Kamila Suemy e Priscila Pereira

1. Thrombin Inhibition –
Hirudin-VARIANT-2
Código PDB: 3F68
Produção: Kamila Suemy RA 11020810
Priscila Pereira RA 11101511
Direção: Prof. Dr. Rodrigo Cunha

2. PDB 3F68 - Thrombin Inhibition
Hirudin-Variant-2
1.Justificativa do interesse na proteína;
2.Descrição da proteína;
3.Descrição da estrutura;
4.Relação da estrutura com seu papel biológico;
5.Implicações práticas do conhecimento da
estrutura;
6.Referências.

3. 1. Justificativa do interesse na proteína
Esta proteína foi escolhida devido a
curiosidade da dupla a respeito do
funcionamento do sistema de inibição da
trombina, proteína responsável pela
coagulação sanguínea.
Mais especificamente, a relação entre as
sanguessugas, conhecidas cientificamente
por Hirudo Medicinallis, e a anticoagulação
sanguínea

4. 2. Descrição da proteína: Organismo de
origem e papel biológico
A Hirudina provém originalmente
da Hirudo Medicinalis,
conhecida popularmente como
sanguessuga, que é excretada
pelas glândulas salivares.
Atualmente pode ser produzida
em laboratório através do
método de DNA recombinante.
Seu principal papel biológico é
a de anticoagulação do sangue,
por meio da inibição da
trombina, proteína responsável
pela transformação do
fibrinogênio em fibrina.
(Oliveira, Luciana C. O., 2001)

5. 3. Descrição da estrutura
A família das hirudinas é
composta por inibidores
homólogos de cerca de 7kDa
com um a cadeia polipeptídica,
com 65 aminoácidos,
estabilizada por três pontes
dissulfeto altamente
conservadas. A estrutura
desses inibidores está
organizada em dois domínios, um
na porção N-terminal (resíduos
3-48) formando um arranjo
rígido estabilizado pelas
pontes de dissulfeto, e outro
na porção C-terminal (resíduos
49-65) formando uma cauda
flexível (Ribeiro, Cristina,
2009).

6. 4. Relação da estrutura com seu papel
biológico
Para que a hirudina consiga
inibir a tranformação do
fribinogênio em fibrina é
preciso que seu domínio amino
terminal interaja com o sítio
ativo da trombina, enquanto o
domínio carboxi terminal de
liga ao sítio externo na
enzima, formando com a
trombina um complexo de
dissociação lenta. Como
mostra a figura ao lado
(Blaya, Carolina, et al):

7. 5. Implicações práticas do conhecimento da
estrutura

A Hirudina é uma substância que impede a coagulação do
sangue, ou seja, é um potente inibidor específico de
Trombina (UniProtKb – P09945).

Hirudina é atualmente produzido sinteticamente por várias
empresas farmacêuticas e são usados na profilaxia e no
tratamento de trombose e de outros distúrbios (Ribei ro,
Cristina, 2009).

Existem fatores referentes a custos e risco hemorrágico
os quais representam importantes barreiras para a
disseminação de seu uso clínico (Oliveira, Luciana C. O.,
2001).

8. 5. Referências

Oliveira, Luciana C. O. NOVAS DROGAS ANTICOAGULANTES. Medicina,
Ribeirão Preto, 2001. Disponível em:< http
://www.fmrp.usp.br/revista/2001/vol34n3e4/novas_drogas_anticoagulantes.pdf
> Acesso em: 12 nov. 2012.

Ribeiro, Cristina. ANÁLISE DE PADRÕES DE INTERAÇÃO ENTRE SERINO
PROTEASES E SEUS INIBIDORES PROTÉICOS. UFMG, Belo Horizonte, 2009.
Disponível em:< http://www.pgbioinfo.icb.ufmg.br/defesas/10D.PDF > Acesso em:
12 nov. 2012.

UniProtKB - P09945, 2012. Disponível em:< http://www.uniprot.org/uniprot/P09945
> Acesso em: 12 nov. 2012.
●
Blaya, Carolina, et al. Análise da Utilização dos Novos Inibidores da Trombina na
Prática Médica. Arq. Bras. Cardiol. vol.71 n.2 São Paulo Aug. 1998. Disponível
em:< http://dx.doi.org/10.1590/S0066-782X1998000800013 > Acesso em: 12 nov.
2012.