O documento discute os desafios e oportunidades na construção de softwares de bioinformática para análises clínicas. Apresenta o laboratório Genomika, especializado em testes genéticos, e como a fusão de biologia molecular e tecnologia da informação é essencial para analisar grandes volumes de dados genéticos. Também destaca a importância da bioinformática para minerar bancos de dados na busca de mutações e como os sistemas de saúde podem ser aprimorados com novas tecnologias.
2. Quem somos ?
Um dos laboratórios mais avançados
em clínica genética do Brasil e o
primeiro localizado na região Norte e
Nordeste.
!
!
!
!
Portfólio de testes genéticos para
diagnóstico e tratamento personalizado
de doenças hereditárias, raras e
tumores.
4. Tecnologia e especialistas
Fusão de especialistas em biologia
molecular e tecnologia de informação
João
Bosco
Oliveira,
CEO
e
Co-‐Fundador
M.D,
PhD
e
ex-‐chefe
de
pesquisa
do
serviço
de
imunologia
e
genética
do
Dpto.
de
Medicina
Laboratorial,
Centro
Clínico,
National
Institutes
of
Health
,
USA.
61. Bioinformática
Nosso desafio diário: Mais de 10 banco de
dados minerados, alguns deles com mais de
1.000.000 anomalias genéticas sendo
analisados para cada 1 amostra.
Númerodebasesdedados
0
4
8
12
16
Númerodeanomalias
(emmilhões)
0
18
35
53
70
Tempo
2013 2014.1 2014.2 2015
62. Bioinformática
Junção processamento de alto desempenho,
algoritmos de big data e armazenamento
escalável de dados
0.1 a 35 GB de dados gerados por
paciente
Mais de 100 amostras processadas
por semana ~= 1.75 TB por semana
Tempo de entrega manter-se
constante
Dados entregues aos especialistas em
um formato de fácil interpretação.
68. Conclusões
Health Informatics
improve health informatics system
Several technologies still to improve
Processes, workflows and user experience
Information architecture
Lack of good solutions
69. Como posso aprender mais?
Tales of Genome (Udacity)
Curso On-line gratuito sobre Genética (bem completo!)