.

1. Proteins
H I B A H U S S E I N
N A G H A M H O U J E I R Y

2. Contents
I n t r o d u c t i o n
S t r u c t u r e s
P r o t e i n d e n a t u r a t i o n
F u n c t i o n s
C h a p e r o n e s
1 .
2 .
3 .
4 .
5 .

3. P r o t e i n s a r e l a r g e b i o l o g i c a l m o l e c u l e s
c o n s i s t i n g o f o n e o r m o r e c h a i n s o f a m i n o a c i d s .
P r o t e i n s d i f f e r f r o m o n e a n o t h e r p r i m a r i l y i n
t h e i r s e q u e n c e o f a m i n o a c i d s .
Introduction

4. Structures of proteins

5. P r i m a r y s t r u c t u r e
a m i n o a c i d s e q u e n c e
d e t e r m i n e d b y g e n e l i n k e d t o
e a c h o t h e r b y p e p t i d e b o n d s

6. S e c o n d a r y s t r u c t u r e
i t r e f e r s t o l o c a l f o l d i n g o f p r o t e i n s
s t a b i l i z e d b y i n t e r m o l e c u l a r h y d r o g e n
b o n d i n g o f a m i d e g r o u p s ,

7. T e r t i a r y s t r u c t u r e
i t i s f o r m e d b y d i f f e r e n t
t y p e s o f i n t e r a c t i o n s , s u c h
a s h y d r o g e n
b o n d i n g s , d i s u l f i d e b o n d s
a n d h y d r o p h o b i c
i n t e r a c t i o n s b e t w e e n R
g r o u p s

8. Q u a t e r n a r y s t r u c t u r e
t w o o r m o r e t e r t i a r y f o l d e d p e p t i d e s b o n d e d
t o g e t h e r t o m a k e a f u n c t i o n a l p r o t e i n .
s u c h a s h e m o g l o b i n .

10. t h e l o s s o f s e c o n d a r y a n d t e r t i a r y
s t r u c t u r e s i n a p r o t e i n o c c u r s
w h e n c o n d i t i o n s c h a n g e s s u c h a s
. i n c r e a s i n g t h e t e m p e r a t u r e
. v e r y a c i d i c o r b a s i c P H
. a d d i t i o n o f h e a v y m e t a l s
. a d d i t i o n o f o r g a n i c c o m p o u n d
. a d d i t i o n o f m e c h a n i c a l a g i t a t i o n
Protein denaturation

11. Function of proteins

12. E n z y m e s a r e p r o t e i n s t h a t
s p e e d u p c h e m i c a l
r e a c t i o n s . s o m e e n z y m e s
a l s o a r e i n v o l v e d i n
d i g e s t i o n
( l i p a s e , a m y l a s e , l a c t a s e . . . . .
) a l s o i n m o l e c u l a r
b i o l o g y ( l i g a s e , p o l y m e r a s e )
c h a n n e l s a n d c a r r i e r p r o t e i n s
t h a t a l l o w m o l e c u l e s t o e n t e r a n d
e x i t t h e c e l l
a l s o i t t r a n s p o r t m o l e c u l e s i n
b l o o d s i n c e h e m o g l o b i n
t r a n s p o r t s o x y g e n
M E T A B O L I S M T R A N S P O R T

13. t h e r e a r e s t r u c t u r a l p r o t e i n s s u c h
a s K e r a t i n e ( h a i r a n d n a i l s ) a n d
C o l l a g e n e ( l i g a m e n t s , t e n d o n s a n d
s k i n
S U P P O R T

14. h o r m o n e s s u c h a s
. I n s u l i n t h a t r e g u l a t e s
t h e a m o u n t o f g l u c o s e i n
t h e b l o o d
. h u m a n g r o w t h h o r m o n e
t h a t d e t e r m i n e t h e
h e i g h t o f a p e r s o n
. r e c e p t o r p r o t e i n s t h a t
d e t e c t c h e m i c a l s i g n a l s
. i n t e r c e l l u l a r m e s s e n g e r
t h a t i n f l u e n c e
m e t a b o l i s m
R E G U L A T I O N

15. a n t i b o d i e s t h a t c o m b a t
b a c t e r i a a n d v i r u s e s
. m u s c l e c o n t r a c t i o n ( a c t i n a n d
m y o s i n )
. m o t o r p r o t e i n s i n t h e
c e l l ( f l a g e l l a , c i l i a )
D E F E N S E
M O T I O N

16. S t o r a g e p r o t e i n s a r e m a i n l y
p r e s e n t i n p l a n t s e e d s , e g g
w h i t e s , a n d m i l k . T h e r e i s a l s o
a n o t h e r t y p e o f s t o r a g e p r o t e i n .
T h i s i s f e r r i t i n , w h i c h s t o r e s i r o n .
S T O R A G E

18. CHAPERONES

19. C h a p e r o n e s o r h e a t s h o c k
p r o t e i n s a r e p r o t e i n s r e q u i r e d f o r
t h e p r o p e r f o l d i n g a n d / o r
a s s e m b l y o f a n o t h e r p r o t e i n o r
p r o t e i n c o m p l e x .
S o m e c h a p e r o n e s a r e i m p o r t a n t i n
k e e p i n g t h e p r o t e i n u n f o l d e d u n t i l
i t s s y n t h e s i s i s f i n i s h e d , o r a c t a s
c a t a l y s t b y i n c r e a s i n g t h e r a t e s o f
t h e f i n a l s t a g e s i n t h e f o l d i n g
p r o c e s s

20. References
T e x t b o o k o f b i o c h e m i s t r y
L i p p i n c o t t ' s r e v i e w s
M a r k ' s b a s i c m e d i c a l b i o c h e m i s t r y
W i k i p e d i a

21. Thank
you