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O registro por Maximização de MI parte de uma orientação e posição dos eixos de ambos
volumes de imagens (exemplo CT e MRI). A maximização da MI se atinge como um processo de
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parece “bom” para a matemática do sistema mas não é o máximo global.
Problema: Rotação > 90 graus Problema: Volumes espelhados
Para resolver os casos anteriores e ainda usufruir das vantagens da Maximização
de MI podemos fazer registro por POIs e depois utilizar Maximização MI para
otimizar o resultado. Normalmente isto produz resultados de registro muito bons.
Esta solução obriga a criar 4 ou mais POIs em ambas sequências, com a mesma
ortografia, em pontos anatômicos equivalentes. Esta metodologia é satisfatória e
segura, porém alguns usuários avaliam que toma tempo e resulta pouco intuitiva.
Com o objetivo de criar caminhos mais simples e intuitivos implementamos um
método equivalente a aproximação inicial por POIs sem a necessidade de criar os
ditos POIs.
A seguir vamos descrever a forma de operação com o novo método, que já
contém várias melhoras em relação a sua primeira implementação no ano de
2015.
Cada vez que o MNPS inicia a Maximização de MI pergunta:
“Need to define registration points?” .
Se você tem a suspeita que os conjuntos de imagens são de difícil registro via Maximização de
MI pura, ou já testou e não deu resultado ótimo, selecione Sim.
Com isto o sistema cria uma janela bipartida que permite navegar pelas imagens internas
(referência) e externas (flutuantes). O usuário deve identificar 3 ou mais pontos equivalentes e
vinculá-los graficamente com um segmento de reta.
NOTA: Geralmente a fusão de CT
axial com MRI axial pode ser feita
em forma totalmente automática e
não precisa deste recurso.
Layout da janela de trabalho para criar pares de pontos vinculados
• A sequência com a borda vermelha está selecionada para navegação.
• Para mudar a sequência selecionada deve fazer CLICK do mouse na sequência
• Pode navegar nas imagens com as teclas <PageUp> e <PageDown>.
• Também pode ir ao início da sequência com botão “Go First IMG” e ao fim com “Go Last IMG”.
Quando localizar um par de planos que contém pontos equivalentes:
• CLICK no botão “New Pair”.
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• Para terminar de criar o par pode usar tecla <ENTER> ou duplo CLICK
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Localizando olho esquerdo em sequência sagital. O normal é aparecer primeiro o direito
Após o terceiro par de pontos o MNPS verifica se já existem condições para
iniciar a maximização da MI. Observar o sinal: “Matching looks GOOD !” .PontosnofastígiodoIVventrículo
NOTA: Em sequências sagitais fica confuso determinar qual é o olho direito (hemisfério direito) e
esquerdo. Se a sequência foi feita com o padrão radiológico vigente, o primeiro olho a aparecer é o
direito. Observar indexador da imagem na sequência como referência.
Sugestão: Na sequência sagital CLICK no botão “Go First IMG”, depois dar <PageUp> até o centro do
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Com apenas três pares de pontos o MNPS pode gerar um quarto ponto considerando que
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O quarto ponto é criado com produtos vetoriais ( A x B ). Sendo válidas estas duas
condições podemos terminar com três pontos marcados.
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Caso as condições da lâmina anterior não sejam válidas ou ante a dúvida, o
usuário deve marcar 4 ou mais pares de pontos para que o registro que
segue seja correto.
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Com estes pontos o MNPS vai calcular a matriz de transformação
aproximada de uma sequência para a outra e vai dar inicio à Maximização da
MI a partir dela.
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É importante destacar que agora podemos importar POIs e Tractografias, além de ROIs,
da sequência de imagens externa.
Veja na imagem que segue o novo menu da Fusão. Lembre que o menu da fusão abre
com <ALT-F5> ou pelo menu da ajuda.
Somente inicie esta importação depois que a qualidade do registro esteja comprovada,
pois esta importação utiliza a mesma matriz de transformação da fusão.
POIs que já existem não serão importados, para evitar perdas.
Outra novidade fundamental para explorar integralmente as possibilidades
derivadas dos Virtual Fiducials é a capacidade do MNPS para exportar para
fusão – coisa que apenas fazia o CAT3D.
Observe que existe uma entrada nova no menu “Load Sequence with Same
Registration”. Este recurso facilita o registro de uma segunda sequência que tem a
mesma orientação da sequência que está registrada e fundida. Exemplos, uma T1
seguida de um T2. Caso as sequências não estejam com orientação exatamente igual,
sempre pode voltar ao menu e pedir uma nova maximização da informação mútua. Este
recurso é fundamental para o uso do atlas LPBA40, primeiro deve registrar e fundir com
a sequência máscara, somente depois se carrega a sequência de “labels”, com o mesmo
registro que a máscara.
Dica para facilitar a fusão por
maximização de MI: Evite grandes
divergências dos volumes a
registrar.
No caso ao lado a MRI vai até os
ombros do paciente enquanto a CT
termina no topo de C1.
Informações complementares sobre registro e fusão estão disponíveis em
aulas de cursos anteriores.
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Curso MNPS 2017. Registro e Fusão de imagens. Image Registration and Fusion

  • 1. Curso de Atualização e Técnicas Avançadas em MNPS – 2017 (ver 10.36.00) Recursos de Registro e Fusão multimodal de imagens Armando Alaminos Bouza. Físico-Médico Equipe de desenvolvimento do MNPS/CAT3D Mevis Informática Médica LTDA. Brasil São Paulo. 24 de Junho 2017.
  • 2. Até a versão 10.32.02 o MNPS apresentava dois caminhos para iniciar o registro: • Registro por POIs (necessita 4 ou mais POIs nas imagens externas e internas) • Registro por Maximização da Informação Mútua (MI). O registro por Maximização de MI parte de uma orientação e posição dos eixos de ambos volumes de imagens (exemplo CT e MRI). A maximização da MI se atinge como um processo de otimização não-linear e estes processos podem ficar “presos” dentro de um máximo local, que parece “bom” para a matemática do sistema mas não é o máximo global. Problema: Rotação > 90 graus Problema: Volumes espelhados
  • 3. Para resolver os casos anteriores e ainda usufruir das vantagens da Maximização de MI podemos fazer registro por POIs e depois utilizar Maximização MI para otimizar o resultado. Normalmente isto produz resultados de registro muito bons. Esta solução obriga a criar 4 ou mais POIs em ambas sequências, com a mesma ortografia, em pontos anatômicos equivalentes. Esta metodologia é satisfatória e segura, porém alguns usuários avaliam que toma tempo e resulta pouco intuitiva. Com o objetivo de criar caminhos mais simples e intuitivos implementamos um método equivalente a aproximação inicial por POIs sem a necessidade de criar os ditos POIs. A seguir vamos descrever a forma de operação com o novo método, que já contém várias melhoras em relação a sua primeira implementação no ano de 2015.
  • 4. Cada vez que o MNPS inicia a Maximização de MI pergunta: “Need to define registration points?” . Se você tem a suspeita que os conjuntos de imagens são de difícil registro via Maximização de MI pura, ou já testou e não deu resultado ótimo, selecione Sim. Com isto o sistema cria uma janela bipartida que permite navegar pelas imagens internas (referência) e externas (flutuantes). O usuário deve identificar 3 ou mais pontos equivalentes e vinculá-los graficamente com um segmento de reta. NOTA: Geralmente a fusão de CT axial com MRI axial pode ser feita em forma totalmente automática e não precisa deste recurso.
  • 5. Layout da janela de trabalho para criar pares de pontos vinculados
  • 6. • A sequência com a borda vermelha está selecionada para navegação. • Para mudar a sequência selecionada deve fazer CLICK do mouse na sequência • Pode navegar nas imagens com as teclas <PageUp> e <PageDown>. • Também pode ir ao início da sequência com botão “Go First IMG” e ao fim com “Go Last IMG”.
  • 7. Quando localizar um par de planos que contém pontos equivalentes: • CLICK no botão “New Pair”. • Modificar o segmento de reta arrastando cada ponta com o mouse • Para terminar de criar o par pode usar tecla <ENTER> ou duplo CLICK
  • 8. Após o ENTER a linha fica verde e o número de “Matching points” aumenta (este é outro caso, de CT axial com MRI em sagital)
  • 9. Localizando olho esquerdo em sequência sagital. O normal é aparecer primeiro o direito
  • 10. Após o terceiro par de pontos o MNPS verifica se já existem condições para iniciar a maximização da MI. Observar o sinal: “Matching looks GOOD !” .PontosnofastígiodoIVventrículo
  • 11. NOTA: Em sequências sagitais fica confuso determinar qual é o olho direito (hemisfério direito) e esquerdo. Se a sequência foi feita com o padrão radiológico vigente, o primeiro olho a aparecer é o direito. Observar indexador da imagem na sequência como referência. Sugestão: Na sequência sagital CLICK no botão “Go First IMG”, depois dar <PageUp> até o centro do primeiro olho aparecer. Esse deve ser o direito. Olho direito Olho esquerdo
  • 12. Com apenas três pares de pontos o MNPS pode gerar um quarto ponto considerando que os corpos são rígidos e assumindo que ambos são sistemas do mesmo tipo de giro. O quarto ponto é criado com produtos vetoriais ( A x B ). Sendo válidas estas duas condições podemos terminar com três pontos marcados. Sistemas de coordenadas cartesianas ortogonais tridimensionais Produto vetorial em sistema dextrógiro
  • 13. Caso as condições da lâmina anterior não sejam válidas ou ante a dúvida, o usuário deve marcar 4 ou mais pares de pontos para que o registro que segue seja correto. Ao terminar de marcar pares de pontos deve fazer CLICK no botão “Done”. Com estes pontos o MNPS vai calcular a matriz de transformação aproximada de uma sequência para a outra e vai dar inicio à Maximização da MI a partir dela. O restante do processo é similar ao registro com Maximização da MI.
  • 14. É importante destacar que agora podemos importar POIs e Tractografias, além de ROIs, da sequência de imagens externa. Veja na imagem que segue o novo menu da Fusão. Lembre que o menu da fusão abre com <ALT-F5> ou pelo menu da ajuda. Somente inicie esta importação depois que a qualidade do registro esteja comprovada, pois esta importação utiliza a mesma matriz de transformação da fusão. POIs que já existem não serão importados, para evitar perdas.
  • 15. Outra novidade fundamental para explorar integralmente as possibilidades derivadas dos Virtual Fiducials é a capacidade do MNPS para exportar para fusão – coisa que apenas fazia o CAT3D.
  • 16. Observe que existe uma entrada nova no menu “Load Sequence with Same Registration”. Este recurso facilita o registro de uma segunda sequência que tem a mesma orientação da sequência que está registrada e fundida. Exemplos, uma T1 seguida de um T2. Caso as sequências não estejam com orientação exatamente igual, sempre pode voltar ao menu e pedir uma nova maximização da informação mútua. Este recurso é fundamental para o uso do atlas LPBA40, primeiro deve registrar e fundir com a sequência máscara, somente depois se carrega a sequência de “labels”, com o mesmo registro que a máscara.
  • 17. Dica para facilitar a fusão por maximização de MI: Evite grandes divergências dos volumes a registrar. No caso ao lado a MRI vai até os ombros do paciente enquanto a CT termina no topo de C1.
  • 18. Informações complementares sobre registro e fusão estão disponíveis em aulas de cursos anteriores. http://www.slideshare.net/alabouza/mnps-curso-20142 http://www.slideshare.net/alabouza/mnps-curso-20143