Gestão editorial: tendências e desafios na transição para a ciência aberta

Solange Santos
Lilian Caló
Lançamento: Gestão editorial de Periódicos científicos – tendências e boas práticas, 02 de Junho de 2020
Solange Santos and Lilian Caló, 2020, CC-BY

Nova mentalidade carregando....
O ajuste das políticas e da gestão editorial na perspectiva da adoção
progressiva da ciência aberta

1 Preprints
comunicação rápida da pesquisa
2 Dados Abertos
reprodutibilidade, reusabilidade, investimento
3 Artigos de Dados- Periódicos de dados
Data papers e Data journals
4 Avaliação por pares
transparência e abertura
Capítulo 1
Gestão editorial: tendências e desafios na transição para a ciência aberta
Práticas editoriais abertas:

O primeiro serviço de pré-impressão foi fundado no Laboratório Nacional Los Alamos. “ O Laboratório Científico Los Alamos publicou The Atom, uma revista de funcionários. Em 1974, a
revista destacou mulheres cientistas e destacou Julia Hardin na capa. "
Começou em 1990, quando artigos no domínio da física passaram a ser depositados em um servidor situado no Laboratório
Nacional Los Alamos, do Departamento de Energia dos Estados Unidos. Logo passou a armazenar artigos de astronomia,
matemática, ciências da computação, biologia quantitativa e estatística.
PREPRINT - Antecedentes

 Resultado da insatisfação da comunidade científica pressionando algumas
estruturas da publicação científica tradicional – velocidade e eficiência (pesado
processo editorial e revisão por pares tradicional).
 Agências de fomento passam a aceitar o depósito em servidores de preprints
(Wellcome Trust, Gates Foundation, NIH). Em termos de infraestrutura de
publicação, o Crossref agora permite atribuir DOIs aos preprints, vínculo ao
histórico de publicação subsequente, e o ORCID.
Preprint - Antecedentes

 Havia receio de que os periódicos pudessem rejeitar artigos que haviam sido
depositados em servidores preprint. Isso está mudando rapidamente. Com tantos
editores importantes no setor de preprints, a maioria permite a publicação de pré-
impressões antes do envio para seus periódicos.
 Hoje, observamos que além das comunidades de preprints que normalmente são
organizadas em torno de um campo ou conjunto de campos, nos últimos anos, as
grandes editores também passaram a fazer seus próprios investimentos em
plataformas de preprints.
Preprints – Antecedentes

 Os editores estão integrando o depósito de preprint em seus fluxos de trabalho
de envio de manuscritos e adotando uma estratégia comum projetada para
retomar o controle das pré-impressões.
 Quase uma dúzia de novos serviços de preprints surgiram no último ano - usando
uma variedade de modelos organizacionais - lançados no ano passado.
 Outra tendência no ambiente de preprints é o estabelecimento de novas
plataformas nacionais e regionais por defensores da ciência aberta (AfricArxiv;
IndiaRxiv; SciELO Preprints, etc)
Preprint - Antecedentes

O que aprenderemos sobre a publicação acadêmica
como resultado do COVID-19?

https://github.com/nicholasmfraser/covid19_preprints
O coronavírus forçou a pesquisa médica a acelerar e os preprints decolaram!!!
Preprints – Papel e o uso de preprints na pesquisa COVID-19

 O medRxiv foi listado como um dos links diretos na página inicial do Google Scholar
para artigos depositados sobre o COVID-19.
 As mídias sociais tornaram-se um dos principais canais de descoberta de preprints,
aumentando a preocupação com os riscos associados à pesquisa que não passou
pela revisão por pares que circulam amplamente.
 No centro de sua apreensão está o risco potencial de o público confiar em um
preprint, sem perceber que ainda não passaram por um processo de validação e
podem não ser confiáveis.
Preprints – Tendências

 Em fevereiro de 2020, um artigo sobre o coronavírus publicado no bioRxiv foi
imediatamente retirado devido às críticas ferozes à metodologia e aos argumentos do
estudo.
 Houve um intenso debate nas mídias sociais sobre os riscos associados a artigos não
revisados sendo distribuídos através de servidores de preprints e o valor do modelo
tradicional de publicação na filtragem de lixo eletrônico.
 Houve a rápida disseminação e retirada do artigo foi um bom momento para a ciência,
ilustrando o papel que os servidores de preprint podem desempenhar na geração de
reações rápidas da comunidade científica e na aceleração da ciência.

 A importância das políticas e práticas de curadoria de preprints e conteúdo como
indicadores de qualidade, a fim de estabelecer as preprints como um formato
acadêmico confiável.
 Há esforços para aumentar a conscientização sobre a necessidade de todos os tipos
de leitores, inclusive jornalistas, para examinar os preprints com cautela e
reconhecer que os resultados apresentados são preliminares e ainda não passaram
por um processo de verificação científica
 Durante a pandemia do COVID-19, o bioRxiv e o medRxiv adicionaram novas
políticas e observações de advertência para enfatizar que os preprints são relatórios
preliminares de trabalho que não foram certificados pela revisão por pares e não
devem ser relatados pela mídia como informações estabelecidas.

 Artigo do britânico Wakefield de 1998, que relacionava o
autismo em crianças à vacina tríplice viral.
 Suspeitas importantes foram trazidas a público, mas o
trabalho na prestigiada The Lancet foi retratado somente
12 anos depois.
 Wakefield teve todo esse tempo para convencer milhares
de pais a desistir de imunizar seus filhos, dando início a
um surto de caxumba e sarampo no Reino Unido
Notório caso de “ fake news ” da ciência

Preprints – A Política editorial dos periódicos deve ser transparente
 Política editorial – definir o posicionamento do periódico sobre aceitação preprints?
Aceita? Não Aceita? Não diz nada?
-
Qual é o posicionamento acerca do Ineditismo e revisão duplo cego
 Sistema de gestão de manuscritos – Perguntar no check list
- É um preprint?
- Sim. nome do servidor de preprint - URL do preprint
 Quais servidores de preprints são aceitos? aceitáveis/confiáveis
- O servidor estabelece critérios para aceitação dos manuscritos?
- há atribuição de DOI no momento do deposito?
- opera com controle de versões?
- preservação?
- Interoperabilidade? link para a versão publicada em um periódico?

 Algoritmos
 Amostras
 Arquivos de áudio
 Arquivos de log
 Artefatos
 Cadernos de campo
 Cadernos de laboratório
 Códigos
 Contribuições em redes
sociais
 Diários
 Documentos textuais
 Entrevistas
 Estatísticas
 Fotografias / Imagens
 Metodologias e fluxos de
trabalho
 Modelos
 Padrões
 Planilhas
 Procedimentos operacionais
Dados de pesquisa são como fontes primárias na investigação científica. Os registros
produzidos, obtidos ou usados durante o processo de pesquisa e que são necessários
para validar os resultados de investigação.
DADOS ABERTOS - Dados de Pesquisa
 Protocolos
 Questionários
 Scripts
 Sequências de genéticas ou de
proteínas
 Simulações
 Softwares
 Transcrições
 Vídeos
 Workflows

Os dados abertos são os dados de pesquisa que estão disponíveis para todos
acessarem, usarem e compartilharem.
Possibilitam:
Uso na avaliação por pares;
Validação;
Reanálise;
Reinterpretação;
Inclusão em metanálises;
Reprodutibilidade da pesquisa.
Dados Abertos
Boas práticas na apresentação de dados
abertos
O depósito de dados em repositórios
deve obedecer aos
Princípios FAIR – Findable, Accessible,
Interoperable & Reusable

+ CC-BY
Machine readable
A descrição de conjuntos de dados – datasets – promove a documentação, intercâmbio e
reutilização de dados que servem de base para as descobertas, aumentando a eficiência
e sustentabilidade da pesquisa
http://dx.doi.org/10.1037/a0028240
Citações WoS Data Citation Index; Data Citation Elsevier
Dados de Pesquisa - repositórios de dados abertos

 A epidemia é um argumento poderoso para os dados abertos da pesquisa, as
pandemias o tornam irrefutável.
 Centenas de milhares de vidas dependem da realização de meta-análises robustas
dos estudos COVID-19 e, para essas meta-análises, precisamos dos dados brutos do
estudo.
 Quaisquer que sejam os obstáculos para abrir os dados da pesquisa, eles ESTÃO
SENDO serão REMOVIDOS.
Dados Abertos - Dados de Pesquisa

 Preprints e outros compartilhamentos on-line se tornaram a norma quando o atraso
de algumas semanas para publicação pode significar vidas perdidas.
 O sigilo e a acumulação habituais de dados que podem levar a subsídios e
promoções estão foram deixados de lado pela urgência do momento.
 As falhas fundamentais das práticas tradicionais de pesquisa e compartilhamento
estão sendo reveladas pela pandemia. Se esse nível de colaboração aberta e global é
o necessário para combater o COVID-19, por que não Alzheimer e câncer? Por que
não as mudanças climáticas?
Veremos maior abertura e colaboração na pesquisa?
Dados Abertos - Dados de Pesquisa

Abertura em tempos de Covid19 - monitoramento e dados globais

Dados abertos - Transparência dos periódicos em relação à abertura de dados
de pesquisa
 Política editorial – o posicionamento do periódico sobre abertura dos dados de pesquisa
Encoraja? Exige? Não diz nada?
 Instruções aos autores – orientar claramente sobre os procedimentos para citar e
referenciar e disponibilizar os dados, códigos, programas, outros materiais. Três
comprometimentos:
(a) incentivar/promover a citação e referenciamento;
(b) exigir a citação e referenciamento e indicar como norma para citar dados; e,
(c) exigir que os conteúdos citados e referenciados sejam disponibilizados livremente
exceto em casos especiais.
 Quais repositórios de dados são aceitos/indicados como aceitáveis/confiáveis?
- Principios FAIR: metadatos, dados, ...
- atribuição DOI
- preservação
 Publicação de artigos de dados

 O artigo de dados é um tipo de publicação cujo principal objetivo é descrever uma
coleção/conjunto de dados de pesquisa. Esse tipo de publicação não apenas
descreve os metadados dos dados de pesquisa também relata as etapas
metodológicas de obtenção dos dados (descrição minuciosa dos dados e dos ativos
que compõem o conjunto de dados).
 São semelhantes a um artigo científico convencional, podendo incluir tópicos como:
resumo, introdução e contextualização, procedimentos metodológicos e conflito de
interesses, agradecimentos e referências.
 Normalmente os periódicos solicitam que seja incluída na seção que detalha a
descrição dos dados a composição, o formato, a localização e as formas de acesso e
manipulação dos dados, sistemas e softwares para processamento, entre outros.
ARTIGOS DE DADOS e PERIÓDICOS DE DADOS – Tendências

Seções de um artigo de dados
Artigo de Dados e Periódicos de dados – Tendências

 Dada a importância crescente dos dados de pesquisa e seu reconhecimento como
contribuição intelectual original, os conjuntos de dados de pesquisa também devem ser
citados e referenciados da mesma forma como acontece com livros, artigos e outras
fontes comumente citadas em artigos científicos.
 Referências levam o usuário/leitor a detectar através destes dados qual é o objeto
referido e no objeto usualmente é possível associar mais dados dos que os disponíveis
na citação. Assim, a citação é útil, indiretamente, para acessar conjuntos maiores de
metadados e por isso deve ser mencionada nas instruções aos autores que pretendem
submeter seus artigos como parte obrigatória do processo de submissão para periódicos
alinhados com a ciência aberta
Gestão de dados de pesquisaArtigo de Dados e Periódicos de dados – Tendências

São periódicos especializados na publicação de artigo de dados.
Disponível aqui
Periódicos de dados/Data Journals – Tendências

A denominada “crise da avaliação por pares” envolvendo a saturação da demanda
por pareceres, consequente baixa qualidade das avaliações e notícias de fraude e má
conduta ética deu origem a uma ampla discussão sobre formas alternativas de
avaliação, tendo em vista as críticas ao modelo vigente
1. Pouco fidedigno e
inconsistente
Nem sempre detecta erros, ou pode haver inconsistências entre os informes dos
pareceristas. Atribui um selo de qualidade que muitas vezes não se justifica
2. É muito demorado e oneroso
Dificuldade em encontrar bons pareceristas e obter pareceres no tempo
preconizado pelo processo editorial dos periódicos
3. Falta de responsabilidades e
risco de vieses
Anonimato permite vieses sociais e de publicação. Falta de treinamento adequado
de pareceristas
4. Sem incentivo aos pareceristas
Os pareceristas raramente recebem créditos por seu esforço. Plataformas como
Publons e ReviewerCredits buscam preencher esta lacuna.
5. Desperdício de esforços
O mesmo manuscrito pode ser revisado muitas vezes, à medida que passa por
ciclos de envio e reprovação. O trabalho minucioso é descartado após a aprovação
do manuscrito
REVISÃO POR PARES ABERTA - Peer review antecedentes
Críticas ao modelo atual de avaliação por pares

OPR
Vantagens
Informes sobre
peer review
Pareceres são parte
integral do registro
do artigo
Material de
aprendizagem
Registra o trabalho do
parecerista e
reconhece sua
expertise
Pareceres
construtivos
Transparência
Pareceres abertos e de
melhor qualidade
Open Peer review – revisão aberta /transparente

Open Peer
Review
Identidades abertas
Informes abertos
Interação aberta
Abrir os manuscritos previamente à revisão
Abrir a versão final aos comentarios (pós-publicação)
Plataformas abertas (third party peer review)
Reutilização de pareceres
Participação aberta
Open Peer review (OPR) – Revisão por pares abertura e transparência
Há pelo menos umas 22 variações/combinações

OPR
Desvantagens
Pareceristas de
diferentes área reagem
diferentemente
Peer review é mais que
o relato dos pareceristas
Temos por represálias
Uso indevido dos pareceres
para avaliar pesquisadores
Uso indevido por opositores
de pesquisas controversas
Contestar a decisão final do
editor com base nas avaliações
Aspectos operacionais
Peer review – abertura e transparência

https://transpose-publishing.github.io/#/
Informação sobre as políticas editoriales de + 3000 periódicos - principalmente las
modalidades de revisão por pares

Informação sobre transparência dos processos editoriais + 380 periódicos
https://www.responsiblejournals.org/database/statistics

 Política definir o posicionamento abertura progressiva do processo de avaliação por pares
Aceita? Não Aceita? Encoraja? Não diz nada?
 Instruções aos autores – informar claramente sobre os procedimentos que serão
adotados e oferecer opções de abertura
- Abertura opcional das identidades dos autores e pareceristas;
- Publicação opcional de informes dos pareceristas – um novo tipo de documento
- Publicação do nome do editor responsável pelo processo/aprovação no artigo
- ....
Revisão por pares – A Política editorial dos periódicos deve ser transparente

Solange Santos
Solangesan@gmail.com
Lilian Caló
calolilian@gmail.com
Obrigada!!!

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