O documento aborda a utilização de nematoides para monitorar a qualidade do solo, discutindo a mensuração de comunidades de nematoides e índices ecológicos. Inclui análises estatísticas, estrutura do curso e exemplos práticos na aplicação de dados sobre diversidade e funcionalidade da cadeia trófica. Ferramentas moleculares como o sistema NINJA são mencionadas para auxiliar na análise dos dados obtidos.

1. Marechal Cândido Rondon, 26 de abril de 2016
Utilização de nematoides para
monitoramento da qualidade do solo
Parte 2 – Mensuração das cominidades
Dr. Giovani de Oliveira Arieira

2. Mensuração de comunidades de nematoides
- Índices ecológicos gerais
- Índices ecológicos específicos para nematoides do solo
- Análise estatística
- Softwares disponíveis
Aplicação prática dos índices em dados prévios utilizando a
Plataforma NINJA
Exemplos de aplicação prática
ESTRUTURA DO CURSOESTRUTURA DO CURSO

3. MENSURAÇÃOMENSURAÇÃO

4. Mensuração
• Diversidade
- Shannon-Weaver, Simpson, etc.
• Perturbação ambiental
- Escala Colonizador – persistente (Bongers, 1990)
• Estrutura trófica (Yeates et al., 1993)
• Funcionalidade e cadeia trófica
- Estrutura, Enriquecimento, Guildas funcionais, etc.
(Ferris et al., 2001)
• Pegadas metabólicas (Ferris et al., 2010)

5. Diversidade
 Diversidade genética
 Diversidade de ecossistemas
 Diversidade taxonômica
 Diversidade trófica

6. Diversidade e Riqueza
Comunidade A
S = 3
Comunidade B
S = 5
N = 24 N = 24

7. Diversidade e Riqueza
Comunidade A
S = 3
Comunidade B
S = 5
N = 24 N = 24

8. Diversidade
Diversidade de Shannon-Weaver:
 Semelhança: , onde
 Riqueza de Margalef:
 Dominância de Simpson:
 Diversidade:
∑=
−=
S
i
iei pLogpH
1
'
MaxH
H
J '
'
'
= SLogH eMax ='
NLog
S
SR
e
1−
=
∑=
2
ipλ
λeLogH −=2

9. Perturbação
Família valor c-p Família valor c-p
Alaimidae 4 Monhysteridae 2
Aphelenchidae 2 Mononchidae 4
Aphelenchoididae 2 Nordiidae 4
Anguinidae 2 Panagrolaimidae 1
Aporcelaimidae 5 Paratylenchidae 2
Bastianiidae 3 Plectidae 2
Belondiridae 5 Pratylenchidae 3
Bunonematidae 1 Psilenchidae 2
Cephalobidae 2 Prismatolaimidae 3
Chromadoridae 3 Qudsianematidae 4
Criconematidae 3 Rhabditidae 1
Diphtherophoridae 3 Teratocephalidae 3
Diplogasteridae 1 Thornenematidae 5
Dolichodoridae 3 Tobrilidae 3
Hemicycliophoridae 3 Trichodoridae 4
Hoplolaimidae 3 Tripylidae 3
Leptonchidae 4 Tylenchidae 2
Longidoridae 5
Fonte: Yeates e Bongers, 1999
∑=
⋅−=
n
i
pipicD
1

10. Perturbação
Gênero C-p
Floresta
0-10cm 10-20cm 20-30cm
Acrobeles 2 0,0000 0,0000 0,0000
Acrobeloides 2 0,0082 0,5492 0,0545
Aphelenchoides 2 0,0082 0,0000 0,0000
Aphelenchus 2 0,0000 0,0082 0,0182
Chiloplacus 2 0,0000 0,0082 0,0000
Discocrinemella 3 0,3197 0,3607 0,2909
Dorylaimellus 4 0,0000 0,0000 0,0000
Eudorylaimus 4 0,0000 0,0000 0,0000
Helicotylenchus 3 0,1639 0,0328 0,0909
Hoplolaimus 3 0,0000 0,0000 0,0000
Ironus 4 0,0000 0,0082 0,0000
Labronema 4 0,0000 0,0000 0,0000
Mesocriconema 3 0,3197 0,0000 0,4727
Mesorhabditis 1 0,0082 0,0000 0,0000
Monhystera 2 0,0000 0,0000 0,0000
Mononchus 4 0,0000 0,0000 0,0000
Mychonchus 4 0,0000 0,0000 0,0000
Nygolaimus 4 0,0000 0,0000 0,0000
Panagrolaimus 1 0,0574 0,0082 0,0000
Plectus 2 0,0000 0,0000 0,0000
Pratylenchus 3 0,0000 0,0000 0,0000
Prionchulus 4 0,0000 0,0000 0,0000
Prismatolaimus 3 0,0000 0,0000 0,0182
Prodorylaimus 4 0,0246 0,0164 0,0000

11. Perturbação
Gênero C-p
Floresta
0-10cm 10-20cm 20-30cm
Acrobeles 2 0,0000 0,0000 0,0000
Acrobeloides 2 0,0082 0,5492 0,0545
Aphelenchoides 2 0,0082 0,0000 0,0000
Aphelenchus 2 0,0000 0,0082 0,0182
Chiloplacus 2 0,0000 0,0082 0,0000
Discocrinemella 3 0,3197 0,3607 0,2909
Dorylaimellus 4 0,0000 0,0000 0,0000
Eudorylaimus 4 0,0000 0,0000 0,0000
Helicotylenchus 3 0,1639 0,0328 0,0909
Hoplolaimus 3 0,0000 0,0000 0,0000
Ironus 4 0,0000 0,0082 0,0000
Labronema 4 0,0000 0,0000 0,0000
Mesocriconema 3 0,3197 0,0000 0,4727
Mesorhabditis 1 0,0082 0,0000 0,0000
Monhystera 2 0,0000 0,0000 0,0000
Mononchus 4 0,0000 0,0000 0,0000
Mychonchus 4 0,0000 0,0000 0,0000
Nygolaimus 4 0,0000 0,0000 0,0000
Panagrolaimus 1 0,0574 0,0082 0,0000
Plectus 2 0,0000 0,0000 0,0000
Pratylenchus 3 0,0000 0,0000 0,0000
Prionchulus 4 0,0000 0,0000 0,0000
Prismatolaimus 3 0,0000 0,0000 0,0182
Prodorylaimus 4 0,0246 0,0164 0,0000
MI

12. Perturbação
Gênero C-p
Floresta
0-10cm 10-20cm 20-30cm
Acrobeles 2 0,0000 0,0000 0,0000
Acrobeloides 2 0,0082 0,5492 0,0545
Aphelenchoides 2 0,0082 0,0000 0,0000
Aphelenchus 2 0,0000 0,0082 0,0182
Chiloplacus 2 0,0000 0,0082 0,0000
Discocrinemella 3 0,3197 0,3607 0,2909
Dorylaimellus 4 0,0000 0,0000 0,0000
Eudorylaimus 4 0,0000 0,0000 0,0000
Helicotylenchus 3 0,1639 0,0328 0,0909
Hoplolaimus 3 0,0000 0,0000 0,0000
Ironus 4 0,0000 0,0082 0,0000
Labronema 4 0,0000 0,0000 0,0000
Mesocriconema 3 0,3197 0,0000 0,4727
Mesorhabditis 1 0,0082 0,0000 0,0000
Monhystera 2 0,0000 0,0000 0,0000
Mononchus 4 0,0000 0,0000 0,0000
Mychonchus 4 0,0000 0,0000 0,0000
Nygolaimus 4 0,0000 0,0000 0,0000
Panagrolaimus 1 0,0574 0,0082 0,0000
Plectus 2 0,0000 0,0000 0,0000
Pratylenchus 3 0,0000 0,0000 0,0000
Prionchulus 4 0,0000 0,0000 0,0000
Prismatolaimus 3 0,0000 0,0000 0,0182
Prodorylaimus 4 0,0246 0,0164 0,0000
MI 2-5

13. Perturbação
Gênero C-p
Floresta
0-10cm 10-20cm 20-30cm
Acrobeles 2 0,0000 0,0000 0,0000
Acrobeloides 2 0,0082 0,5492 0,0545
Aphelenchoides 2 0,0082 0,0000 0,0000
Aphelenchus 2 0,0000 0,0082 0,0182
Chiloplacus 2 0,0000 0,0082 0,0000
Discocrinemella 3 0,3197 0,3607 0,2909
Dorylaimellus 4 0,0000 0,0000 0,0000
Eudorylaimus 4 0,0000 0,0000 0,0000
Helicotylenchus 3 0,1639 0,0328 0,0909
Hoplolaimus 3 0,0000 0,0000 0,0000
Ironus 4 0,0000 0,0082 0,0000
Labronema 4 0,0000 0,0000 0,0000
Mesocriconema 3 0,3197 0,0000 0,4727
Mesorhabditis 1 0,0082 0,0000 0,0000
Monhystera 2 0,0000 0,0000 0,0000
Mononchus 4 0,0000 0,0000 0,0000
Mychonchus 4 0,0000 0,0000 0,0000
Nygolaimus 4 0,0000 0,0000 0,0000
Panagrolaimus 1 0,0574 0,0082 0,0000
Plectus 2 0,0000 0,0000 0,0000
Pratylenchus 3 0,0000 0,0000 0,0000
Prionchulus 4 0,0000 0,0000 0,0000
Prismatolaimus 3 0,0000 0,0000 0,0182
Prodorylaimus 4 0,0246 0,0164 0,0000
PPI

14. Estrutura trófica
 Fitófagos (fitoparasitas)
 Bacteriófagos
 Micófagos/Fungívoros
 Predadores/Carnívoros
 Ingestores de substrato
 Algívoros
 Parasitas de animais
 Onívoros

15. Funcionalidade de cadeia trófica
 Via principal de decomposição de matéria orgânica:
Relação entre nematóides microbiófagos (Ba/(Ba+Fu) e
entre microbiófagos e fitoparasitas (Pl/(Ba+Fu+Pl);
 Guildas funcionais:Classificação reunindo os grupos
tróficos e valores c-p;
 Índices de cadeia trófica: Baseados no papel das
guildas funcionais no solo  Índice Basal, Índice de
Estrutura, Índice de Enriquecimento e Índice Canal;

16. Funcionalidade de cadeia trófica
Ca2
Om4 Om5
Ca3 Ca4 Ca5
Fu2 Fu3 Fu4 Fu5
Ba1
Fu2
Ba2 Ba3 Ba4 Ba50.8
3.2
0.8
0.8
0.8
1.8
1.8
1.8
3.2 5.0
5.0
5.0
5.0
3.2
3.2
3.2
Basal
Estruturado
Enriquecido
FUNGÍVOROS
cp-2 cp-3 cp-4 cp-5
B M
E ONÍVOROS
CARNÍVOROS
BACTERIÓFAGOS
cp-1
cp-2
Trajetória de Estrutura
TrajetóriadeEnriquecimento

17. Funcionalidade de cadeia trófica
( )be
e
EI
+
⋅=100
( )bs
s
SI
+
⋅=100
( )seb
b
BI
++
⋅=100∑ ⋅= bb pkb
∑ ⋅= ee pke
∑ ⋅= ss pks
Kb Ba2 Fu2
Ke Ba1 Fu2
Ks Ba3-5 Fu3-5 Om3-5 Ca2-5
( )21
2
8,02,3
8,0
100
FuBa
Fu
CI
+
⋅=
Índice Canal

18. Funcionalidade de cadeia trófica
Índice de Estrutura (SI)
ÍndicedeEnriquecimento(EI)
A B
D C
0
0
• Perturbado
• N-enriquecido
• Baixa C:N
• Bacteriófagos
• Maduro
• N-enriqecido
• Baixa C:N
• Bacteriófagos
• Maduro
• Fértil
• Moderada C:N
• Bact./Fungívoros
• Degradado
• Esgotado
• Alta C:N
• Fungívoros

19. FERRAMENTASFERRAMENTAS

20. Utilização de ferramentas moleculares

21. NINJA: Nematode INdicator Joint
Analysis (Sieriebriennikov, Ferris e de Goede, 2014)
https://sieriebriennikov.shinyapps.io/ninja/

22. NINJA: Nematode INdicator Joint Analysis

23. NINJA: Nematode INdicator Joint Analysis

24. NINJA: Nematode INdicator Joint Analysis

25. NINJA: Nematode INdicator Joint Analysis

26. Programa de Pós-graduação em AgronomiaPrograma de Pós-graduação em Agronomia
Universidade Estadual de LondrinaUniversidade Estadual de Londrina
giovaniarieira@yahoo.com.brgiovaniarieira@yahoo.com.br