Este documento relata dois casos de pacientes com Anemia de Fanconi que desenvolveram doença do enxerto contra o hospedeiro crônica (DECH-C) de boca após transplante de células-tronco hematopoiéticas. O tratamento com Sirolimus (rapamicina) mostrou-se eficaz no controle da DECH-C de boca refratária a corticóides em ambos os casos, permitindo a redução e suspensão da corticoterapia.