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Publicações Integradas, Inteligentes e Inovadoras
José Carvalho, Susana Costa, Eloy Rodrigues
Universidade do Minho
O sistema de comunicação
académica está “quebrado”!
A inovação na publicação científica...
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• Criar um ecossistema de gestão dessas revistas por forma a simplificar, integrar
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• Atualizar o serviço SCIELO Portugal para alinhar com as diretivas centrais e
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Objetivos
• Modernizar as plataformas de gestão do ciclo de vida editorial por forma a
abraçar os conceitos de Ciência Aberta tais como open peer review ou o open
annotations bem como os novos paradigmas de relacionamento com o cidadão e
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Atividades
• WP1 - Gestão do projeto
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● Quadrante – Associação de Professores de Matemática;
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JATS-XML
O que é?
- JATS (Journal Article Tag Suite) é um formato do XML , que é a norma ISO
Z39.96 e define um conjunto padrão de tags para marcar os metadados e
o conteúdo dos artigos de revistas científicas.
- Padrão internacional e aberto de comunicação científica que define o
conjunto de elementos e atributos e identifica detalhadamente as
estruturas, elementos bibliográficos, tabelas, textos, fórmulas, etc, que
compõem os artigos, enriquecendo desta forma a semântica dos
mesmos.
Vantagens
● Formato que é processado por máquinas e legível por humanos;
● viabiliza a automatização dos processos, ao permitir a extração dos textos marcados, os
metadados do artigo e as referências bibliográficas que permitem efetuar cálculos de
indicadores bibliométricos;
● JATS é próprio para artigos de investigação, é um formato ajustável à forma como as
revistas e os pré-prints são publicados;
● Existe documentação variada disponível online sobre o conjunto de tags, com
explicações e exemplos, assim como, várias recomendações de práticas;
Vantagens
● Existência de ferramentas para controlar a qualidade e para produção do ficheiro de
saída disponíveis gratuitamente: texture, github, entre outros;
● Assume um padrão dinâmico, pelo que os editores e utilizadores podem solicitar novos
recursos e alterações, através do site www.niso.org/standards-committees/jats.
● O formato JATS-XML garante que os arquivos sejam legíveis ao longo do tempo,
independentemente dos avanços tecnológicos, possibilitando a preservação digital;
● Interoperabilidade ao possibilitar a reutilização por vários sistemas;
● Capacidade de geração de vários formatos (html, pdf, epub,...) e de apresentação em
diversos dispositivos.
Novos Workflows de Publicação
Científica
Casos de Uso
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publicar em JATS-
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XML e o usa para
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XML SciELO e o
usa para serviços
externos
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editorial, com exemplos e documentação.
Preservação Digital de Revistas Científicas
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assegurar a preservação digital das revistas
científicas.
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serviços a desenvolver, o aprovisionamento técnico e
desenvolvimento de documentação de apoio.
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período
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anteriormente mencionados (numa primeira fase,
serviços piloto), a formação de utilizadores, a
comunicação e suporte da comunidade.
Website PUB In
Notícias
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Base de conhecimento com documentação de
apoio
Criação de Comunidade
Brevemente disponível em: https://pubin.pt
Conclusão
O PUB In visa:
● Apoio e promoção do JATS-XML
● Revitalização da iniciativa SCIELO Portugal
● Identificar e caracterizar as revistas portuguesas (fase 2)
● Disponibilizar Serviços e Ferramentas para a comunidade
● Adotar e promover Inovações para Ciência Aberta (open peer review, open
annotation, integração de dados, conteúdos interativos, métricas de uso, …)
● Promover Eventos (workshops e conferências para criar comunidade)
O que se pretende?
Um salto qualitativo do tecido editorial português respeitante às publicações
periódicas, afastando-se do padrão fragmentado e difuso em que parte
significativa das estruturas editoriais continua a laborar, para ganhar coerência
e robustez interna, que vão traduzir-se em reforço de visibilidade externa, em
atratividade científica e em capacidade de projeção internacional.
Porquê?
● Otimizar processos
● Reduzir custos
● Aumentar a reutilização das publicações
● Promover os FAIR principles nas publicações
● Facilitar integrações
● Assegurar novos serviços (text mining, análises bibliográficas, …)
Ou seja...
… Para tornar a ciência mais
aberta, transparente e
adequada tecnologicamente!
Obrigado!
info@pubin.pt

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  • 5. Objetivos • Promover a gestão integrada da presença de revistas científicas nacionais em acesso aberto em diretórios e plataformas de indexação nacionais e internacionais; • Criar um ecossistema de gestão dessas revistas por forma a simplificar, integrar e tornar coerente a oferta atual de plataformas para a gestão do ciclo de vida (submissão, revisão, publicação) editorial de revistas científicas nacionais; • Atualizar o serviço SCIELO Portugal para alinhar com as diretivas centrais e integrar novas normas da comunidade.
  • 6. Objetivos • Modernizar as plataformas de gestão do ciclo de vida editorial por forma a abraçar os conceitos de Ciência Aberta tais como open peer review ou o open annotations bem como os novos paradigmas de relacionamento com o cidadão e o uso de formatos e protocolos reconhecidos internacionalmente. • Promover a preservação digital dos objetos digitais das revistas científicas.
  • 8. Atividades • WP1 - Gestão do projeto • WP2 - Estudos e Prospeção • WP3 - Serviços eletrónicos – Infraestruturas • WP4 - Serviços eletrónicos – Sistemas • WP5 - Apoio aos utilizadores • WP6 - Políticas e Diretrizes • WP7 - Comunicação, Disseminação e Formação
  • 9. Estudos e Prospeção Para sistematizar a análise sobre a situação atual, as ameaças e oportunidades para a publicação científica, e mapear as inovações tecnológicas e conceptuais foram realizados dois estudos prévios: - Estudo sobre Plataformas de Publicação Científica - Estudo sobre Inovações na Publicação Científica
  • 11. Serviço de Apoio JATS-XML Disponibiliza informação de apoio, manuais, tutoriais, ferramentas e exemplos de processos para a formatação do JATS-XML, um standard NISO para a descrição de trabalhos científicos. HTML PDF ePub Text mining, acessibilidades, publicações FAIR etc...
  • 12. Serviço SCIELO Portugal O SCIELO Portugal foi reconfigurado para que possa adotar as recomendações emanadas pela SCIELO no que diz respeito ao uso do formato JATS-XML. Implica a parametrização dos novos sistemas necessários para disponibilizar a informação no novo formato. Além disso, visa manter o serviço com novas revistas a integrar a base SCIELO Portugal de acordo com as novas orientações.
  • 13. Índice de Revistas Científicas Portuguesas Compilação de uma lista de revistas científicas portuguesas com a caracterização das mesmas para servir de contacto no âmbito do projeto e uma ponte entre as revistas e outros serviços potenciadores de valor acrescentado. Pretende-se ainda solicitar atualizações regulares por parte dos editores das suas políticas de auto arquivo para atualizar o serviço Blimunda/Sherpa Romeo e obter um panorama que caracterize as revistas e permita fornecer serviços orientados às suas reais necessidades.
  • 14. Serviço de Alojamento de Revistas Portuguesas (SARC Light) Serviço de alojamento de revistas científicas com base no OJS (SEER). Este serviço é disponibilizado nos moldes de Software as a Service (SaaS) com uma sessão de formação inicial. Gratuito, sujeito a contrapartidas como a revisão aberta pelos pares ou a publicação no formato JATS- XML.
  • 15. Revistas integradas no SARC Light ● Análise Psicológica – ISPA – Instituto Universitário; ● Análise Social – Instituto de Ciências Sociais da Universidade de Lisboa; ● Referência Enfermagem – Escola Superior de Enfermagem de Coimbra; ● Etnográfica – Centro em Rede de Investigação em Antropologia; ● Quadrante – Associação de Professores de Matemática; ● Servir – Associação Católica dos Profissionais de Enfermagem e Saúde; ● Conservar Património – Associação Prof. de Conservadores-Restauradores de Portugal; ● Revista Portuguesa de Pedopsiquiatria – Associação Port. de Psiquiatria da Infância e da Adolescência; ● Práticas da História – Faculdade de Ciências Sociais e humanas da UNL; ● Revista de Educação à Distância e eLearning – Universidade Aberta.
  • 16. Plano de Formação Desenvolvido um levantamento de necessidades para criação de plano de formação. Sessões online e presenciais. Para diferentes níveis de conhecimentos.
  • 17. Indexação de Revistas Este serviço visa a promoção das revistas em índices com níveis de qualidade mais exigentes. Pretende-se identificar esses serviços e clarificar para a comunidade os requisitos necessários à sua integração.
  • 18. Integrações de Serviços Com um número crescente de serviços disponíveis para a comunidade científica, é necessária uma orientação, quer conceptual, quer técnica de como integrar os diferentes serviços disponíveis. Este serviço visa facilitar esse processo.
  • 19. Inovações ● Identificadores de autor; ● Identificadores de publicações; ● Estatísticas de Uso; ● Métricas Alternativas; ● Textos completos em formato JATS-XML; ● Disponibilização dos dados de investigação; ● Publicação Contínua; ● Revisão por pares aberta; ● Interação com recursos (comentários e anotações);
  • 20. Inovações ● Declaração de Contribuição de Autores; ● Crédito aos Revisores; ● Marketing e Publicidade; ● Licenças Creative Commons; ● Preservação Digital; ● Integrações com outros sistemas (pré-prints, ferramentas de escrita colaborativa, overlay publishing); ● Publicações mais interativas;
  • 22. O que é? - JATS (Journal Article Tag Suite) é um formato do XML , que é a norma ISO Z39.96 e define um conjunto padrão de tags para marcar os metadados e o conteúdo dos artigos de revistas científicas. - Padrão internacional e aberto de comunicação científica que define o conjunto de elementos e atributos e identifica detalhadamente as estruturas, elementos bibliográficos, tabelas, textos, fórmulas, etc, que compõem os artigos, enriquecendo desta forma a semântica dos mesmos.
  • 23. Vantagens ● Formato que é processado por máquinas e legível por humanos; ● viabiliza a automatização dos processos, ao permitir a extração dos textos marcados, os metadados do artigo e as referências bibliográficas que permitem efetuar cálculos de indicadores bibliométricos; ● JATS é próprio para artigos de investigação, é um formato ajustável à forma como as revistas e os pré-prints são publicados; ● Existe documentação variada disponível online sobre o conjunto de tags, com explicações e exemplos, assim como, várias recomendações de práticas;
  • 24. Vantagens ● Existência de ferramentas para controlar a qualidade e para produção do ficheiro de saída disponíveis gratuitamente: texture, github, entre outros; ● Assume um padrão dinâmico, pelo que os editores e utilizadores podem solicitar novos recursos e alterações, através do site www.niso.org/standards-committees/jats. ● O formato JATS-XML garante que os arquivos sejam legíveis ao longo do tempo, independentemente dos avanços tecnológicos, possibilitando a preservação digital; ● Interoperabilidade ao possibilitar a reutilização por vários sistemas; ● Capacidade de geração de vários formatos (html, pdf, epub,...) e de apresentação em diversos dispositivos.
  • 25. Novos Workflows de Publicação Científica
  • 26. Casos de Uso 1º - Editor que vai publicar em JATS- XML. 2º - Editor que vai publicar em JATS- XML e o usa para serviços externos 3º - Editor que precisa do JATS- XML SciELO e o usa para serviços externos
  • 27. Processo de Decisão Apoiar e orientar no processo de decisão editorial, com exemplos e documentação.
  • 28. Preservação Digital de Revistas Científicas Disponibilizar informação de apoio para assegurar a preservação digital das revistas científicas.
  • 29. Situação atual e trabalho em curso 1º período Desenvolvimento de 3 estudos prévios, a definição dos serviços a desenvolver, o aprovisionamento técnico e desenvolvimento de documentação de apoio. 2º período Desenvolvimento e disponibilização dos serviços anteriormente mencionados (numa primeira fase, serviços piloto), a formação de utilizadores, a comunicação e suporte da comunidade.
  • 30. Website PUB In Notícias Eventos Base de conhecimento com documentação de apoio Criação de Comunidade Brevemente disponível em: https://pubin.pt
  • 31. Conclusão O PUB In visa: ● Apoio e promoção do JATS-XML ● Revitalização da iniciativa SCIELO Portugal ● Identificar e caracterizar as revistas portuguesas (fase 2) ● Disponibilizar Serviços e Ferramentas para a comunidade ● Adotar e promover Inovações para Ciência Aberta (open peer review, open annotation, integração de dados, conteúdos interativos, métricas de uso, …) ● Promover Eventos (workshops e conferências para criar comunidade)
  • 32. O que se pretende? Um salto qualitativo do tecido editorial português respeitante às publicações periódicas, afastando-se do padrão fragmentado e difuso em que parte significativa das estruturas editoriais continua a laborar, para ganhar coerência e robustez interna, que vão traduzir-se em reforço de visibilidade externa, em atratividade científica e em capacidade de projeção internacional.
  • 33. Porquê? ● Otimizar processos ● Reduzir custos ● Aumentar a reutilização das publicações ● Promover os FAIR principles nas publicações ● Facilitar integrações ● Assegurar novos serviços (text mining, análises bibliográficas, …) Ou seja...
  • 34. … Para tornar a ciência mais aberta, transparente e adequada tecnologicamente!