Apresentações da Reunião RCAAP Online 06 de maio de 2020 10h30 - 12h

1. Reunião RCAAP
Maio, 6, 2020

2. Programa
Boas vindas João Mendes Moreira / Eloy
Rodrigues
Destaques (Planos de atividades)
Repositórios Científicos 7 min Paulo Lopes
Revistas Científicas 7 min José Carvalho
Gestão de Dados de Investigação 7 min Filipa Pereira
Perguntas & Respostas 5 min
A Ciência Aberta no contexto do Covid-19 60 min Eloy Rodrigues; João Mendes
Moreira; Nuno Feixa Rodrigues;
Paulo Pereira; José Miguel
Pêgo

3. Áreas de atividade - Do acesso aberto à ciência aberta
Repositórios Científicos
● Core RCAAP
● Integrações
● Serviços
Revistas Científicas
● Plataforma Editorial
● SciELO Portugal
● Serviços
Dados de Investigação
● Governação e
Políticas
● Infraestruturas
● Serviços

4. Repositórios Científicos
Paulo Lopes - plopes@fccn.pt

5. Atividades Repositórios Científicos
Repositórios Científicos
● Core RCAAP
● Integrações
● Serviços
Infraestruturas, gestão, operação e manutenção
dos serviços
Intergações RCAAP - PTCRIS
Serviços de apoio, Serviço DOI, Comunicação
disseminação e formação

6. Integrações RCAAP - PTCRIS - Porquê

7. Integrações RCAAP - PTCRIS - Como
Reclamar
autorias de
trabalhos
Depósitos no
RI a partir de
entidades
externas
Sincronização
de informação
entre sistemas
Controlo de
autoridade
Definição de
tarefas de
curadoria dos
dados

8. Integrações RCAAP - PTCRIS - Como
Adopção do Quadro Normativo PTCRIS

9. Integrações RCAAP - PTCRIS
Controlo de
autoridade

10. Integrações RCAAP - PTCRIS
Reclamar
autorias de
trabalhos

11. Integrações RCAAP - PTCRIS
Depósitos no
RI a partir de
entidades
externas

12. Destaques 2020 - Novo modelo de dados do Portal RCAAP
Isolar publicações por:
● Identificador de Autor
● Identificador de Financiamento
● Identificador de Organização
Isolar autores por projeto de financiamento ou por organização;
Isolar projetos de financiamento por organizações abrangidas;
(...)

13. Destaques 2020 - Novo modelo de dados do Portal RCAAP
Algumas das principais vantagens:
● Melhorar a integração entre sistemas;
● Melhorar a monitorização da Política de Acesso Aberto da FCT;
● Melhorar os processos de reporting;
● Melhorar o nível de informação relacionado com cada uma das entidades;
● ...

14. Destaques 2020 - Nova versão do software de repositórios - DSpace 7
Julho
7.0 Beta 4
Batch processing
Junho
7.0 Beta 3
Account Profiles,
Submission
20/Abril
7.0 Beta 2
Authentication /
Authorization
3/Março
7.0 Beta 1
Security and Performance
Agosto
7.0 Beta 5
bug fixing & cleanup
Outubro / Novembro
7.0 Release

15. Destaques 2020 - Nova versão do software de repositórios - DSpace 7

16. Jornadas FCCN

17. Destaques 2020

18. Revistas Científicas
José Carvalho - jcarvalho@sdum.uminho.pt

19. Problemas para Resolver
- Acabar com a gestão verticalizada ao nível da oferta de serviços editoriais
(revistas científicas) para os tornar mais interoperáveis entre si e com outras
plataformas de gestão editorial;
- Modernizar as plataformas, adotando as tecnologias standard mais recentes e
dotando-as de funcionalidades na área do acesso e partilha da informação;
- Garantir a preservação digital dos trabalhos científicos nacionais
- Apoiar a comunidade nas tarefas de gestão editorial para clarificar e otimizar os
processos e orientar à possível obtenção de requisitos necessários para integrar
bases de indexação.

20. Objetivos
● Promover a gestão integrada da presença de revistas científicas nacionais em acesso
aberto em diretórios e plataformas de indexação nacionais e internacionais;
● Criar um ecossistema de gestão por forma a simplificar, integrar e tornar coerente a oferta
atual de plataformas para a gestão do ciclo de vida (submissão, revisão, publicação)
editorial de revistas científicas nacionais;
● Atualizar o serviço SCIELO Portugal para alinhar com as diretivas centrais e integrar novas
normas da comunidade.
● Modernizar as plataformas de gestão do ciclo de vida editorial por forma a abraçar os
conceitos de Ciência Aberta.
● Promover a preservação digital dos objetos digitais das revistas científicas.

21. PUB IN
Nova Iniciativa - PUB In
● Estudos
● Infraestruturas técnicas
● Serviços
○ Formação
○ Apoio
○ Promoção de inovações
https://www.pubin.pt

22. PUB IN
Outputs
- Relatórios
- Documentação de apoio / factsheets
- Iniciativas de Formação
- Índice de Revistas Portuguesas
- Alojamento de Revistas
- Promoção de integrações e Inovações
- Serviço SCIELO Portugal com XML

23. SCIELO Portugal
A iniciativa PUB In visa ainda a atualização do serviço SciELO Portugal através da:
- Migração da infraestrutura técnica para datacenter da FCT/FCCN
- Atualização das metodologias de marcação para SciELO PS (XML)
- Reformulação do funcionamento de gestão e operação
- Comité científico gerido pela FCT
- Operação pela Universidade do Minho

24. SARC
Integração de
Funcionalidades de
integração com ORCID
ORCIDs associados a
autores:
Abril: 1454
Maio: 1539

25. Candidatura para Alojamento de Revistas
A partir de 18 de maio…
manifestação de interesse e candidatura ao Serviço de Alojamento de Revistas Científicas
(SARC) integrado no PUB In.
A candidatura oferece alojamento gratuito em troca da adoção mandatória de inovações
na publicação científica e serviços de apoio:
- Adoção de revisão aberta por pares
- Uso de identificadores de autor
- Publicação Contínua em JATS-XML
- ...

26. Gestão de Dados de Investigação
Filipa Pereira - filipa.pereira@fccn.pt

27. ENQUADRAMENTO
Comunidade
científica
Sociedade Empresas
Partilha de conhecimento
Reconhecimento, impacto social e
económico da Ciência
CIÊNCIA ABERTA

28. CIÊNCIA ABERTA - PRINCÍPIOS ORIENTADORES
Projetos financiados por fundos públicos
Princípios orientadores da
Ciência Aberta
- Publicações de Acesso Aberto
- Dados de Investigação de Acesso Aberto
- Preservação das publicações e dados científicos

29. PLANO DE ATIVIDADES - GESTÃO DE DADOS DE INVESTIGAÇÃO
Governação
e Políticas
Infraestruturas
e Serviços
Comunicação
e
Disseminação
Alinhamento
de iniciativas
EIXOS DE AÇÃO
Candidatura SAMA - Transformação Digital da Administração Pública

30. PLANO DE ATIVIDADES GDI - GOVERNAÇÃO E POLÍTICAS
Governação e
Políticas
Definição de um modelo de estratégia
e governação FCT para a gestão de
dados de investigação
Revisão e alargamento da adoção
de políticas sobre a disponibilização
de dados e outros resultados

31. PLANO DE ATIVIDADES GDI - INFRAESTRUTURAS E SERVIÇOS
Infraestruturas
e Serviços
2021
Serviço base de
Sistema de Planos de
Gestão de Dados de
Investigação
Repositório de Dados
de Investigação -
Piloto
Sistema de Planos de
Gestão de Dados de
Investigação mais
detalhado
Repositório de Dados de
Investigação
Helpdesk
2020

32. PLANO DE ATIVIDADES GDI - COMUNICAÇÃO E DISSEMINAÇÃO
Comunicação
e
Disseminação
6º Fórum de Gestão de Dados de
Investigação
Fórum de Gestão de Dados de
Investigação - Edição Infraestruturas
de Ciência e Tecnologia
Preparação de materiais a
disponibilizar à Comunidade na área
da gestão de dados

33. PLANO DE ATIVIDADES GDI - ALINHAMENTO DE INICIATIVAS
Alinhamento de
iniciativas
nacionais e
internacionais
Colaboração com outros parceiros

34. - Diagnóstico
- Serviços base de
gestão de dados
- Avaliação de potenciais
colaborações:
- Convergência de
serviços;
- Novos serviços.
Fase 2 - 2021/2022Fase 1 - 2020/2021
PolíticadeDadosFCT
Coordenação
Infraestruturas Serviços
Comunicação, Disseminação e
Capacitação
Alinhamento de
Iniciativas
PLANO GERAL DE ATIVIDADES - GESTÃO DE DADOS DE INVESTIGAÇÃO

35. DESTAQUE GESTÃO DE DADOS DE INVESTIGAÇÃO - 2020
Data ainda a definir
Último quadrimestre 2020
Edição Extra Infraestruturas
30 de junho e 1 de julho - Virtual

36. Perguntas e Respostas

37. A Ciência Aberta no contexto do
covid-19
Eloy Rodrigues
João Mendes Moreira
Nuno Feixa Rodrigues
Paulo de Carvalho Pereira
José Miguel Pêgo

38. Desde que a epidemia revelou potencial de se transformar em
pandemia, e começou a afetar um crescente número de países
e regiões (a partir de janeiro de 2020), multiplicaram-se as
iniciativas de acesso aberto, partilha de dados, e outras
práticas abertas de ciência, investigação e inovação.

42. "Normal imperatives like
academic credit have been set
aside. Online repositories make
studies available months ahead of
journals. Researchers have
identified and shared hundreds of
viral genome sequences. More
than 200 clinical trials have been
launched, bringing together
hospitals and laboratories around
the globe."

43. Vivemos hoje um momento de
Ciência Aberta sem precedentes,
no qual os investigadores estão
"a entregar os seus diamantes
para que outros cientistas os
lapidem".
David Marçal

46. https://www.bloomberg.com/opinion/articles/2020-05-05/coronavirus-research-moves-faster-than-medical-journals

47. O que se está a passar com a Covid-19, parece comprovar o que os defensores da ciência
aberta têm vindo a repetir há cerca de duas décadas:
a investigação realizada de modo aberto, colaborativo e transparente,
facilitando a partilha e a comunicação dos processos e resultados (dados,
publicações e outros resultados), é a forma mais eficiente de promover o
avanço da ciência e a geração de novo conhecimento, maximizar o retorno
do investimento (essencialmente público) que as nossas sociedades realizam
nos seus sistemas científicos, e ajudar a enfrentar os vários desafios com
que a humanidade se confronta.

48. “Sim, a tempestade vai passar, a humanidade sobreviverá, a maioria de nós ainda estaremos
vivos — mas habitaremos um mundo diferente.
Muitas medidas de emergência a curto prazo tornar-se-ão um aspeto da vida.
Essa é a natureza das emergências. Aceleram processos históricos.” - YUVAL
NOAH HARARI
Será que a adoção das práticas abertas e colaborativas vai
permanecer após a pandemia?
O que podemos fazer para que as alterações conjunturais se
transformem em estruturais?

49. What is EOSC?
Enabling the digital transformation of research: towards more of data-intensive, collaborative
and cross-disciplinary science
EOSC will provide 2 million
EU researchers and
innovators with a service
environment
for research data
management, analysis and
re-use across disciplines,
increasing the creativity,
productivity and
reproducibility of research

50. EOSC Objectives

51. The vision (2016)Key issues for the next two years✔ Governance model and best-fit legal vehicle for after 2020
✔ Financing model(s) to sustain EOSC infrastructure and services in the long run
✔ Rules of participation that would govern future EOSC transactions
✔ Compatibility of EOSC-relevant national initiatives
✔ Evolution of the EOSC Portal and its interfaces, expansion of the EOSC service offering
to the researchers
✔ FAIR digital objects: turning principles into practice
✔ Widening strategy for the EOSC user base,
✔ Role of the private sector
✔ EOSC in the international context
Turning FAIR into Reality: Report and Action Plan: https://doi.org/10.2777/1524
Prompting an EOSC in practice: https://ec.europa.eu/info/events/2nd-eosc-summit-2018-jun-11_en
Key issues by end of 2020

52. European COVID-19 Data Platform
Credits to:
Rolf Apweiler
Director, EMBL-
EBI

54. COVID-19 Data Layers
SARS-Cov-2 Virus Biology
Human COVID19 Biology
Population Dynamics of
Humans + Virus
Service
(enabling research)
Research
(doing)
Other
DBs
DataHubs + ENA
Federated EGA
COVID-19 Portal
Phylogeny
Chemobiology
Protein/RNA
Interactomes
Human
Genetics
Analysing
human
responses
Protein and
RNA Structures
National PHI &
Infrastructure
Clinical
Research

55. National
Infrastructure
s
- Data Spaces
- Cloud
- Workflows
- Expert
support
- link national (Node) infrastructures into Interconnected
European Data Spaces for COVID-19
- Open & Reproducible Workflows and Tools
- Connect experts across Europe to build capacity and support
national operations
- Pilot connections for B1MG via federated EGA
EUropean COVID-
19 Data
Platform
COVID-19
Portal
SARS-CoV-2
Data Hubs
- COVID-19 BioBank
directory
- Regulatory support
- Alliance Medical RI (w BBMRI
& ECRIN)
- Clinical Trial Repository (Data)
- COVID-19 Clinical trial
taskforce
- Emergency Archiving
- Disease models (Mouse
strains)
- Access to containment
facilities (Class IV )
- Drug repurposing screens
- Access to Screening / Med
Chem facilities
- Priority access to EM, NMR and
X- ray facilities for imaging and
structure based drug design
- Priority access to imaging
facilities
EOSC-Life actions:
1. Researcher data access – open & link RI data for COVID19
research
2. Broad and open access to analysis and integration workflows
(Galaxy)
3. Orchestrate data flows across infrastructures and European
platforms
4. Fast track User access
EMBL COVID-19 Response plan
1. Link national labs to SARS-CoV-2
Data Hubs
2. Integrate data through COVID-19
Portal
3. Align & connect with national
infrastructures through ELIXIR
Interconnected European Data Spaces for COVID-19 form part of the emerging EOSC

56. European COVID-19 Data Platform process flow
Inquérito!

57. Questions
?
Thank you!

71. Perguntas e Debate