As doenças mais comuns a bordo das naus de Fernão de Magalhães incluíam escorbuto, febre tifóide e malária. O escorbuto era causado pela falta de vitamina C na dieta dos marinheiros, enquanto a febre tifóide e a malária eram transmitidas por água e mosquitos contaminados. Os tratamentos disponíveis na época eram limitados.