A avaliação institucional na UFRN é coordenada pela CPA e envolve autoavaliação, avaliação externa pelo INEP e avaliação dos estudantes pelo ENADE. A UFRN tem tido bons resultados nas avaliações externas, porém ainda enfrenta fragilidades como falta de assessoria pedagógica em alguns centros e descumprimento de diretrizes curriculares por alguns cursos.