Introdução a Tecnologia do
rDNA e Produção de Plantas
        Transgênicas
Caracterização do Transgene
     e Estrutura do locus
       Andréa A. Carneiro
PRODUÇÃO DE PLANTAS TRANSGÊNICAS

Agrobacterium




 Biobalística
PRODUÇÃO DE PLANTAS TRANSGÊNICAS

Agrobacteria




Biobalística
PRODUÇÃO DE PLANTAS TRANSGÊNICAS

Agrobacteria




Biobalística
PRODUÇÃO DE PLANTAS TRANSGÊNICAS

Agrobacteria




Biobalística
PRODUÇÃO DE PLANTAS TRANSGÊNICAS

Agrobacteria




Biobalística
Agrobacterium tumefaciens      TRANSFORMAÇÃO DE PLANTAS



plasmídeo “Ti”
(tumor inducer)

        célula transformada
         TRANSGÊNICA !
                                                  célula da planta




                                             “GALHA DA COROA”

     crescimento acelerado e
     desordenado do tecido     TUMORIZAÇÃO
Transformação Genética de Plantas
                Agrobacterium tumefaciens
                             Agrobacterium 4.Transferência do
                                                  T-DNA para a célula
                                                  vegetal
     Plasmídeo Ti          2.Ativação dos
                           genes vir
     EE             ED
                                                    Ti
                                 Genes vir                    3.Cópia e
            T-DNA
                                                              excisão
Genes Vir
                                                              do T-DNA
                                             att, chvA, B, E, pscA

                                    CROMOSSOMA BACTERIANO
Transformação por
                            Agrobacterium spp.

                             Casa de
                            vegetação
co-cultivo




                   calo




plaqueamento
  (eliminação
 Agrobacterium)                         indução e regeneração
                  seleção
Transformação Genética de Plantas
        Transferência Direta de DNA
• Microinjeção
• Transformação de protoplastos via
  polietileno glicol
• Eletroporação
• Fibrilas de carboneto de silício
• Bombardeamento de Partículas
Ponto comum: Fatores físicos ou químicos
facilitam a entrada do DNA na célula vegetal
Transformação Genética de Plantas
        Transferência Direta de DNA

     Bombardeamento de Partículas
Microcarreador
  Material
  Genético

  Célula
BIOBALÍSTICA (“gene gun”)


                   Tubo de
                 aceleração
                     de gás

                               Disco de
                               ruptura

          Aparato para          Macrocarreador
           disparo dos
      microcarreadores



                                 Tela de
         Microcarreadores        anteparo
                 cobertos
                com DNA

Tecido alvo
Transformação Genética de Plantas
            CONSTRUÇÃO GÊNICA
• Genes – Uma região de DNA que codifica para a
  produção de uma proteína ou característica
• Rede interativa - DNA, RNA e proteínas
Transformação Genética de Plantas
              CONSTRUÇÃO GÊNICA
• Transgenes – genes manipulados através das técnicas
  de DNA recombinante (rDNA)
   – Obtidos de organismos doadores (vírus, bactérias,
     fungos, vegetais e animais)
   – Sintetizados “in vitro”
   – Genes provenientes do mesmo organismo (cisgênico)
     ou de organismos diferentes (transgênico)
   – Transgênico pode ser produzido pela adição,
     deleção, iRNA.
Evento                              Características
T25         Tolerância ao herbicida glufosinato de amônio
MON 810     Resistência a insetos da ordem Lepidóptera
BT11        Resistência a insetos da ordem Lepidóptera e tolerância ao
            herbicida glufosinato de amônio
NK 603      Tolerância ao herbicida glifosato
GA21        Tolerância ao herbicida glufosinato de amônio
HERCULEX    Resistência a insetos da ordem Lepidóptera e tolerância ao
            herbicida glufosinato de amônio
MIR162    Resistência a insetos da ordem Lepidóptera
MON 810 x Resistência a insetos da ordem Lepidóptera e tolerância ao
NK603     herbicida glifosato
BT11       x Resistência a insetos da ordem Lepidóptera, tolerância aos
GA21         herbicidas glifosato e glufosinato de amônio
MON89034 Resistência a insetos da ordem Lepidóptera
TC1507  x Resistência a insetos da ordem Lepidóptera, tolerância aos
NK603     herbicidas glifosato e glufosinato de amônio
Transformação Genética de Plantas
                 CONSTRUÇÃO GÊNICA

          PROMOTOR       REGIÃO CODIFICADORA      TERMINADOR



Localização: Célula, tecido, órgão
Estágio de Desenvolvimento                       Final do Processo
Quantidade produzida

    35S; Ubiquitina; Actina                       NOS; polyA 35S

                                     Proteína


                               cry; vip; epsps
Transformação Genética de Plantas
   CONSTRUÇÃO GÊNICA - Promotor
         Promotor   uidA (GUS)   NOS
NcoI                          BamH
                            1.893 kb
                                                 I
                        cry1C (codon
                         optimized)

HindIII         BglII                            EcoRI
      d35S            AMV              NOS-Ter
    promoter
Transformação Genética de Plantas
        CONSTRUÇÃO GÊNICA
Transformação Genética de Plantas
        CONSTRUÇÃO GÊNICA
Transformação Genética de Plantas
        CONSTRUÇÃO GÊNICA
Transformação Genética de Plantas
        CONSTRUÇÃO GÊNICA
Transformação Genética de Plantas
 Biossegurança – Análises Moleculares
Biossegurança – Análise Moleculares
            Transgene e vetores

 Qual o método de transformação foi utilizado?
   – Foi considerado os riscos de cada método?
   – Foi utilizado todo o vetor ou apenas partes?
 Quais são os principais transgenes presentes no
  evento?
    Resistência a insetos / Genes cry
    Tolerância a herbicidas / Genes epsps
Biossegurança – Análise Moleculares
            Transgene e vetores

 Quais os organismos foram os doadores de genes?
    Organismo diferente?
    Mesmo organismo?
    Removido do seu contexto fisiológico, o gene se torna
     um rDNA com todos os riscos associados de qualquer
     rDNA.
Biossegurança – Análise Moleculares
              Transgene e vetores

 Os genes foram manipulados criando fusões entre diferentes genes
  ou tiveram alguma parte sintetizadas in vitro?
    Transgene pode ter sido modificado para ser expresso de
      maneira mais eficiente (codon usage)
    Recodificados ao nível dos nucleotídeos para ter um codon
      preferido pelo organismo recipiente.
    Ex: genes cry de Bacillus foram recodificados resultando em um
      aumento de 100X de expressão (Trends Biotechnol. 2004. 22, 346-353)


                    Milho AGG – Arginina (14,8%)
                    Milho CGA - Arginina (4,3%)
Biossegurança – Análise Moleculares
            Transgene e vetores
 Quais os genes foram utilizados para a seleção das
  células modificadas?
    Resistência a antibióticos – nptII –kan; bla - amp
    Tolerância a Herbicida epsps –glifosato; pat e bar -
     glifosinato
 O gene de seleção foi retirado? Como?
    Seleção de progênie
    Recombinase
 Como foi confirmado a remoção?
    Southern blot, PCR
Biossegurança – Análise Moleculares
            Transgene e vetores
 A sequência do transgene e o mapa de restrição são
  equivalentes?
 Dados de sequenciamento mostrando:
    O sítio de inserção do transgene no cromossomo
    A sequência que foi inserida
    As sequências flanqueando o transgene
 Foi verificado a ausência de outras integrações,
  completa ou parcial?
Biossegurança – Análise Moleculares
            Transgene e vetores
 Foi verificado rearranjamentos nos cromossomos?
 Qual o número de cópias do transgene presente no
  evento gerado?
 Houve integração de sequências estruturais do vetor?
Transformação Genética de Plantas
 Biossegurança – Análises Moleculares




         EcoRI              AluI EcoRI


   GAATTCCGTAATCGCCATGGTAGCTGGCGAATTCGGGAATG
Transformação Genética de Plantas
 Biossegurança – Análises Moleculares



         Southern blot
         PCR
         Sequenciamento
Mapa de Restrição
Biossegurança
Genoma
Transcriptoma, Proteoma e Metaboloma
Saúde humana e animal
Meio ambiente

         Biosafety Assessment Tool
         https://bat.genok.or/bat/
OBRIGADA!
    Andréa A. Carneiro
andreac@cnpms.embrapa.br

281112 andrea v2

  • 1.
    Introdução a Tecnologiado rDNA e Produção de Plantas Transgênicas Caracterização do Transgene e Estrutura do locus Andréa A. Carneiro
  • 2.
    PRODUÇÃO DE PLANTASTRANSGÊNICAS Agrobacterium Biobalística
  • 3.
    PRODUÇÃO DE PLANTASTRANSGÊNICAS Agrobacteria Biobalística
  • 4.
    PRODUÇÃO DE PLANTASTRANSGÊNICAS Agrobacteria Biobalística
  • 5.
    PRODUÇÃO DE PLANTASTRANSGÊNICAS Agrobacteria Biobalística
  • 6.
    PRODUÇÃO DE PLANTASTRANSGÊNICAS Agrobacteria Biobalística
  • 7.
    Agrobacterium tumefaciens TRANSFORMAÇÃO DE PLANTAS plasmídeo “Ti” (tumor inducer) célula transformada TRANSGÊNICA ! célula da planta “GALHA DA COROA” crescimento acelerado e desordenado do tecido TUMORIZAÇÃO
  • 8.
    Transformação Genética dePlantas Agrobacterium tumefaciens Agrobacterium 4.Transferência do T-DNA para a célula vegetal Plasmídeo Ti 2.Ativação dos genes vir EE ED Ti Genes vir 3.Cópia e T-DNA excisão Genes Vir do T-DNA att, chvA, B, E, pscA CROMOSSOMA BACTERIANO
  • 9.
    Transformação por Agrobacterium spp. Casa de vegetação co-cultivo calo plaqueamento (eliminação Agrobacterium) indução e regeneração seleção
  • 10.
    Transformação Genética dePlantas Transferência Direta de DNA • Microinjeção • Transformação de protoplastos via polietileno glicol • Eletroporação • Fibrilas de carboneto de silício • Bombardeamento de Partículas Ponto comum: Fatores físicos ou químicos facilitam a entrada do DNA na célula vegetal
  • 11.
    Transformação Genética dePlantas Transferência Direta de DNA Bombardeamento de Partículas Microcarreador Material Genético Célula
  • 12.
    BIOBALÍSTICA (“gene gun”) Tubo de aceleração de gás Disco de ruptura Aparato para Macrocarreador disparo dos microcarreadores Tela de Microcarreadores anteparo cobertos com DNA Tecido alvo
  • 13.
    Transformação Genética dePlantas CONSTRUÇÃO GÊNICA • Genes – Uma região de DNA que codifica para a produção de uma proteína ou característica • Rede interativa - DNA, RNA e proteínas
  • 14.
    Transformação Genética dePlantas CONSTRUÇÃO GÊNICA • Transgenes – genes manipulados através das técnicas de DNA recombinante (rDNA) – Obtidos de organismos doadores (vírus, bactérias, fungos, vegetais e animais) – Sintetizados “in vitro” – Genes provenientes do mesmo organismo (cisgênico) ou de organismos diferentes (transgênico) – Transgênico pode ser produzido pela adição, deleção, iRNA.
  • 15.
    Evento Características T25 Tolerância ao herbicida glufosinato de amônio MON 810 Resistência a insetos da ordem Lepidóptera BT11 Resistência a insetos da ordem Lepidóptera e tolerância ao herbicida glufosinato de amônio NK 603 Tolerância ao herbicida glifosato GA21 Tolerância ao herbicida glufosinato de amônio HERCULEX Resistência a insetos da ordem Lepidóptera e tolerância ao herbicida glufosinato de amônio MIR162 Resistência a insetos da ordem Lepidóptera MON 810 x Resistência a insetos da ordem Lepidóptera e tolerância ao NK603 herbicida glifosato BT11 x Resistência a insetos da ordem Lepidóptera, tolerância aos GA21 herbicidas glifosato e glufosinato de amônio MON89034 Resistência a insetos da ordem Lepidóptera TC1507 x Resistência a insetos da ordem Lepidóptera, tolerância aos NK603 herbicidas glifosato e glufosinato de amônio
  • 16.
    Transformação Genética dePlantas CONSTRUÇÃO GÊNICA PROMOTOR REGIÃO CODIFICADORA TERMINADOR Localização: Célula, tecido, órgão Estágio de Desenvolvimento Final do Processo Quantidade produzida 35S; Ubiquitina; Actina NOS; polyA 35S Proteína cry; vip; epsps
  • 17.
    Transformação Genética dePlantas CONSTRUÇÃO GÊNICA - Promotor Promotor uidA (GUS) NOS
  • 18.
    NcoI BamH 1.893 kb I cry1C (codon optimized) HindIII BglII EcoRI d35S AMV NOS-Ter promoter
  • 19.
    Transformação Genética dePlantas CONSTRUÇÃO GÊNICA
  • 20.
    Transformação Genética dePlantas CONSTRUÇÃO GÊNICA
  • 21.
    Transformação Genética dePlantas CONSTRUÇÃO GÊNICA
  • 22.
    Transformação Genética dePlantas CONSTRUÇÃO GÊNICA
  • 23.
    Transformação Genética dePlantas Biossegurança – Análises Moleculares
  • 24.
    Biossegurança – AnáliseMoleculares Transgene e vetores  Qual o método de transformação foi utilizado? – Foi considerado os riscos de cada método? – Foi utilizado todo o vetor ou apenas partes?  Quais são os principais transgenes presentes no evento?  Resistência a insetos / Genes cry  Tolerância a herbicidas / Genes epsps
  • 25.
    Biossegurança – AnáliseMoleculares Transgene e vetores  Quais os organismos foram os doadores de genes?  Organismo diferente?  Mesmo organismo?  Removido do seu contexto fisiológico, o gene se torna um rDNA com todos os riscos associados de qualquer rDNA.
  • 26.
    Biossegurança – AnáliseMoleculares Transgene e vetores  Os genes foram manipulados criando fusões entre diferentes genes ou tiveram alguma parte sintetizadas in vitro?  Transgene pode ter sido modificado para ser expresso de maneira mais eficiente (codon usage)  Recodificados ao nível dos nucleotídeos para ter um codon preferido pelo organismo recipiente.  Ex: genes cry de Bacillus foram recodificados resultando em um aumento de 100X de expressão (Trends Biotechnol. 2004. 22, 346-353) Milho AGG – Arginina (14,8%) Milho CGA - Arginina (4,3%)
  • 27.
    Biossegurança – AnáliseMoleculares Transgene e vetores  Quais os genes foram utilizados para a seleção das células modificadas?  Resistência a antibióticos – nptII –kan; bla - amp  Tolerância a Herbicida epsps –glifosato; pat e bar - glifosinato  O gene de seleção foi retirado? Como?  Seleção de progênie  Recombinase  Como foi confirmado a remoção?  Southern blot, PCR
  • 28.
    Biossegurança – AnáliseMoleculares Transgene e vetores  A sequência do transgene e o mapa de restrição são equivalentes?  Dados de sequenciamento mostrando:  O sítio de inserção do transgene no cromossomo  A sequência que foi inserida  As sequências flanqueando o transgene  Foi verificado a ausência de outras integrações, completa ou parcial?
  • 29.
    Biossegurança – AnáliseMoleculares Transgene e vetores  Foi verificado rearranjamentos nos cromossomos?  Qual o número de cópias do transgene presente no evento gerado?  Houve integração de sequências estruturais do vetor?
  • 30.
    Transformação Genética dePlantas Biossegurança – Análises Moleculares EcoRI AluI EcoRI GAATTCCGTAATCGCCATGGTAGCTGGCGAATTCGGGAATG
  • 31.
    Transformação Genética dePlantas Biossegurança – Análises Moleculares Southern blot PCR Sequenciamento
  • 33.
  • 34.
    Biossegurança Genoma Transcriptoma, Proteoma eMetaboloma Saúde humana e animal Meio ambiente Biosafety Assessment Tool https://bat.genok.or/bat/
  • 35.
    OBRIGADA! Andréa A. Carneiro andreac@cnpms.embrapa.br