O documento descreve novos recursos de registro e fusão multimodal de imagens no software MNPS, incluindo:
1) Um método para registro inicial por pontos de interesse (POIs) sem necessidade de criar os POIs manualmente.
2) A capacidade de importar POIs, tractografias e ROIs da sequência externa após o registro.
3) A exportação de fusões para facilitar o registro de outras sequências com a mesma orientação.
Curso MNPS 2017. Registro e Fusão de imagens. Image Registration and Fusion
1. Curso de Atualização e Técnicas Avançadas em
MNPS – 2017 (ver 10.36.00)
Recursos de Registro e Fusão multimodal de imagens
Armando Alaminos Bouza.
Físico-Médico
Equipe de desenvolvimento do MNPS/CAT3D
Mevis Informática Médica LTDA. Brasil
São Paulo. 24 de Junho 2017.
2. Até a versão 10.32.02 o MNPS apresentava dois caminhos para iniciar o registro:
• Registro por POIs (necessita 4 ou mais POIs nas imagens externas e internas)
• Registro por Maximização da Informação Mútua (MI).
O registro por Maximização de MI parte de uma orientação e posição dos eixos de ambos
volumes de imagens (exemplo CT e MRI). A maximização da MI se atinge como um processo de
otimização não-linear e estes processos podem ficar “presos” dentro de um máximo local, que
parece “bom” para a matemática do sistema mas não é o máximo global.
Problema: Rotação > 90 graus Problema: Volumes espelhados
3. Para resolver os casos anteriores e ainda usufruir das vantagens da Maximização
de MI podemos fazer registro por POIs e depois utilizar Maximização MI para
otimizar o resultado. Normalmente isto produz resultados de registro muito bons.
Esta solução obriga a criar 4 ou mais POIs em ambas sequências, com a mesma
ortografia, em pontos anatômicos equivalentes. Esta metodologia é satisfatória e
segura, porém alguns usuários avaliam que toma tempo e resulta pouco intuitiva.
Com o objetivo de criar caminhos mais simples e intuitivos implementamos um
método equivalente a aproximação inicial por POIs sem a necessidade de criar os
ditos POIs.
A seguir vamos descrever a forma de operação com o novo método, que já
contém várias melhoras em relação a sua primeira implementação no ano de
2015.
4. Cada vez que o MNPS inicia a Maximização de MI pergunta:
“Need to define registration points?” .
Se você tem a suspeita que os conjuntos de imagens são de difícil registro via Maximização de
MI pura, ou já testou e não deu resultado ótimo, selecione Sim.
Com isto o sistema cria uma janela bipartida que permite navegar pelas imagens internas
(referência) e externas (flutuantes). O usuário deve identificar 3 ou mais pontos equivalentes e
vinculá-los graficamente com um segmento de reta.
NOTA: Geralmente a fusão de CT
axial com MRI axial pode ser feita
em forma totalmente automática e
não precisa deste recurso.
5. Layout da janela de trabalho para criar pares de pontos vinculados
6. • A sequência com a borda vermelha está selecionada para navegação.
• Para mudar a sequência selecionada deve fazer CLICK do mouse na sequência
• Pode navegar nas imagens com as teclas <PageUp> e <PageDown>.
• Também pode ir ao início da sequência com botão “Go First IMG” e ao fim com “Go Last IMG”.
7. Quando localizar um par de planos que contém pontos equivalentes:
• CLICK no botão “New Pair”.
• Modificar o segmento de reta arrastando cada ponta com o mouse
• Para terminar de criar o par pode usar tecla <ENTER> ou duplo CLICK
8. Após o ENTER a linha fica verde e o número de “Matching points” aumenta
(este é outro caso, de CT axial com MRI em sagital)
10. Após o terceiro par de pontos o MNPS verifica se já existem condições para
iniciar a maximização da MI. Observar o sinal: “Matching looks GOOD !” .PontosnofastígiodoIVventrículo
11. NOTA: Em sequências sagitais fica confuso determinar qual é o olho direito (hemisfério direito) e
esquerdo. Se a sequência foi feita com o padrão radiológico vigente, o primeiro olho a aparecer é o
direito. Observar indexador da imagem na sequência como referência.
Sugestão: Na sequência sagital CLICK no botão “Go First IMG”, depois dar <PageUp> até o centro do
primeiro olho aparecer. Esse deve ser o direito.
Olho direito Olho esquerdo
12. Com apenas três pares de pontos o MNPS pode gerar um quarto ponto considerando que
os corpos são rígidos e assumindo que ambos são sistemas do mesmo tipo de giro.
O quarto ponto é criado com produtos vetoriais ( A x B ). Sendo válidas estas duas
condições podemos terminar com três pontos marcados.
Sistemas de coordenadas cartesianas ortogonais tridimensionais
Produto vetorial em
sistema dextrógiro
13. Caso as condições da lâmina anterior não sejam válidas ou ante a dúvida, o
usuário deve marcar 4 ou mais pares de pontos para que o registro que
segue seja correto.
Ao terminar de marcar pares de pontos deve fazer CLICK no botão “Done”.
Com estes pontos o MNPS vai calcular a matriz de transformação
aproximada de uma sequência para a outra e vai dar inicio à Maximização da
MI a partir dela.
O restante do processo é similar ao registro com Maximização da MI.
14. É importante destacar que agora podemos importar POIs e Tractografias, além de ROIs,
da sequência de imagens externa.
Veja na imagem que segue o novo menu da Fusão. Lembre que o menu da fusão abre
com <ALT-F5> ou pelo menu da ajuda.
Somente inicie esta importação depois que a qualidade do registro esteja comprovada,
pois esta importação utiliza a mesma matriz de transformação da fusão.
POIs que já existem não serão importados, para evitar perdas.
15. Outra novidade fundamental para explorar integralmente as possibilidades
derivadas dos Virtual Fiducials é a capacidade do MNPS para exportar para
fusão – coisa que apenas fazia o CAT3D.
16. Observe que existe uma entrada nova no menu “Load Sequence with Same
Registration”. Este recurso facilita o registro de uma segunda sequência que tem a
mesma orientação da sequência que está registrada e fundida. Exemplos, uma T1
seguida de um T2. Caso as sequências não estejam com orientação exatamente igual,
sempre pode voltar ao menu e pedir uma nova maximização da informação mútua. Este
recurso é fundamental para o uso do atlas LPBA40, primeiro deve registrar e fundir com
a sequência máscara, somente depois se carrega a sequência de “labels”, com o mesmo
registro que a máscara.
17. Dica para facilitar a fusão por
maximização de MI: Evite grandes
divergências dos volumes a
registrar.
No caso ao lado a MRI vai até os
ombros do paciente enquanto a CT
termina no topo de C1.
18. Informações complementares sobre registro e fusão estão disponíveis em
aulas de cursos anteriores.
http://www.slideshare.net/alabouza/mnps-curso-20142
http://www.slideshare.net/alabouza/mnps-curso-20143