem as forquilhas de seguem nas duas direções até o(s) ponto(s) de término. O Forquilha de replicação Forquilha de replicação T T Direção da replicação O → Origem T → Término
  • 46. Como todas as enzimas trabalham juntas na forquilha de duplicação?
  • 47. Duplicação simultânea das duas fitas de DNA www.enq.ufsc.br/.../genetica/DNA.html
  • 48. Qual é a função da DNA topoisomerase I ?
  • 49. DNA topoisomerase I  Reduz o enovelamento a frente da forquilha de duplicação  Cataliza quebras transitórias das ligações fosfodiéster em um dos filamentos fornecendo um eixo de rotação que permite que os segmentos de DNA em lados opostos da quebra girem independentemente, com o filamento intacto servindo como eixo.
  • 50. Duplicação do DNA  A medida que as novas moléculas vão sendo sintetizadas assumem a conformação em α-hélice theuniversalmatrix.com/pt-br/artigos/?p=86