Aula introdutória à bioinformática e genômica com enfoque em bioinformática clínica. Aula dada na cadeira de Bioquímica 2 do curso de Biomedicina da UFPE 2017.1.
3. O que é bioinformática?
ref.: OMGenomics
(http://omgenomics.com/what-is-bioin
formatics/)
- A aplicação ou criação de ferramentas computacionais para analisar as
informações associadas à biomoléculas em larga escala [1, 2, 3].
4. O que é bioinformática?
ref.: OMGenomics
(http://omgenomics.com/what-is-bioin
formatics/)
- A aplicação ou criação de ferramentas computacionais para analisar as
informações associadas à biomoléculas em larga escala [1, 2, 3].
ref.: http://essayhomeworkhelp.org/articles/sample-essay-central-dogma-molecular-biology/
15. Bioinformática hoje
- Tecnologia da informação: armazenamento, transferência, transformação;
- Ciência da computação: algoritmos avançados, toolkits;
- Estatística: modelagem de dados, inferências;
- Ciências da vida: testes de hipóteses, interpretação.
16. Principais áreas [4]
- Análise filogenética
- Design de fármacos
- Bioinformática estrutural
- Ômicas
- Genômica
- Proteômica
- Transcriptômica
- Metabolômica
- Epigenômica
- Farmacogenômica
- Metagenômica
- Biologia de sistemas (Panômica)
17. Análise filogenética [5, 6]
- Filogenia: História evolucionária das espécies
- Filogenética: Estuda as filogenias, as relações evolutivas entre espécies
- Análise filogenética: Métodos usados para estimar relações filogenéticas
18.
19.
20. Bioinformática estrutural [7]
- Análise e predição da estrutura
tridimensional de macromoléculas
- Refinamento de estruturas
resolvidas (raio-X ou RMN)
- Desenho de fármacos [8]
- Desenho de novas proteínas
- Predição funcional
ref.: Liu, Fangyu, et
al. "Molecular
Structure of the
human CFTR ion
channel." Cell 169.1
(2017): 85-95.
23. Biologia de sistemas (panômica)
- Retorno a complexidade dos sistemas
- Estudo sistemático de interações em
um sistema biológico
- Teoria dos grafos
ref.: Wang, Min, et al. "Candidate genes and pathogenesis investigation for sepsis-related acute
respiratory distress syndrome based on gene expression profile." Biological research 49.1 (2016): 25.
24. Biologia de sistemas (panômica)
ref.: Wang, Min, et al. "Candidate genes and pathogenesis investigation for sepsis-related acute
respiratory distress syndrome based on gene expression profile." Biological research 49.1 (2016): 25.
25. Genômica
- É o estudo da sequência completa de DNA
(genoma) de um organismo, podendo se
limitar ao estudo de porção do genoma que
sejam de interesse clínico
- Entender doenças
- Abordagens personalizadas de tratamento
28. Genomika
- Um dos laboratórios mais avançados
em genética clínica no Brasil
- O primeiro na região Norte e Nordeste
- Portfólio de testes genéticos para
diagnóstico e tratamento personalizado
de doenças hereditárias, raras e
tumores
32. Por onde começar? [9, 10]
- Conhecimento em ao menos duas linguagens
- Conhecimento em estatística
- Conhecimento das técnicas de biologia molecular
- Experiência em Unix Shell
- Familiaridade com toolkits
- Familiaridade com bancos de dados
- Habilidades de comunicação
35. Oportunidades na área
- @bioinfojobs - Bioinfo.ca jobs
- @TxGenJobs - TxGenJobs
- Linkedin
- Genomika Diagnostics
- Hospital Israelita Albert Einstein
- Centro de Genomas(R)
- Mendelics
- Grupo Fleury
- Helixxa Serviços Genômicos S.A
- Hermes Pardini
- Laboratório Sabin
- Grupo DASA
36. 1. Luscombe, Nicholas M., Dov Greenbaum, and Mark Gerstein. "What is bioinformatics? An introduction and overview."
Yearbook of Medical Informatics 1.83-100 (2001): 2.
2. “WHAT IS BIOINFORMATICS?” by JOANNE FOX (https://www.scq.ubc.ca/what-is-bioinformatics/)
3. Bayat A. Bioinformatics. BMJ : British Medical Journal. 2002;324(7344):1018-1022.
4. “What are the various fields in bioinformatics?” (https://www.quora.com/What-are-the-various-fields-in-bioinformatics)
5. ‘Phylogenetics: DNA Protocol’ (http://bcrc.bio.umass.edu/intro/content/phylogenetics-dna-protocol)
6. ‘Introdução à bioinformática - Análise filogenética’
(https://edisciplinas.usp.br/pluginfile.php/3482372/mod_resource/content/1/IBM1029_aula11.pdf)
7. Bioinformática: da Biologia à Flexibilidade Moleculares (https://www.ufrgs.br/bioinfo/ebook/)
8. Katara, Pramod. "Role of bioinformatics and pharmacogenomics in drug discovery and development process." Network
Modeling Analysis in Health Informatics and Bioinformatics 2.4 (2013): 225-230.
9. ‘"Short List" of Bioinformatics Skills’
(https://www.reddit.com/r/bioinformatics/comments/5miwnr/short_list_of_bioinformatics_skills/)
10. ‘10 Useful Bioinformatics Skills to Have’
(http://bioinfonecia.blogspot.com.br/2011/06/10-useful-bioinformatics-skills-to-have.html)
11. Tutorial de BLAST (https://digitalworldbiology.com/tutorial/blast-for-beginners)
Referências
