As bactérias podem causar doenças graves em peixes de cultivo, como a furunculose causada pela bactéria Aeromonas salmonicida e a doença branquial bacteriana causada por Flavobacterium branchiophilum. Estas doenças podem ter altas taxas de mortalidade e são difíceis de tratar, sendo necessário identificar corretamente o agente causador e aplicar antibióticos de forma adequada para controlar surtos e minimizar perdas econômicas.