(1) O documento apresenta um modelo booleano de rede regulatória do ciclo celular com foco na transição G1/S; (2) O modelo simulou a dinâmica da rede e identificou um grande atrator correspondente à fase S do ciclo celular; (3) Análises comparativas demonstraram que a rede proposta é mais robusta do que redes aleatórias e pode ser decomposta em um "backbone motif" essencial para suas funções biológicas.
Rethinking microbial diversity analysis in the high throughput sequencing eraLeandro Lemos
Este documento discute a análise da diversidade microbiana na era do sequenciamento de alto rendimento. Ele conclui que abordagens baseadas na filogenia são importantes para comparar comunidades microbianas com alta ou baixa cobertura de sequências, enquanto abordagens baseadas em unidades taxonômicas operacionais requerem alta cobertura para detectar mudanças. A quantidade de sequências necessária depende do ambiente analisado e se ele é similar ou não.
Aula ministrada no curso de Biodiversidade e Conservação, dos cursos de Ciências Biológicas e Engenharia Agronômica, da Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ/USP).
Seminário final de Métodos estatísticos aplicados às Ciências Biológicas - MA...Leandro Lemos
1) O estudo avaliou as diferenças nas comunidades microbianas entre tecidos normais e tumorais de 8 pacientes chineses com câncer colorretal usando sequenciamento do gene 16S;
2) A análise revelou dois padrões de variação - aumento de Roseburia em 50% dos pacientes e diminuição de Microbacterium e Anoxybacillus em 75%;
3) Os resultados mostraram padrões semelhantes de microbiota entre populações diferentes, sugerindo fatores de risco comuns para câncer colorretal.
Arquéias oxidadoras de amônia (Seminário final de Ecologia Microbiana [Usp])Leandro Lemos
O documento resume as principais informações sobre Archaea oxidadoras de amônia (AOA), incluindo sua descoberta, fisiologia, bioquímica e genômica comparativa. As AOA desempenham um papel importante no ciclo do nitrogênio e competem com bactérias oxidadoras de amônia por substratos como amônia. Sua fisiologia extremamente oligotrófica lhes permite ocupar muitos habitats diferentes.
Bioinformática aplicada nas análises da microbiota do rúmenLeandro Lemos
Aula ministrada na disciplina 'Genômica e Bioinformática', do curso de pós-graduação em Ciências (Energia Nuclear), do Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA/USP).
1) Bivalvia inclui cerca de 8.000 espécies, a maioria marinha, como ostras, mexilhões e vierias.
2) Possuem concha dividida em duas valvas e um par de brânquias.
3) Seu achatamento lateral facilita a escavação no sedimento para obtenção de alimento enquanto enterrados.
O documento descreve as características e classificação de bactérias e arqueas, que pertencem ao Reino Monera. As bactérias podem ser classificadas de acordo com sua forma, como coco, bacilo, espirroquetas e vibrião. Elas se reproduzem principalmente de forma assexuada e desempenham papéis importantes na natureza, como decomposição de matéria orgânica. As arqueas são organismos procariontes encontrados em ambientes extremos como fontes termais.
O documento discute as características dos reinos Bactéria e Arquea. Ele descreve que as bactérias são microorganismos unicelulares procariotas que possuem parede celular, enquanto as arqueas também são microscópicas mas não possuem peptidoglicano em sua parede celular. O documento fornece detalhes sobre a classificação, reprodução, nutrição e papéis das bactérias e arqueas na indústria, biotecnologia e doenças.
Rethinking microbial diversity analysis in the high throughput sequencing eraLeandro Lemos
Este documento discute a análise da diversidade microbiana na era do sequenciamento de alto rendimento. Ele conclui que abordagens baseadas na filogenia são importantes para comparar comunidades microbianas com alta ou baixa cobertura de sequências, enquanto abordagens baseadas em unidades taxonômicas operacionais requerem alta cobertura para detectar mudanças. A quantidade de sequências necessária depende do ambiente analisado e se ele é similar ou não.
Aula ministrada no curso de Biodiversidade e Conservação, dos cursos de Ciências Biológicas e Engenharia Agronômica, da Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ/USP).
Seminário final de Métodos estatísticos aplicados às Ciências Biológicas - MA...Leandro Lemos
1) O estudo avaliou as diferenças nas comunidades microbianas entre tecidos normais e tumorais de 8 pacientes chineses com câncer colorretal usando sequenciamento do gene 16S;
2) A análise revelou dois padrões de variação - aumento de Roseburia em 50% dos pacientes e diminuição de Microbacterium e Anoxybacillus em 75%;
3) Os resultados mostraram padrões semelhantes de microbiota entre populações diferentes, sugerindo fatores de risco comuns para câncer colorretal.
Arquéias oxidadoras de amônia (Seminário final de Ecologia Microbiana [Usp])Leandro Lemos
O documento resume as principais informações sobre Archaea oxidadoras de amônia (AOA), incluindo sua descoberta, fisiologia, bioquímica e genômica comparativa. As AOA desempenham um papel importante no ciclo do nitrogênio e competem com bactérias oxidadoras de amônia por substratos como amônia. Sua fisiologia extremamente oligotrófica lhes permite ocupar muitos habitats diferentes.
Bioinformática aplicada nas análises da microbiota do rúmenLeandro Lemos
Aula ministrada na disciplina 'Genômica e Bioinformática', do curso de pós-graduação em Ciências (Energia Nuclear), do Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA/USP).
1) Bivalvia inclui cerca de 8.000 espécies, a maioria marinha, como ostras, mexilhões e vierias.
2) Possuem concha dividida em duas valvas e um par de brânquias.
3) Seu achatamento lateral facilita a escavação no sedimento para obtenção de alimento enquanto enterrados.
O documento descreve as características e classificação de bactérias e arqueas, que pertencem ao Reino Monera. As bactérias podem ser classificadas de acordo com sua forma, como coco, bacilo, espirroquetas e vibrião. Elas se reproduzem principalmente de forma assexuada e desempenham papéis importantes na natureza, como decomposição de matéria orgânica. As arqueas são organismos procariontes encontrados em ambientes extremos como fontes termais.
O documento discute as características dos reinos Bactéria e Arquea. Ele descreve que as bactérias são microorganismos unicelulares procariotas que possuem parede celular, enquanto as arqueas também são microscópicas mas não possuem peptidoglicano em sua parede celular. O documento fornece detalhes sobre a classificação, reprodução, nutrição e papéis das bactérias e arqueas na indústria, biotecnologia e doenças.
CONTROLE MPC MULTIVARIÁVEL COM RESTRIÇÕES USANDO FUNÇÕES DE LAGUERREUFPA
Este documento descreve uma dissertação de mestrado que apresenta um controlador preditivo multivariável com restrições usando funções de Laguerre. O controlador propõe usar funções de Laguerre para prever trajetórias de sinal de controle e reduzir a carga computacional, melhorando o compromisso entre viabilidade do sinal de controle e desempenho do sistema. O documento relata testes com um manipulador robótico e uma coluna de destilação.
A cadeia de Markov na análise de convergência do algoritmo genético quando...vcsouza
1. O documento apresenta uma tese de doutorado sobre análise de convergência de algoritmos genéticos usando cadeia de Markov.
2. A tese usa cadeia de Markov para modelar e analisar a convergência tanto de algoritmos genéticos homogêneos quanto não-homogêneos.
3. Testes comparam o desempenho de um algoritmo genético padrão com um algoritmo genético nebuloso, onde a taxa de mutação é ajustada por um controlador nebuloso.
Este documento descreve uma dissertação de mestrado sobre um conversor multinível modular (CMM). O trabalho apresenta um modelo analítico do CMM em regime permanente que descreve matematicamente variáveis como oscilação de tensão dos capacitores e corrente circulante. O modelo inclui controle de corrente circulante de segundo harmônico e permite estudar o funcionamento do CMM sem simulação numérica.
Algoritmo genético aplicado no planejamento da operação de um parque eólicoRobson Josué Molgaro
1) O documento apresenta uma metodologia para o planejamento da operação de médio prazo de um parque eólico utilizando algoritmos genéticos, com o objetivo de minimizar os custos de geração a partir de energia eólica.
2) Foram modeladas curvas de potência e custo específico para três aerogeradores do parque eólico. Um algoritmo genético é utilizado para determinar a energia que cada aerogerador deve produzir para atender a demanda com menor custo.
3) O planejamento
operacao e manutencao de sistemas de cogeracao1 convertedPedro Amone
Este documento descreve o funcionamento e manutenção de sistemas de cogeração. Apresenta os principais componentes destes sistemas e os modos de operação, incluindo o funcionamento em paridade térmica e elétrica. Também aborda os processos de manutenção de turbinas a gás e trocadores de calor, elementos essenciais destes sistemas.
Este documento apresenta um estudo comparativo de três arquiteturas para monitoração e controle do sistema de alimentação elétrica do Pátio Itaquera a partir do Centro de Controle Operacional. Foram identificadas as partes interessadas, levantados os requisitos técnicos e operacionais e desenvolvidas as arquiteturas conceituais. A seleção da melhor alternativa ocorreu com base em uma matriz de decisão que considerou custos, segurança, interferência operacional e tempo médio de reparo.
O documento apresenta o programa da disciplina de Modelagem e Simulação de Processos. A disciplina introduz conceitos de modelagem matemática de processos da engenharia química através da aplicação das leis de conservação e métodos computacionais para simulação e otimização de processos. O programa inclui tópicos sobre modelagem de reatores e sistemas de separação, simulação estática e dinâmica, introdução à otimização de processos e uso de softwares de simulação.
ESTUDO DE MÉTODOS DE IDENTIFICAÇÃO DE SISTEMAS EM MALHA FECHADA APLICADOS A P...Patrick Pires Alvim
Neste trabalho são apresentados os principais métodos de identificação em malha fechada
para a obtenção de modelos matemáticos mais exatos do processo. Como contribuição é
proposto a aplicação do método em uma planta real didática. Inicialmente é realizado o ensaio
da planta em malha aberta e então projetado um controlador do tipo PI discreto para o
controle do nível. Com a planta operando em malha fechada controlada foi aplicado o método
de identificação em malha fechada denominado método de entrada-saída conjunta em três
diferentes ensaios, com diferentes sinais de excitação e então, estimado os possíveis modelos
matemáticos da planta. Para a estimativa dos modelos foram testadas as estruturas ARX,
ARMAX e OE no qual a OE foi a que apresentou melhores resultados. Com a realização dos
ensaios foi possível concluir que o controlador PI projetado em malha aberta obteve bom
desempenho, porém o método de identificação em malha fechada não obteve bom resultado,
podendo este estar relacionado à dificuldade da estimativa da função de sensibilidade do
sistema, às componentes de alta freqüência existentes nos sinais utilizados para identificação,
ou aos zeros de fase não mínima dos controladores e funções de transferência estimadas.
Este documento apresenta um estudo e estimação de parâmetros de um modelo elétrico de bateria. Foram implementados modelos elétricos e baseados em impedância para simular o comportamento de baterias. Um sistema experimental foi desenvolvido para testar baterias e estimar parâmetros internos através de espectroscopia de impedância eletroquímica. Os resultados obtidos permitiram analisar o desempenho dos diferentes modelos de bateria.
Contribuições ao controle de variância minima generalizado: abordagem de proj...UFPA
Neste trabalho, o controlador de Variância Mínima Generalizado, GMV, é desenvolvido no domínio de representações no espaço de estados, beneficiando-se de uma equivalência de seu preditor de variância mínima
com uma solução particular do Filtro de Kalman, a qual caracteriza uma atraente abordagem por evitar a solução da equação de Diophantine.
O documento descreve um curso de pós-graduação em sistemas elétricos oferecido pela Universidade Paulista - UNIP. O curso tem como objetivo capacitar profissionais da área elétrica para os desafios tecnológicos do setor, preparando-os através de nove módulos que cobrem tópicos como sistemas elétricos, máquinas elétricas, proteção, subestações e qualidade de energia. O curso tem duração de 12 meses, carga horária de 360 horas e é voltado a gradu
[1] O documento apresenta uma introdução ao programa ATP (Alternative Transients Program), que é um simulador digital para estudos de fenômenos transitórios em sistemas elétricos.
[2] O ATP permite a modelagem de vários componentes elétricos como linhas de transmissão, transformadores, bancos de capacitores e disjuntores, usando elementos concentrados e distribuídos.
[3] O documento descreve os principais modelos disponíveis no ATP como PI-equivalentes, transformadores e indutores não-lineares, que
Este documento apresenta um exemplo de cálculo dos indicadores de confiabilidade de um sistema de transmissão elétrica utilizando o método da perda total de continuidade de serviço e o esquema equivalente de confiabilidade. O sistema possui 6 componentes e 4 caminhos possíveis. Os cálculos resultam em uma frequência de falha de 0,814922 falhas/ano, duração média de falha de 5,95 horas e indisponibilidade de 4,844746 horas/ano.
PLANEJAMENTO DA OPERAÇÃO DE CURTO PRAZO: MODELAGEM E SIMULAÇÃO (Mota junior, ...Cláudio Siervi
Este trabalho trata de um estudo de caso sobre a operação coordenada de duas
hidrelétricas localizadas no Rio Corrente, na região Centro-Oeste do Brasil, sujeitas a
regimes regulatórios distintos: a usina de montante pertence ao despacho centralizado
do Operador Nacional do Sistema Elétrico (ONS) enquanto que a de jusante é
despachada fora do controle do ONS. O estudo teve como contexto o setor elétrico
brasileiro e foi desenvolvido em um ambiente com escassez de informações, onde o
operador busca por soluções viáveis para o problema de programação de operação.
Na primeira etapa do trabalho, foi feita uma análise qualitativa da conjuntura das
usinas a partir de uma perspectiva regulatória. Em seguida, empregando a técnica de
Dinâmica de Sistemas (que, de acordo com Ford (2010), é baseada em modelagem
simbólica de alto nível e simulação numérica), foi realizada uma elicitação da
metodologia empregada na programação de operação das usinas estudadas. Os
principais resultados foram: (a) a justificativa da construção de um único modelo de
operação coordenada para usinas de regimes regulatórios distintos e (b) um modelo
conceitual que foi convertido em um simulador de cenários operativos.
Este documento discute a estimação de canais PLC (Power Line Communications) e a avaliação do desempenho de sistemas OFDM usando esses canais. Ele propõe um método paramétrico baseado em EM para estimar os parâmetros do modelo de canal PLC de Zimmermann e testa seu desempenho em diferentes redes. Também avalia o desempenho de modulações BPSK, QPSK e 16-PSK usando o estimador proposto com diferentes proporções de pilotos no canal. Finalmente, sugere áreas para pesquisas futuras, como estim
Este documento descreve uma estratégia baseada em redes neurais artificiais para seleção on-line de controladores para sistemas não-lineares. O método é aplicado a um tanque esférico sujeito a perturbações, onde diferentes controladores PID são avaliados e uma rede neural é treinada para selecionar o melhor controlador com base em critérios de desempenho. Resultados de simulação demonstram a capacidade da rede neural em alternar entre controladores para manter o desempenho do sistema.
O documento apresenta os resultados preliminares de um projeto de prospecção tecnológica no setor de energia elétrica brasileiro. O estudo realizou um diagnóstico da situação atual identificando pontos fortes, fracos, desafios e oportunidades para o desenvolvimento tecnológico no setor. O documento também discute a visão de futuro construída para o armazenamento de energia, com entrada intensa de novas soluções entre 2025-2030.
Aula Biologia de Sistemas e ferramentas ômicasSandraMuxel
O documento discute a biologia dos sistemas, incluindo: 1) ômicas como dados para biologia dos sistemas; 2) bioinformática e suas aplicações; 3) bancos de dados que armazenam dados ômicos. Ele também aborda redes biológicas e ferramentas de bioinformática para análise de dados ômicos.
Modelagem de cargas utilizando sistemas baseados em regrasSuzana Viana Mota
Este documento propõe o desenvolvimento de modelos para prever o comportamento de cargas elétricas residenciais usando lógica fuzzy e um sistema especialista baseado em regras. O sistema foi implementado em Java e testado em diferentes situações para validar sua capacidade de modelar cargas elétricas de forma não intrusiva.
UPARSE: Análises de sequências de 16S rRNALeandro Lemos
O documento descreve o pipeline UPARSE para análise de sequências do gene 16S rRNA, incluindo qualidade de sequenciamento, demultiplexagem, remoção de primers, filtragem de sequências de baixa qualidade, agrupamento de OTUs e predição de taxonomia. O pipeline é implementado no software Usearch e permite processar milhares de sequências com alta acurácia em poucas horas.
O documento apresenta uma introdução ao sistema operacional Linux, abordando seus principais pontos como ser livre, ter diversas distribuições disponíveis, organizar arquivos em diretórios, utilizar programas de linha de comando para manipular arquivos de texto e navegar pelo sistema através do terminal.
Mais conteúdo relacionado
Semelhante a Seminário final de Introdução a Redes Booleanas Probabilísticas
CONTROLE MPC MULTIVARIÁVEL COM RESTRIÇÕES USANDO FUNÇÕES DE LAGUERREUFPA
Este documento descreve uma dissertação de mestrado que apresenta um controlador preditivo multivariável com restrições usando funções de Laguerre. O controlador propõe usar funções de Laguerre para prever trajetórias de sinal de controle e reduzir a carga computacional, melhorando o compromisso entre viabilidade do sinal de controle e desempenho do sistema. O documento relata testes com um manipulador robótico e uma coluna de destilação.
A cadeia de Markov na análise de convergência do algoritmo genético quando...vcsouza
1. O documento apresenta uma tese de doutorado sobre análise de convergência de algoritmos genéticos usando cadeia de Markov.
2. A tese usa cadeia de Markov para modelar e analisar a convergência tanto de algoritmos genéticos homogêneos quanto não-homogêneos.
3. Testes comparam o desempenho de um algoritmo genético padrão com um algoritmo genético nebuloso, onde a taxa de mutação é ajustada por um controlador nebuloso.
Este documento descreve uma dissertação de mestrado sobre um conversor multinível modular (CMM). O trabalho apresenta um modelo analítico do CMM em regime permanente que descreve matematicamente variáveis como oscilação de tensão dos capacitores e corrente circulante. O modelo inclui controle de corrente circulante de segundo harmônico e permite estudar o funcionamento do CMM sem simulação numérica.
Algoritmo genético aplicado no planejamento da operação de um parque eólicoRobson Josué Molgaro
1) O documento apresenta uma metodologia para o planejamento da operação de médio prazo de um parque eólico utilizando algoritmos genéticos, com o objetivo de minimizar os custos de geração a partir de energia eólica.
2) Foram modeladas curvas de potência e custo específico para três aerogeradores do parque eólico. Um algoritmo genético é utilizado para determinar a energia que cada aerogerador deve produzir para atender a demanda com menor custo.
3) O planejamento
operacao e manutencao de sistemas de cogeracao1 convertedPedro Amone
Este documento descreve o funcionamento e manutenção de sistemas de cogeração. Apresenta os principais componentes destes sistemas e os modos de operação, incluindo o funcionamento em paridade térmica e elétrica. Também aborda os processos de manutenção de turbinas a gás e trocadores de calor, elementos essenciais destes sistemas.
Este documento apresenta um estudo comparativo de três arquiteturas para monitoração e controle do sistema de alimentação elétrica do Pátio Itaquera a partir do Centro de Controle Operacional. Foram identificadas as partes interessadas, levantados os requisitos técnicos e operacionais e desenvolvidas as arquiteturas conceituais. A seleção da melhor alternativa ocorreu com base em uma matriz de decisão que considerou custos, segurança, interferência operacional e tempo médio de reparo.
O documento apresenta o programa da disciplina de Modelagem e Simulação de Processos. A disciplina introduz conceitos de modelagem matemática de processos da engenharia química através da aplicação das leis de conservação e métodos computacionais para simulação e otimização de processos. O programa inclui tópicos sobre modelagem de reatores e sistemas de separação, simulação estática e dinâmica, introdução à otimização de processos e uso de softwares de simulação.
ESTUDO DE MÉTODOS DE IDENTIFICAÇÃO DE SISTEMAS EM MALHA FECHADA APLICADOS A P...Patrick Pires Alvim
Neste trabalho são apresentados os principais métodos de identificação em malha fechada
para a obtenção de modelos matemáticos mais exatos do processo. Como contribuição é
proposto a aplicação do método em uma planta real didática. Inicialmente é realizado o ensaio
da planta em malha aberta e então projetado um controlador do tipo PI discreto para o
controle do nível. Com a planta operando em malha fechada controlada foi aplicado o método
de identificação em malha fechada denominado método de entrada-saída conjunta em três
diferentes ensaios, com diferentes sinais de excitação e então, estimado os possíveis modelos
matemáticos da planta. Para a estimativa dos modelos foram testadas as estruturas ARX,
ARMAX e OE no qual a OE foi a que apresentou melhores resultados. Com a realização dos
ensaios foi possível concluir que o controlador PI projetado em malha aberta obteve bom
desempenho, porém o método de identificação em malha fechada não obteve bom resultado,
podendo este estar relacionado à dificuldade da estimativa da função de sensibilidade do
sistema, às componentes de alta freqüência existentes nos sinais utilizados para identificação,
ou aos zeros de fase não mínima dos controladores e funções de transferência estimadas.
Este documento apresenta um estudo e estimação de parâmetros de um modelo elétrico de bateria. Foram implementados modelos elétricos e baseados em impedância para simular o comportamento de baterias. Um sistema experimental foi desenvolvido para testar baterias e estimar parâmetros internos através de espectroscopia de impedância eletroquímica. Os resultados obtidos permitiram analisar o desempenho dos diferentes modelos de bateria.
Contribuições ao controle de variância minima generalizado: abordagem de proj...UFPA
Neste trabalho, o controlador de Variância Mínima Generalizado, GMV, é desenvolvido no domínio de representações no espaço de estados, beneficiando-se de uma equivalência de seu preditor de variância mínima
com uma solução particular do Filtro de Kalman, a qual caracteriza uma atraente abordagem por evitar a solução da equação de Diophantine.
O documento descreve um curso de pós-graduação em sistemas elétricos oferecido pela Universidade Paulista - UNIP. O curso tem como objetivo capacitar profissionais da área elétrica para os desafios tecnológicos do setor, preparando-os através de nove módulos que cobrem tópicos como sistemas elétricos, máquinas elétricas, proteção, subestações e qualidade de energia. O curso tem duração de 12 meses, carga horária de 360 horas e é voltado a gradu
[1] O documento apresenta uma introdução ao programa ATP (Alternative Transients Program), que é um simulador digital para estudos de fenômenos transitórios em sistemas elétricos.
[2] O ATP permite a modelagem de vários componentes elétricos como linhas de transmissão, transformadores, bancos de capacitores e disjuntores, usando elementos concentrados e distribuídos.
[3] O documento descreve os principais modelos disponíveis no ATP como PI-equivalentes, transformadores e indutores não-lineares, que
Este documento apresenta um exemplo de cálculo dos indicadores de confiabilidade de um sistema de transmissão elétrica utilizando o método da perda total de continuidade de serviço e o esquema equivalente de confiabilidade. O sistema possui 6 componentes e 4 caminhos possíveis. Os cálculos resultam em uma frequência de falha de 0,814922 falhas/ano, duração média de falha de 5,95 horas e indisponibilidade de 4,844746 horas/ano.
PLANEJAMENTO DA OPERAÇÃO DE CURTO PRAZO: MODELAGEM E SIMULAÇÃO (Mota junior, ...Cláudio Siervi
Este trabalho trata de um estudo de caso sobre a operação coordenada de duas
hidrelétricas localizadas no Rio Corrente, na região Centro-Oeste do Brasil, sujeitas a
regimes regulatórios distintos: a usina de montante pertence ao despacho centralizado
do Operador Nacional do Sistema Elétrico (ONS) enquanto que a de jusante é
despachada fora do controle do ONS. O estudo teve como contexto o setor elétrico
brasileiro e foi desenvolvido em um ambiente com escassez de informações, onde o
operador busca por soluções viáveis para o problema de programação de operação.
Na primeira etapa do trabalho, foi feita uma análise qualitativa da conjuntura das
usinas a partir de uma perspectiva regulatória. Em seguida, empregando a técnica de
Dinâmica de Sistemas (que, de acordo com Ford (2010), é baseada em modelagem
simbólica de alto nível e simulação numérica), foi realizada uma elicitação da
metodologia empregada na programação de operação das usinas estudadas. Os
principais resultados foram: (a) a justificativa da construção de um único modelo de
operação coordenada para usinas de regimes regulatórios distintos e (b) um modelo
conceitual que foi convertido em um simulador de cenários operativos.
Este documento discute a estimação de canais PLC (Power Line Communications) e a avaliação do desempenho de sistemas OFDM usando esses canais. Ele propõe um método paramétrico baseado em EM para estimar os parâmetros do modelo de canal PLC de Zimmermann e testa seu desempenho em diferentes redes. Também avalia o desempenho de modulações BPSK, QPSK e 16-PSK usando o estimador proposto com diferentes proporções de pilotos no canal. Finalmente, sugere áreas para pesquisas futuras, como estim
Este documento descreve uma estratégia baseada em redes neurais artificiais para seleção on-line de controladores para sistemas não-lineares. O método é aplicado a um tanque esférico sujeito a perturbações, onde diferentes controladores PID são avaliados e uma rede neural é treinada para selecionar o melhor controlador com base em critérios de desempenho. Resultados de simulação demonstram a capacidade da rede neural em alternar entre controladores para manter o desempenho do sistema.
O documento apresenta os resultados preliminares de um projeto de prospecção tecnológica no setor de energia elétrica brasileiro. O estudo realizou um diagnóstico da situação atual identificando pontos fortes, fracos, desafios e oportunidades para o desenvolvimento tecnológico no setor. O documento também discute a visão de futuro construída para o armazenamento de energia, com entrada intensa de novas soluções entre 2025-2030.
Aula Biologia de Sistemas e ferramentas ômicasSandraMuxel
O documento discute a biologia dos sistemas, incluindo: 1) ômicas como dados para biologia dos sistemas; 2) bioinformática e suas aplicações; 3) bancos de dados que armazenam dados ômicos. Ele também aborda redes biológicas e ferramentas de bioinformática para análise de dados ômicos.
Modelagem de cargas utilizando sistemas baseados em regrasSuzana Viana Mota
Este documento propõe o desenvolvimento de modelos para prever o comportamento de cargas elétricas residenciais usando lógica fuzzy e um sistema especialista baseado em regras. O sistema foi implementado em Java e testado em diferentes situações para validar sua capacidade de modelar cargas elétricas de forma não intrusiva.
Semelhante a Seminário final de Introdução a Redes Booleanas Probabilísticas (20)
UPARSE: Análises de sequências de 16S rRNALeandro Lemos
O documento descreve o pipeline UPARSE para análise de sequências do gene 16S rRNA, incluindo qualidade de sequenciamento, demultiplexagem, remoção de primers, filtragem de sequências de baixa qualidade, agrupamento de OTUs e predição de taxonomia. O pipeline é implementado no software Usearch e permite processar milhares de sequências com alta acurácia em poucas horas.
O documento apresenta uma introdução ao sistema operacional Linux, abordando seus principais pontos como ser livre, ter diversas distribuições disponíveis, organizar arquivos em diretórios, utilizar programas de linha de comando para manipular arquivos de texto e navegar pelo sistema através do terminal.
O documento descreve o processo de análise de metagenomas, incluindo a geração massiva de dados de sequenciamento, desafios de bioinformática e ferramentas como MG-RAST. O documento também discute a predição de genes, identificação funcional e análises comparativas de amostras usando bancos de dados públicos.
Seminário de Extremófilos - TermoadaptaçãoLeandro Lemos
1. O documento discute a análise de genomas microbianos para identificar genes associados à adaptação a ambientes extremos, como altas temperaturas.
2. Foi realizada a análise do genoma da bactéria termofílica Geobacillus kaustophilus para identificar características genômicas relacionadas à termofilia.
3. Foram identificados diversos genes candidatos envolvidos na adaptação térmica de G. kaustophilus, incluindo genes para estabilização do DNA e RNA.
Novas Perspectivas em Estudos de Ecologia MicrobianaLeandro Lemos
Aula ministrada junto à disciplina “Microbiologia Ruminal: Abordagem Molecular” [Tópico: Novas Perspectivas em Estudos de Ecologia Microbiana], do curso de pós-graduação em Ciências (Energia Nuclear), do Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA/USP).
Integração de dados genômicos e estatísticos no RStudioLeandro Lemos
O documento apresenta uma introdução ao software R para análise estatística e integração de dados genômicos. É descrito como R pode ser usado para ler, manipular e visualizar dados através de vetores, data frames e funções. Além disso, são explicados índices de diversidade, análises multivariadas como PCoA e CCA e o pacote ggplot2 para criação de gráficos. No final, há uma discussão sobre quais métodos aplicar no estudo do apresentador.
Análises de sequências metagenômicas via MG-RASTLeandro Lemos
This document discusses analyzing metagenomic sequences using the MG-RAST platform. It covers topics such as big data in molecular biology, bioinformatics tools for processing large datasets, metagenomics for studying microbial communities, and the MG-RAST pipeline for quality control, gene prediction, taxonomic and functional annotation of metagenomic samples. Examples of analyzing samples on MG-RAST and comparing samples are also provided.
Slides Lição 10, Central Gospel, A Batalha Do Armagedom, 1Tr24.pptxLuizHenriquedeAlmeid6
Slideshare Lição 10, Central Gospel, A Batalha Do Armagedom, 1Tr24, Pr Henrique, EBD NA TV, Revista ano 11, nº 1, Revista Estudo Bíblico Jovens E Adultos, Central Gospel, 2º Trimestre de 2024, Professor, Tema, Os Grandes Temas Do Fim, Comentarista, Pr. Joá Caitano, estudantes, professores, Ervália, MG, Imperatriz, MA, Cajamar, SP, estudos bíblicos, gospel, DEUS, ESPÍRITO SANTO, JESUS CRISTO, Com. Extra Pr. Luiz Henrique, 99-99152-0454, Canal YouTube, Henriquelhas, @PrHenrique
Folheto | Centro de Informação Europeia Jacques Delors (junho/2024)Centro Jacques Delors
Estrutura de apresentação:
- Apresentação do Centro de Informação Europeia Jacques Delors (CIEJD);
- Documentação;
- Informação;
- Atividade editorial;
- Atividades pedagógicas, formativas e conteúdos;
- O CIEJD Digital;
- Contactos.
Para mais informações, consulte o portal Eurocid:
- https://eurocid.mne.gov.pt/quem-somos
Autor: Centro de Informação Europeia Jacques Delors
Fonte: https://infoeuropa.mne.gov.pt/Nyron/Library/Catalog/winlibimg.aspx?doc=48197&img=9267
Versão em inglês [EN] também disponível em:
https://infoeuropa.mne.gov.pt/Nyron/Library/Catalog/winlibimg.aspx?doc=48197&img=9266
Data de conceção: setembro/2019.
Data de atualização: maio-junho 2024.
Egito antigo resumo - aula de história.pdfsthefanydesr
O Egito Antigo foi formado a partir da mistura de diversos povos, a população era dividida em vários clãs, que se organizavam em comunidades chamadas nomos. Estes funcionavam como se fossem pequenos Estados independentes.
Por volta de 3500 a.C., os nomos se uniram formando dois reinos: o Baixo Egito, ao Norte e o Alto Egito, ao Sul. Posteriormente, em 3200 a.C., os dois reinos foram unificados por Menés, rei do alto Egito, que tornou-se o primeiro faraó, criando a primeira dinastia que deu origem ao Estado egípcio.
Começava um longo período de esplendor da civilização egípcia, também conhecida como a era dos grandes faraós.
Redação e Leitura_7º ano_58_Produção de cordel .pptx
Seminário final de Introdução a Redes Booleanas Probabilísticas
1. Introdução Objetivos Modelos e resultados Discussão e Conclusão
Seminário de Introdução a Redes Booleanas Probabilísticas
Leandro Nascimento Lemos
Departamento de Bioquímica
Instituto de Química- USP
Mestrando em Bioinformática
2. Introdução Objetivos Modelos e resultados Discussão e Conclusão
Paper
Yang et al., 2013.
Figura 1: Based on interactions among transcription factor, oncogenes, tumor supressor, and microRNAs, a Boolean network model
of cancer network regulated by miR-17-92 cluster is constructed, and the network is associated with the control of G1/S transition in the
mammalian cell cycle.
3. Introdução Objetivos Modelos e resultados Discussão e Conclusão
Ciclo Celular
Conceitos gerais
Fases do Ciclo de celular:
Figura 2: A proliferação celular é dividida em quatro fases: G1 -> S -> G2 -> Mitose. Pontos de parada (G1/S e G2).
4. Introdução Objetivos Modelos e resultados Discussão e Conclusão
Ciclo Celular
Conceitos gerais
Câncer:
Figura 3: Células cancerígenas abandonam esse controle.
5. Introdução Objetivos Modelos e resultados Discussão e Conclusão
Ciclo Celular
Boolean Network Theory: Cell cycle
Rede da Li.
Figura 4: Análise da robustez das interações do ciclo celular da levedura
6. Introdução Objetivos Modelos e resultados Discussão e Conclusão
microRNAs
microRNAs
Principais características:
São importantes na regulação do ciclo celular;
RNAs não-codificadores de proteínas com um tamanho de 19 a 23
nucleotídeos;
microRNAs estão envolvidos na regulação do ciclo celular de células
normais e de células cancerígenas;
Podem inibir a expressão de genes.
Podem atuar como oncogênes e genes supressores de tumores.
7. Introdução Objetivos Modelos e resultados Discussão e Conclusão
microRNAs
miR-17-92 cluster
Principais características:
Superexpressão do gene miR-17-92 tem sido encontrada em inúmeros
tipos de câncer (e.g., leucemia, câncer de pulmão);
No entanto, miR-17-92 pode atuar como gene supressor tumoral em
câncer de mama.
8. Introdução Objetivos Modelos e resultados Discussão e Conclusão
Checkpoints
Checkpoints
Figura 5: Elementos regulatórios relacionados a transição G1/S do ciclo celular de eucariotos.
9. Introdução Objetivos Modelos e resultados Discussão e Conclusão
Perguntas e objetivos
Perguntas
???
Qual é o papel do miR-17-92 durante o ciclo celular?
Existe um “backbone” que pode ter uma função biológica?
10. Introdução Objetivos Modelos e resultados Discussão e Conclusão
Perguntas e objetivos
Objetivos
!!!
Construir uma rede de interação do ciclo celular com elementos
regulatórios envolvidos na transição G1/S;
Avaliar o papel do miR-17-92 no processamento do ciclo celular.
11. Introdução Objetivos Modelos e resultados Discussão e Conclusão
Modelos e resultados
Elementos regulatórios
!!!
Fatores de transcrição (E2F e Myc);
Oncogenes (Cdk2/Cyclin E, Cdc25A e Cdk4/cyclin);
Supressor tumoral (pRb e p27);
miR-17-92
12. Introdução Objetivos Modelos e resultados Discussão e Conclusão
Modelos e resultados
Elementos regulatórios
Figura 6: Figure 1. Mammalian cancer cell network during G1/S transition (MGSTR network)The 8-node network is constructed on the
basis of previous experimental results. The circular nodes represent oncogene, the octagon nodes represent tumor supressors, and the
quadrilateral nodes represent oncogenes or tumor supressor. Green arrow represents active interactions, and the blur (or black)
hammerheads represent inhibitory interactions.
13. Introdução Objetivos Modelos e resultados Discussão e Conclusão
Modelos e resultados
Aplicando a Teoria Booleana
Figura 7: Figure 1. Dinâmica da rede. Cada nó possui um estado binário. Ação ativadora do nó i sobre o nó j é quantificada por
um peso aji = 1. Ação inibitória aji = -1. Sem ação aji (-r)
14. Introdução Objetivos Modelos e resultados Discussão e Conclusão
Modelos e resultados
Aplicando a Teoria Booleana
Figura 8: Table 1. Structure parameter aji of the MGSTR network.
15. Introdução Objetivos Modelos e resultados Discussão e Conclusão
Modelos e resultados
Simulação da Rede regulatória do câncer
Figura 9: Basin size of attraction for the fixed point and network state of each attractor of the MGSTR network. The model was
processed in each of the 256 possible states and all nodes are simultaneously updated. It can be the most of the state attractor or super
stable or super stable attractor which attracts 184 or 71.9%
16. Introdução Objetivos Modelos e resultados Discussão e Conclusão
Modelos e resultados
Trajetórias
Figura 10: Figure 2. Dynamic trajectories. Dynamic trajectories of the regulatory network with 256 initial states in state space. All states
converge towards fixed point attractors. Each green circle corresponds to one specific network state, and the largest circle corresponds to
the S phase. Arrows between the network states indicate the dynamic flow from one state to its subsequent state, and the size of flow is
indicated by the thickness of arrows.
17. Introdução Objetivos Modelos e resultados Discussão e Conclusão
Modelos e resultados
Atratores
Interpretações:
Kauffman descreve um atrator como um tipo celular;
Outra interpretação seria correspondente ao estado de crescimento,
diferenciação e apoptose da célula;
Neste caso, o atrator representa a transição do estado G1 para o
estado S do ciclo celular.
O maior atrator corresponde a transição da fase G1/S para a fase S.
18. Introdução Objetivos Modelos e resultados Discussão e Conclusão
Modelos e resultados
Dados experimentais
Figura 11: Table 3. Switch characteristics of key regulators during G1/S transition and the references of corresponding
experiments. A comparison between Table 2 and Table 3 reveals that the biggest attractor is S phase
19. Introdução Objetivos Modelos e resultados Discussão e Conclusão
Modelos e resultados
Via biológica da transição G1/S
Figura 12: Existem quatro etapas para a expressão ou ativação dos reguladores. Por exemplo, na primeira etapa ocorre a expressão do
E2F, pRb e CyclinD/Cdk4.
20. Introdução Objetivos Modelos e resultados Discussão e Conclusão
Modelos e resultados
Via biológica da transição G1/S
Os resultados obtidos a partir do modelo matemático (Tabela 4) são
consistentes com os resultados experimentais (Tabela 3);
e.g., the expression of Cdc25A and Cdk2/CyclinE can be activated by
each other, and the miR-17-92 has a degradation effect;
21. Introdução Objetivos Modelos e resultados Discussão e Conclusão
Modelos e resultados
3. Comparação com redes randômicas: teste de robustez
Investigar a arquitetura da rede
Análise da rede booleana e de 1.000 redes randômicas com o mesmo
número de nodos e o mesmo número de linhas de uma MGSTR
network;
(i) As redes randômicas apresentaram uma média 7.6 atratores/rede; O
tamanho da bacia de atração do maior atrator de todas as redes
randômicas é menor que o da MGSTR network;
-> Esse resultado indica que o tamanho da bacia de atração da MGSTR
network é otimizado para fornecer função biológica.
22. Introdução Objetivos Modelos e resultados Discussão e Conclusão
Modelos e resultados
Simulação da Rede regulatória do câncer
Figura 13: A distribuição do tamanho da bacia de atração das redes randômicas segue a Lei da Potência. Somente 2.89% dos
atratatores são iguais ou maiores que o maior atrator (B=184) da MGSTR network
23. Introdução Objetivos Modelos e resultados Discussão e Conclusão
Modelos e resultados
3. Comparação com redes randômicas: teste de robustez
Investigar a arquitetura da rede
Análise da rede booleana e de 1.000 redes randômicas com o mesmo
número de nodos e o mesmo número de linhas de uma MGSTR
network;
(i) As redes randômicas apresentaram uma média 7.6 atratores/rede; O
tamanho da bacia de atração do maior atrator de todas as redes
randômicas é menor que o da MGSTR network;
-> Esse resultado indica que o tamanho da bacia de atração da MGSTR
network é otimizado para fornecer função biológica.
24. Introdução Objetivos Modelos e resultados Discussão e Conclusão
Modelos e resultados
Perturbação
Figura 14: A. Perturbation of deleting interaction B. Perturbation of adding interactions C. Perturbation of switching interaction. A
mudança relativa de B para o maior atrator delta B/B pode ser uma medida de robustez
25. Introdução Objetivos Modelos e resultados Discussão e Conclusão
4.Backbone motif of Cancer Regulatory Network
Boolean Network Theory: Cell cycle
Decomposição
Figura 15: Backbone motif é a menor rede capaz de fornecer uma funcionalidade.
26. Introdução Objetivos Modelos e resultados Discussão e Conclusão
4.Backbone motif of Cancer Regulatory Network
4.Backbone motif of Cancer Regulatory Network
Se há um backbone motif, qual é o comportamento deste motifo?
Process-based network decomposition.
27. Introdução Objetivos Modelos e resultados Discussão e Conclusão
4.Backbone motif of Cancer Regulatory Network
Figura 16: Dados gerados a partir de um conjunto de equações
.
28. Introdução Objetivos Modelos e resultados Discussão e Conclusão
4.Backbone motif of Cancer Regulatory Network
Backbone motif
Para investigar o papel do backbone motif na rede regulatória da etapa
G1/S do ciclo celular, foi computado as propriedades dinâmicas da rede
com base nas propriedades booleanas.
30. Introdução Objetivos Modelos e resultados Discussão e Conclusão
4.Backbone motif of Cancer Regulatory Network
Backbone motif
Figura 17: O backbone motif é o bloco fundamental da rede regulatória. No entanto, a bacia de atração do maior atrator
corresponde apenas 120 ou 46.9% dos estados iniciais, sendo muito menor que a rede regulatória completa (71.9%). Isso implica
que parte da rede regulatória apresenta um papel biológico importante, e que as propriedades dinâmicas do backbone motif
torna-se instável sem o motifo restante
.
31. Introdução Objetivos Modelos e resultados Discussão e Conclusão
4.Backbone motif of Cancer Regulatory Network
Backbone motif
Figura 18: Full MGSTR network is decomposed into a backbone motif (a) which provide the major biological functions and a
remaining motif (b) which makes the system more stabe
.
32. Introdução Objetivos Modelos e resultados Discussão e Conclusão
5. Discussão e Conclusão
Atrator com 184 (71.9%) dos estados iniciais da rede booleana (Tabela
2);
A dinâmica da rede de regulação é estável e robusta (Fig. 4, 5 e 6);
Foi possível decompor o modelo em um backbone motif que
apresentasse funções biológicas importantes.