Aplicações de computação científica na Embrapa (Wagner Arbex e Kátia Santos). Palestra apresentada no SACI 2013 - I Seminário de Aplicações em Computação e Informática. O SACI 2013 foi organizado pela UFJF e Embrapa, sendo realizado no dia 25/5/2013 na Embrapa, em Juiz de Fora, MG.

1. Aplicações de Computação
Científica na Embrapa
Wagner Arbex
Katia Santos
{wagner.arbex, katia.santos}@embrapa.br
SACI’13
I Seminário de Aplicações em Computação e Informática
Embrapa Gado de Leite
Juiz de Fora – 24/5/2013

2. A Embrapa
• Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária:
~ 50 centros serviços e de pesquisa de produtos,
temas básicos e ecorregionais país;
~ 12 projetos ou laboratórios de pesquisa,
prospecção e articulação no exterior;
• Embrapa Gado de Leite
Centro Nacional de Pesquisa de Gado de Leite;

3. A Embrapa

4. O que é computação científica

5. O que é computação científica
• Também chamada e-science ou ciência computacional
e não deve ser confundida com ciência da computação;
• Aplicação de modelagem matemática e computacional
em problemas científicos e tecnológicos;
• Promove/Possibilita a computação massiva e/ou
complexa, o que são “novos” paradigmas da pesquisa
científica;

6. O que é computação científica

7. O que é computação científica
• É comum...
• basear-se em software livre;
• exigir recursos de computação de alto
desempenho;
• não apresentar padrão para demanda de
processamento ou para uso de recursos
computacionais;
• “pagar pra ver”...
testar inovações, novas tecnologias e/ou recursos
tecnológicos - algumas vezes, sem comprovação
de eficiência - para buscar alguma nova solução.

8. Como se faz computação científica
• Sob aspectos gerais, na computação científica...
... são utilizadas algumas disciplinas muito próximas
de SI, tal como, banco de dados;
... são utilizadas algumas disciplinas muito
próximas de CC:
• algoritmos, estrutura de dados e
complexidade; IA; matemática e estatística;
programação; sistemas distribuídos; sistemas
operacionais;

9. Como se faz computação científica
• Então, na prática...
• modelagem matemática e computacional para
predição de resultados biológicos:
algoritmos e programação (Perl, C e “pacotes”);
IA (aprendizado de máquina); matemática e
estatística (aprendizado estatístico e aplicativos);
SO (Linux);
• modelos computacionais para estabelecimento de
procedimentos metodológicos para bioinformática;

10. Como se faz computação científica
• Então, na prática...
• definir uma arquitetura computacional que
proporcione um ambiente de execução mais
eficiente e robusto;
• desenvolvimento e implementação de um array de
discos para storage e backup;

11. Array de discos para storage e backup

12. O que tem se falado sobre
computação científica

13. O que tem se falado sobre
computação científica

14. MUITO OBRIGADO!
Aplicações de Computação
Científica na Embrapa
Wagner Arbex
Katia Santos
{wagner.arbex, katia.santos}@embrapa.br
SACI’13
I Seminário de Aplicações em Computação e Informática
Embrapa Gado de Leite
Juiz de Fora – 25/5/2013