O documento discute vários tipos de poluição aquática e desequilíbrios, incluindo poluição hídrica por lixo, esgoto e resíduos industriais e agrícolas; eutrofização; marés vermelhas causadas por proliferação de algas tóxicas; poluição térmica; poluição por mercúrio de fontes como queima de combustíveis e mineração; e poluição por esgoto. O documento também menciona problemas específicos de poluição no Rio São Francisco, como algas e embarcações abandonadas.