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Characterization, developmental
  expression and evolutionary
  features of the huntingtin gene in
  the amphioxus Branchiostoma
  floridae



Daniel Gomes Xavier
Universidade Federal do ABC
Proposta
Investigar se o gene Huntingtina (IT15)
estava envolvido no desenvolvimento do
Sistema Nervoso no último ancestral
comum dos Cordados, o Anfioxo.
Anfioxo
Doença de Huntington

É um distúrbio neurológico hereditário que
foi descrito em 1872 pelo médico norte-
americano George Huntington.
Doença de Huntington

A doença é responsável pela degeneração
corporal e mental do seu portador e se
desenvolve geralmente por volta dos 40
anos.
Doença de Huntington

- O doente passa a ter movimentos
involuntários do corpo, que mais tarde se
torna uma rigidez.
- Além disso perde capacidade mental,
impossibilitando a pessoa de viver de
forma autônoma.
Doença de Huntington

- Por ser uma doença
genética não possui
cura e as chances de um
pai/mãe passar para o
filho são de 50%, uma
vez que é autossômica
dominante.
Doença de Huntington: causa

- Alteração no gene IT15.




          Esboço da proteína sintetizada à partir do IT15.
Gene IT15

A função do gene ainda é objeto de estudo de
cientistas, mas pelas características da doença
de Huntington deduz-se que sua atuação em
funções cerebrais é grande.

Além disso a sequência de nucleotídios que
compõe o gene está praticamente toda
conservada, indicando sua importância.
Gene IT15

A alteração no gene que resulta o surgimento da
Doença de Huntington é uma repetição anormal
da trinca CAG, responsável pela codificação da
glutamina.
Gene IT15

As cadeias polyQ são normais nas porções das
proteínas dos mamíferos, mas nos portadores
de Huntington são alongadas ao extremo.
A quantidade de trincas de CAG no gene IT15
em uma pessoal saudável gira em torno de 20.
Nos doentes são encontradas pelo menos mais
de 36 vezes.
Gene IT15

Como mencionado anteriormente existe muita
dificuldade em caracterizar uma função ao gene.
Um dos motivos é que a sequência de
aminoácidos codificados por ele, não é parecida
com a de nenhuma outra proteína.
Gene IT15

Entretanto estudos mostram que sua função
pode estar ligada a participação nas interações
de proteínas.

Repetição HEAT consensa: cerca de 40
aminoácidos de longas sequências que ocorre
múltiplas vezes.
Mas por que o Anfioxo?

Alguns pesquisadores descobriram diferenças
entre a Huntingtina de vertebrados e
invertebrados, como mostrado à seguir:

                                Vertebrados   Invertebrados

        Splicing alternativo                        x

     Presença da cadeia PolyQ        x

     Função neuro-relacionada        x
Mas por que o Anfioxo?

- O Anfioxo é considerado um Cordado
invertebrado. São nele os primeiros registros de
aparição da notocorda.

- Aproveitou-se o fato de seu genoma ter sido
sequenciado

- Sistema nervoso parecido com o dos
vertebrados.
Mas por que o Anfioxo?




  1 - gânglio cerebral       8 - poro abdominal           15 - gónadas
  2 - notocorda              9 - lacuna supra-faríngica   16 - sensor de luz
  3 - nervo dorsal           10 - abertura branquial      17 - nervos
  4 - barbatana pós-anal     11 - faringe                 18 - barbatana
  5 - ânus                   12 - lacuna bucal            abdominal
  6 - tubo digestivo         13 - mimosa                  19 - bolsa hepática
  7 - sistema circulatório   14 - abertura bucal
Clonagem e Caracterização do Gene
Método aplicado: RT-PCR nos clones de um anfioxo adulto e PCR nos clones dos
embriões.

Método RT-PCR




Método PCR
Clonagem e Caracterização do Gene
Método aplicado: RT-PCR nos clones de um anfioxo adulto e PCR nos clones dos
embriões.
Clonagem e Caracterização do Gene
                           Camundongo

                          Rato Marrom


                         Homem


                 Porco Doméstico


                            Galo

                            Rã


               Peixe

               Peixe


               Peixe


               Anfioxo


  Ciona

  Ciona
Clonagem e Caracterização do Gene
Clonagem e Caracterização do Gene
Conclusões da análise:
1- Mamíferos com sequências muito parecidas.
2- Variação da sequência praticamente apenas
nas cadeias PolyQ e PolyP .
3- Cadeia PolyQ presente apenas em vertebrados
e cadeia PolyP apenas nos mamíferos.
4- Anfioxo apresenta cadeia PolyQ.
Clonagem e Caracterização do Gene
Comparação da repetição HEAT:
Comparação da organização genônica do IT15


                     Anfioxo   Peixes   Humanos   Ciona


       Exons           63       67        67       61




 Tamanho da Região    50Kb     80Kb      180Kb    33Kb
Comparação Exons/Introns
Expressão da Huntingtina do Anfioxo
Foi feita observação do desenvolvimento do
Anfioxo até virar uma larva.
- No primeiro estágio (fertilização 0h – gástrula
10h) não foi detectada transcrição da
Huntingtina.
- A primeira expressão visível foi observada no
estágio de nêurula-precoce 11h. A maioria das
transcrições foi observada na ponta anterior da
placa neural e foi se espalhando ao longo da
vesícula cerebral com o tempo.
Discussão geral
O gene Huntingtina (IT15) do Anfioxo não sofreu
eventos que caracterizam extensas duplicações
de genômas dos vertebrados, porém também
possui uma cadeia polyQ.
Discussão geral
Em relação a repetição HEAT consensa os testes
mostraram uma conservação desde os Anfioxos
no extremo terminal N (posição inicial). Porém
isso não é suficiente para uma conclusão mais
aprofundada da função do gene.
Conclusão
Estudos recentes apontavam que a Huntingtina
nos mamíferos tinham diversas funções em seu
desenvolvimento. Eles acreditavam que isso era
fruto de uma função ancestral de sistema
nervoso mal organizado.
Conclusão
Porém esse estudo mostra que o gene nos
Anfioxos (540 milhões de anos atrás) já era
expresso particularmente em seu sistema
nervoso.
Além disso acredita-se que essa função ancestral
está posicionada no extremo terminal N da
cadeia polipeptídica.
Bibliografia
Artigo: Characterization, developmental
expression and evolutionary features of the
huntingtin gene in the amphioxus Branchiostoma
floridae – BioMed Central Ltd.

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Caracterização do Gene Huntingtina (IT15)

  • 1. Characterization, developmental expression and evolutionary features of the huntingtin gene in the amphioxus Branchiostoma floridae Daniel Gomes Xavier Universidade Federal do ABC
  • 2. Proposta Investigar se o gene Huntingtina (IT15) estava envolvido no desenvolvimento do Sistema Nervoso no último ancestral comum dos Cordados, o Anfioxo.
  • 4. Doença de Huntington É um distúrbio neurológico hereditário que foi descrito em 1872 pelo médico norte- americano George Huntington.
  • 5. Doença de Huntington A doença é responsável pela degeneração corporal e mental do seu portador e se desenvolve geralmente por volta dos 40 anos.
  • 6. Doença de Huntington - O doente passa a ter movimentos involuntários do corpo, que mais tarde se torna uma rigidez. - Além disso perde capacidade mental, impossibilitando a pessoa de viver de forma autônoma.
  • 7. Doença de Huntington - Por ser uma doença genética não possui cura e as chances de um pai/mãe passar para o filho são de 50%, uma vez que é autossômica dominante.
  • 8. Doença de Huntington: causa - Alteração no gene IT15. Esboço da proteína sintetizada à partir do IT15.
  • 9. Gene IT15 A função do gene ainda é objeto de estudo de cientistas, mas pelas características da doença de Huntington deduz-se que sua atuação em funções cerebrais é grande. Além disso a sequência de nucleotídios que compõe o gene está praticamente toda conservada, indicando sua importância.
  • 10. Gene IT15 A alteração no gene que resulta o surgimento da Doença de Huntington é uma repetição anormal da trinca CAG, responsável pela codificação da glutamina.
  • 11. Gene IT15 As cadeias polyQ são normais nas porções das proteínas dos mamíferos, mas nos portadores de Huntington são alongadas ao extremo. A quantidade de trincas de CAG no gene IT15 em uma pessoal saudável gira em torno de 20. Nos doentes são encontradas pelo menos mais de 36 vezes.
  • 12. Gene IT15 Como mencionado anteriormente existe muita dificuldade em caracterizar uma função ao gene. Um dos motivos é que a sequência de aminoácidos codificados por ele, não é parecida com a de nenhuma outra proteína.
  • 13. Gene IT15 Entretanto estudos mostram que sua função pode estar ligada a participação nas interações de proteínas. Repetição HEAT consensa: cerca de 40 aminoácidos de longas sequências que ocorre múltiplas vezes.
  • 14. Mas por que o Anfioxo? Alguns pesquisadores descobriram diferenças entre a Huntingtina de vertebrados e invertebrados, como mostrado à seguir: Vertebrados Invertebrados Splicing alternativo x Presença da cadeia PolyQ x Função neuro-relacionada x
  • 15. Mas por que o Anfioxo? - O Anfioxo é considerado um Cordado invertebrado. São nele os primeiros registros de aparição da notocorda. - Aproveitou-se o fato de seu genoma ter sido sequenciado - Sistema nervoso parecido com o dos vertebrados.
  • 16. Mas por que o Anfioxo? 1 - gânglio cerebral 8 - poro abdominal 15 - gónadas 2 - notocorda 9 - lacuna supra-faríngica 16 - sensor de luz 3 - nervo dorsal 10 - abertura branquial 17 - nervos 4 - barbatana pós-anal 11 - faringe 18 - barbatana 5 - ânus 12 - lacuna bucal abdominal 6 - tubo digestivo 13 - mimosa 19 - bolsa hepática 7 - sistema circulatório 14 - abertura bucal
  • 17. Clonagem e Caracterização do Gene Método aplicado: RT-PCR nos clones de um anfioxo adulto e PCR nos clones dos embriões. Método RT-PCR Método PCR
  • 18. Clonagem e Caracterização do Gene Método aplicado: RT-PCR nos clones de um anfioxo adulto e PCR nos clones dos embriões.
  • 19. Clonagem e Caracterização do Gene Camundongo Rato Marrom Homem Porco Doméstico Galo Rã Peixe Peixe Peixe Anfioxo Ciona Ciona
  • 21. Clonagem e Caracterização do Gene Conclusões da análise: 1- Mamíferos com sequências muito parecidas. 2- Variação da sequência praticamente apenas nas cadeias PolyQ e PolyP . 3- Cadeia PolyQ presente apenas em vertebrados e cadeia PolyP apenas nos mamíferos. 4- Anfioxo apresenta cadeia PolyQ.
  • 22. Clonagem e Caracterização do Gene Comparação da repetição HEAT:
  • 23. Comparação da organização genônica do IT15 Anfioxo Peixes Humanos Ciona Exons 63 67 67 61 Tamanho da Região 50Kb 80Kb 180Kb 33Kb
  • 25. Expressão da Huntingtina do Anfioxo Foi feita observação do desenvolvimento do Anfioxo até virar uma larva. - No primeiro estágio (fertilização 0h – gástrula 10h) não foi detectada transcrição da Huntingtina. - A primeira expressão visível foi observada no estágio de nêurula-precoce 11h. A maioria das transcrições foi observada na ponta anterior da placa neural e foi se espalhando ao longo da vesícula cerebral com o tempo.
  • 26. Discussão geral O gene Huntingtina (IT15) do Anfioxo não sofreu eventos que caracterizam extensas duplicações de genômas dos vertebrados, porém também possui uma cadeia polyQ.
  • 27. Discussão geral Em relação a repetição HEAT consensa os testes mostraram uma conservação desde os Anfioxos no extremo terminal N (posição inicial). Porém isso não é suficiente para uma conclusão mais aprofundada da função do gene.
  • 28. Conclusão Estudos recentes apontavam que a Huntingtina nos mamíferos tinham diversas funções em seu desenvolvimento. Eles acreditavam que isso era fruto de uma função ancestral de sistema nervoso mal organizado.
  • 29. Conclusão Porém esse estudo mostra que o gene nos Anfioxos (540 milhões de anos atrás) já era expresso particularmente em seu sistema nervoso. Além disso acredita-se que essa função ancestral está posicionada no extremo terminal N da cadeia polipeptídica.
  • 30. Bibliografia Artigo: Characterization, developmental expression and evolutionary features of the huntingtin gene in the amphioxus Branchiostoma floridae – BioMed Central Ltd.