O slideshow foi denunciado.
Seu SlideShare está sendo baixado. ×

VODAN BR – rede de dados de surto de covid-19 no brasil: a gestão de dados no enfrentamento de pandemias

Anúncio
Anúncio
Anúncio
Anúncio
Anúncio
Anúncio
Anúncio
Anúncio
Anúncio
Anúncio
Anúncio
Anúncio
Carregando em…3
×

Confira estes a seguir

1 de 49 Anúncio
Anúncio

Mais Conteúdo rRelacionado

Semelhante a VODAN BR – rede de dados de surto de covid-19 no brasil: a gestão de dados no enfrentamento de pandemias (20)

Mais de Projeto RCAAP (20)

Anúncio

Mais recentes (20)

VODAN BR – rede de dados de surto de covid-19 no brasil: a gestão de dados no enfrentamento de pandemias

  1. 1. Viviane Veiga, Maria Luiza Campos, Carlos Roberto Lyra da Silva, João Moreira e Patricia Corrêa Henning
  2. 2. Módulo 8 - Projeto VODAN Brasil – Rede de dados de pesquisa para enfrentamento da COVID19 A infraestrutura atual de registro e conexão de dados de paciente está equipada para lidar com um surto mundial de vírus de maneira eficiente?
  3. 3. COVID-19 - Como compreender? Fontes: https://infographics.channelnewsasia.com/covid-19/map.html http://www.conass.org.br/painelconasscovid19/ https://covid19primer.com/dashboard
  4. 4. COVID-19 - Como compreender? Dados de Saúde Patógeno Medicamentos Infraestrutura de Saúde Genômica Paciente Ambiente e Regulações Locais
  5. 5. COVID-19 - Como compreender? Dados de Saúde Patógeno Medicamentos Ambiente e Regulações Locais Infraestrutura de Saúde Genômica Paciente Bases Biomédicas Genes, Proteínas, Drogas, Doenças, Medicamentos Bases Pacientes Sintomas, Doenças pré-existentes,Tratamento s, Exames, Detecção Bases Demográficas Características da População, Distanciamento Social e Quarentena Bases Patógeno Cepas, relação patógeno-hospedeiro, Surtos Anteriores (SARS/MERS) Bases Saúde Unidades Hospitalares, Equipes de Saúde, EPIs e cadeia de suprimento
  6. 6. COVID-19 - Como compreender? Interoperando Dados (FAIR) em Bases Heterogêneas Painéis Gráficos (Dashboards) Modelos Projeções Publicações Ciência de Dados Mineração Estatística Inteligência Artificial Métodos Numéricos
  7. 7. https://www.go-fair.org/implementation-networks/overview/vodan/
  8. 8. https://www.go-fair.org/implementation-networks/overview/vodan/
  9. 9. https://www.go-fair.org/implementation-networks/overview/vodan/
  10. 10. https://www.go-fair.org/implementation-networks/overview/vodan/
  11. 11. https://www.go-fair.org/implementation-networks/overview/vodan/
  12. 12. https://www.go-fair.org/implementation-networks/overview/vodan/
  13. 13. Integração de diversas iniciativas para dados de pesquisa
  14. 14. O que é a rede VODAN? Módulo 8 - Projeto VODAN Brasil Rede de dados de pesquisa para enfrentamento da COVID19
  15. 15. Esta rede tem coordenação geral da Fundação GO FAIR na Holanda e conta com participação de vários países.
  16. 16. VODAN IN CLUSTERS https://www.go-fair.org/implementation-networks/overview/vodan/vodan-in-clusters/
  17. 17. https://www.nature.com/articles/s41431-020-0635-7
  18. 18. VODAN Brasil Rede de Dados para enfrentamento das pandemias Módulo 8 - Projeto VODAN Brasil – Rede de dados de pesquisa para enfrentamento da COVID19
  19. 19. Estabelecer uma infraestrutura federada de dados seguindo os princípios FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable) para dados de epidemias Disponibilizar essa infraestrutura para possibilitar que unidades de saúde possam coletar e implementar a gestão dos dados de pacientes que carregam o SARS-CoV2, o novo Coronavírus possibilitar o seu reuso em novas pesquisas, facilitará a tomada de decisão baseada em evidências, evitando medidas equivocadas por parte dos gestores e profissionais de saúde possibilitar a geração de dados mais confiáveis, contribuindo para a transparência, produção e disseminação do conhecimento científico. Tornar os dados de epidemias disponíveis para reutilização em novas pesquisas, monitoramento e outros fins, em condições bem definidas, respeitando a privacidade dos pacientes, conforme a legislação vigente. neste momento visando o surto atual da pandemia causada pela Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)
  20. 20. BRAzIL
  21. 21. BRAzIL HOSPITAL MUNICIPAL SÃO JOSÉ HOSPITAL UNIVERSITÁRIO GAFFREE E GUINLE
  22. 22. BRAZIL
  23. 23. BRASIL Fonte: O globo, 17/06/2020  https://oglobo.globo.com/sociedade/coronavirus/com-i nformacao-de-75-mil-pacientes-fapesp-abre-primeiro- banco-de-dados-sobre-covid-19-24484057?versao=a Fonte: http://www.unirio.br/news/unirio-integra-rede-internacion al-de-gerenciamento-de-dados-do-coronavirus Fonte: https://www.icict.fiocruz.br/content/covid-19-icict-integ ra-parceria-para-o-gerenciamento-de-dados-dos-paci entes
  24. 24. Dados FAIR Dados FAIR DADOS FAIR
  25. 25. Dados FAIR – COMO? “There is no FAIR data without machine-actionable metadata” ● ○ ○ ○ ● ○ ○ ● ○ ○ ○ Dados FAIRDADOS FAIR – COMO?
  26. 26. Plataforma VODAN BRASILDados FAIRPLATAFORMA VODAN BRASIL
  27. 27. Capturar os dados estabelecidos pela Organização Mundial de Saúde no CRF_WHO_COVID-19* (*) CRF_WHO_COVID-19: Case Report Form from World Health Organization to COVID-19 Premissas do Projeto Módulos dos formulários de registro de casos da OMS WHO COVID-19 RAPID VERSION Dados FAIRPREMISSAS DO PROJETO
  28. 28. ▪ WHO’s COVID 19 CRF, rapid version: https://www.who.int/docs/defaultsource/coronaviruse/who-ncov-crf.p df?sfvrsn=84766e69_2 ▪ Arquivo fonte do formulário: https://github.com/FAIRDataTeam/WHO-COVID-CRF ▪ Documentação: https://vodan-ontology.github.io ▪ Publicado no BioPortal: http://bioportal.bioontology.org/ontologies/COVIDCRFRAPID ▪ Versão em portugues já disponível no Github Dados FAIRWorld Health Organization COVID-19 e-CRF
  29. 29. Premissas do Projeto Módulos dos formulários de registro de casos da OMS WHO COVID-19 RAPID VERSION PREMISSAS DO PROJETO
  30. 30. Módulos do formulários de registro de casos da OMS WHO COVID-19 RAPID VERSION Módulos Grupos de Questões Questões Flexibilidade para criar novos módulos, inserir novas questões ou grupos de questões Premissas do ProjetoPremissas do ProjetoPREMISSAS DO PROJETO
  31. 31. Extrato da ontologia COVIDCRFRAPID**, utilizando Protégé (**) WHO_COVID-19_Rapid_Version_CRF_Ontology – disponível em https://github.com/FAIRDataTeam/WHO-COVID-CRF Dados Interligados Considerar o modelo semântico da Ontologia COVIDCRFRAPID - Triplificação dos Dados (RDF) (*) RDF - Resource Description Framework Premissas do ProjetoPremissas do ProjetoPREMISSAS DO PROJETO
  32. 32. Premissas do Projeto http://bioportal.bioontology.org/ontologies/COVIDCRFRAPID Converter Dados coletados nos formulários para o formato RDF Premissas do ProjetoPREMISSAS DO PROJETO
  33. 33. Resumo das Premissas Consideradas World Health Organization (WHO) CASE RECORD FORM (CRF) : NOVEL CORONAVIRUS (COVID-19) - RAPID VERSION* Dados e Metadados Interligados WHO_COVID-19_Rapid_Version_CRF_Ontology.owl** Informações Adicionais – CRF Nacionais - SRAG_SIVEP_GRIPE (Prefeitura de São Paulo) - E-SUS-VE - Outros Prontuários…. (*) Disponível em: https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/who-ncov-crf.pdf?sfvrsn=84766e69_2 (**) Disponível em: https://github.com/FAIRDataTeam/WHO-COVID-CRF Apoio à aplicação para Coleta dos Dados do Formulário da Organização Mundial de Saúde (OMS)
  34. 34. Projeto de Banco de Dados - Etapas 1 A nálise de Requisitos 2 Projeto C onceitual 3 Projeto Lógico 4 Projeto Físico Banco de Dados de ApoioPremissas do ProjetoBANCO DE DADOS DE APOIO
  35. 35. • • • • •
  36. 36. • • • • •
  37. 37. Fonte: https://www.zonmw.nl/fileadmin/zonmw/documenten/Toegang_tot_data/Webinar_DS_7_mei_2020_-topic_1-2-3.pdf FAIR Data Points
  38. 38. https://eross2020.inf.unibz.it/programme/
  39. 39. Expertise Multidisciplinar Módulo 8 - Projeto VODAN Brasil – Rede de dados de pesquisa para enfrentamento da COVID19
  40. 40. Objetos digitais FAIR só podem existir em um ecossistema FAIR https://ec.europa.eu/info/sites/info/files/turning_fair_into_reality_1.pdf Módulo 8 - Projeto VODAN Brasil – Rede de dados de pesquisa para enfrentamento da COVID19 Premissas do Projeto
  41. 41. Módulo 8 - Projeto VODAN Brasil – Rede de dados de pesquisa para enfrentamento da COVID19 PESQUISADOR BIBLIOTECÁRIO DE DADOS ANALISTA DE SISTEMAS PROFISSIONAL DE SAÚDE PACIENTE Premissas do Projeto
  42. 42. Módulo 8 - Projeto VODAN Brasil – Rede de dados de pesquisa para enfrentamento da COVID19 VOCÊ FALTA... Please GO FAIR •GT GO FAIR BRASIL METADADOS E PLATAFORMAS •GT GO FAIR BRASIL SAÚDE ONTOLOGIA •GT GO FAIR BRASIL CAPACITAÇÃO •SUBREDE VODAN BR gofairbrasilsaude@icict.fiocruz.br
  43. 43. •GT GO FAIR BRASIL METADADOS E PLATAFORMAS •GT GO FAIR BRASIL SAÚDE ONTOLOGIA •GT GO FAIR BRASIL CAPACITAÇÃO •GT GO FAIR BRASIL POLÍTICA •VODAN BR GO FAIR gofairbrasilsaude@icict.fiocruz.br
  44. 44. Equipe VODAN - Brasil ❖ Adriana Leão-Helder – ENSP/Fiocruz ❖ Alessandra Rocha – UNIRIO ❖ Andrea Garcia – UNIRIO ❖ Andréia da Conceição – ENSP/Fiocruz ❖ Carlos da Silva – UNIRIO ❖ Christovam Barcelos – ICICT/Fiocruz ❖ Diogo Nolasco – PPGI/UFRJ ❖ Diogo Patrao – Albert Einstein ❖ Diogo Rocco – BCC/UFRJ ❖ Edson Amaro – Albert Einstein ❖ Elaine Lucia da Silva – INCQS/Fiocruz ❖ Erick Penedo – ICICT/Fiocruz ❖ Fabiana Assumpção – PPGHIV/UNIRIO ❖ Fernando Ferry – UNIRIO ❖ Giseli Lopes – PPGI/UFRJ ❖ Jefferson Lima – ICICT/Fiocruz ❖ João Moreira – University of Twente ❖ Jorge Leite – UNIRIO ❖ Jorge Magalhaes – Farmanguinhos/Fiocruz ❖ José Berenguer Flores – UNIRIO ❖ José Hisse – BCC/UFRJ ❖ José Honório Gimenes - ENSP/Fiocruz ❖ Jose Walter Farias – FARMACOS/Fiocruz ❖ Leticia Verona – PPGI/UFRJ ❖ Luis Olavo Bonino – University of Twente ❖ Madalena Lopes e Silva – IME/RJ ❖ Marcos Paulo Moraes – PPGI/UFRJ ❖ Marcus F. Gonçalves – PPGI/UFRJ ❖ Maria Cláudia Cavalcanti – IME/RJ ❖ Maria Eduarda Teixeira – ICICT/Fiocruz ❖ Maria Luiza Campos – PPGI/UFRJ ❖ Matheus Puime Feijoó - PPGI/FRJ ❖ Natália Oliveira – PPGI/UFRJ ❖ Patricia Henning – UNIRIO ❖ Paula Fukusawa – UNIRIO ❖ Renata Cristina Matta – ENSP/Fiocruz ❖ Romero de Melo Silva – UNIRIO ❖ Sérgio de Aquino - UNIRIO ❖ Sérgio Serra da Cruz – PPGI/UFRJ ❖ Simone Faury Dib – ICICT/Fiocruz ❖ Tiago de Macedo – UFRJ ❖ Vania A S Borges – PPGI/UFRJ ❖ Viviane Veiga – ICICT/Fiocruz ❖ Wilker Fazolo – PPGI/UFRJ EQUIPE
  45. 45. VODAN BRASIL COORDENAÇÃO Patricia HenningViviane Veiga João Moreira Maria Luiza Campos Carlos Lyra
  46. 46. Nosso contatos : viviane.veiga@icict.fiocruz.br mluiza@ppgi.ufrj.br https://bit.ly/GOFAIRBRASILSAUDE gofairbrasilsaude@icict.fiocruz.br
  47. 47. Referências Virus Outbreak Data Network (VODAN). Disponível em: https://www.go-fair.org/implementation-networks/overview/vodan/ “Webinar FAIR data in ZonMw COVID-19 research” - Margreet Bloemers, May 7, 2020. Disponível em: https://www.zonmw.nl/en/research-and-results/fair-data-and-data-management/webinars-for-support-c ommunity-building/ “Metadata for Machines Workshop: VODAN Africa” - Dr. Erik Schultes, PhD. April 28, 2020. Disponível em: https://drive.google.com/file/d/1ALyiKAF5fzx9BhHJUZcx_gMHArgkmBQO/view Módulo 8 - Projeto VODAN Brasil – Rede de dados de pesquisa para enfrentamento da COVID19REFERÊNCIAS

×