Uso Aplicado das Tecnologias de Genotipagem na Predição do Mérito Genético em Nelore - Jason Osterstock

1. 1 ANCP – 15MAY2015
USO APLICADO DAS TECNOLOGIAS DE
GENOTIPAGEM NA PREDIÇÃO DO
MERITO GENÉTICO EM NELORE
Jason B. Osterstock, DVM, PhD
Director, Global Genetics Technical Services

2. 2 ANCP – 15MAY2015
Aumente a sua Lucratividade

3. 3 ANCP – 15MAY2015
A carteira de quem vc vai escolher?
• Você pode escolher de acordo com a reputação
das pessoas nesse auditório...

4. 4 ANCP – 15MAY2015
A carteira de quem você via escolher?
• Vc pode escolher com base no grossura da
carteira…

5. 5 ANCP – 15MAY2015
A carteira de quem vc vai escolher?
• Vc pode escolher olhando o que tem dentro
dela…

6. 6 ANCP – 15MAY2015
Tecnologias Genômicas
Aumentar a acurácia na seleção
Muitos tipos de informação
contribuem para a acurácia
das nossas predições –
pedigree, desempenho,
progenie & genomica.
Predições mais acuradas
suportam decisões mais
precisas e acelerado
ganho genético
Fornecer estimativas na fase inicial (animais jovens)
Quanto mais cedo
identificarmos animais
superiores, mais cedo
poderemos implementar
estratégias de
melhoramento genético. A
genômica fornece
informações valiosas sobre
caracteristicas que não
podem ser medidas antes
da vida adulta (i.e.,
fertilidade e longevidade),
e carcterísticas que não
podem ser mensuradas em
vida (i.e., carcassa )
Características de difícil
mensuração
Para algumas
características, coletar
fenótipo para informar as
predições genéticas
podem ser muito difícil e
de alto custo (i.e., ingestão
de comida e longevidade).
A genômica ajuda a
informar sobre o potencial
gen´tico para essas
características, mesmo nos
animais em que não é
possível observar o
fenótipo.

7. 7 ANCP – 15MAY2015
Uso das Avaliações Genômicas
Canada
Angus, Holstein, Jersey,
Brown Swiss, Ayrshire
Argentina
Holstein
Oceania
Angus, Holstein, Jersey
USA
Angus, Holstein, Jersey,
Brown Swiss, Ayrshire,
Hereford, Simmental,
Red Angus, Brangus,
Gelbvieh, Santa
Getrudis, Limousin…
Europe
Holstein, Irish Beef
Brazil
Nelore

8. 8 ANCP – 15MAY2015
Melhoramento Genético - Simplificado
Quais
animais devo
manter ou
comprar, e
quais
descartar?
Qual touro
deveria
servir essa
novilha ou
vaca?
Quantos
filhos eu
quero ter
dessa matriz
no ano?
A genômica consegue fornecer informações no
momento adequado e isso ajuda a acertar nas
decisões de seleção que resultarão maior rentablidade
no futuro.

9. 9 ANCP – 15MAY2015
Exemplo – Three Trees Ranch, Georgia, USA

10. 10 ANCP – 15MAY2015
0
20
40
60
80
100
120
140
2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013
IdadedosPais(Meses)
Year de Nascimento do Touro
Sire
Dam
Idades dos Pais dos Touros HO nos EUA
Wiggans, China Emerging Markets Seminar, 2013

11. 11 ANCP – 15MAY2015
Progresso Genético em gado HO nos EUA
Início do
uso da
genômica
(parte do
rebanho)
Todas as
bezerras
testadas

12. 12 ANCP – 15MAY2015
Equilibrandro o valor da Tecnologia
Como encontrar o
equilíbrio entre a
necessidade de aumentar
a acurácia com o custo
efetivo da solução?
Genotipagem com
plataformas de alta
densidade tem alto custo.
Vale a pena usá-las?

13. 13 ANCP – 15MAY2015
Influência do número de marcadores na
confiabilidade
Confiabilidade esperada de acordo com o número de touros na população de
referência usando chips com 3.000, 50.000 or 500.000 marcadores
VanRaden, et al. Genetics Selection Evolution 2011 43:10

14. 14 ANCP – 15MAY2015
Influência do número de marcadores na
correlação genética
0
0,1
0,2
0,3
0,4
0,5
0,6
0,7
0,8
IPP PPP STAY P120 P210 P365 P450
CorrelaçãoGenética
Validação Externa
50Kv2 Calibration 770K Calibration
Boddhireddy et al. J Anim Sci 2013 Vol. 91, E-Suppl. 2.

15. 15 ANCP – 15MAY2015
Genotipagem de baixa densidades e
Imputação
• Estimar a genotipagem de um
animal em alta densidade,
partindo de uma com menor
densidade:
– Otimiza o equilibrio entre custo
da genotipagem e a acurácidade
nas predições
– Proporciona um melhor
custo/benefício, permitindo que
os produtores tenham mais
animais testados para tomar
decisões de seleção.
é como ler uma
frase com letras
que faltam

16. 16 ANCP – 15MAY2015
A eficiência da imputação
90
92
94
96
98
100
0 20 40 60 80
AcurácidadenaImputação
(%)
Número de marcadores no Chip
Carvalheiro et al. Genet Sel Evol 2014 46:69.
• A acurácia na imputação depende parcialmente da densidade do
chip.
• O ponto chave é ter uma imputação referência que seja validada
com uma boa quantidade de animais importantes.

17. 17 ANCP – 15MAY2015
Produtos genômicos no
Angus USA

18. 18 ANCP – 15MAY2015
A genômica no gado comercial…

19. 19 ANCP – 15MAY2015
Resumindo
• O uso da informação genômica na avaliação
genética está se tornando comum mundialmente.
– ANCP está bem posicionada para liderar esses avanços na
raça Nelore.
– Plataformas de genotipagem com bom custo/benefício
combinado com a imputação estão agregando valor à
genômica.
– Criadores estão usando a genômica de forma mais intensa
em seus rebanhos:
• Menos marketing / Mais melhorias nas estratégias de melhoramento
– Criando novas oportunidades para rebanhos comerciais
• Seleção de novilhas de reposição complementando o uso que é
feito nos touros de rebanhos registrados/selecionados.